| Gene Information Plasmid Coverage information Fosmid Coverage information Sequence |
Gene Information |
| Locus tag | BcerKBAB4_3477 |
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| Symbol | |
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| ID | 5843689 |
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| Type | CDS |
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| Is gene spliced | No |
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| Is pseudo gene | No |
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| Organism name | Bacillus weihenstephanensis KBAB4 |
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| Kingdom | Bacteria |
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| Replicon accession | NC_010184 |
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| Strand | + |
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| Start bp | 3526858 |
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| End bp | 3529668 |
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| Gene Length | 2811 bp |
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| Protein Length | 936 aa |
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| Translation table | 11 |
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| GC content | 50% |
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| IMG OID | 641378600 |
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| Product | triple helix repeat-containing collagen |
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| Protein accession | YP_001646278 |
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| Protein GI | 163941394 |
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| COG category | |
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| COG ID | |
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| TIGRFAM ID | |
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Plasmid Coverage information |
| Num covering plasmid clones | 1 |
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| Plasmid unclonability p-value | 0.00171179 |
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| Plasmid hitchhiking | No |
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| Plasmid clonability | decreased coverage |
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Fosmid Coverage information |
| Num covering fosmid clones | n/a |
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| Fosmid unclonability p-value | n/a |
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| Fosmid Hitchhiker | n/a |
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| Fosmid clonability | n/a |
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Sequence |
| Gene sequence | ATGTCTCGCT TTAACGACAA TCAAAATAAA TACTCCAATC CATGCTTTCC AACTAGCGCT
GGACGAATTC CAACTACCCC AACGATTCCA ATTACTAAAG CGCAAATTAG AACATTCCGT
GCAATCATTA ACGATTTAAT AAAAATAATC CCTAAACTTT TCGCCAATCC ATCTCCCAAA
AACATTGAGA ATCTAATAGA TACATTGCAC CTACTAAGCA AATTCATCTG TTCACTAGAC
ACTACTTCCG CTCTGAAAGC ACAAGGATTA GCCATCATTA AAAACTTAAT AACTATATTA
AAAAATCCAA CCTTCGTAGC AAGTGCTGTA TTTGTTGAAC TTCAAATTTT AATTAATTAT
TTACTTTACA TTACAAAGTT ATTCCGAATT GATCCTTGTA CACTCCAAGA ACTCCTTAAA
TTAATTGCAG AGTTACAAAC TACTCTAGTT AATTCAGCTT CGTTCGGCAG AGGACCTACT
GGACCTACTG GACCTAGAGG TAACACGGGC GCTACTGGCG CTACCGGACC TAGAGGTAAC
ACGGGCGCTA CTGGTGCGAC CGGACCTAGA GGTAACACGG GCGCTACTGG TGCGACCGGA
CCTAGAGGTA ACACAGGTGC TACTGGTGCG ACCGGACCTA GAGGTAACAC GGGCGCTACT
GGTGCGACCG GACCTAGAGG TAACACAGGT GCTACTGGTG CGACCGGACC TAGAGGTAAC
ACGGGCGCTA CTGGTGCGAC CGGACCTAGA GGTAACACGG GCGCTACTGG TGCGACCGGA
CCTAGAGGTA ACACGGGCGC TACTGGTGCG ACCGGACCTA GAGGTAACAC AGGTGCTACT
GGTGCGATCG GACCTAGAGG TAACACGGGC GCTACTGGTG CGACCGGACC TAGAGGTAAC
ACAGGTGCTA CTGGTGCGAC CGGACCTAGA GGTAACACAG GTGCTACTGG TGCGACCGGA
CCTAGAGGTA ACACAGGTGC TACTGGTTCC ACTGGACCTC AAGGTGCGCA AGGTAACACG
GGTGCTACTG GACCTCAAGG CGTTCAAGGT AACACAGGTG CTACTGGACC TCAAGGTGCG
CAAGGTAACA CGGGTGCTAC TGGACCTCAA GGCGTTCAAG GTAACACAGG TGCTACCGGT
TCCACTGGAC CTCAAGGTCT TCAAGGTAAC ACAGGTGCTA CCGGTTCCAC CGGACCTCAA
GGTGCGCAAG GTAACACAGG TGCTACTGGA CCTCAAGGCG TTCAAGGTAA CACAGGTGCG
ACTGGTTCCA CTGGACCTCA AGGTCTTCAA GGTAACACAG GTGCTACTGG TTCCACTGGA
CCTCAAGGTC TTCAAGGTAA CACAGGTGCT ACCGGTTCCA CTGGACCTCA AGGTGCGCAA
GGTAACACAG GTGCTACTGG ACCTCAAGGC GTTCAAGGTA ACACAGGTGC TACCGGTTCC
ACTGGACCTC AAGGCGTTCA AGGTAACACG GGTGCTACCG GTTCCACTGG ACCCCAAGGC
GTTCAAGGTA ACACGGGTGC TACTGGACCT CAAGGCGTTC AAGGTAACAC AGGTGCTACT
GGTTCCACTG GACCTCAAGG CGTTCAAGGT AACACAGGTG CTACTGGACC TCAAGGTGCT
CAAGGTAACA CGGGTGCTAC TGGACCTCAA GGCGTTCAAG GTAACACAGG TGCTACCGGT
TCCACTGGAC CTCAAGGCGT TCAAGGTAAC ACAGGTGCTA CTGGACCTCA AGGCGTTCAA
GGTAACACAG GTGCTACTGG TTCCACTGGA CCTCAAGGCG TTCAAGGTAA CACAGGTGCT
ACTGGACCTC AAGGTGCGCA AGGTAACACG GGTGCTACTG GACCTCAAGG CGTTCAAGGT
AACACAGGTG CTACTGGTTC CACTGGACCT CAAGGCGTTC AAGGTAACAC AGGTGCTACC
GGACCTCAAG GCACTCAAGG TAATACGGGT GCTACCGGAC CTCAAGGTGC TCAAGGTAAC
ACGGGTGCTA CCGGACCTCA AGGTGCTCAA GGTAACACAG GTGCGACTGG TATAGGAGTT
ACCGGACCTA CCGGACCTTC TGGTGGGCCT CCTGGACCTA CTGGACCTCA AGGTATTCAA
GGTAACACAG GTGCTACCGG ACCTCAAGGT GTTCAAGGTA ACACGGGTGC TACCGGACCT
CAAGGTGCTC AAGGTAACAC GGGTGCTACC GGACCTCAAG GTGCTCAAGG TAACACGGGT
GCTACCGGAC CTCAAGGTGC TCAAGGTAAC ACAGGTGCTA CCGGACCTCA AGGTGCTCAA
GGTAACACAG GTGCGACTGG TATAGGAGTT ACCGGACCTA CTGGACCTCA AGGTAACACG
GGTGCGACTG GACCTCAAGG TGTTCAAGGA CCAACGGGTG CGACTGGTAT AGGAGTTACC
GGACCTACTG GACCTAGCTT CCCAGTAGCA ACAATCGTTG TAACAAACAA CATCCAACAA
ACAGTAATCC AATTTAATAA CTTTATTTTT AGTACTGCAA TTAACGTAAA CAATATTATC
TTTAACGGCA CAAATACAGT TACTGTTATT AACGCTGGTA TTTATGTAAT TAGCGTATCT
ATTTCTACAA CTGCGCCAGG ATGCGCTCCA CTTGGAGTAG GAATTTCAAT TAATGGAGCA
GTTGCTACTG ACAACTTCTC TTCAAATCTA ATAGGCGACT CACTTTCATT TACTACAATC
GAAACATTAG CTGCTGGAGC AAACATTTCT GTCCAATCTA CTCTTAACGA GATTACGATC
CCTGCAACAG GAAACACTAA CATTCGTCTT ACTGTATTTA GAATCGCTTA A
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| Protein sequence | MSRFNDNQNK YSNPCFPTSA GRIPTTPTIP ITKAQIRTFR AIINDLIKII PKLFANPSPK
NIENLIDTLH LLSKFICSLD TTSALKAQGL AIIKNLITIL KNPTFVASAV FVELQILINY
LLYITKLFRI DPCTLQELLK LIAELQTTLV NSASFGRGPT GPTGPRGNTG ATGATGPRGN
TGATGATGPR GNTGATGATG PRGNTGATGA TGPRGNTGAT GATGPRGNTG ATGATGPRGN
TGATGATGPR GNTGATGATG PRGNTGATGA TGPRGNTGAT GAIGPRGNTG ATGATGPRGN
TGATGATGPR GNTGATGATG PRGNTGATGS TGPQGAQGNT GATGPQGVQG NTGATGPQGA
QGNTGATGPQ GVQGNTGATG STGPQGLQGN TGATGSTGPQ GAQGNTGATG PQGVQGNTGA
TGSTGPQGLQ GNTGATGSTG PQGLQGNTGA TGSTGPQGAQ GNTGATGPQG VQGNTGATGS
TGPQGVQGNT GATGSTGPQG VQGNTGATGP QGVQGNTGAT GSTGPQGVQG NTGATGPQGA
QGNTGATGPQ GVQGNTGATG STGPQGVQGN TGATGPQGVQ GNTGATGSTG PQGVQGNTGA
TGPQGAQGNT GATGPQGVQG NTGATGSTGP QGVQGNTGAT GPQGTQGNTG ATGPQGAQGN
TGATGPQGAQ GNTGATGIGV TGPTGPSGGP PGPTGPQGIQ GNTGATGPQG VQGNTGATGP
QGAQGNTGAT GPQGAQGNTG ATGPQGAQGN TGATGPQGAQ GNTGATGIGV TGPTGPQGNT
GATGPQGVQG PTGATGIGVT GPTGPSFPVA TIVVTNNIQQ TVIQFNNFIF STAINVNNII
FNGTNTVTVI NAGIYVISVS ISTTAPGCAP LGVGISINGA VATDNFSSNL IGDSLSFTTI
ETLAAGANIS VQSTLNEITI PATGNTNIRL TVFRIA
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