33 decreased-coverage genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Ssol_0184  CDS  CP001800  158831  159373  +  543  conserved hypothetical protein  ACX90480  decreased coverage  0.000319897  n/a    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea 
 
 
-
 
Ssol_0185  CDS  CP001800  159332  159901  -  570  KH domain protein  ACX90481  decreased coverage  0.00031707  n/a    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea 
 
 
-
 
Ssol_0379  CDS  CP001800  343147  344139  +  993  conserved hypothetical protein  ACX90664  decreased coverage  0.00595472  n/a    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea 
 
 
-
 
Ssol_0400  CDS  CP001800  360035  360550  -  516  Protein of unknown function DUF429  ACX90683  decreased coverage  0.00365884  n/a    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea 
 
 
-
 
Ssol_0554  CDS  CP001800  500463  502199  +  1737  glycoside hydrolase 15-related protein  ACX90830  decreased coverage  0.000579959  n/a    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea 
 
 
-
 
Ssol_0589  CDS  CP001800  537830  538099  -  270  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  ACX90865  decreased coverage  0.000249296  n/a    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea 
 
 
-
 
Ssol_0590  CDS  CP001800  538096  539319  -  1224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  ACX90866  decreased coverage  0.00186747  n/a    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea 
 
 
-
 
Ssol_0591  CDS  CP001800  539339  539695  -  357  conserved hypothetical protein  ACX90867  decreased coverage  0.000222776  n/a    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea 
 
 
-
 
Ssol_0724    CP001800  666909  669000  +  2092      decreased coverage  0.00877806  n/a    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea 
 
 
-
 
Ssol_0736  CDS  CP001800  682041  682994  +  954  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  ACX90995  decreased coverage  0.000627011  n/a    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea 
 
 
-
 
Ssol_0737  CDS  CP001800  683327  684085  +  759  Protein of unknown function DUF1626  ACX90996  decreased coverage  0.000438836  n/a    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea 
 
 
-
 
Ssol_0738    CP001800  684247  685220  -  974      decreased coverage  0.000736258  n/a    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea 
 
 
-
 
Ssol_0764  CDS  CP001800  707148  707741  +  594  sulfocyanin  ACX91018  decreased coverage  0.00176358  n/a    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea 
 
 
-
 
Ssol_0941  CDS  CP001800  883949  885031  -  1083  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  ACX91186  decreased coverage  0.000857514  n/a    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea 
 
 
-
 
Ssol_0984  CDS  CP001800  925282  926463  +  1182  glycosyl transferase family 2  ACX91228  decreased coverage  0.00499556  n/a    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea 
 
 
-
 
Ssol_1054  CDS  CP001800  984990  985535  -  546  ribosomal protein S4  ACX91297  decreased coverage  0.00520973  n/a    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea 
 
 
-
 
Ssol_1068  CDS  CP001800  999919  1000311  -  393  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  ACX91311  decreased coverage  0.0039063  n/a    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea 
 
 
-
 
Ssol_1094  CDS  CP001800  1023286  1024797  -  1512  conserved hypothetical protein  ACX91337  decreased coverage  0.00376614  n/a    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea 
 
 
-
 
Ssol_1181  CDS  CP001800  1100968  1101231  -  264  Like-Sm ribonucleoprotein core  ACX91419  decreased coverage  0.00764274  n/a    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea 
 
 
-
 
Ssol_1182  CDS  CP001800  1101338  1101637  +  300  transcriptional regulator, ArsR family  ACX91420  decreased coverage  0.00795875  n/a    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea 
 
 
-
 
Ssol_1340  CDS  CP001800  1237455  1238354  +  900  regulatory protein MarR  ACX91576  decreased coverage  0.00576351  n/a    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea 
 
 
-
 
Ssol_1448  CDS  CP001800  1332179  1333123  -  945  Phosphomethylpyrimidine kinase  ACX91680  decreased coverage  0.00994121  n/a    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea 
 
 
-
 
Ssol_1788  CDS  CP001800  1596164  1596439  -  276  conserved hypothetical protein  ACX92004  decreased coverage  0.00801447  n/a    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea 
 
 
-
 
Ssol_1965  CDS  CP001800  1749187  1750887  -  1701  Starch synthase  ACX92176  decreased coverage  0.00319381  n/a    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea 
 
 
-
 
Ssol_2225  CDS  CP001800  2003902  2005287  -  1386  conserved hypothetical protein  ACX92414  decreased coverage  0.00595472  n/a    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea 
 
 
-
 
Ssol_2329  CDS  CP001800  2129828  2130511  -  684  conserved hypothetical protein  ACX92502  decreased coverage  0.000461934  n/a    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea 
 
 
-
 
Ssol_2419    CP001800  2221860  2222108  +  249      decreased coverage  0.000770339  n/a    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea 
 
 
-
 
Ssol_2486  CDS  CP001800  2287593  2288660  +  1068  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  ACX92622  decreased coverage  0.0095339  n/a    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea 
 
 
-
 
Ssol_2716  CDS  CP001800  2490158  2490799  +  642  DNA binding domain protein, excisionase family  ACX92808  decreased coverage  0.00788025  n/a    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea 
 
 
-
 
Ssol_2732    CP001800  2502325  2502585  -  261      decreased coverage  0.00753922  n/a    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea 
 
 
-
 
Ssol_2737  CDS  CP001800  2505319  2506578  -  1260  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  ACX92824  decreased coverage  0.00462913  n/a    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea 
 
 
-
 
Ssol_2857  CDS  CP001800  2616405  2617496  +  1092  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  ACX92934  decreased coverage  0.000247505  n/a    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea 
 
 
-
 
Ssol_2858  CDS  CP001800  2617493  2618740  +  1248  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  ACX92935  decreased coverage  0.00166125  n/a    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>