58 decreased-coverage genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Daud_0031  CDS  NC_010424  39142  40485  +  1344  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  YP_001716232  decreased coverage  0.00000324435  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0051  CDS  NC_010424  56360  57262  +  903  Allergen V5/Tpx-1 family protein  YP_001716252  decreased coverage  0.0000168583  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0185  CDS  NC_010424  212313  213428  +  1116  PilT domain-containing protein  YP_001716381  decreased coverage  0.000000117639  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0208  CDS  NC_010424  238127  238363  +  237  ribosomal protein L33  YP_001716401  decreased coverage  0.00000103911  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0219  CDS  NC_010424  252776  253060  +  285  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  YP_001716412  decreased coverage  0.00000001803  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0251  CDS  NC_010424  269828  270214  +  387  ribosomal protein S11  YP_001716444  decreased coverage  0.0000000118892  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0252  CDS  NC_010424  270226  270852  +  627  RNA-binding S4 domain-containing protein  YP_001716445  decreased coverage  0.000000365501  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0272  CDS  NC_010424  291930  293540  +  1611  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  YP_001716465  decreased coverage  0.00870047  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0281  CDS  NC_010424  302306  303802  -  1497  threonine synthase  YP_001716474  decreased coverage  0.0000457965  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0328  CDS  NC_010424  351849  352502  +  654  metal dependent phosphohydrolase  YP_001716518  decreased coverage  0.0000000109078  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0481  CDS  NC_010424  520047  521399  +  1353  magnesium transporter  YP_001716659  decreased coverage  0.000026878  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0494  CDS  NC_010424  534218  534565  -  348  hypothetical protein  YP_001716672  decreased coverage  0.0000000256479  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0605  CDS  NC_010424  643352  644131  +  780  transcriptional repressor CodY  YP_001716771  decreased coverage  0.0000000244841  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0623  CDS  NC_010424  662307  663425  +  1119  riboflavin biosynthesis protein RibD  YP_001716789  decreased coverage  0.000000156623  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0624  CDS  NC_010424  663406  664053  +  648  riboflavin synthase subunit alpha  YP_001716790  decreased coverage  0.00110444  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0810  CDS  NC_010424  854266  854604  +  339  hypothetical protein  YP_001716958  decreased coverage  0.000112059  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0811    NC_010424  854641  855060  +  420      decreased coverage  0.000166134  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0897  CDS  NC_010424  956695  958173  +  1479  stage IV sporulation protein A  YP_001717042  decreased coverage  0.00196828  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0899  CDS  NC_010424  958800  959090  +  291  hypothetical protein  YP_001717044  decreased coverage  0.000183873  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0912  CDS  NC_010424  973336  975978  +  2643  alanyl-tRNA synthetase  YP_001717057  decreased coverage  0.00106674  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0932  CDS  NC_010424  992233  992454  +  222  hypothetical protein  YP_001717077  decreased coverage  0.000776235  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0963  CDS  NC_010424  1021403  1021801  -  399  hypothetical protein  YP_001717107  decreased coverage  0.000000566967  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_0964  CDS  NC_010424  1021876  1022139  -  264  hypothetical protein  YP_001717108  decreased coverage  0.0000016688  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1110  CDS  NC_010424  1168518  1169786  +  1269  GTP-binding protein, HSR1-related  YP_001717253  decreased coverage  0.000000612987  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1164  CDS  NC_010424  1218407  1219048  +  642  hypothetical protein  YP_001717307  decreased coverage  0.0000515055  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1165  CDS  NC_010424  1219030  1219716  -  687  rhomboid family protein  YP_001717308  decreased coverage  0.00020927  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1186  CDS  NC_010424  1241493  1242677  -  1185  tryptophan synthase subunit beta  YP_001717329  decreased coverage  0.00284462  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1216  CDS  NC_010424  1275724  1277160  -  1437  copper amine oxidase domain-containing protein  YP_001717359  decreased coverage  0.00000673824  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1220  CDS  NC_010424  1283574  1283930  -  357  SpoVA protein  YP_001717363  decreased coverage  0.00000192439  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1307  CDS  NC_010424  1385244  1385507  -  264  hypothetical protein  YP_001717450  decreased coverage  0.0000742811  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1359  CDS  NC_010424  1432917  1434035  -  1119  queuine tRNA-ribosyltransferase  YP_001717500  decreased coverage  0.000569759  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1367  CDS  NC_010424  1444916  1445587  -  672  hypothetical protein  YP_001717508  decreased coverage  0.0000299984  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1428  CDS  NC_010424  1510350  1511402  -  1053  cell division protein FtsZ  YP_001717567  decreased coverage  0.0000540584  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1451  CDS  NC_010424  1534693  1534956  -  264  50S ribosomal protein L27  YP_001717589  decreased coverage  0.00000000109711  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1551  CDS  NC_010424  1638254  1638478  -  225  FeoA family protein  YP_001717685  decreased coverage  0.000000938461  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1552  CDS  NC_010424  1638559  1639737  -  1179  YibE/F family protein  YP_001717686  decreased coverage  0.0000166872  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1599  CDS  NC_010424  1687549  1688427  -  879  hypothetical protein  YP_001717733  decreased coverage  0.000000017463  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1679  CDS  NC_010424  1775071  1775502  +  432  hypothetical protein  YP_001717811  decreased coverage  0.00000033772  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1727  CDS  NC_010424  1819043  1819648  -  606  phospholipid/glycerol acyltransferase  YP_001717857  decreased coverage  0.00676958  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1733  CDS  NC_010424  1828874  1830547  +  1674  hypothetical protein  YP_001717862  decreased coverage  0.00187554  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1835  CDS  NC_010424  1935794  1936735  +  942  hypothetical protein  YP_001717960  decreased coverage  0.0000212032  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1836  CDS  NC_010424  1936758  1937111  +  354  flagellar protein FhlB-like cytoplasmic domain-containing protein  YP_001717961  decreased coverage  0.000000219189  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1837  CDS  NC_010424  1937090  1937551  +  462  ribonuclease H  YP_001717962  decreased coverage  0.0000000470607  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1876  CDS  NC_010424  1974766  1975635  +  870  Na+/Pi-cotransporter  YP_001718001  decreased coverage  0.00688097  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1906  CDS  NC_010424  2009443  2009778  -  336  hypothetical protein  YP_001718031  decreased coverage  0.00000000662924  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1950  CDS  NC_010424  2054371  2054697  -  327  diverged CheY-domain  YP_001718073  decreased coverage  0.0000000182046  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1975  CDS  NC_010424  2078252  2079436  -  1185  hypothetical protein  YP_001718098  decreased coverage  0.00000141125  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1976  CDS  NC_010424  2079502  2079696  -  195  hypothetical protein  YP_001718099  decreased coverage  0.0000000175321  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_1980  CDS  NC_010424  2083691  2084149  -  459  pyruvoyl-dependent arginine decarboxylase  YP_001718103  decreased coverage  0.0000000794867  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_2087  CDS  NC_010424  2200287  2200538  -  252  PRC-barrel domain-containing protein  YP_001718208  decreased coverage  0.000370117  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_2121  CDS  NC_010424  2238804  2240918  -  2115  copper amine oxidase domain-containing protein  YP_001718240  decreased coverage  0.000127816  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_2154  CDS  NC_010424  2269238  2270305  -  1068  peptide chain release factor 1  YP_001718273  decreased coverage  0.000000509235  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_2183  CDS  NC_010424  2296538  2297026  -  489  AsnC family transcriptional regulator  YP_001718302  decreased coverage  0.00948662  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_R0012  tRNA  NC_010424  220296  220371  +  76  tRNA-Met    decreased coverage  0.00000000664581  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_R0013  tRNA  NC_010424  220386  220461  +  76  tRNA-Thr    decreased coverage  0.00000000622484  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_R0014  tRNA  NC_010424  220469  220545  +  77  tRNA-Met    decreased coverage  0.00000000605229  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_R0027  tRNA  NC_010424  1169824  1169901  +  78  tRNA-Pro    decreased coverage  0.0000000011857  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Daud_R0048  tRNA  NC_010424  1967347  1967421  -  75  tRNA-Ala    decreased coverage  0.0000000143033  n/a    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>