30 decreased-coverage genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
OSTLU_17975  CDS  NC_009368  44201  46233  -  2033  predicted protein  XP_001421374  normal  0.796717  decreased coverage  0.000290426  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_18007  CDS  NC_009368  125527  127209  +  1683  predicted protein  XP_001421212  decreased coverage  0.00198856  normal  0.151799  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_18085  CDS  NC_009368  324011  325306  +  1296  predicted protein  XP_001421263  normal  0.0963143  decreased coverage  0.000212922  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_18135  CDS  NC_009368  463262  463759  -  498  predicted protein  XP_001421474  decreased coverage  0.000129475  normal  1  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_18182  CDS  NC_009368  582870  585119  -  2250  predicted protein  XP_001421509  normal  0.28956  decreased coverage  0.00382688  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_18191  CDS  NC_009368  606731  607912  +  1182  predicted protein  XP_001421337  decreased coverage  0.000000000000101363  normal  0.119889  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_2257  CDS  NC_009368  154771  156225  -  1455  predicted protein  XP_001421402  normal  1  decreased coverage  0.00414592  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_25463  CDS  NC_009368  42063  44097  +  2035  predicted protein  XP_001421192  normal  0.261555  decreased coverage  0.000278196  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_25476  CDS  NC_009368  149511  151665  -  2155  predicted protein  XP_001421400  normal  0.102353  decreased coverage  0.00487339  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_27316  CDS  NC_009368  46642  47013  -  372  predicted protein  XP_001421375  normal  0.489763  decreased coverage  0.000180673  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_27317  CDS  NC_009368  48475  49522  +  1048  predicted protein  XP_001421193  normal  0.0699942  decreased coverage  0.000232091  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_27318  CDS  NC_009368  49553  56137  -  6585  predicted protein  XP_001421376  unclonable  0.000601275  decreased coverage  0.00115713  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_27344  CDS  NC_009368  104745  105278  +  534  predicted protein  XP_001421208  decreased coverage  0.00843923  normal  0.0707375  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_27367  CDS  NC_009368  147944  149463  +  1520  O-acetylserine sulfhydrylase/homocysteine synthase  XP_001421219  normal  0.365897  decreased coverage  0.00396876  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_27457  CDS  NC_009368  322538  323553  +  1016  ZIP family transporter: zinc ion  XP_001421262  normal  1  decreased coverage  0.000202119  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_27548  CDS  NC_009368  492501  494570  -  2070  predicted protein  XP_001421479  decreased coverage  0.0000091689  normal  0.509661  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_27575  CDS  NC_009368  533458  533761  -  304  predicted protein  XP_001421493  decreased coverage  0.00551101  normal  0.214901  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_27607  CDS  NC_009368  577054  579698  -  2645  predicted protein  XP_001421508  decreased coverage  0.00000643073  normal  0.153648  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_27610  CDS  NC_009368  585755  587206  +  1452  predicted protein  XP_001421329  normal  1  decreased coverage  0.0032201  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_27614  CDS  NC_009368  590100  591389  -  1290  predicted protein  XP_001421511  normal  0.0699718  decreased coverage  0.0032931  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_27615  CDS  NC_009368  591527  592679  -  1153  predicted protein  XP_001421512  normal  0.572712  decreased coverage  0.00312462  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_27622  CDS  NC_009368  605350  606519  +  1170  predicted protein  XP_001421336  decreased coverage  0.000000000000102365  normal  0.120545  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_3353  misc_feature  NC_009368  325607  326840  -  1234      normal  1  decreased coverage  0.00019695  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_3730  CDS  NC_009368  509277  510500  +  1224  predicted protein  XP_001421302  normal  0.0269126  decreased coverage  0.00961002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_43228  CDS  NC_009368  321849  322496  -  648  predicted protein  XP_001421442  normal  1  decreased coverage  0.000182258  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_47582  CDS  NC_009368  588748  590032  +  1285  predicted protein  XP_001421331  normal  0.206644  decreased coverage  0.00317201  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_89084  CDS  NC_009368  152030  152800  -  771  predicted protein  XP_001421401  normal  0.0362829  decreased coverage  0.00339448  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_89085  CDS  NC_009368  153824  154711  +  888  predicted protein  XP_001421220  normal  0.0507895  decreased coverage  0.00342054  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_93660  CDS  NC_009368  81263  82051  -  789  predicted protein  XP_001421382  decreased coverage  0.00000000959583  normal  0.036188  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
OSTLU_93733  CDS  NC_009368  585221  585598  +  378  predicted protein  XP_001421328  normal  0.99504  decreased coverage  0.00233071  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>