66 decreased-coverage genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CFF8240_0031  CDS  NC_008599  31739  32368  +  630  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  YP_891241  decreased coverage  0.0000116097  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_0183  CDS  NC_008599  165822  166583  +  762  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  YP_891388  decreased coverage  0.00000000942393  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_0184  CDS  NC_008599  166702  167994  +  1293  multidrug-efflux transporter  YP_891389  decreased coverage  0.000000154899  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_0346  CDS  NC_008599  315785  317443  +  1659  sodium-dependent transporter  YP_891548  decreased coverage  0.0000913851  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_0414  CDS  NC_008599  388097  388837  -  741  fumarate reductase iron-sulfur subunit  YP_891616  decreased coverage  0.00379964  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_0459  CDS  NC_008599  440056  441807  -  1752  hypothetical protein  YP_891658  decreased coverage  0.00151029  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_0523  CDS  NC_008599  528939  529727  +  789  flagellar basal body rod protein FlgG  YP_891713  decreased coverage  0.00648555  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_0526  CDS  NC_008599  532629  533993  +  1365  integral membrane protein  YP_891716  decreased coverage  0.0035517  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_0607  CDS  NC_008599  612568  615453  +  2886  hypothetical protein  YP_891783  decreased coverage  0.00641948  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_0609  CDS  NC_008599  616590  617297  -  708  hypothetical protein  YP_891785  decreased coverage  0.00000000000964449  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_0610  CDS  NC_008599  617323  620073  +  2751  isoleucyl-tRNA synthetase  YP_891786  decreased coverage  0.00000217018  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_0612  CDS  NC_008599  621539  622990  +  1452  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  YP_891788  decreased coverage  0.00142081  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_0615  CDS  NC_008599  624277  625083  +  807  carbon-nitrogen family hydrolase  YP_891791  decreased coverage  0.00206547  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_0622  CDS  NC_008599  630118  631182  -  1065  acyl-CoA dehydrogenase  YP_891798  decreased coverage  0.00205931  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_0623  CDS  NC_008599  631200  631730  -  531  hypothetical protein  YP_891799  decreased coverage  0.0005983  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_0698  CDS  NC_008599  704046  704630  +  585  NUDIX domain-containing protein  YP_891873  decreased coverage  0.0079062  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_0734  CDS  NC_008599  741052  742221  +  1170  folylpolyglutamate synthase  YP_891909  decreased coverage  0.00291399  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_0737  CDS  NC_008599  743444  746401  +  2958  transcription-repair coupling factor  YP_891912  decreased coverage  0.00351961  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_0741  CDS  NC_008599  748482  748883  +  402  protein YgiW  YP_891916  decreased coverage  0.000152573  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_0742  CDS  NC_008599  748953  749432  +  480  CoA-binding domain-containing protein  YP_891917  decreased coverage  0.000457668  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_0743  CDS  NC_008599  749416  750627  +  1212  threonine dehydratase  YP_891918  decreased coverage  0.00847234  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_0756  CDS  NC_008599  766135  767040  -  906  putative integral membrane protein  YP_891931  decreased coverage  0.0000863608  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_0761  CDS  NC_008599  773169  774428  +  1260  ComEC/Rec2 family protein  YP_891936  decreased coverage  0.0064683  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_0765  CDS  NC_008599  778050  778922  +  873  co-chaperone protein DnaJ  YP_891940  decreased coverage  0.000000175229  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_0769  CDS  NC_008599  782439  783011  +  573  hypothetical protein  YP_891944  decreased coverage  0.00415936  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_0770  CDS  NC_008599  783084  783857  +  774  inner membrane protein YfcA  YP_891945  decreased coverage  0.00655401  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_0771  CDS  NC_008599  783911  784591  +  681  F0F1 ATP synthase subunit A  YP_891946  decreased coverage  0.00573947  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_0791  CDS  NC_008599  801778  803652  +  1875  putative ATP-dependent RNA helicase RhlE  YP_891966  decreased coverage  0.00000437602  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_0794  CDS  NC_008599  805261  806121  +  861  fructose-1,6-bisphosphatase  YP_891969  decreased coverage  0.0000000000251337  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_0795  CDS  NC_008599  806342  806443  +  102  hypothetical protein  YP_891970  decreased coverage  0.0000000000415432  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_0803  CDS  NC_008599  815703  816497  -  795  CheR methyltransferase SAM-binding domain-containing protein  YP_891979  decreased coverage  0.00000813552  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_0842  CDS  NC_008599  848522  849745  +  1224  argininosuccinate synthase  YP_892017  decreased coverage  0.00643097  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_0940  CDS  NC_008599  943744  944895  -  1152  quinone-reactive Ni/Fe-hydrogenase small chain  YP_892110  decreased coverage  0.0025548  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_0943  CDS  NC_008599  946203  948776  -  2574  chaperone ClpB  YP_892113  decreased coverage  0.000000133749  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_1029  CDS  NC_008599  1030305  1032842  +  2538  alanyl-tRNA synthetase  YP_892193  decreased coverage  0.00361534  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_1030  CDS  NC_008599  1032839  1033333  +  495  hypothetical protein  YP_892194  decreased coverage  0.000147782  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_1031  CDS  NC_008599  1033330  1033878  +  549  Maf-like protein  YP_892195  decreased coverage  0.000336605  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_1032  CDS  NC_008599  1033875  1035812  +  1938  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  YP_892196  decreased coverage  0.00344643  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_1039  CDS  NC_008599  1038384  1039730  -  1347  signal recognition particle protein  YP_892203  decreased coverage  0.00689452  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_1082  CDS  NC_008599  1079862  1081604  +  1743  threonine synthase  YP_892243  decreased coverage  0.000183977  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_1085  CDS  NC_008599  1082891  1083850  +  960  GGDEF domain-containing protein  YP_892246  decreased coverage  0.000216184  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_1088  CDS  NC_008599  1086768  1087598  +  831  PvdS  YP_892249  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_1090  CDS  NC_008599  1089670  1090191  -  522  co-chaperone GrpE  YP_892251  decreased coverage  0.0000000000331967  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_1091  CDS  NC_008599  1090188  1090976  -  789  heat-inducible transcription repressor  YP_892252  decreased coverage  0.000000000108949  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_1112  CDS  NC_008599  1105792  1107729  -  1938  NAD-dependent DNA ligase LigA  YP_892270  decreased coverage  0.00321747  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_1117  CDS  NC_008599  1111251  1111721  -  471  dinucleoside polyphosphate hydrolase  YP_892275  decreased coverage  0.0000000062607  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_1118  CDS  NC_008599  1111836  1112876  +  1041  coproporphyrinogen III oxidase  YP_892276  decreased coverage  0.0000000123325  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_1149  CDS  NC_008599  1138723  1139049  +  327  hypothetical protein  YP_892307  decreased coverage  0.00367294  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_1161  CDS  NC_008599  1147281  1150058  -  2778  nitrate reductase catalytic subunit  YP_892319  decreased coverage  0.00142269  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_1164  CDS  NC_008599  1151812  1152606  -  795  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  YP_892322  decreased coverage  0.00378552  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_1170  CDS  NC_008599  1157294  1157626  -  333  hypothetical protein  YP_892328  decreased coverage  0.00706615  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_1271  CDS  NC_008599  1263186  1263713  +  528  putative ATP/GTP-binding protein  YP_892427  decreased coverage  0.00459565  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_1287  CDS  NC_008599  1276774  1277019  +  246  AraC family transcriptional regulator  YP_892442  decreased coverage  0.00907942  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_1319  CDS  NC_008599  1311805  1312509  -  705  50S ribosomal protein L1  YP_892471  decreased coverage  0.0000000101939  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_1321  CDS  NC_008599  1313012  1313542  -  531  transcription antitermination protein NusG  YP_892473  decreased coverage  0.000000116235  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_1493  CDS  NC_008599  1472133  1474649  -  2517  translation initiation factor IF-2  YP_892627  decreased coverage  0.00496659  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_1520  CDS  NC_008599  1497325  1498590  -  1266  translocation protein TolB  YP_892654  decreased coverage  0.0000000368707  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_1521  CDS  NC_008599  1498587  1499399  -  813  periplasmic protein, putative  YP_892655  decreased coverage  0.0000000345203  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_1526  CDS  NC_008599  1502202  1503089  -  888  F0F1 ATP synthase subunit gamma  YP_892660  decreased coverage  0.000000258594  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_1560  CDS  NC_008599  1532184  1533431  -  1248  NADP-dependent malic enzyme  YP_892693  decreased coverage  0.00518562  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_1568  CDS  NC_008599  1540404  1541666  -  1263  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  YP_892701  decreased coverage  0.00000718376  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_1569  CDS  NC_008599  1541667  1542413  -  747  pyrroline-5-carboxylate reductase  YP_892702  decreased coverage  0.00000273602  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_1702  CDS  NC_008599  1665675  1667528  -  1854  threonyl-tRNA synthetase  YP_892822  decreased coverage  0.000310236  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_1794  CDS  NC_008599  1747186  1747767  +  582  MdaB  YP_892902  decreased coverage  0.000000827251  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_1801  CDS  NC_008599  1750881  1752530  -  1650  GMC oxidoreductase family protein  YP_892909  decreased coverage  0.0000289048  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
CFF8240_1803  CDS  NC_008599  1753069  1753503  -  435  integral membrane protein  YP_892911  decreased coverage  0.00000242993  n/a    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>