24 decreased-coverage genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Bamb_5591  CDS  NC_008392  20229  23642  +  3414  trehalose synthase  YP_777472  decreased coverage  0.00664495  normal  1  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_5634  CDS  NC_008392  67629  68240  -  612  hypothetical protein  YP_777515  decreased coverage  0.00782523  normal  0.0387967  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_5647  CDS  NC_008392  81261  82211  -  951  glycosyl transferase, group 1  YP_777528  decreased coverage  0.00735071  normal  0.258712  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_5902  CDS  NC_008392  384361  384921  +  561  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  YP_777781  decreased coverage  0.000787864  hitchhiker  0.00615481  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_5908  CDS  NC_008392  389997  391070  -  1074  porin  YP_777787  normal  0.359102  decreased coverage  0.00179215  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_5909  CDS  NC_008392  391183  392814  +  1632  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  YP_777788  normal  0.0340398  decreased coverage  0.00203075  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_5910  CDS  NC_008392  393560  394273  +  714  LuxR family transcriptional regulator  YP_777789  normal  0.0531603  decreased coverage  0.00148471  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_5911  CDS  NC_008392  394310  394657  +  348  LuxR family transcriptional regulator  YP_777790  normal  0.116094  decreased coverage  0.00152039  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_5912  CDS  NC_008392  394800  395627  +  828  xylose isomerase domain-containing protein  YP_777791  normal  0.2156  decreased coverage  0.00155667  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_5913  CDS  NC_008392  395624  396538  +  915  shikimate 5-dehydrogenase  YP_777792  normal  0.705052  decreased coverage  0.00175054  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_5914  CDS  NC_008392  396586  397599  -  1014  alcohol dehydrogenase  YP_777793  normal  0.96705  decreased coverage  0.00164429  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_5915  CDS  NC_008392  397596  399134  -  1539  condensation domain-containing protein  YP_777794  normal  0.416497  decreased coverage  0.00198316  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_5916  CDS  NC_008392  399149  400390  -  1242  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  YP_777795  normal  0.628752  decreased coverage  0.00179215  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_5917  CDS  NC_008392  400483  401430  -  948  phosphopantetheine-binding  YP_777796  normal  1  decreased coverage  0.00147293  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_5918  CDS  NC_008392  401424  402482  -  1059  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  YP_777797  normal  1  decreased coverage  0.00164429  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_5919  CDS  NC_008392  402538  409929  -  7392  beta-ketoacyl synthase  YP_777798  normal  1  decreased coverage  0.00253672  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_5928  CDS  NC_008392  455620  457167  -  1548  FAD dependent oxidoreductase  YP_777807  decreased coverage  0.00202441  hitchhiker  0.00883605  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6049  CDS  NC_008392  609716  610642  -  927  chlorinating enzyme  YP_777927  decreased coverage  0.00398666  normal  1  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6050  CDS  NC_008392  610721  610969  -  249  acyl carrier protein  YP_777928  decreased coverage  0.00630342  normal  1  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6128  CDS  NC_008392  689072  689326  -  255  hypothetical protein  YP_778006  normal  1  decreased coverage  0.00902758  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6132  CDS  NC_008392  692436  693449  -  1014  ABC transporter related  YP_778010  normal  0.756648  decreased coverage  0.00989011  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6133  CDS  NC_008392  693463  694536  -  1074  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  YP_778011  normal  0.165198  decreased coverage  0.00922022  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6290  CDS  NC_008392  884484  885884  +  1401  AAA ATPase  YP_778168  decreased coverage  0.00474888  normal  1  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Bamb_6506  CDS  NC_008392  1191024  1192661  +  1638  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_778384  decreased coverage  0.00389964  normal  0.364964  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>