36 decreased-coverage genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
ANIA_05148  CDS  BN001305  1087160  1088360  -  1201  Fe superoxide dismutase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07210)  CBF80959  decreased coverage  0.000120882  normal  1  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_05164  CDS  BN001305  1143333  1144977  -  1645  30S ribosomal subunit S4, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06980)  CBF80996  decreased coverage  0.00412047  normal  0.822552  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_05186  CDS  BN001305  1222185  1224755  +  2571  ubiquitin C-terminal hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07160)  CBF81041  decreased coverage  0.000787837  normal  1  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_05237  CDS  BN001305  1379649  1382191  -  2543  conserved hypothetical protein  CBF81142  decreased coverage  0.00419082  hitchhiker  0.0029586  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_05241  CDS  BN001305  1388858  1390104  +  1247  conserved hypothetical protein  CBF81151  decreased coverage  0.000534718  hitchhiker  0.00000493019  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_05250  CDS  BN001305  3122483  3124873  +  2391  conserved hypothetical protein  CBF82244  decreased coverage  0.0000970536  normal  1  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_05311  CDS  BN001305  2929019  2930361  +  1343  tyrosinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01070)  CBF82122  decreased coverage  0.00354279  normal  1  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_05345  CDS  BN001305  2826790  2829078  -  2289  conserved hypothetical protein  CBF82064  decreased coverage  0.00681608  normal  0.0540826  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_05351  CDS  BN001305  2814612  2815794  +  1183  ubiquitin conjugating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14130)  CBF82055  decreased coverage  0.000233397  hitchhiker  0.00417771  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_05374  CDS  BN001305  2752212  2753399  -  1188  conserved hypothetical protein  CBF82014  decreased coverage  0.000483904  normal  1  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_05427  CDS  BN001305  2591438  2593620  +  2183  chromate ion transporter (Eurofung)  CBF81927  decreased coverage  0.00300888  normal  0.119006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_05430  CDS  BN001305  2581801  2583174  +  1374  hypothetical protein  CBF81923  decreased coverage  0.0000287707  normal  0.0105054  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_05432  CDS  BN001305  2576213  2577242  +  1030  conserved hypothetical protein  CBF81919  decreased coverage  0.000576174  normal  0.0296891  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_05453  CDS  BN001305  2506690  2508236  -  1547  arrestin (or S-antigen), N-terminal domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G13380)  CBF81883  decreased coverage  0.000665406  normal  1  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_05455  CDS  BN001305  2498404  2503997  +  5594  U3 small nucleolar RNA-associated protein 10 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B1X5]  CBF81880  decreased coverage  0.008098  normal  1  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_05466  CDS  BN001305  2458099  2461098  -  3000  conserved hypothetical protein  CBF81859  decreased coverage  0.000886581  normal  1  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_05474  CDS  BN001305  2433755  2434554  -  800  conserved hypothetical protein  CBF81843  decreased coverage  0.00000000323968  normal  0.146106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_05493  CDS  BN001305  2359141  2361126  -  1986  nucleoside transporter (Eurofung)  CBF81804  decreased coverage  0.00128768  normal  1  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_05504  CDS  BN001305  2329886  2331736  +  1851  HET domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G01020)  CBF81783  decreased coverage  0.00377896  normal  0.664486  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_05535  CDS  BN001305  2225544  2227823  +  2280  cell cycle control protein (Cwf19), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11830)  CBF81719  decreased coverage  0.00000104315  normal  1  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_05543  CDS  BN001305  2203857  2204320  -  464  conserved hypothetical protein  CBF81704  decreased coverage  0.00417215  normal  1  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_05605  CDS  BN001305  1993517  1994375  -  859  conserved hypothetical protein    decreased coverage  0.000358689  normal  0.158596  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_05619  CDS  BN001305  1936175  1938933  +  2759  ADAM family of metalloprotease ADM-B (AFU_orthologue; AFUA_4G11150)  CBF81538  decreased coverage  0.00103668  normal  0.0270477  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_05624  CDS  BN001305  1920121  1924209  +  4089  C2 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G11110)  CBF81529  normal  1  decreased coverage  0.00865536  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_05750  CDS  BN001305  1551873  1553462  -  1590  conserved hypothetical protein  CBF81281  normal  0.370428  decreased coverage  0.00524089  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_05752  CDS  BN001305  1546873  1547738  +  866  Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 18 (Mediator complex subunit 18) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B128]  CBF81278  decreased coverage  0.00400845  hitchhiker  0.00637079  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_08382  CDS  BN001305  302521  303493  -  973  hypothetical protein  CBF80426  decreased coverage  0.0000480691  normal  1  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_08393  CDS  BN001305  342426  342860  +  435  conserved hypothetical protein  CBF80448  decreased coverage  0.00148588  normal  1  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_08438  CDS  BN001305  480219  481977  +  1759  cytochrome P450, putative (Eurofung)  CBF80552  decreased coverage  0.000836245  normal  1  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_08507  CDS  BN001305  718653  720255  +  1603  conserved hypothetical protein  CBF80699  decreased coverage  0.000000272571  normal  0.0467557  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_08509  CDS  BN001305  723623  725185  +  1563  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  CBF80703  normal  1  decreased coverage  0.00195451  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_09477  CDS  BN001305  703011  703639  -  629  conserved hypothetical protein  CBF80688  decreased coverage  0.000477869  normal  0.033609  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_10657  CDS  BN001305  2995517  2997225  +  1709  conserved hypothetical protein  CBF82169  decreased coverage  0.00945329  normal  1  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_10662  CDS  BN001305  2810631  2812229  +  1599  conserved hypothetical protein  CBF82052  normal  1  decreased coverage  0.000601095  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_10664  CDS  BN001305  2812876  2814319  +  1444  conserved hypothetical protein  CBF82053  hitchhiker  0.000198861  decreased coverage  0.000704409  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
ANIA_11483  CDS  BN001305  2068104  2068554  -  451  hypothetical protein  CBF81617  decreased coverage  0.00092524  normal  1  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>