45 decreased-coverage genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Synpcc7942_0053  CDS  NC_007604  55204  56352  -  1149  hypothetical protein  YP_399072  decreased coverage  0.0000565511  normal  1  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0112  CDS  NC_007604  111686  113140  +  1455  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  YP_399131  decreased coverage  0.00531501  normal  1  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0567  CDS  NC_007604  548019  549368  -  1350  hypothetical protein  YP_399586  normal  0.806895  decreased coverage  0.0060454  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0568  CDS  NC_007604  549371  550687  -  1317  cytosine deaminase-like protein  YP_399587  normal  0.322505  decreased coverage  0.00702757  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0569  CDS  NC_007604  550718  551653  -  936  DNA-directed RNA polymerase sigma subunit (sigma70/sigma32)-like  YP_399588  normal  1  decreased coverage  0.00544782  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0697  CDS  NC_007604  689222  690748  -  1527  photosystem II core light harvesting protein  YP_399716  decreased coverage  0.00000016119  normal  0.0946335  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0715  CDS  NC_007604  709992  711179  +  1188  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  YP_399734  decreased coverage  0.0000000000290657  normal  1  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0854  CDS  NC_007604  850233  852629  +  2397  hypothetical protein  YP_399871  normal  0.50872  decreased coverage  0.00887321  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0889  CDS  NC_007604  894636  896453  -  1818  hypothetical protein  YP_399906  normal  0.914068  decreased coverage  0.000140666  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0890  CDS  NC_007604  896748  901358  +  4611  glutamate synthase (ferredoxin)  YP_399907  hitchhiker  0.00390315  decreased coverage  0.000127994  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0891  CDS  NC_007604  901736  902035  +  300  hypothetical protein  YP_399908  hitchhiker  0.0000000173413  decreased coverage  0.0000877955  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0892  CDS  NC_007604  902109  903119  -  1011  FO synthase subunit 1  YP_399909  decreased coverage  0.0000000000147702  decreased coverage  0.000138874  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0893  CDS  NC_007604  903201  904283  +  1083  photosystem q(b) protein  YP_399910  hitchhiker  0.000000000240892  decreased coverage  0.000169599  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_0987  CDS  NC_007604  996280  996723  -  444  ferric uptake regulator family protein  YP_400004  normal  1  decreased coverage  0.00388915  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_1061  CDS  NC_007604  1072278  1073213  +  936  hypothetical protein  YP_400078  decreased coverage  0.000000000109934  normal  0.0587349  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
 
Synpcc7942_1089  CDS  NC_007604  1104710  1107361  +  2652  ATPase  YP_400106  normal  1  decreased coverage  0.00000277828  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_1090  CDS  NC_007604  1107477  1108274  -  798  hypothetical protein  YP_400107  normal  0.879899  decreased coverage  0.000000796571  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_1091  CDS  NC_007604  1108372  1109535  +  1164  hypothetical protein  YP_400108  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_1351  CDS  NC_007604  1382386  1383096  -  711  HAD family hydrolase  YP_400368  decreased coverage  0.00941248  normal  1  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_1398  CDS  NC_007604  1447847  1450069  -  2223  cellulose synthase (UDP-forming)  YP_400415  decreased coverage  0.00289904  normal  1  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_1421  CDS  NC_007604  1475239  1475547  +  309  putative carboxysome assembly protein  YP_400438  decreased coverage  0.00194265  normal  1  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_1451  CDS  NC_007604  1504300  1504761  +  462  hypothetical protein  YP_400468  normal  1  decreased coverage  0.00694087  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_1452  CDS  NC_007604  1504758  1506194  -  1437  DNA repair protein RadA  YP_400469  normal  1  decreased coverage  0.00987951  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_1459  CDS  NC_007604  1511592  1512212  -  621  hypothetical protein  YP_400476  normal  0.0233371  decreased coverage  0.00798208  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_1460  CDS  NC_007604  1512321  1512578  -  258  hypothetical protein  YP_400477  normal  0.0271116  decreased coverage  0.00664473  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_1464  CDS  NC_007604  1517237  1518832  +  1596  porin  YP_400481  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_1527  CDS  NC_007604  1586243  1588759  +  2517  nitrogen assimilation regulatory protein  YP_400544  normal  1  decreased coverage  0.000360333  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_1635  CDS  NC_007604  1702823  1704469  -  1647  porin; major outer membrane protein  YP_400652  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_1791  CDS  NC_007604  1861831  1863066  -  1236  hypothetical protein  YP_400808  normal  1  decreased coverage  0.00386684  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_1792  CDS  NC_007604  1863290  1864270  +  981  delta-aminolevulinic acid dehydratase  YP_400809  normal  1  decreased coverage  0.00323607  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_1793  CDS  NC_007604  1864440  1864763  +  324  thioredoxin  YP_400810  normal  0.99578  decreased coverage  0.00274383  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_1794  CDS  NC_007604  1864768  1865946  +  1179  succinyldiaminopimelate transaminase  YP_400811  normal  0.455812  decreased coverage  0.0036927  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_1795  CDS  NC_007604  1865979  1866443  -  465  SsrA-binding protein  YP_400812  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_1899  CDS  NC_007604  1972290  1972778  -  489  hypothetical protein  YP_400916  decreased coverage  0.000990864  normal  0.472298  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_2244  CDS  NC_007604  2309788  2310333  -  546  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  YP_401261  decreased coverage  0.000000000219282  normal  0.593282  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_2367  CDS  NC_007604  2432951  2433454  -  504  hypothetical protein  YP_401384  decreased coverage  0.00815435  normal  1  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_2402  CDS  NC_007604  2476025  2477155  +  1131  hypothetical protein  YP_401419  hitchhiker  0.00162245  decreased coverage  0.000927611  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_2404  CDS  NC_007604  2477807  2478547  +  741  hypothetical protein  YP_401421  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_2405  CDS  NC_007604  2478739  2478993  -  255  hypothetical protein  YP_401422  decreased coverage  0.000012248  hitchhiker  0.00954272  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_2406  CDS  NC_007604  2479051  2480190  +  1140  FAD dependent oxidoreductase  YP_401423  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_2540  CDS  NC_007604  2621837  2622298  -  462  blue-copper-protein-like protein  YP_401557  decreased coverage  0.00275414  normal  1  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_2541  CDS  NC_007604  2622353  2622766  +  414  50S ribosomal protein L19  YP_401558  decreased coverage  0.00272416  normal  1  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_R0009  tRNA  NC_007604  2309655  2309726  -  72  tRNA-Gly    decreased coverage  0.000000000199446  normal  0.87079  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_R0014  tRNA  NC_007604  2478513  2478585  +  73  tRNA-Phe    decreased coverage  0.0000072957  hitchhiker  0.009028  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Synpcc7942_R0040  tRNA  NC_007604  711226  711312  +  87  tRNA-Leu    decreased coverage  0.0000000000000876767  normal  1  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>