3323 genes were found for organism Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 34    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Dole_0001  CDS  NC_009943  50  1432  +  1383  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_001527888  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0002  CDS  NC_009943  1624  3012  +  1389  FAD linked oxidase domain-containing protein  YP_001527889  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0003  CDS  NC_009943  3019  3234  -  216  hypothetical protein  YP_001527890  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0004  CDS  NC_009943  3231  4013  -  783  inositol-phosphate phosphatase  YP_001527891  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0005  CDS  NC_009943  4067  5764  -  1698  GTP-binding protein HSR1-related  YP_001527892  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0006  CDS  NC_009943  5815  7230  -  1416  replicative DNA helicase  YP_001527893  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0007  CDS  NC_009943  7279  7734  -  456  50S ribosomal protein L9  YP_001527894  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0008  CDS  NC_009943  7957  8940  -  984  hypothetical protein  YP_001527895  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0009  CDS  NC_009943  8962  9213  -  252  30S ribosomal protein S18  YP_001527896  normal  0.99289  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0010  CDS  NC_009943  9267  9773  -  507  30S ribosomal protein S6  YP_001527897  normal  0.490507  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0011  CDS  NC_009943  10367  11674  -  1308  hypothetical protein  YP_001527898  hitchhiker  0.00000177215  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0012  CDS  NC_009943  11993  13690  -  1698  integrin-like repeat-containing protein  YP_001527899  hitchhiker  0.000000257714  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0013  CDS  NC_009943  13760  15190  -  1431  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, B subunit  YP_001527900  hitchhiker  0.00000416618  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0014  CDS  NC_009943  15398  16750  +  1353  putative ribonuclease BN  YP_001527901  normal  0.113788  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0015  CDS  NC_009943  17136  17657  -  522  carboxymuconolactone decarboxylase  YP_001527902  hitchhiker  0.00130633  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0016  CDS  NC_009943  17995  18588  -  594  hypothetical protein  YP_001527903  hitchhiker  0.0000000162864  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0017  CDS  NC_009943  18772  19362  -  591  hypothetical protein  YP_001527904  hitchhiker  0.00000000138236  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0018  CDS  NC_009943  19366  20346  -  981  hypothetical protein  YP_001527905  unclonable  0.000000000671428  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0019  CDS  NC_009943  20373  20849  -  477  hypothetical protein  YP_001527906  hitchhiker  0.00000000207386  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0020  CDS  NC_009943  20846  22312  -  1467  hypothetical protein  YP_001527907  normal  0.0144278  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0021  CDS  NC_009943  22361  23017  -  657  hydrolase  YP_001527908  normal  0.993674  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0022  CDS  NC_009943  23014  23517  -  504  hypothetical protein  YP_001527909  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0023  CDS  NC_009943  23527  23751  -  225  hypothetical protein  YP_001527910  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0024  CDS  NC_009943  23770  24261  -  492  phosphodiesterase  YP_001527911  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0025  CDS  NC_009943  25106  27145  -  2040  primosomal protein N'  YP_001527912  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0026  CDS  NC_009943  27261  28541  -  1281  citrate synthase I  YP_001527913  hitchhiker  0.0000469449  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0027  CDS  NC_009943  28802  29572  +  771  hypothetical protein  YP_001527914  decreased coverage  0.00000000116236  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0028  CDS  NC_009943  29588  30250  +  663  beta-lactamase domain-containing protein  YP_001527915  normal  0.0137537  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0029  CDS  NC_009943  30274  30918  -  645  two component LuxR family transcriptional regulator  YP_001527916  normal  0.317943  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0030  CDS  NC_009943  30896  36115  -  5220  ATPase domain-containing protein  YP_001527917  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0031  CDS  NC_009943  36230  37147  -  918  hypothetical protein  YP_001527918  normal  0.929118  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0032  CDS  NC_009943  37152  37847  -  696  hypothetical protein  YP_001527919  normal  0.164045  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0033  CDS  NC_009943  37857  38633  -  777  hypothetical protein  YP_001527920  hitchhiker  0.000645659  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0034  CDS  NC_009943  38838  41114  +  2277  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  YP_001527921  unclonable  0.00000015313  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0035  CDS  NC_009943  41182  42708  +  1527  SpoIID/LytB domain-containing protein  YP_001527922  unclonable  0.00000000486765  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0036  CDS  NC_009943  42966  43844  +  879  hypothetical protein  YP_001527923  unclonable  0.000000000461635  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0037  CDS  NC_009943  43905  45068  +  1164  TPR repeat-containing protein  YP_001527924  hitchhiker  0.000760847  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0038  CDS  NC_009943  45095  45967  +  873  putative periplasmic protein  YP_001527925  normal  0.0958409  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0039  CDS  NC_009943  46138  46875  +  738  nitroreductase  YP_001527926  normal  0.499814  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0040  CDS  NC_009943  46877  49003  +  2127  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_001527927  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0041  CDS  NC_009943  49047  50552  +  1506  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  YP_001527928  normal  0.0492791  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0042  CDS  NC_009943  50587  51408  -  822  pantoate--beta-alanine ligase  YP_001527929  hitchhiker  0.0000112642  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0043  CDS  NC_009943  51701  54091  +  2391  LVIVD repeat-containing protein  YP_001527930  decreased coverage  0.0000100601  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0044  CDS  NC_009943  54260  54673  +  414  single-strand binding protein  YP_001527931  normal  0.139232  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0045  CDS  NC_009943  54839  55024  -  186  twin arginine translocase protein A  YP_001527932  normal  0.895264  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0046  CDS  NC_009943  55182  56252  +  1071  hypothetical protein  YP_001527933  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0047  CDS  NC_009943  56392  57237  +  846  ATPase central domain-containing protein  YP_001527934  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0048  CDS  NC_009943  57271  58482  +  1212  hypothetical protein  YP_001527935  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0049  CDS  NC_009943  58501  59181  +  681  response regulator receiver protein  YP_001527936  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0050  CDS  NC_009943  59332  59658  +  327  addiction module killer protein  YP_001527937  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0051  CDS  NC_009943  59661  59939  +  279  putative transcriptional regulator  YP_001527938  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0052  CDS  NC_009943  60037  60615  +  579  hypothetical protein  YP_001527939  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0053  CDS  NC_009943  60688  60942  +  255  hypothetical protein  YP_001527940  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0054  CDS  NC_009943  60975  62369  -  1395  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  YP_001527941  normal  0.536242  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0055  CDS  NC_009943  62536  63330  +  795  hypothetical protein  YP_001527942  normal  0.345745  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0056  CDS  NC_009943  63436  63921  +  486  hypothetical protein  YP_001527943  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0057  CDS  NC_009943  64046  65218  -  1173  alanine racemase  YP_001527944  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0058  CDS  NC_009943  65215  65940  -  726  pseudouridine synthase  YP_001527945  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0059  CDS  NC_009943  65937  67118  -  1182  arginine biosynthesis bifunctional protein ArgJ  YP_001527946  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0060  CDS  NC_009943  67250  67978  -  729  vitamin B12 dependent methionine synthase activation region  YP_001527947  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0061  CDS  NC_009943  67985  68638  -  654  cobalamin B12-binding domain-containing protein  YP_001527948  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0062  CDS  NC_009943  68641  69801  -  1161  uroporphyrinogen decarboxylase  YP_001527949  normal  0.629057  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0063  CDS  NC_009943  69963  71192  +  1230  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  YP_001527950  normal  0.323797  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0064  CDS  NC_009943  72123  72590  +  468  hypothetical protein  YP_001527951  decreased coverage  0.00196397  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0065  CDS  NC_009943  72623  73765  -  1143  hypothetical protein  YP_001527952  normal  0.0335874  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0066  CDS  NC_009943  73762  74082  -  321  hypothetical protein  YP_001527953  normal  0.243898  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0067  CDS  NC_009943  75364  75825  -  462  cyclic nucleotide-binding protein  YP_001527954  normal  0.821564  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0068  CDS  NC_009943  75864  77306  -  1443  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  YP_001527955  normal  0.552857  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0069  CDS  NC_009943  77706  78359  +  654  GrpE protein  YP_001527956  normal  0.311586  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0070  CDS  NC_009943  78419  80347  +  1929  chaperone protein DnaK  YP_001527957  normal  0.0113032  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0071  CDS  NC_009943  80417  80896  +  480  NADPH-dependent FMN reductase  YP_001527958  normal  0.109479  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0072  CDS  NC_009943  80934  81455  -  522  hypothetical protein  YP_001527959  normal  0.732528  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0073  CDS  NC_009943  81514  82383  -  870  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  YP_001527960  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0074  CDS  NC_009943  82431  83597  -  1167  succinyl-CoA synthetase subunit beta  YP_001527961  normal  0.698704  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0075  CDS  NC_009943  83597  85642  -  2046  hypothetical protein  YP_001527962  normal  0.273109  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0076  CDS  NC_009943  85681  85911  -  231  hypothetical protein  YP_001527963  normal  0.596251  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0077  CDS  NC_009943  85930  87483  -  1554  carboxyl transferase  YP_001527964  normal  0.371983  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0078  CDS  NC_009943  87606  88601  -  996  LAO/AO transport system ATPase  YP_001527965  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0079  CDS  NC_009943  88777  90897  -  2121  methylmalonyl-CoA mutase  YP_001527966  normal  0.373309  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0080  CDS  NC_009943  90941  91348  -  408  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_001527967  normal  0.0425619  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0081  CDS  NC_009943  91385  92572  -  1188  aspartate aminotransferase  YP_001527968  normal  0.0248669  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0082  CDS  NC_009943  92860  93045  +  186  hypothetical protein  YP_001527969  normal  0.0469897  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0083  CDS  NC_009943  93215  94264  +  1050  queuosine biosynthesis protein  YP_001527970  normal  0.0181092  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0084  CDS  NC_009943  94358  95512  +  1155  queuine tRNA-ribosyltransferase  YP_001527971  hitchhiker  0.00000052368  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0085  CDS  NC_009943  95607  95825  +  219  NifU domain-containing protein  YP_001527972  unclonable  0.0000000000210342  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0086  CDS  NC_009943  95992  96306  +  315  50S ribosomal protein L21  YP_001527973  hitchhiker  0.0000000109341  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0087  CDS  NC_009943  96368  96619  +  252  50S ribosomal protein L27  YP_001527974  hitchhiker  0.00000279495  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0088  CDS  NC_009943  96616  97617  +  1002  GTP-binding protein Obg/CgtA  YP_001527975  hitchhiker  0.00208899  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0089  CDS  NC_009943  97607  98737  +  1131  glutamate 5-kinase  YP_001527976  normal  0.512468  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0090  CDS  NC_009943  98775  100031  +  1257  gamma-glutamyl phosphate reductase  YP_001527977  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0091  CDS  NC_009943  100059  100727  +  669  nicotinate (nicotinamide) nucleotide adenylyltransferase  YP_001527978  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0092  CDS  NC_009943  100724  101068  +  345  iojap-like protein  YP_001527979  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0093  CDS  NC_009943  101094  102629  +  1536  phosphoglyceromutase  YP_001527980  normal  0.784712  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0094  CDS  NC_009943  103072  104205  +  1134  DNA polymerase III, beta subunit  YP_001527981  unclonable  0.000000000475987  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0095  CDS  NC_009943  104210  106654  +  2445  DNA gyrase, B subunit  YP_001527982  normal  0.0142901  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0096  CDS  NC_009943  106651  107988  -  1338  asparaginyl-tRNA synthetase  YP_001527983  normal  0.317765  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0097  CDS  NC_009943  108032  110485  +  2454  radical SAM domain-containing protein  YP_001527984  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0098  CDS  NC_009943  110589  112142  +  1554  ribonuclease  YP_001527985  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0099  CDS  NC_009943  112349  112483  +  135  ribosomal protein L34  YP_001527986  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Dole_0100  CDS  NC_009943  112621  112986  +  366  ribonuclease P protein component  YP_001527987  normal  1  n/a    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 34    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>