4137 genes were found for organism Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 42    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Dd703_0001  CDS  NC_012880  188  1576  +  1389  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_002985642  normal  0.138659  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0002  CDS  NC_012880  1581  2681  +  1101  DNA polymerase III subunit beta  YP_002985643  normal  0.161415  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0003  CDS  NC_012880  2800  3885  +  1086  recombination protein F  YP_002985644  normal  0.0385213  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0004  CDS  NC_012880  3903  6314  +  2412  DNA gyrase subunit B  YP_002985645  normal  0.428577  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0005  CDS  NC_012880  6528  7712  -  1185  major facilitator superfamily MFS_1  YP_002985646  normal  0.32076  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0006  CDS  NC_012880  7960  8823  -  864  HNH nuclease  YP_002985647  normal  0.457974  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0007  CDS  NC_012880  8816  9562  -  747  hypothetical protein  YP_002985648  normal  0.231859  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0008  CDS  NC_012880  9566  11128  -  1563  hypothetical protein  YP_002985649  normal  0.556224  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0009  CDS  NC_012880  11561  12307  -  747  putative methyltransferase  YP_002985650  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0010  CDS  NC_012880  12310  14352  -  2043  oligopeptidase A  YP_002985651  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0011  CDS  NC_012880  14477  14761  -  285  hypothetical protein  YP_002985652  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0012  CDS  NC_012880  14928  15770  +  843  protein of unknown function DUF519  YP_002985653  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0013  CDS  NC_012880  15968  17320  +  1353  glutathione reductase  YP_002985654  normal  0.607831  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0014  CDS  NC_012880  17493  20270  -  2778  putative DNA helicase  YP_002985655  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0015  CDS  NC_012880  20675  21709  -  1035  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  YP_002985656  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0016  CDS  NC_012880  22163  22687  +  525  hypothetical protein  YP_002985657  normal  0.864114  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0017  CDS  NC_012880  22767  23414  -  648  protein of unknown function DUF161  YP_002985658  normal  0.438672  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0018  CDS  NC_012880  23614  24084  +  471  transcriptional regulator, AsnC family  YP_002985659  normal  0.38788  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0019  CDS  NC_012880  24074  25156  -  1083  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  YP_002985660  normal  0.21113  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0020  CDS  NC_012880  25301  25756  +  456  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_002985661  normal  0.0314229  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0021  CDS  NC_012880  26097  26825  +  729  hypothetical protein  YP_002985662  decreased coverage  0.00866828  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0022  CDS  NC_012880  26896  28293  -  1398  DNA-cytosine methyltransferase  YP_002985663  normal  0.0809764  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0023  CDS  NC_012880  28702  28872  +  171  hypothetical protein  YP_002985664  normal  0.0423509  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0024  CDS  NC_012880  29573  30541  +  969  glucokinase  YP_002985665  normal  0.577938  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0025  CDS  NC_012880  30639  32123  -  1485  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  YP_002985666  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0026  CDS  NC_012880  32524  33639  -  1116  uncharacterized peroxidase-related enzyme  YP_002985667  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0027  CDS  NC_012880  33636  34673  -  1038  Luciferase-like monooxygenase  YP_002985668  normal  0.844059  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0028  CDS  NC_012880  34700  36340  -  1641  ABC transporter related  YP_002985669  normal  0.0987785  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0029  CDS  NC_012880  36343  37197  -  855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002985670  normal  0.0296749  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0030  CDS  NC_012880  37200  38135  -  936  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002985671  normal  0.0364256  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0031  CDS  NC_012880  38315  39958  -  1644  extracellular solute-binding protein family 5  YP_002985672  normal  0.255435  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0032  CDS  NC_012880  40345  41370  +  1026  putative cytoplasmic protein  YP_002985673  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0033  CDS  NC_012880  41602  42366  -  765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_002985674  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0034  CDS  NC_012880  42667  43992  +  1326  hypothetical protein  YP_002985675  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0035  CDS  NC_012880  44318  45154  +  837  ABC transporter related  YP_002985676  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0036  CDS  NC_012880  45144  46022  +  879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002985677  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0037  CDS  NC_012880  46023  47111  +  1089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002985678  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0038  CDS  NC_012880  47251  48261  +  1011  NMT1/THI5 like domain protein  YP_002985679  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0039  CDS  NC_012880  48304  48990  +  687  transcriptional regulator, TetR family  YP_002985680  normal  0.618128  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0040  CDS  NC_012880  49032  49838  +  807  transcriptional regulator, AraC family  YP_002985681  normal  0.451948  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0041  CDS  NC_012880  50045  50656  +  612  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  YP_002985682  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0042  CDS  NC_012880  50676  51950  -  1275  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  YP_002985683  normal  0.346938  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0043  CDS  NC_012880  52958  53062  +  105  hypothetical protein  YP_002985684  normal  0.903261  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0044  CDS  NC_012880  53059  54477  +  1419  glutamate synthase subunit beta  YP_002985685  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0045  CDS  NC_012880  54470  55783  +  1314  dihydropyrimidine dehydrogenase  YP_002985686  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0046  CDS  NC_012880  55825  57270  +  1446  phenylhydantoinase  YP_002985687  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0047  CDS  NC_012880  57352  58638  +  1287  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  YP_002985688  normal  0.21885  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0048  CDS  NC_012880  58821  59138  -  318  NIPSNAP family containing protein  YP_002985689  normal  0.99438  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0049  CDS  NC_012880  59473  60525  +  1053  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  YP_002985690  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0050  CDS  NC_012880  60637  61890  -  1254  valine--pyruvate transaminase  YP_002985691  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0051  CDS  NC_012880  61991  62152  +  162  hypothetical protein  YP_002985692  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0052  CDS  NC_012880  62286  63494  +  1209  hypothetical protein  YP_002985693  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0053  CDS  NC_012880  63722  64246  -  525  hypothetical protein  YP_002985694  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0054  CDS  NC_012880  64258  65481  -  1224  abortive infection protein  YP_002985695  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0055  CDS  NC_012880  65850  66815  -  966  Gluconate 2-dehydrogenase  YP_002985696  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0056  CDS  NC_012880  67055  67303  +  249  protein of unknown function DUF1471  YP_002985697  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0057  CDS  NC_012880  67363  67812  -  450  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_002985698  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0058  CDS  NC_012880  67809  68447  -  639  DNA-3-methyladenine glycosylase I  YP_002985699  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0059  CDS  NC_012880  68575  69381  +  807  protein of unknown function DUF81  YP_002985700  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0060  CDS  NC_012880  69529  70443  +  915  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  YP_002985701  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0061  CDS  NC_012880  70453  72522  +  2070  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  YP_002985702  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0062  CDS  NC_012880  72706  73713  -  1008  hypothetical protein  YP_002985703  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0063  CDS  NC_012880  73881  74975  -  1095  ABC transporter related  YP_002985704  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0064  CDS  NC_012880  75338  76537  -  1200  ROK family protein  YP_002985705  normal  0.370021  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0065  CDS  NC_012880  76787  77908  +  1122  ROK family protein  YP_002985706  normal  0.600972  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0066  CDS  NC_012880  77905  79659  +  1755  hypothetical protein  YP_002985707  normal  0.365274  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0067  CDS  NC_012880  79714  80958  +  1245  extracellular solute-binding protein family 1  YP_002985708  normal  0.469085  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0068  CDS  NC_012880  80955  81902  +  948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002985709  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0069  CDS  NC_012880  81899  82717  +  819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002985710  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0070  CDS  NC_012880  83208  83918  +  711  hypothetical protein  YP_002985711  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0071  CDS  NC_012880  84020  85912  -  1893  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_002985712  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0072  CDS  NC_012880  86505  87131  -  627  Superoxide dismutase  YP_002985713  normal  0.7057  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0073  CDS  NC_012880  87335  88168  -  834  formate dehydrogenase accessory protein  YP_002985714  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0074  CDS  NC_012880  88530  90068  +  1539  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  YP_002985715  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0075  CDS  NC_012880  90118  91041  -  924  transcriptional regulator, AraC family  YP_002985716  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0076  CDS  NC_012880  91121  91669  -  549  isochorismatase hydrolase  YP_002985717  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0077  CDS  NC_012880  91802  93262  -  1461  xylulokinase  YP_002985718  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0078  CDS  NC_012880  93337  94656  -  1320  xylose isomerase  YP_002985719  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0079  CDS  NC_012880  95013  96011  +  999  D-xylose transporter subunit XylF  YP_002985720  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0080  CDS  NC_012880  96094  97635  +  1542  xylose transporter ATP-binding subunit  YP_002985721  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0081  CDS  NC_012880  97613  98785  +  1173  inner-membrane translocator  YP_002985722  normal  0.806759  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0082  CDS  NC_012880  98921  100108  +  1188  transcriptional regulator, AraC family  YP_002985723  normal  0.719713  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0083  CDS  NC_012880  100179  100766  -  588  ThiJ/PfpI domain protein  YP_002985724  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0084  CDS  NC_012880  100950  101228  -  279  protein of unknown function DUF156  YP_002985725  normal  0.702684  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0085  CDS  NC_012880  101327  102442  +  1116  high-affinity nickel-transporter  YP_002985726  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0086  CDS  NC_012880  102770  104122  +  1353  argininosuccinate synthase  YP_002985727  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0087  CDS  NC_012880  104197  104697  -  501  transcriptional regulator, MarR family  YP_002985728  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0088  CDS  NC_012880  105005  105877  +  873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  YP_002985729  normal  0.529373  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0089  CDS  NC_012880  106261  107238  +  978  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  YP_002985730  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0090  CDS  NC_012880  107251  107517  +  267  hypothetical protein  YP_002985731  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0091  CDS  NC_012880  107507  108118  +  612  hypothetical protein  YP_002985732  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0092  CDS  NC_012880  108139  109500  +  1362  multi antimicrobial extrusion protein MatE  YP_002985733  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0093  CDS  NC_012880  109487  110488  +  1002  hypothetical protein  YP_002985734  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0094  CDS  NC_012880  110470  111027  -  558  transcriptional regulator, AraC family  YP_002985735  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0095  CDS  NC_012880  111476  112183  +  708  ABC transporter related  YP_002985736  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0096  CDS  NC_012880  112188  114629  +  2442  protein of unknown function DUF214  YP_002985737  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0097  CDS  NC_012880  114948  116348  +  1401  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  YP_002985738  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0098  CDS  NC_012880  116341  117660  +  1320  histidine kinase  YP_002985739  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0099  CDS  NC_012880  117617  118363  +  747  4'-phosphopantetheinyl transferase  YP_002985740  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Dd703_0100  CDS  NC_012880  118424  119164  -  741  hypothetical protein  YP_002985741  normal  1  n/a    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 42    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>