4398 genes were found for organism Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 44    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
PC1_0001  CDS  NC_012917  72  1469  +  1398  chromosomal replication initiation protein  YP_003015600  decreased coverage  0.00156244  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0002  CDS  NC_012917  1474  2574  +  1101  DNA polymerase III subunit beta  YP_003015601  hitchhiker  0.00514307  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0003  CDS  NC_012917  2624  3709  +  1086  recombination protein F  YP_003015602  normal  0.279219  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0004  CDS  NC_012917  3728  6145  +  2418  DNA gyrase subunit B  YP_003015603  normal  0.777143  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0005  CDS  NC_012917  6488  7678  -  1191  major facilitator superfamily MFS_1  YP_003015604  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0006  CDS  NC_012917  7843  8211  +  369  glutathione-dependent formaldehyde-activating GFA  YP_003015605  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0007  CDS  NC_012917  8261  10171  -  1911  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  YP_003015606  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0008  CDS  NC_012917  10548  11561  -  1014  transcriptional regulator, LacI family  YP_003015607  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0009  CDS  NC_012917  11776  12081  +  306  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  YP_003015608  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0010  CDS  NC_012917  12098  13411  +  1314  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  YP_003015609  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0011  CDS  NC_012917  13401  13727  +  327  phosphotransferase system PTS lactose/cellobiose-specific IIA subunit  YP_003015610  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0012  CDS  NC_012917  13760  15202  +  1443  glycoside hydrolase family 1  YP_003015611  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0013  CDS  NC_012917  15358  16173  +  816  sugar phosphatase  YP_003015612  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0014  CDS  NC_012917  16319  17215  -  897  transcriptional regulator, LysR family  YP_003015613  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0015  CDS  NC_012917  17358  18908  +  1551  extracellular solute-binding protein family 5  YP_003015614  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0016  CDS  NC_012917  18978  19862  +  885  dihydrodipicolinate synthetase  YP_003015615  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0017  CDS  NC_012917  19965  20918  +  954  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  YP_003015616  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0018  CDS  NC_012917  20920  21927  +  1008  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  YP_003015617  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0019  CDS  NC_012917  21927  22904  +  978  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_003015618  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0020  CDS  NC_012917  22901  23809  +  909  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_003015619  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0021  CDS  NC_012917  23825  25657  +  1833  ABC transporter related  YP_003015620  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0022  CDS  NC_012917  25733  25990  -  258  hypothetical protein  YP_003015621  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0023  CDS  NC_012917  26163  26963  -  801  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  YP_003015622  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0024  CDS  NC_012917  26960  27754  -  795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_003015623  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0025  CDS  NC_012917  27765  28907  -  1143  alkanesulfonate monooxygenase  YP_003015624  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0026  CDS  NC_012917  28966  29988  -  1023  alkanesulfonate transporter substrate-binding subunit  YP_003015625  normal  0.778935  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0027  CDS  NC_012917  30438  31883  +  1446  major facilitator superfamily MFS_1  YP_003015626  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0028  CDS  NC_012917  32221  32544  +  324  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  YP_003015627  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0029  CDS  NC_012917  32541  33863  +  1323  PTS system, lactose/cellobiose family IIC subunit  YP_003015628  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0030  CDS  NC_012917  33889  35301  +  1413  Beta-glucosidase  YP_003015629  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0031  CDS  NC_012917  35464  35721  -  258  hypothetical protein  YP_003015630  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0032  CDS  NC_012917  35934  37238  +  1305  hypothetical protein  YP_003015631  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0033  CDS  NC_012917  37274  37666  -  393  hypothetical protein  YP_003015632  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0034  CDS  NC_012917  38051  38464  +  414  heat shock protein IbpA  YP_003015633  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0035  CDS  NC_012917  38620  39069  +  450  heat shock chaperone IbpB  YP_003015634  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0036  CDS  NC_012917  39247  40905  +  1659  hypothetical protein  YP_003015635  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0037  CDS  NC_012917  41490  42902  +  1413  anion transporter  YP_003015636  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0038  CDS  NC_012917  43093  44721  +  1629  sensory histidine kinase DcuS  YP_003015637  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0039  CDS  NC_012917  44714  45436  +  723  DNA-binding transcriptional activator DcuR  YP_003015638  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0040  CDS  NC_012917  45514  45918  -  405  hypothetical protein  YP_003015639  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0041  CDS  NC_012917  45955  46509  -  555  flavodoxin/nitric oxide synthase  YP_003015640  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0042  CDS  NC_012917  46614  47012  +  399  transcriptional regulator, HxlR family  YP_003015641  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0043  CDS  NC_012917  47050  48393  -  1344  Citrate carrier protein  YP_003015642  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0044  CDS  NC_012917  49825  51432  +  1608  extracellular solute-binding protein family 5  YP_003015643  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0045  CDS  NC_012917  51666  52685  +  1020  dipeptide transporter permease DppB  YP_003015644  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0046  CDS  NC_012917  52699  53601  +  903  dipeptide transporter  YP_003015645  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0047  CDS  NC_012917  53615  54595  +  981  dipeptide transporter ATP-binding subunit  YP_003015646  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0048  CDS  NC_012917  54592  55602  +  1011  dipeptide transporter ATP-binding subunit  YP_003015647  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0049    NC_012917  55696  55977  -  282      normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0050  CDS  NC_012917  56142  56579  -  438  hypothetical protein  YP_003015648  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0051  CDS  NC_012917  56584  60897  -  4314  YD repeat protein  YP_003015649  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0052  CDS  NC_012917  60909  61316  -  408  hypothetical protein  YP_003015650  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0053  CDS  NC_012917  61325  63178  -  1854  type VI secretion system Vgr family protein  YP_003015651  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0054  CDS  NC_012917  63269  63787  -  519  type VI secretion system effector, Hcp1 family  YP_003015652  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0055  CDS  NC_012917  64344  65594  -  1251  valine--pyruvate transaminase  YP_003015653  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0056  CDS  NC_012917  65988  67196  +  1209  hypothetical protein  YP_003015654  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0057  CDS  NC_012917  67360  68271  +  912  hypothetical protein  YP_003015655  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0058  CDS  NC_012917  68345  69790  -  1446  altronate oxidoreductase  YP_003015656  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0059  CDS  NC_012917  69804  70826  -  1023  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  YP_003015657  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0060  CDS  NC_012917  70969  71883  +  915  transcriptional regulator, GntR family  YP_003015658  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0061  CDS  NC_012917  72097  73446  +  1350  major facilitator superfamily MFS_1  YP_003015659  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0062  CDS  NC_012917  73711  75489  +  1779  gamma-glutamyltransferase  YP_003015660  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0063  CDS  NC_012917  75526  75849  -  324  hypothetical protein  YP_003015661  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0064  CDS  NC_012917  75934  76398  -  465  hypothetical protein  YP_003015662  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0065  CDS  NC_012917  76395  81566  -  5172  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  YP_003015663  normal  0.290227  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0066  CDS  NC_012917  81606  83288  -  1683  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  YP_003015664  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0067  CDS  NC_012917  83546  84889  -  1344  aminotransferase class-III  YP_003015665  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0068  CDS  NC_012917  84922  86283  -  1362  ethanolamine transproter  YP_003015666  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0069  CDS  NC_012917  86542  87549  +  1008  aminoglycoside phosphotransferase  YP_003015667  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0070  CDS  NC_012917  87722  88780  +  1059  transcriptional regulator, AraC family  YP_003015668  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0071  CDS  NC_012917  89012  90043  +  1032  hypothetical protein  YP_003015669  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0072  CDS  NC_012917  90232  91119  +  888  hypothetical protein  YP_003015670  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0073  CDS  NC_012917  91166  94660  -  3495  cellulose synthase subunit BcsC  YP_003015671  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0074  CDS  NC_012917  94642  95757  -  1116  endo-1,4-D-glucanase  YP_003015672  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0075  CDS  NC_012917  95764  98082  -  2319  cellulose synthase regulator protein  YP_003015673  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0076  CDS  NC_012917  98157  100856  -  2700  cellulose synthase catalytic subunit  YP_003015674  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0077  CDS  NC_012917  100853  101590  -  738  cellulose synthase operon protein YhjQ  YP_003015675  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0078  CDS  NC_012917  101593  101802  -  210  hypothetical protein  YP_003015676  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0079  CDS  NC_012917  102133  103737  +  1605  cellulose biosynthesis protein BcsE  YP_003015677  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0080  CDS  NC_012917  103734  103952  +  219  hypothetical protein  YP_003015678  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0081  CDS  NC_012917  103954  105615  +  1662  cellulose synthase operon protein YhjU  YP_003015679  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0082  CDS  NC_012917  105968  107152  +  1185  diguanylate cyclase  YP_003015680  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0083  CDS  NC_012917  107472  108764  +  1293  C4-dicarboxylate transporter DctA  YP_003015681  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0084  CDS  NC_012917  109118  110635  +  1518  peptidase M16 domain protein  YP_003015682  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0085  CDS  NC_012917  110988  111155  +  168  hypothetical protein  YP_003015683  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0086  CDS  NC_012917  111251  112183  -  933  PfkB domain protein  YP_003015684  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0087  CDS  NC_012917  112331  113347  -  1017  ribonuclease  YP_003015685  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0088  CDS  NC_012917  113478  114677  +  1200  major facilitator superfamily transporter  YP_003015686  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0089  CDS  NC_012917  114723  115289  -  567  hypothetical protein  YP_003015687  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0090  CDS  NC_012917  115346  115492  +  147  hypothetical protein  YP_003015688  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0091  CDS  NC_012917  115476  116153  -  678  hypothetical protein  YP_003015689  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0092  CDS  NC_012917  116370  116612  +  243  sulfur transfer protein SirA  YP_003015690  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0093  CDS  NC_012917  116672  119035  -  2364  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  YP_003015691  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0094  CDS  NC_012917  119130  119759  -  630  YhhN family protein  YP_003015692  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0095  CDS  NC_012917  119951  120271  +  321  hypothetical protein  YP_003015693  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0096  CDS  NC_012917  120271  120630  +  360  hypothetical protein  YP_003015694  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0097  CDS  NC_012917  120634  120912  -  279  hypothetical protein  YP_003015695  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0098  CDS  NC_012917  120939  121514  -  576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  YP_003015696  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0099  CDS  NC_012917  121864  123351  +  1488  cell division protein FtsY  YP_003015697  normal  1  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
PC1_0100  CDS  NC_012917  123357  124028  +  672  cell division protein FtsE  YP_003015698  normal  0.578603  n/a    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 44    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>