4367 genes were found for organism Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 44    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Dd1591_0001  CDS  NC_012912  35  1429  +  1395  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_003002374  hitchhiker  0.00240104  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0002  CDS  NC_012912  1434  2534  +  1101  DNA polymerase III subunit beta  YP_003002375  hitchhiker  0.00825161  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0003  CDS  NC_012912  2675  3760  +  1086  recombination protein F  YP_003002376  normal  0.0661286  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0004  CDS  NC_012912  3778  6189  +  2412  DNA gyrase subunit B  YP_003002377  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0005  CDS  NC_012912  6266  7450  -  1185  major facilitator superfamily MFS_1  YP_003002378  normal  0.695547  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0006  CDS  NC_012912  7640  8392  -  753  putative methyltransferase  YP_003002379  normal  0.84846  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0007  CDS  NC_012912  8389  10431  -  2043  oligopeptidase A  YP_003002380  normal  0.73797  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0008  CDS  NC_012912  10557  10841  -  285  hypothetical protein  YP_003002381  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0009  CDS  NC_012912  11228  12070  +  843  protein of unknown function DUF519  YP_003002382  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0010  CDS  NC_012912  12106  13020  -  915  ribonuclease Z  YP_003002383  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0011  CDS  NC_012912  13031  14620  -  1590  Sigma 54 interacting domain protein  YP_003002384  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0012  CDS  NC_012912  14875  15768  +  894  band 7 protein  YP_003002385  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0013  CDS  NC_012912  15836  17059  +  1224  protein of unknown function UPF0027  YP_003002386  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0014  CDS  NC_012912  17448  18800  +  1353  glutathione reductase  YP_003002387  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0015  CDS  NC_012912  19275  20690  +  1416  membrane bound O-acyl transferase MBOAT family protein  YP_003002388  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0016  CDS  NC_012912  20677  21735  +  1059  hypothetical protein  YP_003002389  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0017  CDS  NC_012912  21773  22951  +  1179  hypothetical protein  YP_003002390  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0018  CDS  NC_012912  22994  23641  -  648  protein of unknown function DUF161  YP_003002391  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0019  CDS  NC_012912  23842  24312  +  471  transcriptional regulator, AsnC family  YP_003002392  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0020  CDS  NC_012912  24315  25436  -  1122  aminotransferase class V  YP_003002393  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0021  CDS  NC_012912  25671  26108  +  438  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_003002394  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0022  CDS  NC_012912  26161  26601  -  441  transcriptional regulator, MarR family  YP_003002395  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0023  CDS  NC_012912  26710  27000  +  291  hypothetical protein  YP_003002396  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0024  CDS  NC_012912  27141  28109  +  969  glucokinase  YP_003002397  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0025  CDS  NC_012912  28518  29405  -  888  transcriptional regulator, LysR family  YP_003002398  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0026  CDS  NC_012912  29507  30526  +  1020  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  YP_003002399  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0027    NC_012912  30538  30732  +  195      normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0028  CDS  NC_012912  31185  32303  -  1119  uncharacterized peroxidase-related enzyme  YP_003002400  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0029  CDS  NC_012912  32300  33340  -  1041  Luciferase-like monooxygenase  YP_003002401  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0030  CDS  NC_012912  33343  35019  -  1677  ABC transporter related  YP_003002402  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0031  CDS  NC_012912  35016  35876  -  861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_003002403  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0032  CDS  NC_012912  35878  36819  -  942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_003002404  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0033  CDS  NC_012912  36844  38487  -  1644  extracellular solute-binding protein family 5  YP_003002405  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0034  CDS  NC_012912  38815  39066  +  252  protein of unknown function DUF1471  YP_003002406  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0035  CDS  NC_012912  39224  40480  -  1257  valine--pyruvate transaminase  YP_003002407  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0036  CDS  NC_012912  40873  42081  +  1209  hypothetical protein  YP_003002408  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0037  CDS  NC_012912  42201  42482  +  282  virulence-associated protein D (VapD) conserved region  YP_003002409  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0038  CDS  NC_012912  42542  43504  -  963  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  YP_003002410  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0039  CDS  NC_012912  44061  44516  -  456  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_003002411  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0040  CDS  NC_012912  44513  45073  -  561  DNA-3-methyladenine glycosylase I  YP_003002412  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0041  CDS  NC_012912  45311  46117  +  807  protein of unknown function DUF81  YP_003002413  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0042  CDS  NC_012912  46262  47176  +  915  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  YP_003002414  normal  0.772956  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0043  CDS  NC_012912  47186  49270  +  2085  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  YP_003002415  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0044  CDS  NC_012912  49378  50379  -  1002  hypothetical protein  YP_003002416  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0045  CDS  NC_012912  50811  54404  -  3594  urea carboxylase  YP_003002417  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0046  CDS  NC_012912  54504  55139  -  636  urea carboxylase-associated protein 1  YP_003002418  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0047  CDS  NC_012912  55142  55861  -  720  urea carboxylase-associated protein 2  YP_003002419  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0048  CDS  NC_012912  55879  56658  -  780  ABC transporter related  YP_003002420  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0049  CDS  NC_012912  56686  57498  -  813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_003002421  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0050  CDS  NC_012912  57515  58570  -  1056  ABC transporter periplasmic binding protein, urea carboxylase region  YP_003002422  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0051  CDS  NC_012912  59268  59978  +  711  hypothetical protein  YP_003002423  normal  0.677527  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0052  CDS  NC_012912  60459  62366  +  1908  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  YP_003002424  normal  0.408793  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0053  CDS  NC_012912  62439  63590  +  1152  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  YP_003002425  normal  0.394572  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0054  CDS  NC_012912  63676  64281  +  606  mannitol repressor protein  YP_003002426  normal  0.667154  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0055  CDS  NC_012912  64373  66259  -  1887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_003002427  normal  0.608397  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0056  CDS  NC_012912  66717  67343  -  627  Superoxide dismutase  YP_003002428  normal  0.441294  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0057  CDS  NC_012912  67614  68432  -  819  formate dehydrogenase accessory protein  YP_003002429  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0058  CDS  NC_012912  68798  70333  +  1536  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  YP_003002430  normal  0.491701  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0059  CDS  NC_012912  70585  72045  -  1461  xylulokinase  YP_003002431  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0060  CDS  NC_012912  72167  73486  -  1320  xylose isomerase  YP_003002432  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0061  CDS  NC_012912  73978  74973  +  996  D-xylose transporter subunit XylF  YP_003002433  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0062  CDS  NC_012912  75057  76598  +  1542  xylose transporter ATP-binding subunit  YP_003002434  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0063  CDS  NC_012912  76576  77760  +  1185  inner-membrane translocator  YP_003002435  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0064  CDS  NC_012912  77949  79178  +  1230  transcriptional regulator, AraC family  YP_003002436  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0065  CDS  NC_012912  79299  79874  -  576  ThiJ/PfpI domain protein  YP_003002437  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0066  CDS  NC_012912  80132  80410  -  279  protein of unknown function DUF156  YP_003002438  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0067  CDS  NC_012912  80510  81412  +  903  nickel/cobalt efflux protein RcnA  YP_003002439  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0068  CDS  NC_012912  81706  83055  +  1350  argininosuccinate synthase  YP_003002440  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0069  CDS  NC_012912  83151  83651  -  501  transcriptional regulator, MarR family  YP_003002441  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0070  CDS  NC_012912  84008  84874  +  867  carboxylate/amino acid/amine transporter  YP_003002442  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0071  CDS  NC_012912  85294  86244  +  951  Indigoidine synthase A family protein  YP_003002443  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0072  CDS  NC_012912  86256  86948  +  693  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  YP_003002444  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0073  CDS  NC_012912  87246  91565  +  4320  amino acid adenylation domain protein  YP_003002445  normal  0.236187  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0074  CDS  NC_012912  91841  92845  +  1005  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  YP_003002446  normal  0.0395439  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0075  CDS  NC_012912  92859  93125  +  267  hypothetical protein  YP_003002447  normal  0.169604  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0076  CDS  NC_012912  93115  93768  +  654  hypothetical protein  YP_003002448  normal  0.552489  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0077  CDS  NC_012912  93787  95145  +  1359  Na+-driven multidrug efflux pump-like protein  YP_003002449  normal  0.543424  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0078  CDS  NC_012912  95132  96223  +  1092  hypothetical protein  YP_003002450  normal  0.682762  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0079  CDS  NC_012912  96288  96851  -  564  transcriptional regulator, AraC family  YP_003002451  normal  0.294253  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0080  CDS  NC_012912  97467  98174  +  708  ABC transporter related  YP_003002452  normal  0.348241  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0081  CDS  NC_012912  98179  100611  +  2433  protein of unknown function DUF214  YP_003002453  normal  0.484332  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0082  CDS  NC_012912  100793  102193  +  1401  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  YP_003002454  normal  0.728671  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0083  CDS  NC_012912  102225  103505  +  1281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  YP_003002455  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0084  CDS  NC_012912  103624  104211  +  588  4'-phosphopantetheinyl transferase  YP_003002456  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0085  CDS  NC_012912  104222  104869  -  648  hypothetical protein  YP_003002457  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0086  CDS  NC_012912  105152  106102  -  951  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  YP_003002458  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0087  CDS  NC_012912  106102  106959  -  858  hypothetical protein  YP_003002459  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0088  CDS  NC_012912  106943  108079  -  1137  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  YP_003002460  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0089  CDS  NC_012912  108180  109103  -  924  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  YP_003002461  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0090  CDS  NC_012912  109174  109704  -  531  hypothetical protein  YP_003002462  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0091  CDS  NC_012912  109706  110839  -  1134  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  YP_003002463  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0092  CDS  NC_012912  110836  111267  -  432  hypothetical protein  YP_003002464  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0093  CDS  NC_012912  111349  112881  -  1533  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_003002465  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0094  CDS  NC_012912  112862  114421  -  1560  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_003002466  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0095  CDS  NC_012912  114418  114726  -  309  hypothetical protein  YP_003002467  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0096  CDS  NC_012912  114732  116315  -  1584  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_003002468  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0097  CDS  NC_012912  116327  117247  -  921  hypothetical protein  YP_003002469  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0098  CDS  NC_012912  117244  118566  -  1323  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  YP_003002470  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0099  CDS  NC_012912  118559  118870  -  312  hypothetical protein  YP_003002471  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Dd1591_0100  CDS  NC_012912  119648  120400  +  753  transcriptional regulator, LuxR family  YP_003002472  normal  1  n/a    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 44    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>