2027 genes were found for organism Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 21    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Lreu_0001  CDS  NC_009513  381  1703  +  1323  chromosomal replication initiation protein  YP_001270614  normal  0.203604  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0002  CDS  NC_009513  1879  3021  +  1143  DNA polymerase III, beta subunit  YP_001270615  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0003  CDS  NC_009513  3268  3489  +  222  S4 region, YaaA  YP_001270616  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0004  CDS  NC_009513  3498  4622  +  1125  recombination protein F  YP_001270617  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0005  CDS  NC_009513  4619  6568  +  1950  DNA gyrase subunit B  YP_001270618  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0006  CDS  NC_009513  6611  9115  +  2505  DNA gyrase subunit A  YP_001270619  normal  0.0218004  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0007  CDS  NC_009513  9318  9614  +  297  30S ribosomal protein S6  YP_001270620  hitchhiker  0.000000000132561  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0008  CDS  NC_009513  9652  10215  +  564  single-strand binding protein  YP_001270621  unclonable  0.000000000000109058  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0009  CDS  NC_009513  10249  10485  +  237  30S ribosomal protein S18  YP_001270622  hitchhiker  0.000000183869  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0010  CDS  NC_009513  10702  12720  +  2019  phosphoesterase domain-containing protein  YP_001270623  normal  0.0144039  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0011  CDS  NC_009513  12726  13178  +  453  50S ribosomal protein L9  YP_001270624  normal  0.557694  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0012  CDS  NC_009513  13212  14603  +  1392  primary replicative DNA helicase  YP_001270625  normal  0.781358  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0013  CDS  NC_009513  14725  15927  +  1203  major facilitator transporter  YP_001270626  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0014  CDS  NC_009513  15940  16266  +  327  hypothetical protein  YP_001270627  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0015  CDS  NC_009513  16371  17249  +  879  polyphosphate:AMP phosphotransferase  YP_001270628  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0016  CDS  NC_009513  17279  17836  -  558  XRE family transcriptional regulator  YP_001270629  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0017  CDS  NC_009513  18438  18872  +  435  MarR family transcriptional regulator  YP_001270630  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0018  CDS  NC_009513  18960  20681  +  1722  ABC transporter related  YP_001270631  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0019  CDS  NC_009513  21025  21732  +  708  two component transcriptional regulator  YP_001270632  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0020  CDS  NC_009513  21746  23611  +  1866  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  YP_001270633  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0021  CDS  NC_009513  23589  24884  +  1296  YycH family protein  YP_001270634  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0022  CDS  NC_009513  24897  25739  +  843  hypothetical protein  YP_001270635  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0023  CDS  NC_009513  25757  26563  +  807  beta-lactamase domain-containing protein  YP_001270636  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0024  CDS  NC_009513  26665  27939  +  1275  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  YP_001270637  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0025  CDS  NC_009513  28168  28665  +  498  phosphatidylglycerophosphatase A  YP_001270638  normal  0.6081  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0026  CDS  NC_009513  28974  29960  +  987  hypothetical protein  YP_001270639  normal  0.35198  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0027  CDS  NC_009513  30429  30908  +  480  rRNA large subunit methyltransferase  YP_001270640  hitchhiker  0.000611129  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0028  CDS  NC_009513  31051  31269  +  219  hypothetical protein  YP_001270641  hitchhiker  0.0000164698  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0029  CDS  NC_009513  31343  31879  +  537  NADPH-dependent FMN reductase  YP_001270642  hitchhiker  0.0000000162368  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0030  CDS  NC_009513  32098  33270  +  1173  iron-containing alcohol dehydrogenase  YP_001270643  hitchhiker  0.0000000000706289  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0031  CDS  NC_009513  33514  34377  +  864  sugar transport family protein  YP_001270644  unclonable  0.00000000000014774  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0032  CDS  NC_009513  34492  35268  -  777  hypothetical protein  YP_001270645  hitchhiker  0.0000000000724697  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0033  CDS  NC_009513  35270  36082  -  813  pyrroline-5-carboxylate reductase  YP_001270646  hitchhiker  0.00000000757721  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0034  CDS  NC_009513  36383  37756  +  1374  aldehyde dehydrogenase  YP_001270647  hitchhiker  0.000000822234  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0035  CDS  NC_009513  37932  39014  +  1083  RND family efflux transporter MFP subunit  YP_001270648  hitchhiker  0.0000000302663  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0036  CDS  NC_009513  39016  39714  +  699  ABC transporter related  YP_001270649  hitchhiker  0.00248641  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0037  CDS  NC_009513  39701  40936  +  1236  hypothetical protein  YP_001270650  normal  0.191885  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0038  CDS  NC_009513  41186  41590  +  405  hypothetical protein  YP_001270651  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0039  CDS  NC_009513  41600  41737  +  138  hypothetical protein  YP_001270652  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0040  CDS  NC_009513  41926  43320  +  1395  hypothetical protein  YP_001270653  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0041  CDS  NC_009513  43610  44086  +  477  hypothetical protein  YP_001270654  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0042  CDS  NC_009513  44169  44597  -  429  OsmC family protein  YP_001270655  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0043  CDS  NC_009513  44665  45660  -  996  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  YP_001270656  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0044  CDS  NC_009513  45662  46849  -  1188  aromatic amino acid aminotransferase  YP_001270657  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0045  CDS  NC_009513  47696  49933  +  2238  ATPase  YP_001270658  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0046  CDS  NC_009513  50822  53677  +  2856  hypothetical protein  YP_001270659  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0047  CDS  NC_009513  53759  54343  -  585  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001270660  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0048  CDS  NC_009513  54483  55946  +  1464  cardiolipin synthetase 2  YP_001270661  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0049  CDS  NC_009513  56075  59857  +  3783  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  YP_001270662  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0050  CDS  NC_009513  59857  64035  +  4179  recombination helicase AddA  YP_001270663  normal  0.110759  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0051  CDS  NC_009513  64036  64971  +  936  LacI family transcription regulator  YP_001270664  hitchhiker  0.000000000223899  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0052  CDS  NC_009513  65035  66213  +  1179  acetyl-CoA acetyltransferase  YP_001270665  hitchhiker  0.0000000000885488  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0053  CDS  NC_009513  66525  67874  +  1350  major facilitator transporter  YP_001270666  unclonable  0.0000000000090495  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0054  CDS  NC_009513  67963  70215  +  2253  maltose phosphorylase  YP_001270667  hitchhiker  0.00000286879  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0055  CDS  NC_009513  70234  70896  +  663  beta-phosphoglucomutase  YP_001270668  hitchhiker  0.0000000000775406  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0056  CDS  NC_009513  70973  71455  +  483  hypothetical protein  YP_001270669  hitchhiker  0.00000000000174632  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0057    NC_009513  71540  72164  +  625      unclonable  0.000000000000104622  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0058  CDS  NC_009513  72166  72831  +  666  two component transcriptional regulator  YP_001270670  hitchhiker  0.00000000551146  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0059  CDS  NC_009513  72843  74090  +  1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_001270671  hitchhiker  0.000404489  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0060  CDS  NC_009513  74093  75274  +  1182  hypothetical protein  YP_001270672  normal  0.139873  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0061  CDS  NC_009513  75426  76766  +  1341  glutamate-cysteine ligase  YP_001270673  normal  0.398399  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0062  CDS  NC_009513  77012  77470  +  459  transposase IS200-family protein  YP_001270674  normal  0.121759  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0063  CDS  NC_009513  77669  78397  -  729  peptidase C26  YP_001270675  normal  0.542911  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0064  CDS  NC_009513  78516  79382  +  867  2,5-didehydrogluconate reductase  YP_001270676  normal  0.750291  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0065  CDS  NC_009513  79521  81308  +  1788  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  YP_001270677  normal  0.253496  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0066  CDS  NC_009513  81361  81858  -  498  membrane protein-like protein  YP_001270678  normal  0.0126213  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0067  CDS  NC_009513  82127  83476  +  1350  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_001270679  hitchhiker  0.000104201  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0068  CDS  NC_009513  83536  84510  -  975  guanosine 5'-monophosphate oxidoreductase  YP_001270680  hitchhiker  0.000000829344  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0069  CDS  NC_009513  84706  86004  +  1299  adenylosuccinate synthetase  YP_001270681  hitchhiker  0.0000000215485  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0070  CDS  NC_009513  86115  86900  +  786  hypothetical protein  YP_001270682  hitchhiker  0.00000000000778889  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0071  CDS  NC_009513  87063  87602  +  540  Uracil phosphoribosyltransferase  YP_001270683  hitchhiker  0.00000000000243605  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0072  CDS  NC_009513  87721  88107  -  387  hypothetical protein  YP_001270684  unclonable  0.0000000000000259116  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0073  CDS  NC_009513  88356  89612  -  1257  IS605 family transposase OrfB  YP_001270685  hitchhiker  0.000000149259  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0074  CDS  NC_009513  89687  90142  +  456  transposase IS200-family protein  YP_001270686  normal  0.28559  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0075  CDS  NC_009513  90267  91001  +  735  peptidase C26  YP_001270687  normal  0.70164  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0076  CDS  NC_009513  91007  92401  +  1395  amino acid permease-associated region  YP_001270688  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0077  CDS  NC_009513  92873  93070  +  198  hypothetical protein  YP_001270689  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0078  CDS  NC_009513  93058  93513  +  456  hypothetical protein  YP_001270690  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0079  CDS  NC_009513  93578  94021  -  444  hypothetical protein  YP_001270691  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0080  CDS  NC_009513  94121  95662  +  1542  hypothetical protein  YP_001270692  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0081  CDS  NC_009513  95664  97166  +  1503  hypothetical protein  YP_001270693  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0082  CDS  NC_009513  97278  99095  +  1818  hypothetical protein  YP_001270694  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0083  CDS  NC_009513  99279  100961  +  1683  alpha amylase, catalytic region  YP_001270695  normal  0.0810365  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0084  CDS  NC_009513  100979  102364  +  1386  major facilitator transporter  YP_001270696  hitchhiker  0.0000000380135  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0085  CDS  NC_009513  102442  105612  -  3171  carbamoyl phosphate synthase large subunit  YP_001270697  hitchhiker  0.00260745  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0086  CDS  NC_009513  105605  106693  -  1089  carbamoyl phosphate synthase small subunit  YP_001270698  hitchhiker  0.000481793  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0087  CDS  NC_009513  107075  108448  -  1374  major facilitator transporter  YP_001270699  hitchhiker  0.000000000315537  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0088  CDS  NC_009513  108608  109618  -  1011  LacI family transcription regulator  YP_001270700  unclonable  0.00000000000127052  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0089  CDS  NC_009513  109757  111163  -  1407  RNA methyltransferase  YP_001270701  hitchhiker  0.00000133484  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0090  CDS  NC_009513  111380  111991  +  612  NADPH-dependent FMN reductase  YP_001270702  hitchhiker  0.000000795412  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0091  CDS  NC_009513  111991  113241  +  1251  NADPH-dependent FMN reductase  YP_001270703  hitchhiker  0.0000000139902  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0092  CDS  NC_009513  113244  114170  +  927  ApbE family lipoprotein  YP_001270704  hitchhiker  0.0025456  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0093  CDS  NC_009513  114668  116050  +  1383  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  YP_001270705  normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0095    NC_009513  116315  120965  +  4651      normal  1  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0097  CDS  NC_009513  121729  123036  +  1308  seryl-tRNA synthetase  YP_001270706  decreased coverage  0.00000000017376  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0098  CDS  NC_009513  123305  124768  +  1464  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  YP_001270707  decreased coverage  0.000000000321849  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0099  CDS  NC_009513  124770  125513  +  744  ABC transporter related  YP_001270708  hitchhiker  0.0000131657  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0100  CDS  NC_009513  125817  127166  +  1350  amino acid permease-associated region  YP_001270709  hitchhiker  0.0000148817  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0101  CDS  NC_009513  128117  129328  +  1212  Na+ dependent nucleoside transporter  YP_001270710  hitchhiker  0.0000176042  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Lreu_0102  CDS  NC_009513  129409  130317  +  909  ribonucleoside hydrolase RihC  YP_001270711  hitchhiker  0.0000159714  n/a    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 21    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>