2465 genes were found for organism Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 25    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Hneap_0001  CDS  NC_013422  150  1559  +  1410  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_003261914  decreased coverage  0.000259143  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0002  CDS  NC_013422  1623  2735  +  1113  DNA polymerase III, beta subunit  YP_003261915  decreased coverage  0.00017376  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0003  CDS  NC_013422  2761  3840  +  1080  DNA replication and repair protein RecF  YP_003261916  hitchhiker  0.00348761  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0004  CDS  NC_013422  4029  6482  +  2454  DNA gyrase, B subunit  YP_003261917  normal  0.127407  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0005  CDS  NC_013422  6658  7233  +  576  LemA family protein  YP_003261918  normal  0.141685  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0006  CDS  NC_013422  7248  8171  +  924  hypothetical protein  YP_003261919  normal  0.494318  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0007  CDS  NC_013422  8681  9454  +  774  exodeoxyribonuclease III Xth  YP_003261920  normal  0.645227  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0008  CDS  NC_013422  9655  12165  -  2511  protein of unknown function DUF214  YP_003261921  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0009  CDS  NC_013422  12156  12857  -  702  ABC transporter related protein  YP_003261922  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0010  CDS  NC_013422  13056  13742  +  687  Arylesterase  YP_003261923  normal  0.939172  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0011  CDS  NC_013422  14129  14500  -  372  protein of unknown function DUF559  YP_003261924  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0012  CDS  NC_013422  14569  15519  -  951  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  YP_003261925  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0013  CDS  NC_013422  16436  16546  -  111  hypothetical protein  YP_003261926  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0014  CDS  NC_013422  16642  17178  -  537  type IV pilin structural subunit  YP_003261927  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0015  CDS  NC_013422  17753  18331  +  579  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  YP_003261928  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0016  CDS  NC_013422  18315  18794  +  480  type IV pilus modification protein PilV  YP_003261929  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0017  CDS  NC_013422  18791  19822  +  1032  hypothetical protein  YP_003261930  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0018  CDS  NC_013422  20011  20643  +  633  putative Tfp pilus assembly protein  YP_003261931  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0019  CDS  NC_013422  20656  24519  +  3864  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilY1  YP_003261932  normal  0.582284  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0020  CDS  NC_013422  24658  25152  +  495  PilE protein  YP_003261933  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0021  CDS  NC_013422  25490  26074  +  585  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  YP_003261934  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0022  CDS  NC_013422  26258  26629  +  372  protein of unknown function DUF559  YP_003261935  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0023  CDS  NC_013422  26749  26856  +  108  hypothetical protein  YP_003261936  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0024  CDS  NC_013422  26886  29708  -  2823  excinuclease ABC, A subunit  YP_003261937  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0025  CDS  NC_013422  29824  30381  +  558  single-strand binding protein  YP_003261938  normal  0.326087  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0026  CDS  NC_013422  30592  32391  -  1800  gamma-glutamyltransferase  YP_003261939  normal  0.165843  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0027  CDS  NC_013422  32408  33346  -  939  protein of unknown function DUF519  YP_003261940  normal  0.0764421  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0028  CDS  NC_013422  33737  34285  +  549  phosphodiesterase, MJ0936 family  YP_003261941  normal  0.54449  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0029  CDS  NC_013422  34356  35618  +  1263  Ketohexokinase  YP_003261942  normal  0.892362  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0030  CDS  NC_013422  35755  38121  +  2367  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  YP_003261943  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0031  CDS  NC_013422  38154  38462  +  309  BolA family protein  YP_003261944  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0032  CDS  NC_013422  38491  39528  +  1038  putative signal transduction protein  YP_003261945  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0033  CDS  NC_013422  39572  41770  -  2199  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  YP_003261946  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0034  CDS  NC_013422  41772  42095  -  324  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  YP_003261947  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0035  CDS  NC_013422  42146  42775  -  630  guanylate kinase  YP_003261948  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0036  CDS  NC_013422  42782  43396  -  615  hypothetical protein  YP_003261949  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0037  CDS  NC_013422  43484  43954  -  471  17 kDa surface antigen  YP_003261950  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0038  CDS  NC_013422  44187  44936  +  750  Integral membrane protein TerC  YP_003261951  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0039  CDS  NC_013422  44946  45716  -  771  exodeoxyribonuclease III Xth  YP_003261952  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0040  CDS  NC_013422  46091  47545  -  1455  protease Do  YP_003261953  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0041  CDS  NC_013422  47739  48017  +  279  hypothetical protein  YP_003261954  normal  0.49573  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0042  CDS  NC_013422  48154  50388  +  2235  Alkaline phosphatase  YP_003261955  normal  0.107501  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0043  CDS  NC_013422  50405  51196  -  792  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  YP_003261956  normal  0.58574  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0044  CDS  NC_013422  51408  52196  -  789  molybdopterin binding domain protein  YP_003261957  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0045  CDS  NC_013422  52193  53305  -  1113  ferrochelatase  YP_003261958  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0046  CDS  NC_013422  53431  54390  +  960  thioredoxin reductase  YP_003261959  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0047  CDS  NC_013422  54484  54804  +  321  hypothetical protein  YP_003261960  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0048  CDS  NC_013422  54801  55673  +  873  hypothetical protein  YP_003261961  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0049  CDS  NC_013422  55687  56304  -  618  metal dependent phosphohydrolase  YP_003261962  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0050  CDS  NC_013422  56333  57763  -  1431  deoxyguanosinetriphosphate triphosphohydrolase  YP_003261963  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0051  CDS  NC_013422  57863  58720  +  858  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  YP_003261964  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0052  CDS  NC_013422  58846  60408  +  1563  phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase  YP_003261965  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0053  CDS  NC_013422  60466  62061  +  1596  protein of unknown function DUF195  YP_003261966  normal  0.783995  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0054  CDS  NC_013422  62045  62242  -  198  hypothetical protein  YP_003261967  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0055  CDS  NC_013422  62254  63108  -  855  metallophosphoesterase  YP_003261968  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0056  CDS  NC_013422  63522  63998  +  477  hypothetical protein  YP_003261969  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0057  CDS  NC_013422  64169  64549  +  381  hypothetical protein  YP_003261970  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0058  CDS  NC_013422  64622  67444  +  2823  (Glutamate--ammonia-ligase) adenylyltransferase  YP_003261971  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0059  CDS  NC_013422  67499  67957  +  459  protein of unknown function DUF188  YP_003261972  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0060  CDS  NC_013422  68056  68586  +  531  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  YP_003261973  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0061  CDS  NC_013422  68944  69192  +  249  phosphopantetheine-binding protein  YP_003261974  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0062  CDS  NC_013422  69189  70436  +  1248  Beta-ketoacyl synthase  YP_003261975  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0063  CDS  NC_013422  70516  70800  +  285  acyl carrier protein  YP_003261976  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0064  CDS  NC_013422  70809  71507  +  699  membrane protein-like protein  YP_003261977  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0065  CDS  NC_013422  71516  73297  +  1782  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_003261978  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0066  CDS  NC_013422  73294  74238  +  945  lipid A biosynthesis acyltransferase  YP_003261979  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0067  CDS  NC_013422  74238  74837  +  600  hypothetical protein  YP_003261980  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0068  CDS  NC_013422  74834  77248  +  2415  MMPL domain protein  YP_003261981  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0069  CDS  NC_013422  77245  77697  +  453  hypothetical protein  YP_003261982  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0070  CDS  NC_013422  77721  77927  -  207  hypothetical protein  YP_003261983  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0071  CDS  NC_013422  78057  79043  +  987  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding protein  YP_003261984  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0072  CDS  NC_013422  79194  79484  +  291  type IV pilus assembly PilZ  YP_003261985  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0073  CDS  NC_013422  79586  80446  -  861  glutamate racemase  YP_003261986  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0074  CDS  NC_013422  80598  80861  -  264  addiction module toxin, Txe/YoeB family  YP_003261987  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0075  CDS  NC_013422  80858  81100  -  243  prevent-host-death family protein  YP_003261988  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0076    NC_013422  81147  81383  -  237      normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0077  CDS  NC_013422  81463  81732  -  270  hypothetical protein  YP_003261989  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0078  CDS  NC_013422  81722  81817  -  96  hypothetical protein  YP_003261990  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0079  CDS  NC_013422  82067  82297  -  231  hypothetical protein  YP_003261991  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0080  CDS  NC_013422  82401  82859  -  459  hypothetical protein  YP_003261992  normal  0.670006  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0081  CDS  NC_013422  82918  83169  -  252  hypothetical protein  YP_003261993  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0082  CDS  NC_013422  83197  83307  -  111  hypothetical protein  YP_003261994  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0083  CDS  NC_013422  83541  83720  +  180  hypothetical protein  YP_003261995  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0084  CDS  NC_013422  83787  83966  +  180  hypothetical protein  YP_003261996  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0085  CDS  NC_013422  84404  84736  -  333  hypothetical protein  YP_003261997  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0086  CDS  NC_013422  84810  85118  -  309  hypothetical protein  YP_003261998  normal  0.584541  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0087  CDS  NC_013422  85145  85255  -  111  hypothetical protein  YP_003261999  normal  0.701079  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0088  CDS  NC_013422  85475  86020  -  546  putative yfeABCD locus regulator  YP_003262000  normal  0.936462  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0089  CDS  NC_013422  86050  86634  -  585  ATPase  YP_003262001  normal  1  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0090  CDS  NC_013422  86936  87046  -  111  hypothetical protein  YP_003262002  normal  0.868132  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0091  CDS  NC_013422  87208  87318  -  111  hypothetical protein  YP_003262003  normal  0.591128  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0092  CDS  NC_013422  87553  87843  -  291  protein of unknown function DUF1330  YP_003262004  normal  0.273128  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0093  CDS  NC_013422  87840  88214  -  375  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_003262005  normal  0.293997  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0094  CDS  NC_013422  88585  89196  -  612  cation efflux protein  YP_003262006  normal  0.19773  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0095  CDS  NC_013422  89303  89722  -  420  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_003262007  normal  0.0938241  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0096  CDS  NC_013422  90138  90461  -  324  hypothetical protein  YP_003262008  normal  0.0395459  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0097  CDS  NC_013422  90867  91082  -  216  hypothetical protein  YP_003262009  normal  0.0748733  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0098  CDS  NC_013422  91085  91495  -  411  putative mercury transport protein MerC  YP_003262010  normal  0.0957231  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0099  CDS  NC_013422  91540  91896  -  357  hypothetical protein  YP_003262011  normal  0.102256  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Hneap_0100  CDS  NC_013422  91913  92266  -  354  hypothetical protein  YP_003262012  normal  0.189126  n/a    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 25    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>