40 genes were found for organism Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
GYMC61_3563  CDS  NC_013412  225  1424  1200  Formyl-CoA transferase  YP_003254590  normal  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3564  CDS  NC_013412  1454  2338  885  pyruvate carboxyltransferase  YP_003254591  normal  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3565    NC_013412  2450  2932  483      normal  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3566  CDS  NC_013412  3144  4331  1188  transposase IS4 family protein  YP_003254592  normal  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3567  CDS  NC_013412  5060  6493  1434  isopropylmalate isomerase large subunit  YP_003254593  normal  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3568  CDS  NC_013412  6490  7101  612  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  YP_003254594  normal  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3569  CDS  NC_013412  7271  9031  1761  transposase IS4 family protein  YP_003254595  normal  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3570  CDS  NC_013412  9288  10085  798  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_003254596  hitchhiker  0.00412685  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3571  CDS  NC_013412  10069  10362  294  hypothetical protein  YP_003254597  hitchhiker  0.000368245  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3572  CDS  NC_013412  10452  11564  1113  DNA-cytosine methyltransferase  YP_003254598  unclonable  0.0000000000674254  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3573  CDS  NC_013412  11723  13354  1632  Restriction endonuclease, type II, AlwI  YP_003254599  unclonable  0.000000000573232  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3574  CDS  NC_013412  13347  13751  405  hypothetical protein  YP_003254600  hitchhiker  0.00000385943  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3575  CDS  NC_013412  13936  14361  426  DNA mismatch endonuclease Vsr  YP_003254601  hitchhiker  0.0000168268  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3576  CDS  NC_013412  15360  16679  1320  replication protein  YP_003254602  normal  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3577  CDS  NC_013412  17402  17623  222  hypothetical protein  YP_003254603  normal  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3578  CDS  NC_013412  17710  18555  846  beta-lactamase domain protein  YP_003254604  normal  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3579  CDS  NC_013412  18566  18781  216  hypothetical protein  YP_003254605  normal  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3580  CDS  NC_013412  19537  19863  327  hypothetical protein  YP_003254606  normal  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3581  CDS  NC_013412  20240  21643  1404  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  YP_003254607  normal  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3582  CDS  NC_013412  21871  22986  1116  protein of unknown function DUF917  YP_003254608  normal  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3583  CDS  NC_013412  22990  24381  1392  Hydantoinaseoxoprolinase domain protein  YP_003254609  normal  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3584  CDS  NC_013412  24457  25773  1317  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  YP_003254610  normal  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3585  CDS  NC_013412  25790  26887  1098  protein of unknown function DUF917  YP_003254611  normal  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3586  CDS  NC_013412  26884  28443  1560  Hydantoinase/oxoprolinase  YP_003254612  normal  0.0167077  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3587  CDS  NC_013412  28716  29630  915  integrase family protein  YP_003254613  decreased coverage  0.00000000515843  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3588  CDS  NC_013412  30226  31377  1152  initiator RepB protein  YP_003254614  hitchhiker  0.000000240112  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3589  CDS  NC_013412  31901  32386  486  hypothetical protein  YP_003254615  normal  0.0141626  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3590  CDS  NC_013412  32383  32952  570  integrase family protein  YP_003254616  normal  0.0592429  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3591  CDS  NC_013412  33134  33604  471  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  YP_003254617  normal  0.0129413  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3592  CDS  NC_013412  33624  33770  147  hypothetical protein  YP_003254618  normal  0.0186043  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3593  CDS  NC_013412  33834  34046  213  hypothetical protein  YP_003254619  normal  0.0118946  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3594  CDS  NC_013412  34064  34285  222  hypothetical protein  YP_003254620  hitchhiker  0.00276008  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3595  CDS  NC_013412  34427  34957  531  hypothetical protein  YP_003254621  hitchhiker  0.00349164  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3596  CDS  NC_013412  35105  36292  1188  transposase IS4 family protein  YP_003254622  decreased coverage  0.00000661029  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3597  CDS  NC_013412  36653  37060  408  CopG domain protein DNA-binding domain protein  YP_003254623  hitchhiker  0.0000464455  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3598  CDS  NC_013412  37251  39170  1920  proprionate catabolism activator, Fis family  YP_003254624  hitchhiker  0.00055082  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3599  CDS  NC_013412  39485  40363  879  transposase IS4 family protein  YP_003254625  normal  0.0109745  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3600  CDS  NC_013412  40560  41186  627  isochorismatase hydrolase  YP_003254626  normal  0.572531  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3601  CDS  NC_013412  41213  43261  2049  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  YP_003254627  normal  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
GYMC61_3602  CDS  NC_013412  43264  45057  1794  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  YP_003254628  normal  n/a    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>