5358 genes were found for organism Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 54    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Vapar_0001  CDS  NC_012791  37  1416  +  1380  chromosomal replication initiation protein  YP_002941930  normal  0.0624121  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0002  CDS  NC_012791  1506  2612  +  1107  DNA polymerase III, beta subunit  YP_002941931  normal  0.0185617  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0003  CDS  NC_012791  2747  5371  +  2625  DNA gyrase, B subunit  YP_002941932  normal  0.202809  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0004  CDS  NC_012791  5659  6645  +  987  hypothetical protein  YP_002941933  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0005  CDS  NC_012791  6745  7032  -  288  hypothetical protein  YP_002941934  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0006  CDS  NC_012791  7335  7847  +  513  hypothetical protein  YP_002941935  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0007  CDS  NC_012791  7977  8465  +  489  hypothetical protein  YP_002941936  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0008  CDS  NC_012791  8597  9844  +  1248  metallophosphoesterase  YP_002941937  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0009  CDS  NC_012791  9860  10360  -  501  hypothetical protein  YP_002941938  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0010  CDS  NC_012791  10565  11140  +  576  hypothetical protein  YP_002941939  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0011  CDS  NC_012791  11137  12108  -  972  hypothetical protein  YP_002941940  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0012  CDS  NC_012791  12105  13373  -  1269  cardiolipin synthase 2  YP_002941941  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0013  CDS  NC_012791  13407  14135  -  729  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  YP_002941942  normal  0.914403  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0014  CDS  NC_012791  14401  14829  +  429  serine/threonine kinase  YP_002941943  normal  0.303718  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0015  CDS  NC_012791  14922  15500  -  579  protein of unknown function DUF1520  YP_002941944  normal  0.0335707  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0016  CDS  NC_012791  15650  16741  -  1092  NADPH-dependent FMN reductase  YP_002941945  normal  0.0120399  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0017  CDS  NC_012791  16817  17716  -  900  Pirin domain protein  YP_002941946  hitchhiker  0.00905247  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0018  CDS  NC_012791  17773  18525  -  753  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_002941947  normal  0.0181113  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0019  CDS  NC_012791  18522  19796  -  1275  glycosyl transferase family 51  YP_002941948  decreased coverage  0.00362252  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0020  CDS  NC_012791  19807  20376  -  570  hypothetical protein  YP_002941949  decreased coverage  0.00154703  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0021  CDS  NC_012791  20357  21286  -  930  hypothetical protein  YP_002941950  hitchhiker  0.00770996  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0022  CDS  NC_012791  21305  23380  -  2076  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  YP_002941951  normal  0.112667  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0023  CDS  NC_012791  23591  25072  +  1482  hypothetical protein  YP_002941952  normal  0.885389  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0024  CDS  NC_012791  25121  27529  +  2409  penicillin-binding protein, 1A family  YP_002941953  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0025  CDS  NC_012791  27609  28214  +  606  hypothetical protein  YP_002941954  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0026  CDS  NC_012791  28221  29663  -  1443  sensory histidine kinase CreC  YP_002941955  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0027  CDS  NC_012791  29660  30442  -  783  two component transcriptional regulator, winged helix family  YP_002941956  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0028  CDS  NC_012791  31014  31973  +  960  hypothetical protein  YP_002941957  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0029  CDS  NC_012791  31986  32390  -  405  transcriptional regulator, MerR family  YP_002941958  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0030  CDS  NC_012791  32387  32581  -  195  Heavy metal transport/detoxification protein  YP_002941959  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0031  CDS  NC_012791  32717  34960  +  2244  heavy metal translocating P-type ATPase  YP_002941960  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0032  CDS  NC_012791  34974  35456  -  483  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_002941961  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0033  CDS  NC_012791  35524  36750  -  1227  Beta-ketoacyl synthase  YP_002941962  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0034  CDS  NC_012791  36747  37049  -  303  phosphopantetheine-binding  YP_002941963  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0035  CDS  NC_012791  37067  37945  -  879  hypothetical protein  YP_002941964  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0036  CDS  NC_012791  38088  38777  +  690  two component transcriptional regulator, winged helix family  YP_002941965  normal  0.796207  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0037  CDS  NC_012791  38774  40186  +  1413  histidine kinase  YP_002941966  normal  0.365028  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0038  CDS  NC_012791  40183  40668  -  486  Endoribonuclease L-PSP  YP_002941967  normal  0.491451  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0039  CDS  NC_012791  40691  41794  -  1104  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  YP_002941968  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0040  CDS  NC_012791  41879  43729  -  1851  protein of unknown function DUF1446  YP_002941969  normal  0.479807  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0041  CDS  NC_012791  43726  44517  -  792  enoyl-CoA hydratase  YP_002941970  normal  0.917664  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0042  CDS  NC_012791  44670  45278  -  609  Glutathione S-transferase domain protein  YP_002941971  normal  0.241664  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0043  CDS  NC_012791  45467  45652  +  186  hypothetical protein  YP_002941972  normal  0.287455  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0044  CDS  NC_012791  45652  45798  +  147  hypothetical protein  YP_002941973  normal  0.667805  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0045  CDS  NC_012791  45983  47941  +  1959  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  YP_002941974  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0046  CDS  NC_012791  47938  48579  +  642  16S rRNA methyltransferase GidB  YP_002941975  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0047  CDS  NC_012791  48695  49309  +  615  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  YP_002941976  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0048  CDS  NC_012791  49317  50231  +  915  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_002941977  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0049  CDS  NC_012791  50231  50782  +  552  protein of unknown function DUF1234  YP_002941978  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0050  CDS  NC_012791  50782  51729  +  948  parB-like partition protein  YP_002941979  normal  0.99928  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0051  CDS  NC_012791  51838  52737  +  900  peptidoglycan-binding domain 1 protein  YP_002941980  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0052  CDS  NC_012791  52820  54244  -  1425  FAD linked oxidase domain protein  YP_002941981  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0053  CDS  NC_012791  54331  54837  +  507  hypothetical protein  YP_002941982  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0054  CDS  NC_012791  54854  55462  +  609  ATP/cobalamin adenosyltransferase  YP_002941983  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0055  CDS  NC_012791  55459  55827  +  369  hypothetical protein  YP_002941984  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0056  CDS  NC_012791  56158  56676  +  519  adenylate cyclase  YP_002941985  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0057  CDS  NC_012791  56686  57324  -  639  lipolytic protein G-D-S-L family  YP_002941986  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0058  CDS  NC_012791  57338  57520  -  183  hypothetical protein  YP_002941987  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0059  CDS  NC_012791  57699  58130  +  432  hypothetical protein  YP_002941988  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0060  CDS  NC_012791  58150  58410  -  261  hypothetical protein  YP_002941989  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0061  CDS  NC_012791  58525  59469  -  945  transcriptional regulator, LysR family  YP_002941990  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0062  CDS  NC_012791  59665  60267  +  603  transcriptional regulator, TetR family  YP_002941991  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0063  CDS  NC_012791  60346  60459  +  114  hypothetical protein  YP_002941992  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0064  CDS  NC_012791  60477  61394  +  918  hypothetical protein  YP_002941993  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0065  CDS  NC_012791  61452  61730  -  279  cell division topological specificity factor MinE  YP_002941994  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0066  CDS  NC_012791  61734  62549  -  816  septum site-determining protein MinD  YP_002941995  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0067  CDS  NC_012791  62605  63378  -  774  septum site-determining protein MinC  YP_002941996  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0068  CDS  NC_012791  63500  64786  -  1287  uracil-xanthine permease  YP_002941997  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0069  CDS  NC_012791  64882  65304  -  423  thioesterase superfamily protein  YP_002941998  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0070  CDS  NC_012791  65388  66728  +  1341  hypothetical protein  YP_002941999  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0071  CDS  NC_012791  66743  68560  -  1818  feruloyl-CoA synthase  YP_002942000  normal  0.687661  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0072  CDS  NC_012791  68562  69503  -  942  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  YP_002942001  normal  0.867637  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0073  CDS  NC_012791  69514  70506  -  993  hypothetical protein  YP_002942002  normal  0.614615  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0074  CDS  NC_012791  70530  71456  -  927  protein of unknown function DUF849  YP_002942003  normal  0.860524  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0075  CDS  NC_012791  71588  72298  +  711  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  YP_002942004  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0076  CDS  NC_012791  72342  74144  -  1803  putative potassium transport flavoprotein  YP_002942005  normal  0.6979  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0077  CDS  NC_012791  74348  76294  -  1947  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  YP_002942006  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0078  CDS  NC_012791  76439  76660  -  222  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  YP_002942007  normal  0.678819  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0079  CDS  NC_012791  76671  77411  -  741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_002942008  normal  0.596846  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0080  CDS  NC_012791  77523  78434  +  912  transcriptional regulator, LysR family  YP_002942009  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0081  CDS  NC_012791  78447  80357  -  1911  Tannase and feruloyl esterase  YP_002942010  normal  0.369493  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0082  CDS  NC_012791  80466  81344  -  879  transcriptional regulator, AraC family  YP_002942011  normal  0.628575  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0083  CDS  NC_012791  81372  82073  -  702  ABC transporter related  YP_002942012  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0084  CDS  NC_012791  82075  82821  -  747  ABC transporter related  YP_002942013  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0085  CDS  NC_012791  82961  83935  -  975  inner-membrane translocator  YP_002942014  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0086  CDS  NC_012791  83932  84804  -  873  inner-membrane translocator  YP_002942015  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0087  CDS  NC_012791  84960  86144  -  1185  Extracellular ligand-binding receptor  YP_002942016  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0088  CDS  NC_012791  86141  86944  -  804  alpha/beta hydrolase fold protein  YP_002942017  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0089  CDS  NC_012791  87084  88631  -  1548  benzoate-CoA ligase family  YP_002942018  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0090  CDS  NC_012791  88660  90210  -  1551  aldehyde dehydrogenase  YP_002942019  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0091  CDS  NC_012791  90207  90680  -  474  hypothetical protein  YP_002942020  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0092  CDS  NC_012791  90881  91831  +  951  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  YP_002942021  normal  1  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0093  CDS  NC_012791  91961  93637  +  1677  benzoyl-CoA-dihydrodiol lyase  YP_002942022  normal  0.918758  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0094  CDS  NC_012791  93679  95106  +  1428  benzoyl-CoA oxygenase, B subunit  YP_002942023  normal  0.606518  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0095  CDS  NC_012791  95235  96521  +  1287  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  YP_002942024  normal  0.841388  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0096  CDS  NC_012791  96532  96975  +  444  MaoC domain protein dehydratase  YP_002942025  normal  0.793561  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0097  CDS  NC_012791  97027  97566  -  540  putative outer membrane adhesin like proteiin  YP_002942026  normal  0.889087  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0098  CDS  NC_012791  97818  98279  +  462  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  YP_002942027  normal  0.35302  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0099  CDS  NC_012791  98269  99177  +  909  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_002942028  normal  0.306887  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Vapar_0100  CDS  NC_012791  99370  100695  -  1326  fumarylacetoacetase  YP_002942029  normal  0.56864  n/a    Variovorax paradoxus S110  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 54    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>