3609 genes were found for organism Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 37    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Dtpsy_0001  CDS  NC_011992  70  1491  1422  chromosomal replication initiation protein  YP_002551490  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0002  CDS  NC_011992  1636  2742  1107  DNA polymerase III, beta subunit  YP_002551491  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0003  CDS  NC_011992  2860  5466  2607  DNA gyrase, B subunit  YP_002551492  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0004  CDS  NC_011992  5621  5854  234  hypothetical protein  YP_002551493  normal  0.83091  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0005  CDS  NC_011992  6024  6545  522  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_002551494  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0006  CDS  NC_011992  6542  6955  414  protein of unknown function UPF0153  YP_002551495  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0007  CDS  NC_011992  7062  7499  438  OsmC family protein  YP_002551496  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0008  CDS  NC_011992  7511  8275  765  protein of unknown function DUF72  YP_002551497  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0009  CDS  NC_011992  8362  8655  294  acylphosphatase  YP_002551498  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0010  CDS  NC_011992  8696  8929  234  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  YP_002551499  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0011  CDS  NC_011992  8991  10586  1596  Gamma-glutamyltransferase  YP_002551500  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0012  CDS  NC_011992  10940  12358  1419  homoserine dehydrogenase  YP_002551501  normal  0.728091  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0013  CDS  NC_011992  12411  12719  309  hypothetical protein  YP_002551502  normal  0.370292  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0014  CDS  NC_011992  12968  15157  2190  ATP-dependent DNA helicase DinG  YP_002551503  normal  0.11513  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0015  CDS  NC_011992  15342  15539  198  hypothetical protein  YP_002551504  normal  0.240004  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0016  CDS  NC_011992  15687  16343  657  DNA-directed DNA polymerase  YP_002551505  normal  0.169701  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0017  CDS  NC_011992  16551  17057  507  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  YP_002551506  normal  0.0687493  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0018  CDS  NC_011992  17352  18680  1329  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  YP_002551507  normal  0.316764  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0019  CDS  NC_011992  18899  19381  483  NLP/P60 protein  YP_002551508  normal  0.0865382  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0020  CDS  NC_011992  19509  20609  1101  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  YP_002551509  normal  0.0655801  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0021  CDS  NC_011992  20851  24528  3678  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  YP_002551510  normal  0.363406  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0022  CDS  NC_011992  24586  25389  804  transcriptional regulator, IclR family  YP_002551511  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0023  CDS  NC_011992  25632  26603  972  hypothetical protein  YP_002551512  normal  0.908143  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0024  CDS  NC_011992  26942  27547  606  hypothetical protein  YP_002551513  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0025  CDS  NC_011992  27674  28303  630  protein of unknown function DUF1520  YP_002551514  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0026  CDS  NC_011992  28616  29593  978  recombination associated protein  YP_002551515  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0027  CDS  NC_011992  29663  31015  1353  sodium:dicarboxylate symporter  YP_002551516  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0028  CDS  NC_011992  31185  33839  2655  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  YP_002551517  normal  0.465168  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0029  CDS  NC_011992  33910  34554  645  two component transcriptional regulator, LuxR family  YP_002551518  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0030  CDS  NC_011992  34609  35862  1254  nucleoside recognition domain protein  YP_002551519  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0031  CDS  NC_011992  36339  36641  303  hypothetical protein  YP_002551520  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0032  CDS  NC_011992  36938  38125  1188  beta-ketothiolase  YP_002551521  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0033  CDS  NC_011992  38122  38673  552  protein of unknown function DUF1130  YP_002551522  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0034  CDS  NC_011992  38686  38901  216  hypothetical protein  YP_002551523  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0035  CDS  NC_011992  39013  39516  504  transcriptional regulator, MerR family  YP_002551524  normal  0.987448  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0036  CDS  NC_011992  39513  39710  198  Heavy metal transport/detoxification protein  YP_002551525  normal  0.749635  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0037  CDS  NC_011992  39889  42237  2349  heavy metal translocating P-type ATPase  YP_002551526  normal  0.374671  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0038  CDS  NC_011992  42422  44074  1653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_002551527  normal  0.398829  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0039  CDS  NC_011992  44261  45010  750  protein of unknown function DUF81  YP_002551528  normal  0.162734  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0040  CDS  NC_011992  45165  46289  1125  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  YP_002551529  normal  0.177424  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0041  CDS  NC_011992  46360  46545  186  hypothetical protein  YP_002551530  normal  0.145803  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0042  CDS  NC_011992  46553  47161  609  Glutathione S-transferase domain protein  YP_002551531  normal  0.245539  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0043  CDS  NC_011992  47296  47562  267  protein of unknown function UPF0153  YP_002551532  normal  0.526455  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0044  CDS  NC_011992  47628  48212  585  NADPH-dependent FMN reductase  YP_002551533  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0045  CDS  NC_011992  48425  50398  1974  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  YP_002551534  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0046  CDS  NC_011992  50395  51075  681  16S rRNA methyltransferase GidB  YP_002551535  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0047  CDS  NC_011992  51110  51724  615  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  YP_002551536  normal  0.743196  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0048  CDS  NC_011992  51741  52511  771  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_002551537  normal  0.627572  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0049  CDS  NC_011992  52598  53140  543  protein of unknown function DUF1234  YP_002551538  normal  0.47324  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0050  CDS  NC_011992  53147  54142  996  parB-like partition protein  YP_002551539  normal  0.383845  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0051  CDS  NC_011992  54168  54965  798  methyltransferase type 12  YP_002551540  normal  0.139499  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0052  CDS  NC_011992  55131  56171  1041  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  YP_002551541  normal  0.246037  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0053  CDS  NC_011992  56416  57132  717  hypothetical protein  YP_002551542  normal  0.498454  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0054  CDS  NC_011992  57198  58118  921  transcriptional regulator, AraC family  YP_002551543  normal  0.354122  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0055  CDS  NC_011992  58178  59425  1248  major facilitator superfamily MFS_1  YP_002551544  normal  0.628299  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0056  CDS  NC_011992  59741  60484  744  ChaC family protein  YP_002551545  normal  0.857973  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0057  CDS  NC_011992  60623  61225  603  flavoprotein WrbA  YP_002551546  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0058  CDS  NC_011992  62519  62827  309  CRISPR-associated protein Cas2  YP_002551547  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0059  CDS  NC_011992  62864  63772  909  protein of unknown function DUF48  YP_002551548  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0060  CDS  NC_011992  63759  67154  3396  CRISPR-associated protein, Csn1 family  YP_002551549  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0061  CDS  NC_011992  67350  68774  1425  FAD linked oxidase domain protein  YP_002551550  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0062  CDS  NC_011992  69026  69406  381  calcium-binding EF-hand-containing protein  YP_002551551  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0063  CDS  NC_011992  69562  70134  573  ATP/cobalamin adenosyltransferase  YP_002551552  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0064  CDS  NC_011992  70493  70915  423  thioesterase superfamily protein  YP_002551553  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0065  CDS  NC_011992  71139  72296  1158  Extracellular ligand-binding receptor  YP_002551554  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0066  CDS  NC_011992  72543  74063  1521  succinate CoA transferase  YP_002551555  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0067  CDS  NC_011992  74263  74994  732  hypothetical protein  YP_002551556  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0068  CDS  NC_011992  75130  76416  1287  uracil-xanthine permease  YP_002551557  normal  0.305614  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0069  CDS  NC_011992  76619  77917  1299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  YP_002551558  normal  0.633184  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0070  CDS  NC_011992  78014  79921  1908  Radical SAM domain protein  YP_002551559  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0071  CDS  NC_011992  80000  81010  1011  diguanylate cyclase with GAF sensor  YP_002551560  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0072  CDS  NC_011992  81098  82363  1266  hypothetical protein  YP_002551561  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0073  CDS  NC_011992  82536  82775  240  hypothetical protein  YP_002551562  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0074  CDS  NC_011992  82917  85004  2088  acetoacetyl-CoA synthetase  YP_002551563  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0075    NC_011992  85204  85517  314      normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0076  CDS  NC_011992  85523  86431  909  transcriptional regulator, LysR family  YP_002551564  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0077  CDS  NC_011992  86480  87709  1230  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  YP_002551565  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0078  CDS  NC_011992  87722  88813  1092  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  YP_002551566  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0079  CDS  NC_011992  88810  89952  1143  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  YP_002551567  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0080  CDS  NC_011992  89962  90762  801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  YP_002551568  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0081  CDS  NC_011992  90968  91948  981  hypothetical protein  YP_002551569  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0082    NC_011992  92017  92358  342      normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0083  CDS  NC_011992  92416  93039  624  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  YP_002551570  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0084  CDS  NC_011992  93269  94036  768  septum site-determining protein MinC  YP_002551571  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0085  CDS  NC_011992  94090  94905  816  septum site-determining protein MinD  YP_002551572  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0086  CDS  NC_011992  94911  95177  267  cell division topological specificity factor MinE  YP_002551573  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0087  CDS  NC_011992  95254  95814  561  flavin reductase domain protein FMN-binding  YP_002551574  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0088  CDS  NC_011992  95923  96705  783  alpha/beta hydrolase fold protein  YP_002551575  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0089  CDS  NC_011992  96844  98034  1191  Extracellular ligand-binding receptor  YP_002551576  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0090  CDS  NC_011992  98047  99387  1341  D-amino-acid dehydrogenase  YP_002551577  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0091  CDS  NC_011992  99475  100386  912  chromosome replication initiation inhibitor protein  YP_002551578  normal  0.730131  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0092  CDS  NC_011992  100457  101089  633  transcriptional regulator, TetR family  YP_002551579  normal  0.367108  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0093  CDS  NC_011992  101090  101512  423  UspA domain protein  YP_002551580  normal  0.29194  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0094  CDS  NC_011992  101625  102470  846  metallophosphoesterase  YP_002551581  normal  0.296609  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0095  CDS  NC_011992  102487  103458  972  transcriptional regulator, LysR family  YP_002551582  normal  0.329429  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0096  CDS  NC_011992  103582  104022  441  hypothetical protein  YP_002551583  normal  0.937756  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0097  CDS  NC_011992  104202  106073  1872  phosphoenolpyruvate carboxykinase  YP_002551584  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0098  CDS  NC_011992  106408  106569  162  hypothetical protein  YP_002551585  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0099  CDS  NC_011992  106677  107876  1200  threonine dehydratase  YP_002551586  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Dtpsy_0100  CDS  NC_011992  107988  109643  1656  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  YP_002551587  normal  n/a    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 37    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>