5002 genes were found for organism Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 51    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Gbro_0001  CDS  NC_013441  333  1862  1530  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_003271255  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0002  CDS  NC_013441  2449  3615  1167  DNA polymerase III, beta subunit  YP_003271256  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0003  CDS  NC_013441  3643  4836  1194  DNA replication and repair protein RecF  YP_003271257  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0004  CDS  NC_013441  4856  5410  555  protein of unknown function DUF721  YP_003271258  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0005  CDS  NC_013441  5755  7812  2058  DNA gyrase, B subunit  YP_003271259  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0006  CDS  NC_013441  7861  10344  2484  DNA gyrase, A subunit  YP_003271260  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0007  CDS  NC_013441  10530  11480  951  hypothetical protein  YP_003271261  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0008  CDS  NC_013441  12075  12665  591  hypothetical protein  YP_003271262  normal  0.462788  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0009  CDS  NC_013441  12781  14352  1572  Integrase catalytic region  YP_003271263  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0010  CDS  NC_013441  14309  15571  1263  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  YP_003271264  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0011    NC_013441  15796  16565  770      normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0012    NC_013441  16605  16946  342      normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0013  CDS  NC_013441  17010  18200  1191  hypothetical protein  YP_003271265  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0014  CDS  NC_013441  18197  18679  483  hypothetical protein  YP_003271266  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0015  CDS  NC_013441  18750  19400  651  hypothetical protein  YP_003271267  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0016  CDS  NC_013441  19510  19977  468  hypothetical protein  YP_003271268  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0017  CDS  NC_013441  20012  20218  207  hypothetical protein  YP_003271269  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0018  CDS  NC_013441  20659  20835  177  hypothetical protein  YP_003271270  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0019  CDS  NC_013441  21232  21402  171  hypothetical protein  YP_003271271  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0020  CDS  NC_013441  21497  22018  522  Peptidylprolyl isomerase  YP_003271272  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0021  CDS  NC_013441  22037  22948  912  Rhomboid family protein  YP_003271273  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0022  CDS  NC_013441  22961  23455  495  hypothetical protein  YP_003271274  normal  0.70725  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0023  CDS  NC_013441  23537  23827  291  protein of unknown function UPF0233  YP_003271275  normal  0.245647  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0024  CDS  NC_013441  23979  24629  651  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  YP_003271276  normal  0.124139  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0025  CDS  NC_013441  24639  26546  1908  Serine/threonine protein kinase-related protein  YP_003271277  normal  0.135449  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0026  CDS  NC_013441  26543  27880  1338  Serine/threonine protein kinase-related protein  YP_003271278  normal  0.397929  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0027  CDS  NC_013441  27877  29364  1488  penicillin-binding protein transpeptidase  YP_003271279  normal  0.474914  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0028  CDS  NC_013441  29361  30791  1431  cell cycle protein  YP_003271280  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0029  CDS  NC_013441  30788  32305  1518  Phosphoprotein phosphatase  YP_003271281  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0030  CDS  NC_013441  32302  32763  462  Forkhead-associated protein  YP_003271282  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0031  CDS  NC_013441  32959  34260  1302  Forkhead-associated protein  YP_003271283  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0032  CDS  NC_013441  35018  35803  786  hypothetical protein  YP_003271284  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0033  CDS  NC_013441  35965  39963  3999  hypothetical protein  YP_003271285  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0034  CDS  NC_013441  39960  43421  3462  helicase domain protein  YP_003271286  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0035  CDS  NC_013441  43418  44542  1125  hypothetical protein  YP_003271287  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0036    NC_013441  44539  46048  1510      normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0037  CDS  NC_013441  46296  46391  96  hypothetical protein  YP_003271288  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0038  CDS  NC_013441  46754  48361  1608  hypothetical protein  YP_003271289  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0039  CDS  NC_013441  49629  50174  546  hypothetical protein  YP_003271290  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0040  CDS  NC_013441  50325  51635  1311  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  YP_003271291  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0041  CDS  NC_013441  51678  52019  342  hypothetical protein  YP_003271292  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0042  CDS  NC_013441  52016  53803  1788  hypothetical protein  YP_003271293  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0043  CDS  NC_013441  54227  55018  792  Protein of unknown function DUF2236  YP_003271294  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0044  CDS  NC_013441  55123  56097  975  protein of unknown function DUF808  YP_003271295  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0045    NC_013441  56216  56596  381      normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0046  CDS  NC_013441  56605  56703  99  hypothetical protein  YP_003271296  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0047    NC_013441  56728  57087  360      normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0048  CDS  NC_013441  57115  58242  1128  2-nitropropane dioxygenase NPD  YP_003271297  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0049  CDS  NC_013441  58370  58591  222  hypothetical protein  YP_003271298  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0050  CDS  NC_013441  58593  59744  1152  beta-lactamase  YP_003271299  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0051  CDS  NC_013441  59852  60637  786  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  YP_003271300  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0052  CDS  NC_013441  60670  61179  510  hypothetical protein  YP_003271301  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0053    NC_013441  61340  62262  923      normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0054  CDS  NC_013441  62265  62366  102  hypothetical protein  YP_003271302  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0055  CDS  NC_013441  62467  62820  354  hypothetical protein  YP_003271303  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0056  CDS  NC_013441  62961  64514  1554  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_003271304  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0057  CDS  NC_013441  64638  66101  1464  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_003271305  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0058  CDS  NC_013441  66184  66750  567  hypothetical protein  YP_003271306  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0059    NC_013441  66841  68153  1313      normal  0.805069  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0060  CDS  NC_013441  68155  69759  1605  ABC transporter related protein  YP_003271307  normal  0.721414  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0061  CDS  NC_013441  69756  70055  300  hypothetical protein  YP_003271308  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0062  CDS  NC_013441  70569  72287  1719  hypothetical protein  YP_003271309  normal  0.161525  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0063  CDS  NC_013441  72324  72713  390  hypothetical protein  YP_003271310  normal  0.197089  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0064  CDS  NC_013441  72750  73499  750  Methyltransferase type 11  YP_003271311  normal  0.262124  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0065  CDS  NC_013441  73813  74613  801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_003271312  normal  0.305038  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0066  CDS  NC_013441  75150  75842  693  hypothetical protein  YP_003271313  normal  0.245126  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0067  CDS  NC_013441  75992  76465  474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  YP_003271314  normal  0.482424  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0068  CDS  NC_013441  76497  79100  2604  regulatory protein LuxR  YP_003271315  normal  0.289946  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0069  CDS  NC_013441  79113  80336  1224  hypothetical protein  YP_003271316  normal  0.828451  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0070  CDS  NC_013441  80583  80873  291  hypothetical protein  YP_003271317  normal  0.536714  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0071    NC_013441  80875  81267  393      normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0072  CDS  NC_013441  81356  82888  1533  flavin-containing monooxygenase FMO  YP_003271318  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0073  CDS  NC_013441  82911  84503  1593  hypothetical protein  YP_003271319  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0074  CDS  NC_013441  84708  86162  1455  monooxygenase flavin-binding family protein  YP_003271320  normal  0.553046  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0075    NC_013441  86296  88567  2272      normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0076  CDS  NC_013441  88505  89761  1257  Formamidase  YP_003271321  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0077  CDS  NC_013441  89876  90160  285  regulatory protein, FmdB family  YP_003271322  normal  0.311805  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0078  CDS  NC_013441  90168  90812  645  beta-Ig-H3/fasciclin  YP_003271323  normal  0.273808  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0079  CDS  NC_013441  90994  92529  1536  oxidoreductase molybdopterin binding protein  YP_003271324  normal  0.256372  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0080  CDS  NC_013441  92574  93842  1269  Glutaminase  YP_003271325  normal  0.742612  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0081  CDS  NC_013441  93922  94503  582  protein of unknown function DUF664  YP_003271326  normal  0.651534  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0082  CDS  NC_013441  94622  95254  633  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  YP_003271327  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0083  CDS  NC_013441  95261  96838  1578  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_003271328  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0084  CDS  NC_013441  96957  97760  804  regulatory protein LuxR  YP_003271329  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0085  CDS  NC_013441  97767  98036  270  hypothetical protein  YP_003271330  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0086  CDS  NC_013441  98221  98808  588  hypothetical protein  YP_003271331  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0087  CDS  NC_013441  98832  100598  1767  helix-turn-helix Fis-type  YP_003271332  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0088  CDS  NC_013441  100784  102385  1602  steroid monooxygenase  YP_003271333  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0089  CDS  NC_013441  102435  103640  1206  beta-lactamase  YP_003271334  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0090    NC_013441  103654  104715  1062      normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0091  CDS  NC_013441  104800  106032  1233  regulatory protein LuxR  YP_003271335  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0092  CDS  NC_013441  106189  107280  1092  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  YP_003271336  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0093  CDS  NC_013441  107277  107909  633  beta-lactamase domain protein  YP_003271337  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0094  CDS  NC_013441  108009  108401  393  DoxX family protein  YP_003271338  normal  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0095  CDS  NC_013441  108559  110211  1653  sulphate transporter  YP_003271339  normal  0.618009  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0096  CDS  NC_013441  110275  111795  1521  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  YP_003271340  normal  0.0228406  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0097  CDS  NC_013441  111802  112602  801  Anti-sigma-K factor RskA  YP_003271341  normal  0.0432899  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0098  CDS  NC_013441  112595  113272  678  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  YP_003271342  normal  0.0185132  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0099  CDS  NC_013441  113272  114075  804  protein of unknown function DUF1295  YP_003271343  hitchhiker  0.00353634  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Gbro_0100  CDS  NC_013441  114075  115361  1287  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  YP_003271344  hitchhiker  0.00779931  n/a    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 51    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>