60 genes were found for organism Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Plim_4245  CDS  NC_014149  21  1133  +  1113  hypothetical protein  YP_003632251  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4246  CDS  NC_014149  1184  2218  +  1035  hypothetical protein  YP_003632252  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4247  CDS  NC_014149  2215  2622  +  408  hypothetical protein  YP_003632253  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4248  CDS  NC_014149  2648  2950  +  303  HNH endonuclease  YP_003632254  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4249  CDS  NC_014149  3082  3564  +  483  phage terminase, small subunit, , P27 family  YP_003632255  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4250  CDS  NC_014149  3509  5182  +  1674  Terminase  YP_003632256  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4251  CDS  NC_014149  5179  6813  +  1635  phage portal protein, HK97 family  YP_003632257  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4252  CDS  NC_014149  6890  7429  +  540  peptidase S14 ClpP  YP_003632258  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4253  CDS  NC_014149  7588  8910  +  1323  phage major capsid protein, HK97 family  YP_003632259  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4254  CDS  NC_014149  9043  9348  +  306  hypothetical protein  YP_003632260  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4255  CDS  NC_014149  9395  9982  +  588  phiE125 gp8 hypothetical protein  YP_003632261  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4256  CDS  NC_014149  9982  10317  +  336  phage head-tail adaptor  YP_003632262  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4257  CDS  NC_014149  10314  10949  +  636  hypothetical protein  YP_003632263  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4258  CDS  NC_014149  10951  11379  +  429  hypothetical protein  YP_003632264  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4259  CDS  NC_014149  11387  11800  +  414  hypothetical protein  YP_003632265  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4260  CDS  NC_014149  11873  12172  +  300  hypothetical protein  YP_003632266  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4261  CDS  NC_014149  12215  12634  +  420  hypothetical protein  YP_003632267  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4262  CDS  NC_014149  12652  12990  +  339  hypothetical protein  YP_003632268  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4263  CDS  NC_014149  12999  14723  +  1725  phage tape measure protein  YP_003632269  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4264  CDS  NC_014149  14723  15616  +  894  hypothetical protein  YP_003632270  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4265  CDS  NC_014149  15650  17374  +  1725  hypothetical protein  YP_003632271  normal  0.877453  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4266  CDS  NC_014149  17378  17734  +  357  hypothetical protein  YP_003632272  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4267  CDS  NC_014149  17731  17955  +  225  hypothetical protein  YP_003632273  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4268  CDS  NC_014149  17955  18122  +  168  hypothetical protein  YP_003632274  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4269  CDS  NC_014149  18131  18652  +  522  hypothetical protein  YP_003632275  normal  0.738808  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4270  CDS  NC_014149  18649  19029  +  381  hypothetical protein  YP_003632276  normal  0.845645  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4271  CDS  NC_014149  19042  20178  +  1137  hypothetical protein  YP_003632277  normal  0.224846  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4272  CDS  NC_014149  20215  21066  +  852  integrase family protein  YP_003632278  normal  0.0641822  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4273  CDS  NC_014149  21071  21376  +  306  hypothetical protein  YP_003632279  normal  0.0605199  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4274  CDS  NC_014149  21502  21636  +  135  hypothetical protein  YP_003632280  normal  0.0449285  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4275  CDS  NC_014149  21633  22457  +  825  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  YP_003632281  normal  0.020773  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4276  CDS  NC_014149  22515  22682  -  168  hypothetical protein  YP_003632282  normal  0.0127394  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4277  CDS  NC_014149  22906  23475  +  570  hypothetical protein  YP_003632283  hitchhiker  0.00893767  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4278  CDS  NC_014149  24051  25166  +  1116  integrase family protein  YP_003632284  normal  0.580574  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4279  CDS  NC_014149  25163  25501  +  339  hypothetical protein  YP_003632285  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4280  CDS  NC_014149  25498  26154  +  657  hypothetical protein  YP_003632286  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4281  CDS  NC_014149  26144  26368  +  225  hypothetical protein  YP_003632287  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4282  CDS  NC_014149  26404  26613  +  210  carbon storage regulator  YP_003632288  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4283  CDS  NC_014149  26606  27634  +  1029  hypothetical protein  YP_003632289  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4284  CDS  NC_014149  27653  28099  +  447  hypothetical protein  YP_003632290  normal  0.146549  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4285  CDS  NC_014149  28108  28287  +  180  hypothetical protein  YP_003632291  hitchhiker  0.00502783  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4286  CDS  NC_014149  28290  28694  +  405  hypothetical protein  YP_003632292  hitchhiker  0.00214169  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4287  CDS  NC_014149  28691  28939  +  249  hypothetical protein  YP_003632293  hitchhiker  0.0000232745  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4288  CDS  NC_014149  28897  29193  -  297  hypothetical protein  YP_003632294  hitchhiker  0.00000222808  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4289  CDS  NC_014149  29216  29470  +  255  hypothetical protein  YP_003632295  hitchhiker  0.000000122342  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4290  CDS  NC_014149  29467  29817  +  351  hypothetical protein  YP_003632296  hitchhiker  0.000000000861736  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4291  CDS  NC_014149  29814  30110  +  297  hypothetical protein  YP_003632297  hitchhiker  0.0000000000242213  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4292  CDS  NC_014149  30107  30514  +  408  hypothetical protein  YP_003632298  hitchhiker  0.00000000000006623  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4293  CDS  NC_014149  30511  30912  +  402  hypothetical protein  YP_003632299  hitchhiker  0.00000000000000729935  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4294  CDS  NC_014149  30909  31148  +  240  hypothetical protein  YP_003632300  hitchhiker  1.14991e-16  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4295  CDS  NC_014149  31127  31486  +  360  hypothetical protein  YP_003632301  decreased coverage  1.48954e-17  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4296  CDS  NC_014149  31603  33477  +  1875  parB-like partition protein  YP_003632302  hitchhiker  1.40492e-23  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4297  CDS  NC_014149  33586  33804  +  219  hypothetical protein  YP_003632303  hitchhiker  0.000000943997  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4298  CDS  NC_014149  33878  34132  +  255  hypothetical protein  YP_003632304  hitchhiker  0.00158991  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4299  CDS  NC_014149  34201  34812  +  612  hypothetical protein  YP_003632305  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4300  CDS  NC_014149  34943  35380  +  438  hypothetical protein  YP_003632306  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4301  CDS  NC_014149  35384  35659  +  276  hypothetical protein  YP_003632307  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4302  CDS  NC_014149  35656  35829  -  174  hypothetical protein  YP_003632308  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4303  CDS  NC_014149  35958  36233  -  276  hypothetical protein  YP_003632309  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_4304  CDS  NC_014149  36330  36944  +  615  hypothetical protein  YP_003632310  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>