4373 genes were found for organism Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 44    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Plim_0001  CDS  NC_014148  614  3166  +  2553  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_003628053  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0002  CDS  NC_014148  3189  4967  -  1779  ATP-binding region ATPase domain protein  YP_003628054  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0003  CDS  NC_014148  5023  5730  -  708  response regulator receiver  YP_003628055  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0004  CDS  NC_014148  5718  5927  -  210  hypothetical protein  YP_003628056  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0005  CDS  NC_014148  6006  7139  -  1134  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  YP_003628057  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0006  CDS  NC_014148  7544  8851  +  1308  oxidoreductase domain protein  YP_003628058  normal  0.696561  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0007  CDS  NC_014148  8976  9230  -  255  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  YP_003628059  normal  0.265122  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0008  CDS  NC_014148  9261  10766  +  1506  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  YP_003628060  normal  0.273138  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0009  CDS  NC_014148  10824  11840  -  1017  D-alanine/D-alanine ligase  YP_003628061  normal  0.542001  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0010  CDS  NC_014148  11910  13304  -  1395  hypothetical protein  YP_003628062  normal  0.921965  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0011  CDS  NC_014148  13644  14522  -  879  UDP-N-acetylenolpyruvoylglucosamine reductase  YP_003628063  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0012  CDS  NC_014148  14413  16122  -  1710  Mur ligase middle domain protein  YP_003628064  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0013  CDS  NC_014148  16614  16946  +  333  regulatory protein ArsR  YP_003628065  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0014  CDS  NC_014148  17043  17984  +  942  thymidylate synthase, flavin-dependent  YP_003628066  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0015  CDS  NC_014148  18212  19546  +  1335  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  YP_003628067  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0016  CDS  NC_014148  19592  21061  -  1470  ATP-binding region ATPase domain protein  YP_003628068  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0017  CDS  NC_014148  21458  23131  +  1674  hypothetical protein  YP_003628069  normal  0.137831  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0018  CDS  NC_014148  23639  24388  +  750  protein of unknown function DUF1080  YP_003628070  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0019  CDS  NC_014148  24534  25226  +  693  hypothetical protein  YP_003628071  normal  0.345545  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0020  CDS  NC_014148  25335  25664  -  330  hypothetical protein  YP_003628072  normal  0.556774  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0021  CDS  NC_014148  26359  26631  -  273  hypothetical protein  YP_003628073  normal  0.550484  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0022  CDS  NC_014148  26666  27772  +  1107  hypothetical protein  YP_003628074  normal  0.860006  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0023  CDS  NC_014148  27971  31606  +  3636  cytochrome c assembly protein  YP_003628075  normal  0.182494  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0024  CDS  NC_014148  31720  32082  -  363  translation initiation factor SUI1  YP_003628076  normal  0.178151  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0025  CDS  NC_014148  32095  33429  -  1335  histidyl-tRNA synthetase  YP_003628077  normal  0.320028  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0026  CDS  NC_014148  34097  35662  +  1566  Cytochrome-c peroxidase  YP_003628078  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0027  CDS  NC_014148  35789  36784  +  996  protein of unknown function DUF1559  YP_003628079  normal  0.13205  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0028  CDS  NC_014148  36879  38324  +  1446  hypothetical protein  YP_003628080  normal  0.33932  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0029  CDS  NC_014148  38564  42169  +  3606  membrane-bound dehydrogenase domain protein  YP_003628081  normal  0.167421  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0030  CDS  NC_014148  42475  43188  +  714  protein of unknown function DUF164  YP_003628082  normal  0.372123  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0031  CDS  NC_014148  43383  43526  -  144  hypothetical protein  YP_003628083  normal  0.897035  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0032  CDS  NC_014148  43882  44853  +  972  protein of unknown function DUF1559  YP_003628084  normal  0.98147  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0033  CDS  NC_014148  44942  45913  +  972  protein of unknown function DUF1559  YP_003628085  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0034  CDS  NC_014148  45961  46794  +  834  biotin apo-protein ligase-related protein  YP_003628086  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0035  CDS  NC_014148  47027  47953  +  927  N-formylglutamate amidohydrolase  YP_003628087  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0036  CDS  NC_014148  48141  49274  +  1134  DNA polymerase III, beta subunit  YP_003628088  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0037  CDS  NC_014148  49565  50875  -  1311  oxidoreductase domain protein  YP_003628089  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0038  CDS  NC_014148  51133  52110  -  978  protein of unknown function DUF1080  YP_003628090  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0039  CDS  NC_014148  52268  52696  -  429  putative thiol-disulfide oxidoreductase DCC  YP_003628091  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0040  CDS  NC_014148  53215  54561  +  1347  hypothetical protein  YP_003628092  normal  0.217581  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0041  CDS  NC_014148  54779  55603  -  825  hypothetical protein  YP_003628093  normal  0.4713  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0042  CDS  NC_014148  55775  56941  +  1167  hypothetical protein  YP_003628094  normal  0.282786  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0043  CDS  NC_014148  57212  58414  -  1203  hypothetical protein  YP_003628095  normal  0.303817  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0044  CDS  NC_014148  58465  59556  -  1092  metallophosphoesterase  YP_003628096  normal  0.941975  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0045  CDS  NC_014148  59974  60768  -  795  Methyltransferase type 12  YP_003628097  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0046  CDS  NC_014148  61141  62496  +  1356  protein of unknown function DUF1080  YP_003628098  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0047  CDS  NC_014148  62730  63809  -  1080  3-dehydroquinate synthase  YP_003628099  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0048  CDS  NC_014148  64239  66605  +  2367  integral membrane protein  YP_003628100  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0049  CDS  NC_014148  66641  67747  -  1107  DNA protecting protein DprA  YP_003628101  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0050  CDS  NC_014148  68055  69056  +  1002  hypothetical protein  YP_003628102  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0051  CDS  NC_014148  69523  71595  +  2073  hypothetical protein  YP_003628103  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0052  CDS  NC_014148  71816  72415  -  600  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  YP_003628104  normal  0.704857  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0053  CDS  NC_014148  72650  72874  +  225  RNA-binding S4 domain protein  YP_003628105  normal  0.525969  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0054  CDS  NC_014148  73146  73466  -  321  histone family protein DNA-binding protein  YP_003628106  normal  0.905154  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0055  CDS  NC_014148  73924  74706  +  783  Forkhead-associated protein  YP_003628107  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0056  CDS  NC_014148  74830  75477  +  648  methyltransferase  YP_003628108  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0057  CDS  NC_014148  75501  75788  -  288  hypothetical protein  YP_003628109  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0058  CDS  NC_014148  75855  76781  -  927  putative membrane bound transporter  YP_003628110  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0059  CDS  NC_014148  77070  77600  -  531  hypothetical protein  YP_003628111  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0060  CDS  NC_014148  77702  77932  -  231  hypothetical protein  YP_003628112  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0061  CDS  NC_014148  77932  78786  -  855  1-(5-phosphoribosyl)-5-amino-4-imidazole- carboxylate (AIR) carboxylase  YP_003628113  normal  0.953155  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0062  CDS  NC_014148  78961  79995  -  1035  6-phosphofructokinase  YP_003628114  normal  0.970858  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0063  CDS  NC_014148  80113  81459  -  1347  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  YP_003628115  normal  0.278337  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0064  CDS  NC_014148  81744  82247  -  504  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxyl carrier protein  YP_003628116  normal  0.674766  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0065  CDS  NC_014148  82469  83659  -  1191  peptidase M24  YP_003628117  normal  0.439358  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0066  CDS  NC_014148  83756  86404  -  2649  MMPL domain protein  YP_003628118  normal  0.82197  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0067  CDS  NC_014148  86633  88777  -  2145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  YP_003628119  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0068  CDS  NC_014148  89058  90866  -  1809  hypothetical protein  YP_003628120  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0069  CDS  NC_014148  91167  92885  -  1719  anion transporter  YP_003628121  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0070  CDS  NC_014148  92956  93969  -  1014  heme exporter protein CcmA  YP_003628122  normal  0.431821  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0071  CDS  NC_014148  94142  94972  -  831  phosphatidate cytidylyltransferase  YP_003628123  normal  0.0774349  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0072  CDS  NC_014148  95821  96777  +  957  protein of unknown function DUF1559  YP_003628124  normal  0.0793398  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0073  CDS  NC_014148  96906  97334  +  429  hypothetical protein  YP_003628125  normal  0.356011  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0074  CDS  NC_014148  97368  97529  +  162  hypothetical protein  YP_003628126  normal  0.417782  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0075  CDS  NC_014148  97673  100711  -  3039  hypothetical protein  YP_003628127  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0076  CDS  NC_014148  101772  104021  +  2250  type IV pilus assembly protein PilM  YP_003628128  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0077  CDS  NC_014148  104138  105877  +  1740  hypothetical protein  YP_003628129  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0078  CDS  NC_014148  105982  108105  +  2124  hypothetical protein  YP_003628130  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0079  CDS  NC_014148  108465  109634  +  1170  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  YP_003628131  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0080  CDS  NC_014148  109938  110912  +  975  PSP1 domain protein  YP_003628132  normal  0.918757  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0081  CDS  NC_014148  110971  111582  +  612  nicotinate (nicotinamide) nucleotide adenylyltransferase  YP_003628133  normal  0.476996  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0082  CDS  NC_014148  111846  113648  +  1803  type II secretion system protein E  YP_003628134  normal  0.214348  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0083  CDS  NC_014148  113736  114410  +  675  hypothetical protein  YP_003628135  normal  0.785791  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0084  CDS  NC_014148  114747  115634  +  888  hypothetical protein  YP_003628136  normal  0.524917  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0085  CDS  NC_014148  115693  116130  -  438  hypothetical protein  YP_003628137  normal  0.760885  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0086  CDS  NC_014148  116372  117409  -  1038  protein of unknown function DUF1559  YP_003628138  normal  0.806187  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0087  CDS  NC_014148  118327  120705  -  2379  heavy metal translocating P-type ATPase  YP_003628139  normal  0.908745  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0088  CDS  NC_014148  121308  121610  +  303  hypothetical protein  YP_003628140  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0089  CDS  NC_014148  121809  122363  +  555  NIPSNAP family containing protein  YP_003628141  normal  0.348759  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0090  CDS  NC_014148  122511  124706  -  2196  hypothetical protein  YP_003628142  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0091  CDS  NC_014148  125143  125289  -  147  hypothetical protein  YP_003628143  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0092  CDS  NC_014148  125292  127025  +  1734  diguanylate cyclase  YP_003628144  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0093  CDS  NC_014148  127138  128703  -  1566  2-isopropylmalate synthase  YP_003628145  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0094  CDS  NC_014148  129287  131785  -  2499  hypothetical protein  YP_003628146  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0095  CDS  NC_014148  131848  132150  -  303  hypothetical protein  YP_003628147  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0096  CDS  NC_014148  132217  132702  -  486  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_003628148  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0097  CDS  NC_014148  132839  133999  -  1161  Radical SAM domain protein  YP_003628149  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0098  CDS  NC_014148  134115  134246  +  132  hypothetical protein  YP_003628150  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0099  CDS  NC_014148  134295  134879  -  585  protein of unknown function DUF820  YP_003628151  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Plim_0100  CDS  NC_014148  134994  138575  -  3582  protein of unknown function DUF214  YP_003628152  normal  1  n/a    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 44    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>