99 genes were found for organism Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Aaci_3049  CDS  NC_013207  79  357  279  transcriptional regulator, LuxR family  YP_003186441  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3050    NC_013207  639  1646  1008      n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3051  CDS  NC_013207  1793  1972  180  hypothetical protein  YP_003186442  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3052  CDS  NC_013207  2032  2364  333  hypothetical protein  YP_003186443  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3053  CDS  NC_013207  2391  2720  330  IS66 Orf2 family protein  YP_003186444  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3054  CDS  NC_013207  2770  2940  171  hypothetical protein  YP_003186445  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3055  CDS  NC_013207  3050  4840  1791  transposase IS4 family protein  YP_003186446  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3056  CDS  NC_013207  4909  6498  1590  transposase IS66  YP_003186447  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3057    NC_013207  6595  7077  483      n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3058    NC_013207  7326  7527  202      n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3059  CDS  NC_013207  7728  8465  738  Ankyrin  YP_003186448  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3060  CDS  NC_013207  9028  10767  1740  transposase IS4 family protein  YP_003186449  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3061  CDS  NC_013207  11093  12394  1302  NHL repeat containing protein  YP_003186450  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3062    NC_013207  12657  12752  96      n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3063  CDS  NC_013207  12917  13522  606  transcriptional regulator, XRE family  YP_003186451  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3064  CDS  NC_013207  13519  13860  342  branched-chain amino acid transport  YP_003186452  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3065  CDS  NC_013207  13868  14581  714  AzlC family protein  YP_003186453  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3066  CDS  NC_013207  14829  15236  408  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  YP_003186454  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3067    NC_013207  15381  15977  597      n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3068  CDS  NC_013207  16109  16363  255  hypothetical protein  YP_003186455  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3069  CDS  NC_013207  16843  17055  213  hypothetical protein  YP_003186456  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3070  CDS  NC_013207  17667  19157  1491  GerA spore germination protein  YP_003186457  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3071  CDS  NC_013207  19154  20356  1203  hypothetical protein  YP_003186458  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3072  CDS  NC_013207  20377  20622  246  hypothetical protein  YP_003186459  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3073  CDS  NC_013207  20628  21728  1101  spore germination protein  YP_003186460  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3074  CDS  NC_013207  21920  22033  114  hypothetical protein  YP_003186461  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3075  CDS  NC_013207  22040  23239  1200  Tetratricopeptide repeat protein  YP_003186462  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3076  CDS  NC_013207  23806  24663  858  diguanylate phosphodiesterase  YP_003186463  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3077    NC_013207  24706  27876  3171      n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3078  CDS  NC_013207  27851  28279  429  response regulator receiver protein  YP_003186464  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3079  CDS  NC_013207  29167  29838  672  histidine kinase  YP_003186465  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3080  CDS  NC_013207  29848  31308  1461  metal dependent phosphohydrolase  YP_003186466  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3081  CDS  NC_013207  31702  31803  102  hypothetical protein  YP_003186467  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3082  CDS  NC_013207  32124  32240  117  hypothetical protein  YP_003186468  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3083  CDS  NC_013207  32884  33081  198  hypothetical protein  YP_003186469  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3084    NC_013207  33995  34974  980      n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3085  CDS  NC_013207  35236  35427  192  hypothetical protein  YP_003186470  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3086  CDS  NC_013207  35502  37217  1716  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  YP_003186471  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3087  CDS  NC_013207  37223  39730  2508  type III restriction protein res subunit  YP_003186472  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3088  CDS  NC_013207  40134  40763  630  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  YP_003186473  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3089  CDS  NC_013207  40853  41011  159  hypothetical protein  YP_003186474  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3090  CDS  NC_013207  41185  41328  144  hypothetical protein  YP_003186475  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3091  CDS  NC_013207  41346  41570  225  hypothetical protein  YP_003186476  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3092  CDS  NC_013207  41864  42607  744  transcriptional regulator, LuxR family  YP_003186477  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3093  CDS  NC_013207  42604  42987  384  hypothetical protein  YP_003186478  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3094  CDS  NC_013207  42984  43268  285  hypothetical protein  YP_003186479  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3095  CDS  NC_013207  43732  43881  150  hypothetical protein  YP_003186480  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3096  CDS  NC_013207  44143  44934  792  hypothetical protein  YP_003186481  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3097  CDS  NC_013207  45309  45749  441  hypothetical protein  YP_003186482  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3098  CDS  NC_013207  45730  46284  555  hypothetical protein  YP_003186483  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3099  CDS  NC_013207  47017  48243  1227  hypothetical protein  YP_003186484  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3100  CDS  NC_013207  48327  51299  2973  Pyrrolo-quinoline quinone  YP_003186485  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3101  CDS  NC_013207  51453  51725  273  transcriptional regulator, AbrB family  YP_003186486  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3102  CDS  NC_013207  51718  52167  450  PilT protein domain protein  YP_003186487  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3103  CDS  NC_013207  52240  52839  600  hypothetical protein  YP_003186488  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3104  CDS  NC_013207  52918  54291  1374  ParB domain protein nuclease  YP_003186489  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3105  CDS  NC_013207  54391  54864  474  hypothetical protein  YP_003186490  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3106  CDS  NC_013207  54889  55356  468  hypothetical protein  YP_003186491  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3107  CDS  NC_013207  55774  56235  462  prophage antirepressor  YP_003186492  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3108  CDS  NC_013207  56242  56697  456  hypothetical protein  YP_003186493  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3109  CDS  NC_013207  56756  57352  597  hypothetical protein  YP_003186494  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3110  CDS  NC_013207  57370  58098  729  hypothetical protein  YP_003186495  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3111  CDS  NC_013207  58140  58397  258  hypothetical protein  YP_003186496  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3112  CDS  NC_013207  58394  58984  591  membrane-bound metal-dependent hydrolase  YP_003186497  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3113  CDS  NC_013207  59018  59332  315  hypothetical protein  YP_003186498  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3114  CDS  NC_013207  59336  59914  579  hypothetical protein  YP_003186499  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3115  CDS  NC_013207  59934  62342  2409  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  YP_003186500  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3116  CDS  NC_013207  62349  65339  2991  hypothetical protein  YP_003186501  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3117  CDS  NC_013207  65385  66434  1050  hypothetical protein  YP_003186502  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3118  CDS  NC_013207  66521  67648  1128  chromosome partitioning ATPase-like protein protein  YP_003186503  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3119  CDS  NC_013207  67648  68466  819  SAF domain protein  YP_003186504  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3120  CDS  NC_013207  68463  69962  1500  type II secretion system protein E  YP_003186505  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3121  CDS  NC_013207  69962  70798  837  hypothetical protein  YP_003186506  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3122  CDS  NC_013207  70964  71527  564  hypothetical protein  YP_003186507  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3123  CDS  NC_013207  71539  72423  885  hypothetical protein  YP_003186508  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3124  CDS  NC_013207  72437  72661  225  hypothetical protein  YP_003186509  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3125  CDS  NC_013207  72633  72935  303  hypothetical protein  YP_003186510  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3126  CDS  NC_013207  73022  73270  249  hypothetical protein  YP_003186511  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3127  CDS  NC_013207  73292  73525  234  hypothetical protein  YP_003186512  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3128  CDS  NC_013207  73545  73769  225  hypothetical protein  YP_003186513  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3129  CDS  NC_013207  73769  74017  249  hypothetical protein  YP_003186514  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3130  CDS  NC_013207  74101  74538  438  hypothetical protein  YP_003186515  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3131  CDS  NC_013207  74557  75102  546  hypothetical protein  YP_003186516  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3132  CDS  NC_013207  75274  76491  1218  transposase mutator type  YP_003186517  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3133  CDS  NC_013207  76641  77066  426  hypothetical protein  YP_003186518  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3134  CDS  NC_013207  77084  77767  684  diguanylate phosphodiesterase  YP_003186519  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3135  CDS  NC_013207  78329  78991  663  hypothetical protein  YP_003186520  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3136  CDS  NC_013207  78988  79434  447  hypothetical protein  YP_003186521  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3137  CDS  NC_013207  79585  79800  216  hypothetical protein  YP_003186522  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3138  CDS  NC_013207  79812  80252  441  hypothetical protein  YP_003186523  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3139  CDS  NC_013207  80257  81315  1059  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  YP_003186524  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3140  CDS  NC_013207  81303  82088  786  SAF domain protein  YP_003186525  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3141  CDS  NC_013207  82072  83340  1269  type II secretion system protein E  YP_003186526  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3142  CDS  NC_013207  83337  84200  864  hypothetical protein  YP_003186527  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3143  CDS  NC_013207  84201  85007  807  hypothetical protein  YP_003186528  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3144  CDS  NC_013207  85312  85740  429  hypothetical protein  YP_003186529  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3145  CDS  NC_013207  85783  86379  597  hypothetical protein  YP_003186530  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3146  CDS  NC_013207  86393  86836  444  peptidase A24A prepilin type IV  YP_003186531  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Aaci_3147  CDS  NC_013207  86833  87279  447  hypothetical protein  YP_003186532  n/a    n/a    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>