2965 genes were found for organism Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 30    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Rmar_0001  CDS  NC_013501  165  1676  +  1512  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_003289298  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0002  CDS  NC_013501  1734  2873  +  1140  DNA polymerase III, beta subunit  YP_003289299  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0003  CDS  NC_013501  2875  3924  -  1050  hypothetical protein  YP_003289300  normal  0.83711  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0004  CDS  NC_013501  4029  4661  -  633  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  YP_003289301  normal  0.401876  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0005  CDS  NC_013501  4892  5335  +  444  ribosomal protein L13  YP_003289302  normal  0.903919  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0006  CDS  NC_013501  5356  5757  +  402  ribosomal protein S9  YP_003289303  normal  0.819912  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0007  CDS  NC_013501  5927  6757  +  831  ribosomal protein S2  YP_003289304  normal  0.468976  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0008  CDS  NC_013501  6790  7620  +  831  translation elongation factor Ts  YP_003289305  normal  0.120995  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0009  CDS  NC_013501  7752  8537  +  786  uridylate kinase  YP_003289306  normal  0.137208  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0010  CDS  NC_013501  8563  9141  +  579  ribosome recycling factor  YP_003289307  normal  0.0696052  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0011  CDS  NC_013501  9350  10228  +  879  YicC domain protein  YP_003289308  normal  0.272506  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0012  CDS  NC_013501  10232  10801  +  570  guanylate kinase  YP_003289309  normal  0.897517  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0013  CDS  NC_013501  10813  12039  +  1227  phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate/cysteine ligase  YP_003289310  normal  0.432806  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0014  CDS  NC_013501  12117  12908  +  792  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  YP_003289311  normal  0.248963  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0015  CDS  NC_013501  12925  15762  +  2838  replicative DNA helicase  YP_003289312  normal  0.756014  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0016  CDS  NC_013501  15964  17640  -  1677  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  YP_003289313  normal  0.929015  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0017  CDS  NC_013501  17779  19092  +  1314  protein of unknown function DUF107  YP_003289314  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0018  CDS  NC_013501  19118  19873  +  756  band 7 protein  YP_003289315  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0019  CDS  NC_013501  20138  20302  -  165  hypothetical protein  YP_003289316  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0020  CDS  NC_013501  20306  20479  -  174  ribosomal protein L33  YP_003289317  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0021  CDS  NC_013501  20497  20733  -  237  ribosomal protein L28  YP_003289318  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0022  CDS  NC_013501  20862  21638  -  777  Phosphosulfolactate synthase  YP_003289319  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0023  CDS  NC_013501  21648  22904  -  1257  protein of unknown function DUF214  YP_003289320  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0024  CDS  NC_013501  22909  23739  -  831  hypothetical protein  YP_003289321  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0025  CDS  NC_013501  23861  24937  +  1077  glycoside hydrolase family 5  YP_003289322  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0026  CDS  NC_013501  25187  25891  +  705  hypothetical protein  YP_003289323  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0027  CDS  NC_013501  25881  26981  -  1101  GTP-binding protein YchF  YP_003289324  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0028  CDS  NC_013501  27092  27598  +  507  hypothetical protein  YP_003289325  normal  0.667239  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0029  CDS  NC_013501  27599  28255  -  657  metallophosphoesterase  YP_003289326  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0030  CDS  NC_013501  28262  28759  -  498  NusB antitermination factor  YP_003289327  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0031  CDS  NC_013501  28915  31308  +  2394  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  YP_003289328  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0032  CDS  NC_013501  31302  32141  -  840  UspA domain protein  YP_003289329  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0033  CDS  NC_013501  32631  33926  -  1296  Glucose-6-phosphate isomerase  YP_003289330  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0034  CDS  NC_013501  34005  35228  +  1224  molybdenum cofactor synthesis domain protein  YP_003289331  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0035  CDS  NC_013501  35283  35897  +  615  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  YP_003289332  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0036  CDS  NC_013501  35926  36534  +  609  hypothetical protein  YP_003289333  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0037  CDS  NC_013501  36538  37227  +  690  NUDIX hydrolase  YP_003289334  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0038  CDS  NC_013501  37270  38448  +  1179  Cupin 4 family protein  YP_003289335  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0039  CDS  NC_013501  38450  39001  +  552  NUDIX hydrolase  YP_003289336  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0040  CDS  NC_013501  38998  39816  +  819  Ion transport protein  YP_003289337  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0041  CDS  NC_013501  39813  40469  +  657  hypothetical protein  YP_003289338  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0042  CDS  NC_013501  40554  42062  +  1509  2-methylcitrate dehydratase  YP_003289339  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0043  CDS  NC_013501  42135  42317  +  183  hypothetical protein  YP_003289340  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0044  CDS  NC_013501  42314  43504  +  1191  PKD domain-containing protein  YP_003289341  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0045  CDS  NC_013501  43505  45157  -  1653  protein of unknown function DUF524  YP_003289342  normal  0.724745  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0046  CDS  NC_013501  45161  46867  -  1707  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  YP_003289343  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0047  CDS  NC_013501  46961  49024  +  2064  excinuclease ABC, B subunit  YP_003289344  normal  0.63144  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0048  CDS  NC_013501  49085  49639  +  555  transcriptional regulator, LuxR family  YP_003289345  normal  0.426983  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0049  CDS  NC_013501  49636  50586  +  951  anti-FecI sigma factor, FecR  YP_003289346  normal  0.895383  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0050  CDS  NC_013501  50598  53306  +  2709  TonB-dependent receptor plug  YP_003289347  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0051  CDS  NC_013501  53381  53860  +  480  Rieske (2Fe-2S) domain protein  YP_003289348  normal  0.782926  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0052  CDS  NC_013501  53873  54592  +  720  hypothetical protein  YP_003289349  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0053  CDS  NC_013501  54604  55200  +  597  YceI family protein  YP_003289350  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0054  CDS  NC_013501  55197  56282  -  1086  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  YP_003289351  normal  0.856082  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0055  CDS  NC_013501  56279  56941  -  663  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  YP_003289352  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0056  CDS  NC_013501  56917  57753  -  837  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  YP_003289353  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0057  CDS  NC_013501  57731  58237  -  507  transcriptional regulator, PadR-like family  YP_003289354  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0058  CDS  NC_013501  58336  59550  +  1215  threonine synthase  YP_003289355  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0059  CDS  NC_013501  59569  60228  +  660  Methyltransferase type 11  YP_003289356  normal  0.624064  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0060  CDS  NC_013501  61068  63755  -  2688  hypothetical protein  YP_003289357  normal  0.130043  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0061  CDS  NC_013501  63811  64023  -  213  DNA binding domain protein, excisionase family  YP_003289358  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0062  CDS  NC_013501  64222  65199  -  978  hypothetical protein  YP_003289359  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0063  CDS  NC_013501  65196  66425  -  1230  integrase family protein  YP_003289360  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0064  CDS  NC_013501  67056  67625  -  570  hypothetical protein  YP_003289361  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0065  CDS  NC_013501  67729  68421  +  693  hypothetical protein  YP_003289362  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0066  CDS  NC_013501  68540  69850  +  1311  outer membrane efflux protein  YP_003289363  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0067  CDS  NC_013501  69872  71233  +  1362  efflux transporter, RND family, MFP subunit  YP_003289364  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0068  CDS  NC_013501  71253  71999  +  747  ABC transporter related protein  YP_003289365  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0069  CDS  NC_013501  72006  72713  +  708  pseudouridine synthase  YP_003289366  normal  0.555782  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0070  CDS  NC_013501  72626  73816  -  1191  alanine racemase domain protein  YP_003289367  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0071  CDS  NC_013501  73892  75469  +  1578  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_003289368  normal  0.603344  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0072  CDS  NC_013501  75470  75898  -  429  ATP synthase F1, epsilon subunit  YP_003289369  normal  0.0836713  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0073  CDS  NC_013501  75901  77406  -  1506  ATP synthase F1, beta subunit  YP_003289370  normal  0.11644  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0074  CDS  NC_013501  77660  80164  +  2505  peptidase M14 carboxypeptidase A  YP_003289371  normal  0.169396  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0075  CDS  NC_013501  80168  81508  -  1341  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  YP_003289372  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0076  CDS  NC_013501  81510  84023  -  2514  glycoside hydrolase family 9  YP_003289373  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0077  CDS  NC_013501  84141  84392  -  252  ribosomal protein L31  YP_003289374  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0078  CDS  NC_013501  84474  86357  -  1884  thiamine biosynthesis protein ThiC  YP_003289375  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0079  CDS  NC_013501  86599  87219  -  621  hypothetical protein  YP_003289376  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0080  CDS  NC_013501  87405  88790  +  1386  deoxyguanosinetriphosphate triphosphohydrolase  YP_003289377  normal  0.204447  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0081  CDS  NC_013501  88795  91740  -  2946  excinuclease ABC, A subunit  YP_003289378  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0082  CDS  NC_013501  91909  92502  +  594  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  YP_003289379  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0083  CDS  NC_013501  92583  92900  +  318  hypothetical protein  YP_003289380  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0084  CDS  NC_013501  92982  95411  -  2430  hypothetical protein  YP_003289381  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0085  CDS  NC_013501  95686  96744  +  1059  WD40 domain protein beta Propeller  YP_003289382  normal  0.869828  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0086  CDS  NC_013501  97028  98026  -  999  voltage-dependent potassium channel, beta subunit  YP_003289383  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0087  CDS  NC_013501  98092  99030  -  939  hypothetical protein  YP_003289384  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0088  CDS  NC_013501  99133  99315  +  183  hypothetical protein  YP_003289385  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0089  CDS  NC_013501  99431  102196  +  2766  peptidase M16 domain protein  YP_003289386  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0090  CDS  NC_013501  102297  103082  +  786  phage shock protein A, PspA  YP_003289387  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0091  CDS  NC_013501  103084  103491  +  408  CG33484-PA-like protein  YP_003289388  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0092  CDS  NC_013501  103491  104408  +  918  hypothetical protein  YP_003289389  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0093  CDS  NC_013501  104417  104755  +  339  hypothetical protein  YP_003289390  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0094  CDS  NC_013501  104752  105549  +  798  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  YP_003289391  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0095  CDS  NC_013501  105549  106799  +  1251  CBS domain containing protein  YP_003289392  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0096  CDS  NC_013501  106883  107431  +  549  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  YP_003289393  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0097  CDS  NC_013501  107466  107933  +  468  hypothetical protein  YP_003289394  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0098  CDS  NC_013501  108023  108730  -  708  hypothetical protein  YP_003289395  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0099  CDS  NC_013501  108811  110880  -  2070  hypothetical protein  YP_003289396  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Rmar_0100  CDS  NC_013501  111302  112435  -  1134  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  YP_003289397  normal  1  n/a    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 30    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>