6952 genes were found for organism Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 70    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Hoch_0001  CDS  NC_013440  109  1605  +  1497  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_003264536  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0002  CDS  NC_013440  2323  3420  +  1098  DNA polymerase III, beta subunit  YP_003264537  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0003  CDS  NC_013440  3430  4578  +  1149  DNA replication and repair protein RecF  YP_003264538  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0004  CDS  NC_013440  4639  7104  +  2466  DNA gyrase, B subunit  YP_003264539  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0005  CDS  NC_013440  7226  8233  +  1008  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  YP_003264540  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0006  CDS  NC_013440  8473  9663  +  1191  hypothetical protein  YP_003264541  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0007  CDS  NC_013440  9660  11042  +  1383  hypothetical protein  YP_003264542  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0008  CDS  NC_013440  11117  12625  -  1509  Leucyl aminopeptidase  YP_003264543  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0009  CDS  NC_013440  12758  13594  -  837  hypothetical protein  YP_003264544  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0010  CDS  NC_013440  13717  14361  +  645  transaldolase  YP_003264545  normal  0.896491  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0011  CDS  NC_013440  14366  14800  +  435  NUDIX hydrolase  YP_003264546  normal  0.695589  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0012  CDS  NC_013440  14890  15513  +  624  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  YP_003264547  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0013  CDS  NC_013440  15541  17559  -  2019  excinuclease ABC, B subunit  YP_003264548  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0014  CDS  NC_013440  17611  18288  +  678  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  YP_003264549  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0015  CDS  NC_013440  18507  18812  +  306  hypothetical protein  YP_003264550  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0016  CDS  NC_013440  19010  19891  -  882  hypothetical protein  YP_003264551  normal  0.436683  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0017  CDS  NC_013440  19888  20652  -  765  OmpA/MotB domain protein  YP_003264552  normal  0.805454  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0018  CDS  NC_013440  20714  22099  +  1386  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  YP_003264553  normal  0.709029  normal  0.924426  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0019  CDS  NC_013440  22306  23013  +  708  hypothetical protein  YP_003264554  normal  1  normal  0.447387  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0020  CDS  NC_013440  23070  24242  -  1173  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  YP_003264555  normal  1  normal  0.947878  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0021  CDS  NC_013440  24316  26331  -  2016  hypothetical protein  YP_003264556  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0022  CDS  NC_013440  26379  27113  -  735  General secretory system II protein E domain protein  YP_003264557  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0023  CDS  NC_013440  27201  33902  -  6702  hypothetical protein  YP_003264558  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0024  CDS  NC_013440  33933  35303  -  1371  O-antigen polymerase  YP_003264559  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0025  CDS  NC_013440  35385  37943  -  2559  UvrD/Rep helicase family protein  YP_003264560  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0026  CDS  NC_013440  38081  40033  +  1953  arginine decarboxylase  YP_003264561  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0027  CDS  NC_013440  40061  41116  -  1056  hypothetical protein  YP_003264562  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0028  CDS  NC_013440  41148  41690  -  543  FHA domain containing protein  YP_003264563  normal  0.821389  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0029  CDS  NC_013440  41687  42781  -  1095  cobalamin synthesis protein P47K  YP_003264564  normal  0.341587  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0030  CDS  NC_013440  42905  44995  -  2091  exported nucleotide-binding protein  YP_003264565  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0031  CDS  NC_013440  45148  46860  +  1713  Protein of unknown function DUF1592  YP_003264566  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0032  CDS  NC_013440  46857  48230  +  1374  protein of unknown function DUF1552  YP_003264567  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0033  CDS  NC_013440  48302  49774  +  1473  Spore coat protein CotH  YP_003264568  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0034  CDS  NC_013440  49955  54601  -  4647  hypothetical protein  YP_003264569  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0035  CDS  NC_013440  54601  60483  -  5883  hypothetical protein  YP_003264570  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0036  CDS  NC_013440  60579  63356  -  2778  hypothetical protein  YP_003264571  normal  1  normal  0.964614  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0037  CDS  NC_013440  63360  67004  -  3645  hypothetical protein  YP_003264572  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0038  CDS  NC_013440  67184  69268  -  2085  transmembrane sensor domain-like protein  YP_003264573  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0039  CDS  NC_013440  69717  70760  +  1044  hypothetical protein  YP_003264574  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0040  CDS  NC_013440  70810  71487  +  678  transcriptional regulator, TetR family  YP_003264575  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0041  CDS  NC_013440  71474  72382  -  909  hypothetical protein  YP_003264576  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0042  CDS  NC_013440  72504  73787  -  1284  hypothetical protein  YP_003264577  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0043  CDS  NC_013440  74659  75573  +  915  hypothetical protein  YP_003264578  normal  0.124113  normal  0.935864  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0044  CDS  NC_013440  75587  75808  +  222  hypothetical protein  YP_003264579  normal  0.0513963  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0045  CDS  NC_013440  76248  77075  +  828  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  YP_003264580  normal  0.0293315  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0046  CDS  NC_013440  77247  77555  +  309  hypothetical protein  YP_003264581  normal  0.284936  normal  0.598601  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0047  CDS  NC_013440  77625  77900  +  276  hypothetical protein  YP_003264582  normal  0.631294  normal  0.610999  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0048  CDS  NC_013440  78121  79302  -  1182  adenosine deaminase  YP_003264583  normal  1  normal  0.331734  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0049  CDS  NC_013440  79402  80355  -  954  glutathione synthetase  YP_003264584  normal  1  normal  0.0437692  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0050  CDS  NC_013440  80380  81927  -  1548  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  YP_003264585  normal  1  normal  0.0532507  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0051  CDS  NC_013440  82219  84060  +  1842  hypothetical protein  YP_003264586  normal  1  normal  0.062012  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0052  CDS  NC_013440  84060  84407  +  348  hypothetical protein  YP_003264587  normal  1  normal  0.0796985  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0053  CDS  NC_013440  84573  85007  +  435  hypothetical protein  YP_003264588  normal  1  normal  0.131053  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0054  CDS  NC_013440  85004  86137  +  1134  transcriptional regulator, MerR family  YP_003264589  normal  1  normal  0.155443  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0055  CDS  NC_013440  86097  87347  -  1251  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  YP_003264590  normal  1  normal  0.16054  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0056  CDS  NC_013440  87461  87877  -  417  hypothetical protein  YP_003264591  normal  1  normal  0.213932  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0057    NC_013440  87935  88168  +  234      normal  1  normal  0.203952  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0058  CDS  NC_013440  88165  89424  +  1260  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  YP_003264592  normal  1  normal  0.161997  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0059  CDS  NC_013440  89421  90782  +  1362  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  YP_003264593  normal  1  normal  0.17333  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0060  CDS  NC_013440  90807  91787  -  981  LPPG domain protein containing protein  YP_003264594  normal  1  normal  0.2602  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0061  CDS  NC_013440  91784  92659  -  876  F420-dependent oxidoreductase  YP_003264595  normal  1  normal  0.259311  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0062  CDS  NC_013440  92656  93390  -  735  NADPH-dependent F420 reductase  YP_003264596  normal  1  normal  0.103158  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0063  CDS  NC_013440  93497  93910  -  414  transcriptional regulator, XRE family  YP_003264597  normal  1  normal  0.0973127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0064  CDS  NC_013440  94140  94868  -  729  transcriptional regulator, TetR family  YP_003264598  normal  1  normal  0.261244  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0065  CDS  NC_013440  95005  95838  +  834  formate dehydrogenase family accessory protein FdhD  YP_003264599  normal  1  normal  0.255284  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0066  CDS  NC_013440  95846  99292  +  3447  Lantibiotic dehydratase domain protein  YP_003264600  normal  1  normal  0.433774  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0067  CDS  NC_013440  99292  100563  +  1272  cytochrome P450  YP_003264601  normal  1  normal  0.838674  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0068  CDS  NC_013440  100792  103797  +  3006  cysteine-rich repeat protein  YP_003264602  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0069  CDS  NC_013440  103817  105514  -  1698  metallophosphoesterase  YP_003264603  normal  0.242459  normal  0.667215  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0070  CDS  NC_013440  105888  107264  +  1377  OmpA/MotB domain protein  YP_003264604  normal  1  normal  0.870169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0071  CDS  NC_013440  107795  108859  -  1065  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  YP_003264605  normal  1  normal  0.81164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0072  CDS  NC_013440  108914  110794  -  1881  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  YP_003264606  normal  1  normal  0.892372  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0073  CDS  NC_013440  111277  112134  +  858  General secretory system II protein E domain protein  YP_003264607  normal  1  normal  0.559065  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0074  CDS  NC_013440  112151  115054  +  2904  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  YP_003264608  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0075  CDS  NC_013440  115596  116570  -  975  Sec-independent protein translocase, TatC subunit  YP_003264609  normal  1  normal  0.96212  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0076  CDS  NC_013440  116563  117132  -  570  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  YP_003264610  normal  1  normal  0.85392  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0077  CDS  NC_013440  117256  118713  -  1458  VanZ family protein  YP_003264611  normal  1  normal  0.720807  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0078  CDS  NC_013440  118939  122010  +  3072  hypothetical protein  YP_003264612  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0079  CDS  NC_013440  122081  123742  +  1662  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_003264613  normal  1  normal  0.737985  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0080  CDS  NC_013440  124038  126788  +  2751  serine/threonine protein kinase  YP_003264614  normal  1  normal  0.861573  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0081  CDS  NC_013440  126986  129286  +  2301  capsular exopolysaccharide family  YP_003264615  normal  1  normal  0.80701  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0082  CDS  NC_013440  129283  131265  +  1983  polysaccharide biosynthesis protein CapD  YP_003264616  normal  1  normal  0.81164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0083  CDS  NC_013440  131354  132241  -  888  hypothetical protein  YP_003264617  normal  0.840734  normal  0.665697  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0084  CDS  NC_013440  132392  133102  +  711  phospholipid/glycerol acyltransferase  YP_003264618  normal  1  normal  0.667757  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0085  CDS  NC_013440  133272  135794  +  2523  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  YP_003264619  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0086  CDS  NC_013440  135901  136479  -  579  hypothetical protein  YP_003264620  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0087  CDS  NC_013440  136541  138643  -  2103  serine/threonine protein kinase  YP_003264621  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0088  CDS  NC_013440  138763  140271  -  1509  Amidase  YP_003264622  normal  1  normal  0.777879  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0089  CDS  NC_013440  140268  141443  -  1176  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  YP_003264623  normal  0.442133  normal  0.763555  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0090  CDS  NC_013440  141686  142213  +  528  YceI family protein  YP_003264624  normal  0.108082  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0091  CDS  NC_013440  142325  144628  -  2304  peptidase M16 domain protein  YP_003264625  normal  0.219479  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0092  CDS  NC_013440  144664  146112  -  1449  peptidase M16 domain protein  YP_003264626  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0093  CDS  NC_013440  146452  146643  -  192  hypothetical protein  YP_003264627  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0094  CDS  NC_013440  146909  147130  +  222  ribosomal protein S21  YP_003264628  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0095  CDS  NC_013440  147216  148097  -  882  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_003264629  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0096  CDS  NC_013440  148233  149144  +  912  ribosomal L11 methyltransferase  YP_003264630  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0097  CDS  NC_013440  149147  149899  +  753  protein of unknown function DUF558  YP_003264631  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0098  CDS  NC_013440  149932  150546  +  615  RDD domain containing protein  YP_003264632  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0099  CDS  NC_013440  150550  152856  +  2307  General secretory system II protein E domain protein  YP_003264633  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Hoch_0100  CDS  NC_013440  152984  155392  -  2409  alpha amylase catalytic region  YP_003264634  normal  1  normal  1  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 70    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>