7399 genes were found for organism Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 74    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Cpin_0001  CDS  NC_013132  126  1559  +  1434  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_003119711  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0002  CDS  NC_013132  1698  2234  +  537  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  YP_003119712  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0003  CDS  NC_013132  2714  3670  +  957  anti-FecI sigma factor, FecR  YP_003119713  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0004  CDS  NC_013132  3910  7302  +  3393  TonB-dependent receptor plug  YP_003119714  normal  0.138653  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0005  CDS  NC_013132  7325  8839  +  1515  RagB/SusD domain protein  YP_003119715  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0006  CDS  NC_013132  9027  10859  +  1833  Alkaline phosphatase  YP_003119716  normal  0.50499  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0007  CDS  NC_013132  10958  11773  -  816  hypothetical protein  YP_003119717  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0008  CDS  NC_013132  11763  12794  -  1032  hypothetical protein  YP_003119718  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0009  CDS  NC_013132  12971  14029  -  1059  Type IIA topoisomerase (DNA gyrase/topo II topoisomerase IV) B subunit-like protein  YP_003119719  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0010  CDS  NC_013132  14069  14728  -  660  two component transcriptional regulator, LuxR family  YP_003119720  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0011  CDS  NC_013132  14721  15506  -  786  histidine kinase  YP_003119721  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0012  CDS  NC_013132  15461  16135  -  675  hypothetical protein  YP_003119722  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0013  CDS  NC_013132  16142  16726  -  585  hypothetical protein  YP_003119723  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0014  CDS  NC_013132  16975  18066  +  1092  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  YP_003119724  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0015  CDS  NC_013132  18056  19609  +  1554  hypothetical protein  YP_003119725  normal  0.364148  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0016  CDS  NC_013132  19620  20486  +  867  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  YP_003119726  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0017  CDS  NC_013132  20571  22211  -  1641  peptidase M28  YP_003119727  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0018  CDS  NC_013132  22332  23375  +  1044  helix-turn-helix domain protein  YP_003119728  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0019  CDS  NC_013132  23557  23724  +  168  hypothetical protein  YP_003119729  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0020  CDS  NC_013132  23772  25049  -  1278  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  YP_003119730  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0021  CDS  NC_013132  25267  26271  +  1005  transcriptional regulator, AraC family  YP_003119731  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0022  CDS  NC_013132  26569  28398  +  1830  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  YP_003119732  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0023  CDS  NC_013132  28422  28760  -  339  hypothetical protein  YP_003119733  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0024  CDS  NC_013132  28887  29225  -  339  hypothetical protein  YP_003119734  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0025  CDS  NC_013132  29511  32027  +  2517  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  YP_003119735  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0026  CDS  NC_013132  32185  32325  +  141  hypothetical protein  YP_003119736  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0027  CDS  NC_013132  32462  32851  +  390  hypothetical protein  YP_003119737  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0028  CDS  NC_013132  32856  33431  +  576  hypothetical protein  YP_003119738  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0029  CDS  NC_013132  33443  34438  +  996  hypothetical protein  YP_003119739  normal  0.759197  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0030  CDS  NC_013132  34570  35058  -  489  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  YP_003119740  normal  0.0252535  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0031  CDS  NC_013132  35061  38162  -  3102  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  YP_003119741  unclonable  0.00000538665  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0032  CDS  NC_013132  38269  39789  -  1521  hypothetical protein  YP_003119742  normal  0.0423403  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0033    NC_013132  40141  40269  +  129      normal  0.267796  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0034    NC_013132  40349  40957  -  609      normal  0.512094  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0035  CDS  NC_013132  41299  41649  +  351  hypothetical protein  YP_003119743  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0036  CDS  NC_013132  42406  42672  +  267  transposase IS3/IS911 family protein  YP_003119744  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0037  CDS  NC_013132  43039  44586  +  1548  Integrase catalytic region  YP_003119745  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0038  CDS  NC_013132  44607  45347  +  741  IstB domain protein ATP-binding protein  YP_003119746  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0039  CDS  NC_013132  45532  45864  -  333  hypothetical protein  YP_003119747  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0040    NC_013132  45893  46119  +  227      normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0041  CDS  NC_013132  46603  49251  -  2649  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  YP_003119748  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0042  CDS  NC_013132  49354  50772  -  1419  RagB/SusD domain protein  YP_003119749  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0043  CDS  NC_013132  50784  54053  -  3270  TonB-dependent receptor plug  YP_003119750  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0044  CDS  NC_013132  54437  54988  +  552  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  YP_003119751  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0045  CDS  NC_013132  55025  56155  +  1131  anti-FecI sigma factor, FecR  YP_003119752  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0046  CDS  NC_013132  56152  56742  +  591  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  YP_003119753  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0047  CDS  NC_013132  56785  57780  +  996  transcriptional regulator, AraC family  YP_003119754  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0048  CDS  NC_013132  57767  58258  -  492  hypothetical protein  YP_003119755  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0049  CDS  NC_013132  58413  59885  +  1473  hypothetical protein  YP_003119756  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0050  CDS  NC_013132  59934  60914  +  981  hypothetical protein  YP_003119757  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0051  CDS  NC_013132  60963  61529  -  567  hypothetical protein  YP_003119758  normal  0.655941  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0052  CDS  NC_013132  62333  63127  +  795  hypothetical protein  YP_003119759  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0053  CDS  NC_013132  62994  64448  -  1455  hypothetical protein  YP_003119760  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0054  CDS  NC_013132  64866  66791  +  1926  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  YP_003119761  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0055  CDS  NC_013132  66785  67132  -  348  hypothetical protein  YP_003119762  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0056  CDS  NC_013132  67214  68575  -  1362  RagB/SusD domain protein  YP_003119763  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0057  CDS  NC_013132  68586  71630  -  3045  TonB-dependent receptor plug  YP_003119764  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0058  CDS  NC_013132  71777  72325  +  549  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  YP_003119765  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0059  CDS  NC_013132  72396  73538  +  1143  anti-FecI sigma factor, FecR  YP_003119766  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0060  CDS  NC_013132  73551  74540  +  990  transcriptional regulator, AraC family  YP_003119767  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0061  CDS  NC_013132  74590  77295  +  2706  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  YP_003119768  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0062  CDS  NC_013132  77417  77956  +  540  hypothetical protein  YP_003119769  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0063  CDS  NC_013132  78150  79151  +  1002  transcriptional regulator, AraC family  YP_003119770  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0064  CDS  NC_013132  79330  80979  +  1650  hypothetical protein  YP_003119771  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0065  CDS  NC_013132  81398  82597  +  1200  hypothetical protein  YP_003119772  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0066  CDS  NC_013132  82615  83859  -  1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  YP_003119773  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0067  CDS  NC_013132  83951  84619  +  669  protein of unknown function DUF1345  YP_003119774  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0068  CDS  NC_013132  84698  85657  -  960  HTTM domain protein  YP_003119775  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0069  CDS  NC_013132  85669  86157  -  489  hypothetical protein  YP_003119776  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0070  CDS  NC_013132  86314  87147  -  834  hypothetical protein  YP_003119777  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0071  CDS  NC_013132  87328  87567  -  240  hypothetical protein  YP_003119778  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0072  CDS  NC_013132  87642  87908  -  267  hypothetical protein  YP_003119779  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0073  CDS  NC_013132  88100  88777  +  678  NUDIX hydrolase  YP_003119780  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0074  CDS  NC_013132  88783  89331  +  549  hypothetical protein  YP_003119781  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0075  CDS  NC_013132  89333  89875  +  543  phosphotransferase KptA/Tpt1  YP_003119782  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0076  CDS  NC_013132  89881  90810  +  930  ADP-ribosylation/Crystallin J1  YP_003119783  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0077  CDS  NC_013132  90811  91542  +  732  metallophosphoesterase  YP_003119784  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0078  CDS  NC_013132  91539  92192  -  654  hypothetical protein  YP_003119785  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0079  CDS  NC_013132  92363  94615  +  2253  cell wall/surface repeat protein  YP_003119786  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0080  CDS  NC_013132  94753  95724  -  972  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  YP_003119787  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0081  CDS  NC_013132  95876  97459  +  1584  L-amino-acid oxidase  YP_003119788  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0082  CDS  NC_013132  97495  98667  +  1173  aminotransferase class I and II  YP_003119789  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0083  CDS  NC_013132  98680  99663  +  984  Hedgehog/intein hint domain protein  YP_003119790  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0084  CDS  NC_013132  99721  101799  -  2079  translation elongation factor G  YP_003119791  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0085  CDS  NC_013132  102313  103176  -  864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_003119792  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0086  CDS  NC_013132  103462  104616  -  1155  hypothetical protein  YP_003119793  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0087  CDS  NC_013132  104684  105508  +  825  hypothetical protein  YP_003119794  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0088  CDS  NC_013132  105837  106751  +  915  hypothetical protein  YP_003119795  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0089  CDS  NC_013132  106979  109012  -  2034  protein of unknown function DUF1680  YP_003119796  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0090  CDS  NC_013132  109177  109734  -  558  hypothetical protein  YP_003119797  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0091  CDS  NC_013132  109963  110160  -  198  hypothetical protein  YP_003119798  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0092  CDS  NC_013132  110267  110995  +  729  hypothetical protein  YP_003119799  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0093  CDS  NC_013132  111040  113235  +  2196  group II decarboxylase family protein  YP_003119800  normal  1  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0094    NC_013132  113345  113739  +  395      normal  0.335138  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0095  CDS  NC_013132  113747  116581  -  2835  hypothetical protein  YP_003119801  normal  0.0167814  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0096  CDS  NC_013132  116800  117090  +  291  hypothetical protein  YP_003119802  decreased coverage  0.00000138623  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0097  CDS  NC_013132  117171  117821  -  651  protein of unknown function DUF1349  YP_003119803  hitchhiker  0.000978689  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0098  CDS  NC_013132  117936  118697  +  762  transcriptional regulator, LuxR family  YP_003119804  hitchhiker  0.00697344  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0099  CDS  NC_013132  118800  119306  +  507  methionine sulfoxide reductase A  YP_003119805  normal  0.101937  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Cpin_0100  CDS  NC_013132  119379  119909  +  531  hypothetical protein  YP_003119806  normal  0.674654  normal  1  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 74    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>