9127 genes were found for organism Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 92    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Caci_0001  CDS  NC_013131  370  2082  +  1713  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_003110797  decreased coverage  0.000116219  normal  0.231349  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0002  CDS  NC_013131  2834  4024  +  1191  DNA polymerase III subunit beta  YP_003110798  normal  0.0135269  normal  0.401999  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0003  CDS  NC_013131  4110  4988  +  879  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  YP_003110799  normal  0.145093  normal  0.523457  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0004  CDS  NC_013131  4998  6143  +  1146  DNA replication and repair protein RecF  YP_003110800  normal  0.321306  normal  0.933031  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0005  CDS  NC_013131  6140  6658  +  519  protein of unknown function DUF721  YP_003110801  normal  0.44696  normal  0.799003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0006  CDS  NC_013131  7225  9210  +  1986  DNA gyrase subunit B  YP_003110802  normal  0.925878  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0007  CDS  NC_013131  9293  11920  +  2628  DNA gyrase subunit A  YP_003110803  normal  0.876673  normal  0.542792  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0008  CDS  NC_013131  12855  13391  +  537  hypothetical protein  YP_003110804  normal  0.368186  normal  0.576466  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0009  CDS  NC_013131  13602  14144  -  543  hypothetical protein  YP_003110805  normal  0.336851  normal  0.758616  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0010  CDS  NC_013131  14277  14699  -  423  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  YP_003110806  normal  0.584311  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0011  CDS  NC_013131  14928  15650  -  723  transcriptional regulator, GntR family  YP_003110807  normal  0.603187  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0012  CDS  NC_013131  15874  16083  +  210  hypothetical protein  YP_003110808  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0013  CDS  NC_013131  16080  16481  +  402  hypothetical protein  YP_003110809  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0014  CDS  NC_013131  16485  16967  +  483  putative signal transduction histidine kinase  YP_003110810  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0015  CDS  NC_013131  16967  17629  +  663  transcriptional regulator, XRE family  YP_003110811  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0016  CDS  NC_013131  17749  18954  -  1206  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  YP_003110812  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0017  CDS  NC_013131  19091  19840  +  750  hypothetical protein  YP_003110813  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0018  CDS  NC_013131  19886  20500  -  615  hypothetical protein  YP_003110814  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0019  CDS  NC_013131  20593  21360  -  768  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  YP_003110815  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0020  CDS  NC_013131  21461  22336  -  876  transcriptional regulator, XRE family  YP_003110816  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0021  CDS  NC_013131  22500  23396  -  897  transcriptional regulator, XRE family  YP_003110817  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0022  CDS  NC_013131  23568  24164  +  597  protein of unknown function UPF0016  YP_003110818  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0023  CDS  NC_013131  24190  24807  -  618  transcriptional regulator, TetR family  YP_003110819  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0024  CDS  NC_013131  24904  26529  +  1626  major facilitator superfamily MFS_1  YP_003110820  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0025  CDS  NC_013131  26620  27483  -  864  NmrA family protein  YP_003110821  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0026  CDS  NC_013131  27626  28087  +  462  transcriptional regulator, HxlR family  YP_003110822  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0027  CDS  NC_013131  28115  28855  +  741  protein tyrosine/serine phosphatase  YP_003110823  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0028  CDS  NC_013131  28835  29308  -  474  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_003110824  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0029  CDS  NC_013131  29325  29969  -  645  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  YP_003110825  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0030  CDS  NC_013131  30098  30643  +  546  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  YP_003110826  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0031  CDS  NC_013131  30640  31470  +  831  putative integral membrane protein  YP_003110827  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0032  CDS  NC_013131  31496  32140  +  645  Methyltransferase type 11  YP_003110828  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0033  CDS  NC_013131  33113  34141  +  1029  FHA domain containing protein  YP_003110829  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0034  CDS  NC_013131  34163  34690  +  528  FHA domain containing protein  YP_003110830  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0035  CDS  NC_013131  34710  36773  +  2064  protein serine/threonine phosphatase  YP_003110831  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0036  CDS  NC_013131  36782  38761  +  1980  cell cycle protein  YP_003110832  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0037  CDS  NC_013131  38758  40230  +  1473  Peptidoglycan glycosyltransferase  YP_003110833  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0038  CDS  NC_013131  40430  42532  +  2103  serine/threonine protein kinase  YP_003110834  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0039  CDS  NC_013131  42621  43256  -  636  para-aminobenzoate synthase component II  YP_003110835  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0040  CDS  NC_013131  43286  43444  -  159  hypothetical protein  YP_003110836  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0041  CDS  NC_013131  43506  44222  -  717  sortase family protein  YP_003110837  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0042  CDS  NC_013131  44241  45053  -  813  protein of unknown function DUF881  YP_003110838  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0043  CDS  NC_013131  45132  45386  +  255  putative septation inhibitor protein  YP_003110839  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0044  CDS  NC_013131  45480  46550  -  1071  Rhomboid family protein  YP_003110840  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0045  CDS  NC_013131  46660  47241  -  582  Peptidylprolyl isomerase  YP_003110841  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0046  CDS  NC_013131  47443  48078  +  636  hypothetical protein  YP_003110842  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0047  CDS  NC_013131  48321  49223  -  903  hypothetical protein  YP_003110843  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0048  CDS  NC_013131  49198  49590  -  393  hypothetical protein  YP_003110844  normal  0.653872  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0049  CDS  NC_013131  49590  49766  -  177  hypothetical protein  YP_003110845  normal  0.92446  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0050  CDS  NC_013131  49782  50486  -  705  type II secretion system protein  YP_003110846  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0051  CDS  NC_013131  50483  51295  -  813  integral membrane protein  YP_003110847  normal  0.741215  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0052  CDS  NC_013131  51292  52770  -  1479  type II secretion system protein E  YP_003110848  normal  0.309192  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0053  CDS  NC_013131  52767  54476  -  1710  hypothetical protein  YP_003110849  normal  0.544146  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0054  CDS  NC_013131  55176  56021  +  846  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  YP_003110850  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0055  CDS  NC_013131  56106  57116  -  1011  TrkA-N domain protein  YP_003110851  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0056  CDS  NC_013131  57158  58456  -  1299  MoeA domain protein domain I and II  YP_003110852  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0057  CDS  NC_013131  58453  59514  -  1062  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein  YP_003110853  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0058  CDS  NC_013131  59678  60886  +  1209  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  YP_003110854  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0059  CDS  NC_013131  60895  61416  +  522  hypothetical protein  YP_003110855  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0060  CDS  NC_013131  61413  61823  +  411  protein of unknown function DUF35  YP_003110856  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0061  CDS  NC_013131  61829  62908  +  1080  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  YP_003110857  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0062  CDS  NC_013131  62905  63306  +  402  MaoC domain protein dehydratase  YP_003110858  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0063  CDS  NC_013131  63309  64481  +  1173  lipid-transfer protein  YP_003110859  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0064  CDS  NC_013131  64495  65247  +  753  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  YP_003110860  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0065  CDS  NC_013131  65385  66143  +  759  transcriptional regulator, MerR family  YP_003110861  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0066  CDS  NC_013131  66209  67510  -  1302  Na+/H+ antiporter NhaA  YP_003110862  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0067  CDS  NC_013131  67729  69684  -  1956  acetate/CoA ligase  YP_003110863  normal  0.118091  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0068  CDS  NC_013131  70063  70797  -  735  two component transcriptional regulator, LytTR family  YP_003110864  decreased coverage  0.00288448  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0069  CDS  NC_013131  70820  72022  -  1203  signal transduction histidine kinase, LytS  YP_003110865  normal  0.0746502  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0070  CDS  NC_013131  72113  72721  +  609  transcriptional regulator, TetR family  YP_003110866  normal  0.128358  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0071  CDS  NC_013131  72736  73662  +  927  hypothetical protein  YP_003110867  normal  0.603187  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0072  CDS  NC_013131  73628  74605  -  978  hypothetical protein  YP_003110868  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0073  CDS  NC_013131  74795  75577  +  783  hypothetical protein  YP_003110869  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0074  CDS  NC_013131  75654  76394  -  741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_003110870  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0075  CDS  NC_013131  76491  77075  +  585  transcriptional regulator, TetR family  YP_003110871  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0076  CDS  NC_013131  77516  78517  +  1002  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  YP_003110872  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0077  CDS  NC_013131  78533  79129  +  597  hypothetical protein  YP_003110873  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0078  CDS  NC_013131  79104  80204  -  1101  aminoglycoside phosphotransferase  YP_003110874  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0079  CDS  NC_013131  80355  81437  +  1083  putative esterase  YP_003110875  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0080  CDS  NC_013131  81501  82199  -  699  hypothetical protein  YP_003110876  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0081  CDS  NC_013131  82507  84381  +  1875  molecular chaperone DnaK  YP_003110877  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0082  CDS  NC_013131  84577  85245  +  669  GrpE protein  YP_003110878  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0083  CDS  NC_013131  85314  86438  +  1125  chaperone protein DnaJ  YP_003110879  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0084  CDS  NC_013131  86446  86916  +  471  transcriptional regulator, MerR family  YP_003110880  normal  1  normal  1  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0085  CDS  NC_013131  87023  89641  +  2619  ATP-dependent chaperone ClpB  YP_003110881  normal  1  normal  0.802904  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0086  CDS  NC_013131  89681  90544  +  864  hypothetical protein  YP_003110882  normal  1  normal  0.202982  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0087  CDS  NC_013131  90541  90918  +  378  hypothetical protein  YP_003110883  normal  1  normal  0.193229  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0088  CDS  NC_013131  90866  91813  -  948  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_003110884  normal  1  normal  0.152071  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0089  CDS  NC_013131  91864  93579  -  1716  serine/threonine protein kinase  YP_003110885  normal  1  normal  0.181904  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0090  CDS  NC_013131  93643  94437  -  795  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  YP_003110886  normal  1  normal  0.0935049  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0091  CDS  NC_013131  94534  96027  -  1494  catalytic domain of components of various dehydrogenase complexes  YP_003110887  normal  1  normal  0.0517108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0092  CDS  NC_013131  96046  97041  -  996  Transketolase central region  YP_003110888  normal  1  normal  0.0757914  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0093  CDS  NC_013131  97043  98170  -  1128  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  YP_003110889  normal  1  normal  0.0532075  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0094  CDS  NC_013131  98378  99079  +  702  two component transcriptional regulator, LuxR family  YP_003110890  normal  1  normal  0.0277195  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0095  CDS  NC_013131  99127  99723  -  597  transcriptional regulator, TetR family  YP_003110891  normal  1  normal  0.0478352  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0096  CDS  NC_013131  99812  100978  +  1167  monooxygenase FAD-binding  YP_003110892  normal  1  normal  0.0544698  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0097  CDS  NC_013131  100989  101933  +  945  Prephenate dehydratase  YP_003110893  normal  1  normal  0.0315701  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0098  CDS  NC_013131  101920  102750  -  831  hypothetical protein  YP_003110894  normal  1  normal  0.0307347  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0099  CDS  NC_013131  102850  103614  +  765  LamB/YcsF family protein  YP_003110895  normal  1  normal  0.0180068  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Caci_0100  CDS  NC_013131  103647  105341  +  1695  Allophanate hydrolase subunit 2  YP_003110896  normal  0.368046  normal  0.0250714  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 92    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>