5471 genes were found for organism Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 55    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Namu_0001  CDS  NC_013235  176  1849  +  1674  chromosomal replication initiation protein  YP_003199428  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0002  CDS  NC_013235  2436  3662  +  1227  DNA polymerase III, beta subunit  YP_003199429  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0003  CDS  NC_013235  3747  4652  +  906  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  YP_003199430  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0004  CDS  NC_013235  4728  5870  +  1143  DNA replication and repair protein RecF  YP_003199431  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0005  CDS  NC_013235  5927  6493  +  567  protein of unknown function DUF721  YP_003199432  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0006  CDS  NC_013235  6560  7174  -  615  hypothetical protein  YP_003199433  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0007  CDS  NC_013235  7832  9844  +  2013  DNA gyrase, B subunit  YP_003199434  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0008  CDS  NC_013235  10015  12510  +  2496  DNA gyrase subunit A  YP_003199435  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0009  CDS  NC_013235  12723  13046  +  324  hypothetical protein  YP_003199436  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0010  CDS  NC_013235  13125  14000  +  876  Bile acid:sodium symporter  YP_003199437  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0011  CDS  NC_013235  14470  14616  +  147  hypothetical protein  YP_003199438  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0012  CDS  NC_013235  14767  15525  -  759  triosephosphate isomerase  YP_003199439  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0013  CDS  NC_013235  15562  16848  -  1287  Ribulose-bisphosphate carboxylase  YP_003199440  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0014  CDS  NC_013235  16936  17670  +  735  glutamine amidotransferase  YP_003199441  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0015  CDS  NC_013235  17674  18018  +  345  hypothetical protein  YP_003199442  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0016  CDS  NC_013235  18068  19756  +  1689  FAD dependent oxidoreductase  YP_003199443  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0017  CDS  NC_013235  19821  21164  -  1344  Amidase  YP_003199444  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0018  CDS  NC_013235  21499  21855  +  357  hypothetical protein  YP_003199445  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0019  CDS  NC_013235  21877  23046  +  1170  hypothetical protein  YP_003199446  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0020  CDS  NC_013235  23132  25150  +  2019  hypothetical protein  YP_003199447  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0021  CDS  NC_013235  25256  26371  +  1116  hypothetical protein  YP_003199448  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0022  CDS  NC_013235  26368  26676  +  309  hypothetical protein  YP_003199449  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0023  CDS  NC_013235  26723  27106  -  384  hypothetical protein  YP_003199450  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0024  CDS  NC_013235  27216  28115  +  900  Auxin Efflux Carrier  YP_003199451  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0025  CDS  NC_013235  28251  29090  +  840  hypothetical protein  YP_003199452  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0026  CDS  NC_013235  29352  31796  +  2445  glycogen/starch/alpha-glucan phosphorylase  YP_003199453  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0027  CDS  NC_013235  31869  33005  +  1137  OmpA/MotB domain protein  YP_003199454  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0028  CDS  NC_013235  33360  34202  +  843  hypothetical protein  YP_003199455  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0029  CDS  NC_013235  34253  34924  -  672  GPR1/FUN34/yaaH family protein  YP_003199456  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0030  CDS  NC_013235  35175  36800  -  1626  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_003199457  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0031  CDS  NC_013235  37024  38223  -  1200  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  YP_003199458  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0032  CDS  NC_013235  38382  38987  +  606  transcriptional regulator, MarR family  YP_003199459  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0033  CDS  NC_013235  38984  40609  +  1626  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  YP_003199460  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0034  CDS  NC_013235  40892  41938  +  1047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  YP_003199461  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0035  CDS  NC_013235  42022  42525  -  504  hypothetical protein  YP_003199462  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0036  CDS  NC_013235  42653  42910  +  258  hypothetical protein  YP_003199463  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0037  CDS  NC_013235  42936  43847  -  912  histidine kinase  YP_003199464  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0038  CDS  NC_013235  43955  44626  -  672  two component transcriptional regulator, winged helix family  YP_003199465  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0039  CDS  NC_013235  44734  46053  -  1320  formiminoglutamate deiminase  YP_003199466  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0040  CDS  NC_013235  46106  47761  -  1656  urocanate hydratase  YP_003199467  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0041  CDS  NC_013235  48240  49703  +  1464  multicopper oxidase type 2  YP_003199468  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0042  CDS  NC_013235  49700  51337  +  1638  FAD linked oxidase domain protein  YP_003199469  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0043  CDS  NC_013235  51410  52216  +  807  transcriptional regulator, IclR family  YP_003199470  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0044  CDS  NC_013235  52369  53544  +  1176  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  YP_003199471  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0045  CDS  NC_013235  53537  54397  +  861  citrate synthase  YP_003199472  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0046  CDS  NC_013235  54390  55253  +  864  Extradiol ring-cleavage dioxygenase class III protein subunit B  YP_003199473  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0047  CDS  NC_013235  55255  55614  +  360  hypothetical protein  YP_003199474  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0048  CDS  NC_013235  55627  57132  +  1506  amidohydrolase  YP_003199475  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0049  CDS  NC_013235  57132  57350  +  219  hypothetical protein  YP_003199476  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0050  CDS  NC_013235  57350  58327  +  978  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  YP_003199477  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0051  CDS  NC_013235  58375  58629  +  255  Rv0623 family protein transcription factor  YP_003199478  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0052  CDS  NC_013235  58626  59027  +  402  PilT protein domain protein  YP_003199479  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0053  CDS  NC_013235  59425  62850  +  3426  SNF2-related protein  YP_003199480  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0054  CDS  NC_013235  63184  64722  +  1539  PTS system, mannitol-specific IIC subunit  YP_003199481  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0055  CDS  NC_013235  64952  65389  +  438  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system EIIA 2  YP_003199482  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0056  CDS  NC_013235  65403  66557  +  1155  mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase  YP_003199483  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0057  CDS  NC_013235  66660  68906  +  2247  6-phosphofructokinase  YP_003199484  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0058  CDS  NC_013235  68975  70141  +  1167  AAA ATPase  YP_003199485  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0059    NC_013235  70222  71208  +  987      normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0060  CDS  NC_013235  71270  72055  +  786  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  YP_003199486  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0061  CDS  NC_013235  72298  73722  -  1425  FAD linked oxidase domain protein  YP_003199487  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0062  CDS  NC_013235  73877  74155  -  279  hypothetical protein  YP_003199488  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0063  CDS  NC_013235  74205  74315  -  111  hypothetical protein  YP_003199489  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0064  CDS  NC_013235  74558  75064  -  507  NUDIX hydrolase  YP_003199490  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0065  CDS  NC_013235  75209  76198  +  990  cation diffusion facilitator family transporter  YP_003199491  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0066  CDS  NC_013235  76213  76626  -  414  ferric uptake regulator, Fur family  YP_003199492  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0067  CDS  NC_013235  76818  77432  +  615  DNJ31; DnaJ-like protein  YP_003199493  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0068  CDS  NC_013235  77491  78027  +  537  Peptidylprolyl isomerase  YP_003199494  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0069  CDS  NC_013235  78092  78970  +  879  Rhomboid family protein  YP_003199495  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0070  CDS  NC_013235  78948  79400  -  453  hypothetical protein  YP_003199496  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0071  CDS  NC_013235  79484  79771  -  288  protein of unknown function UPF0233  YP_003199497  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0072  CDS  NC_013235  79953  80681  +  729  protein of unknown function DUF881  YP_003199498  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0073  CDS  NC_013235  80678  81538  +  861  peptidase C60 sortase A and B  YP_003199499  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0074  CDS  NC_013235  81550  81705  +  156  hypothetical protein  YP_003199500  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0075  CDS  NC_013235  81727  82389  +  663  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  YP_003199501  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0076    NC_013235  82468  83613  -  1146      normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0077  CDS  NC_013235  84213  86243  -  2031  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  YP_003199502  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0078  CDS  NC_013235  86395  87543  -  1149  serine/threonine protein kinase  YP_003199503  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0079  CDS  NC_013235  87562  89043  -  1482  Peptidoglycan glycosyltransferase  YP_003199504  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0080  CDS  NC_013235  89040  90503  -  1464  cell cycle protein  YP_003199505  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0081  CDS  NC_013235  90500  92059  -  1560  protein serine/threonine phosphatase  YP_003199506  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0082  CDS  NC_013235  92139  92609  -  471  FHA domain containing protein  YP_003199507  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0083  CDS  NC_013235  92646  93830  -  1185  FHA domain containing protein  YP_003199508  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0084  CDS  NC_013235  94027  94665  -  639  protein of unknown function UPF0029  YP_003199509  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0085    NC_013235  94800  96166  -  1367      normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0086    NC_013235  96172  99417  -  3246      normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0087  CDS  NC_013235  97344  98744  +  1401  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  YP_003199510  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0088  CDS  NC_013235  99639  99794  -  156  hypothetical protein  YP_003199511  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0089  CDS  NC_013235  99913  100707  -  795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_003199512  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0090  CDS  NC_013235  100760  101410  +  651  transcriptional regulator, TetR family  YP_003199513  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0091  CDS  NC_013235  101840  102853  -  1014  hypothetical protein  YP_003199514  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0092  CDS  NC_013235  103192  104178  +  987  hypothetical protein  YP_003199515  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0093  CDS  NC_013235  104183  105820  -  1638  putative transcriptional regulator  YP_003199516  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0094  CDS  NC_013235  105992  106969  -  978  Helix-turn-helix type 11 domain protein  YP_003199517  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0095  CDS  NC_013235  107100  108101  +  1002  ABC transporter related  YP_003199518  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0096  CDS  NC_013235  108191  108934  +  744  ABC-2 type transporter  YP_003199519  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0097  CDS  NC_013235  109024  109998  +  975  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_003199520  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0098  CDS  NC_013235  110212  111048  +  837  hypothetical protein  YP_003199521  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0099  CDS  NC_013235  111020  111550  +  531  hypothetical protein  YP_003199522  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Namu_0100  CDS  NC_013235  111641  112648  +  1008  Pirin domain protein  YP_003199523  normal  1  normal  1  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 55    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>