2694 genes were found for organism Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 27    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Ksed_00010  CDS  NC_013169  209  1729  +  1521  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_003147866  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00020  CDS  NC_013169  2317  3453  +  1137  DNA polymerase III, beta subunit  YP_003147867  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00030  CDS  NC_013169  3514  4494  +  981  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  YP_003147868  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00040  CDS  NC_013169  4520  5692  +  1173  DNA replication and repair protein RecF  YP_003147869  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00050  CDS  NC_013169  5689  6279  +  591  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  YP_003147870  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00060  CDS  NC_013169  6516  8621  +  2106  DNA gyrase subunit B  YP_003147871  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00070  CDS  NC_013169  8710  11337  +  2628  DNA gyrase subunit A  YP_003147872  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00080  CDS  NC_013169  11334  11822  +  489  hypothetical protein  YP_003147873  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00090  tRNA  NC_013169  11941  12017  +  77  tRNA-Ile    normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00100  tRNA  NC_013169  12031  12103  +  73  tRNA-Ala    normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00110  CDS  NC_013169  12205  12468  +  264  hypothetical protein  YP_003147874  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00120  CDS  NC_013169  12478  12606  +  129  hypothetical protein  YP_003147875  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00130  CDS  NC_013169  12690  13871  -  1182  hypothetical protein  YP_003147876  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00140  CDS  NC_013169  13972  14490  +  519  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  YP_003147877  normal  0.439146  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00150  CDS  NC_013169  14512  15432  +  921  uncharacterized membrane protein  YP_003147878  normal  0.143019  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00160  CDS  NC_013169  15501  15764  -  264  hypothetical protein  YP_003147879  normal  0.160689  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00170  CDS  NC_013169  15871  16575  +  705  hypothetical protein  YP_003147880  normal  0.0524836  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00180  CDS  NC_013169  16616  19471  -  2856  protein kinase family protein with PASTA domain  YP_003147881  decreased coverage  0.000304613  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00190  CDS  NC_013169  19482  21272  -  1791  serine/threonine protein kinase  YP_003147882  normal  0.437157  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00200  CDS  NC_013169  21269  22741  -  1473  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  YP_003147883  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00210  CDS  NC_013169  22738  24129  -  1392  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  YP_003147884  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00220  CDS  NC_013169  24189  25748  -  1560  serine/threonine protein phosphatase  YP_003147885  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00230  CDS  NC_013169  25751  26242  -  492  FHA domain-containing protein  YP_003147886  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00240  CDS  NC_013169  26239  27447  -  1209  FHA domain-containing protein  YP_003147887  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00250  tRNA  NC_013169  27730  27816  +  87  tRNA-Leu    normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00260  CDS  NC_013169  27840  28568  -  729  hypothetical protein  YP_003147888  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00270  CDS  NC_013169  28602  30221  -  1620  phosphate/sulfate permease  YP_003147889  normal  1  normal  0.382263  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00280  CDS  NC_013169  30565  31593  -  1029  Pirin-related protein  YP_003147890  normal  1  normal  0.239735  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00290  CDS  NC_013169  32002  32532  +  531  hypothetical protein  YP_003147891  normal  1  normal  0.565782  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00300  CDS  NC_013169  32599  33540  -  942  hypothetical protein  YP_003147892  normal  1  normal  0.466922  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00310  CDS  NC_013169  33631  35568  -  1938  glutaminase  YP_003147893  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00320  CDS  NC_013169  35601  36134  +  534  hypothetical protein  YP_003147894  normal  1  normal  0.78022  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00330  CDS  NC_013169  36138  37127  -  990  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  YP_003147895  normal  1  normal  0.6279  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00340  CDS  NC_013169  37247  38458  +  1212  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  YP_003147896  normal  1  normal  0.349198  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00350  CDS  NC_013169  38460  39791  -  1332  prolyl aminopeptidase 2  YP_003147897  normal  1  normal  0.358137  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00360  CDS  NC_013169  39827  40258  +  432  Pyrimidine dimer DNA glycosylase /DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  YP_003147898  normal  1  normal  0.516098  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00370  CDS  NC_013169  40290  40880  -  591  hypothetical protein  YP_003147899  normal  1  normal  0.284993  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00380  CDS  NC_013169  40922  41779  -  858  biotin-dependent carboxylase-like protein  YP_003147900  normal  1  normal  0.301441  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00390  CDS  NC_013169  41776  42387  -  612  allophanate hydrolase subunit 1  YP_003147901  normal  1  normal  0.543027  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00400  CDS  NC_013169  42387  43145  -  759  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  YP_003147902  normal  1  normal  0.736442  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00410  CDS  NC_013169  43156  44436  -  1281  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  YP_003147903  normal  1  normal  0.455948  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00420  CDS  NC_013169  44512  45981  -  1470  gamma-aminobutyrate permease-like transporter  YP_003147904  normal  0.736839  normal  0.251816  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00430  CDS  NC_013169  46075  46758  +  684  transcriptional regulator  YP_003147905  normal  1  normal  0.298541  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00440  CDS  NC_013169  46892  48805  +  1914  putative hydrolase, CocE/NonD family  YP_003147906  normal  1  normal  0.403131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00450  CDS  NC_013169  48857  49096  -  240  hypothetical protein  YP_003147907  normal  1  normal  0.53099  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00460  CDS  NC_013169  49221  50918  -  1698  HNH endonuclease  YP_003147908  normal  1  normal  0.711457  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00470  CDS  NC_013169  51114  51482  -  369  ankyrin repeat-containing protein  YP_003147909  normal  1  normal  0.776802  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00480  CDS  NC_013169  51539  53608  -  2070  catalase  YP_003147910  normal  0.954008  normal  0.80551  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00490  CDS  NC_013169  53665  54459  -  795  hypothetical protein  YP_003147911  normal  0.295551  normal  0.866332  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00500  CDS  NC_013169  54493  55614  +  1122  predicted naringenin-chalcone synthase  YP_003147912  normal  0.281948  normal  0.904387  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00510  CDS  NC_013169  55611  56138  +  528  hypothetical protein  YP_003147913  normal  0.20725  normal  0.798456  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00520  CDS  NC_013169  56135  57226  +  1092  flavin-dependent dehydrogenase  YP_003147914  normal  0.845908  normal  0.877711  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00530  CDS  NC_013169  57313  57837  -  525  hypothetical protein  YP_003147915  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00540  CDS  NC_013169  58044  58379  +  336  hypothetical protein  YP_003147916  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00550  CDS  NC_013169  58469  59626  +  1158  predicted transporter component  YP_003147917  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00560  CDS  NC_013169  59684  59914  +  231  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  YP_003147918  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00570  CDS  NC_013169  60008  61147  -  1140  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  YP_003147919  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00580  CDS  NC_013169  61272  61682  +  411  hypothetical protein  YP_003147920  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00590  CDS  NC_013169  61757  63028  -  1272  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  YP_003147921  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00600  CDS  NC_013169  63102  64601  -  1500  MFS transporter, sugar porter family  YP_003147922  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00610  CDS  NC_013169  64672  68484  -  3813  predicted nuclease (RecB family)  YP_003147923  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00620  CDS  NC_013169  68558  70387  -  1830  malate dehydrogenase  YP_003147924  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00630  CDS  NC_013169  70536  70874  +  339  SH3 domain-containing protein  YP_003147925  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00640  CDS  NC_013169  70879  71289  -  411  transposase family protein  YP_003147926  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00650  CDS  NC_013169  71456  71599  +  144  hypothetical protein  YP_003147927  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00660  CDS  NC_013169  71691  72971  +  1281  transposase  YP_003147928  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00670  CDS  NC_013169  72968  73372  +  405  hypothetical protein  YP_003147929  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00680    NC_013169  73394  73657  -  264      normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00690  CDS  NC_013169  73718  74986  +  1269  flavodoxin reductase family protein  YP_003147930  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00700    NC_013169  75123  75733  +  611      normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00710  CDS  NC_013169  75743  76267  -  525  hypothetical protein  YP_003147931  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00720  CDS  NC_013169  77048  77671  -  624  Protein of unknown function (DUF1648)  YP_003147932  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00730  CDS  NC_013169  77868  79457  -  1590  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  YP_003147933  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00740  CDS  NC_013169  79522  80244  +  723  peptidase E  YP_003147934  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00750  CDS  NC_013169  80309  80659  -  351  hypothetical protein  YP_003147935  normal  0.743557  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00760  CDS  NC_013169  81135  82472  -  1338  diaminopimelate decarboxylase  YP_003147936  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00770  CDS  NC_013169  82523  83797  -  1275  LL-diaminopimelate aminotransferase  YP_003147937  normal  0.386201  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00780  CDS  NC_013169  83869  84795  -  927  dihydrodipicolinate synthase  YP_003147938  normal  0.868751  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00790  CDS  NC_013169  84792  85601  -  810  dihydrodipicolinate reductase  YP_003147939  normal  0.610424  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00800  CDS  NC_013169  85798  86148  -  351  hypothetical protein  YP_003147940  normal  0.315104  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00810  CDS  NC_013169  86235  87272  +  1038  prolyl oligopeptidase family protein  YP_003147941  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00820  CDS  NC_013169  87269  88075  +  807  3-dehydroquinate dehydratase  YP_003147942  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00830  CDS  NC_013169  88099  89463  +  1365  esterase/lipase  YP_003147943  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00840  CDS  NC_013169  89571  90842  +  1272  hypothetical protein  YP_003147944  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00850  CDS  NC_013169  90925  91548  -  624  hypothetical protein  YP_003147945  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00860  CDS  NC_013169  91706  93694  +  1989  choline/carnitine/betaine transport  YP_003147946  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00870    NC_013169  93691  94023  -  333      normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00880  CDS  NC_013169  94172  95548  -  1377  sugar phosphate permease  YP_003147947  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00890  CDS  NC_013169  95720  96109  +  390  predicted transcriptional regulator  YP_003147948  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00900  CDS  NC_013169  96224  97285  -  1062  Major Facilitator Superfamily transporter  YP_003147949  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00910  CDS  NC_013169  97291  97689  -  399  cation/cationic drug transporter  YP_003147950  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00920    NC_013169  97754  99014  -  1261      normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00930  CDS  NC_013169  99134  99502  -  369  cation/cationic drug transporter  YP_003147951  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00940  CDS  NC_013169  99499  100026  -  528  cytosine/adenosine deaminase  YP_003147952  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00950  CDS  NC_013169  100023  100646  -  624  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  YP_003147953  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00960  CDS  NC_013169  100729  101175  -  447  transcriptional regulator  YP_003147954  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00970    NC_013169  101465  101695  +  231      normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00980  CDS  NC_013169  101731  101847  +  117  hypothetical protein  YP_003147955  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_00990  CDS  NC_013169  101849  102454  -  606  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  YP_003147956  normal  0.666199  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Ksed_01000  CDS  NC_013169  102451  103569  -  1119  signal transduction histidine kinase  YP_003147957  normal  1  normal  1  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 27    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>