4278 genes were found for organism Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 43    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Bcav_0001  CDS  NC_012669  322  1791  +  1470  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_002880029  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0002  CDS  NC_012669  2331  3467  +  1137  DNA polymerase III, beta subunit  YP_002880030  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0003  CDS  NC_012669  3525  4418  +  894  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  YP_002880031  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0004  CDS  NC_012669  4429  5622  +  1194  DNA replication and repair protein RecF  YP_002880032  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0005  CDS  NC_012669  5612  6133  +  522  protein of unknown function DUF721  YP_002880033  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0006  CDS  NC_012669  6462  8519  +  2058  DNA gyrase subunit B  YP_002880034  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0007  CDS  NC_012669  8610  11267  +  2658  DNA gyrase subunit A  YP_002880035  normal  0.743623  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0008  CDS  NC_012669  11264  11980  +  717  hypothetical protein  YP_002880036  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0009  CDS  NC_012669  12213  12335  +  123  hypothetical protein  YP_002880037  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0010  CDS  NC_012669  12602  12961  -  360  YCII-related protein  YP_002880038  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0011  CDS  NC_012669  13097  13498  +  402  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_002880039  normal  0.708628  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0012  CDS  NC_012669  13509  13895  -  387  Cupin 2 conserved barrel domain protein  YP_002880040  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0013  CDS  NC_012669  14046  14252  -  207  hypothetical protein  YP_002880041  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0014  CDS  NC_012669  14291  15325  +  1035  transcriptional regulator, LacI family  YP_002880042  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0015  CDS  NC_012669  15643  17055  +  1413  extracellular solute-binding protein family 1  YP_002880043  normal  0.768674  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0016  CDS  NC_012669  17126  18061  +  936  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002880044  normal  0.17058  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0017  CDS  NC_012669  18061  18963  +  903  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002880045  normal  0.385749  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0018  CDS  NC_012669  19117  19905  -  789  mucin-associated surface protein (MASP)  YP_002880046  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0019  CDS  NC_012669  20057  20578  +  522  Peptidylprolyl isomerase  YP_002880047  normal  0.567765  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0020  CDS  NC_012669  20631  21578  +  948  Rhomboid family protein  YP_002880048  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0021  CDS  NC_012669  22157  22402  -  246  protein of unknown function UPF0233  YP_002880049  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0022  CDS  NC_012669  22526  23257  +  732  protein of unknown function DUF881  YP_002880050  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0023  CDS  NC_012669  23244  24074  +  831  sortase family protein  YP_002880051  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0024  CDS  NC_012669  24077  24241  +  165  hypothetical protein  YP_002880052  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0025  CDS  NC_012669  24238  24885  +  648  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  YP_002880053  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0026  CDS  NC_012669  24999  26804  -  1806  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  YP_002880054  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0027  CDS  NC_012669  26807  28228  -  1422  serine/threonine protein kinase  YP_002880055  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0028  CDS  NC_012669  28243  29724  -  1482  Peptidoglycan glycosyltransferase  YP_002880056  normal  0.790877  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0029  CDS  NC_012669  29721  31205  -  1485  cell cycle protein  YP_002880057  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0030  CDS  NC_012669  31205  32593  -  1389  protein serine/threonine phosphatase  YP_002880058  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0031  CDS  NC_012669  32598  33083  -  486  FHA domain containing protein  YP_002880059  normal  0.74184  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0032  CDS  NC_012669  33106  33813  -  708  FHA domain containing protein  YP_002880060  normal  0.227994  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0033  CDS  NC_012669  34416  34676  -  261  transcriptional regulator, XRE family  YP_002880061  normal  0.656945  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0034  CDS  NC_012669  34676  35173  -  498  transmembrane transport protein  YP_002880062  normal  0.474573  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0035  CDS  NC_012669  35244  35999  -  756  sortase family protein  YP_002880063  normal  0.143282  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0036  CDS  NC_012669  36084  36938  -  855  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  YP_002880064  normal  0.020454  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0037  CDS  NC_012669  36935  39430  -  2496  beta-mannosidase  YP_002880065  normal  0.306104  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0038  CDS  NC_012669  39798  41504  +  1707  extracellular solute-binding protein family 5  YP_002880066  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0039  CDS  NC_012669  41614  42603  +  990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002880067  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0040  CDS  NC_012669  42614  43576  +  963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002880068  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0041  CDS  NC_012669  43573  44448  +  876  ABC transporter related  YP_002880069  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0042  CDS  NC_012669  44445  45248  +  804  ABC transporter related  YP_002880070  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0043  CDS  NC_012669  45255  46520  +  1266  ROK family protein  YP_002880071  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0044  CDS  NC_012669  46563  47999  -  1437  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  YP_002880072  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0045  CDS  NC_012669  48068  49036  +  969  aldo/keto reductase  YP_002880073  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0046  CDS  NC_012669  49220  49780  +  561  nitroreductase  YP_002880074  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0047  CDS  NC_012669  49746  50270  -  525  GCN5-related protein N-acetyltransferase  YP_002880075  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0048  CDS  NC_012669  50312  51277  +  966  peptidase U61 LD-carboxypeptidase A  YP_002880076  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0049  CDS  NC_012669  51326  52558  +  1233  major facilitator superfamily MFS_1  YP_002880077  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0050  CDS  NC_012669  52568  53443  -  876  hypothetical protein  YP_002880078  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0051  CDS  NC_012669  53603  54091  +  489  hypothetical protein  YP_002880079  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0052  CDS  NC_012669  54095  54730  -  636  hypothetical protein  YP_002880080  normal  1  normal  0.889174  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0053  CDS  NC_012669  54916  56190  -  1275  putative alpha-galactosidase  YP_002880081  normal  1  normal  0.961191  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0054  CDS  NC_012669  56587  57105  -  519  Phosphoglycerate mutase  YP_002880082  normal  1  normal  0.864003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0055  CDS  NC_012669  57164  58135  +  972  transcriptional regulator, LacI family  YP_002880083  normal  1  normal  0.700788  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0056  CDS  NC_012669  58132  59139  +  1008  transcriptional regulator, LacI family  YP_002880084  normal  0.650576  normal  0.249866  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0057  CDS  NC_012669  59501  61432  +  1932  protein of unknown function DUF1680  YP_002880085  normal  1  normal  0.0839925  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0058  CDS  NC_012669  61486  63141  +  1656  extracellular solute-binding protein, family 1  YP_002880086  normal  1  normal  0.182513  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0059  CDS  NC_012669  63248  64210  +  963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002880087  normal  0.542171  normal  0.242962  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0060  CDS  NC_012669  64225  65181  +  957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002880088  normal  0.451347  normal  0.228121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0061  CDS  NC_012669  65181  65867  +  687  protein of unknown function DUF624  YP_002880089  normal  1  normal  0.465262  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0062  CDS  NC_012669  65896  67686  +  1791  protein of unknown function DUF1680  YP_002880090  normal  1  normal  0.560227  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0063  CDS  NC_012669  67871  68305  +  435  GCN5-related protein N-acetyltransferase  YP_002880091  normal  1  normal  0.607567  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0064  CDS  NC_012669  68461  68988  -  528  hypothetical protein  YP_002880092  normal  1  normal  0.630166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0065  CDS  NC_012669  69197  70729  +  1533  Alpha-N-arabinofuranosidase  YP_002880093  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0066  CDS  NC_012669  70799  71659  -  861  transcriptional regulator, AraC family  YP_002880094  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0067  CDS  NC_012669  71731  72546  +  816  Phytanoyl-CoA dioxygenase  YP_002880095  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0068  CDS  NC_012669  72704  74308  +  1605  ankyrin  YP_002880096  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0069  CDS  NC_012669  74423  76042  -  1620  Amidohydrolase 3  YP_002880097  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0070  CDS  NC_012669  76072  76380  -  309  hypothetical protein  YP_002880098  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0071  CDS  NC_012669  76410  77810  -  1401  FAD linked oxidase domain protein  YP_002880099  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0072  CDS  NC_012669  77983  78951  +  969  transcriptional regulator, AraC family  YP_002880100  normal  0.783427  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0073  CDS  NC_012669  79071  79679  +  609  bifunctional deaminase-reductase domain protein  YP_002880101  normal  0.785173  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0074  CDS  NC_012669  79722  80045  +  324  YCII-related protein  YP_002880102  normal  0.888616  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0075  CDS  NC_012669  80053  80652  -  600  Phosphoglycerate mutase  YP_002880103  normal  0.193041  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0076  CDS  NC_012669  80687  81913  -  1227  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  YP_002880104  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0077  CDS  NC_012669  81971  82366  +  396  hypothetical protein  YP_002880105  normal  1  normal  0.805113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0078  CDS  NC_012669  82363  83007  +  645  putative transcriptional regulator  YP_002880106  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0079  CDS  NC_012669  83000  83779  -  780  aminoglycoside phosphotransferase  YP_002880107  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0080    NC_012669  83922  84074  +  153      normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0081  CDS  NC_012669  85484  86029  +  546  hypothetical protein  YP_002880108  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0082  CDS  NC_012669  86628  87593  -  966  transcriptional regulator, TrmB  YP_002880109  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0083  CDS  NC_012669  87706  91791  +  4086  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  YP_002880110  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0084  CDS  NC_012669  92007  93005  +  999  hypothetical protein  YP_002880111  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0085  CDS  NC_012669  93074  93916  +  843  alpha/beta hydrolase fold protein  YP_002880112  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0086  CDS  NC_012669  93928  94485  -  558  GCN5-related protein N-acetyltransferase  YP_002880113  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0087  CDS  NC_012669  94888  95649  +  762  Methyltransferase type 11  YP_002880114  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0088  CDS  NC_012669  95721  96236  -  516  protein of unknown function DUF437  YP_002880115  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0089  CDS  NC_012669  96241  96795  -  555  YceI family protein  YP_002880116  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0090  CDS  NC_012669  96966  98300  +  1335  Pyrrolo-quinoline quinone  YP_002880117  normal  1  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0091  CDS  NC_012669  98409  99344  +  936  aldo/keto reductase  YP_002880118  normal  0.198362  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0092  CDS  NC_012669  99423  100733  -  1311  alanine racemase domain protein  YP_002880119  normal  0.342253  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0093  CDS  NC_012669  100822  101265  +  444  Endoribonuclease L-PSP  YP_002880120  normal  0.248821  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0094  CDS  NC_012669  101273  101482  +  210  hypothetical protein  YP_002880121  normal  0.489208  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0095  CDS  NC_012669  101916  102167  +  252  glutaredoxin-like protein NrdH  YP_002880122  normal  0.729355  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0096  CDS  NC_012669  102268  102684  +  417  NrdI protein  YP_002880123  normal  0.491931  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0097  CDS  NC_012669  102705  104810  +  2106  ribonucleoside-diphosphate reductase, alpha subunit  YP_002880124  normal  0.361083  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0098  CDS  NC_012669  104823  105629  +  807  hypothetical protein  YP_002880125  normal  0.243241  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0099  CDS  NC_012669  105626  106606  +  981  Ribonucleoside-diphosphate reductase  YP_002880126  normal  0.0986719  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Bcav_0100  CDS  NC_012669  107385  109178  +  1794  hypothetical protein  YP_002880127  normal  0.0633382  normal  1  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 43    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>