1422 genes were found for organism Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 15    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Ccur_00010  CDS  NC_013170  130  1650  +  1521  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_003150420  normal  0.993036  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00020  CDS  NC_013170  1872  2969  +  1098  DNA polymerase III, beta subunit  YP_003150421  normal  0.443906  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00030  CDS  NC_013170  2977  4113  +  1137  recF protein  YP_003150422  normal  0.172429  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00040  CDS  NC_013170  4103  4654  +  552  hypothetical protein  YP_003150423  normal  0.018938  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00050  CDS  NC_013170  4816  6753  +  1938  DNA gyrase subunit B  YP_003150424  normal  0.0377504  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00060  CDS  NC_013170  6797  9409  +  2613  DNA gyrase subunit A  YP_003150425  hitchhiker  0.00061935  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00070  tRNA  NC_013170  9520  9596  +  77  tRNA-Ile    hitchhiker  0.00000758823  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00080  tRNA  NC_013170  9672  9747  +  76  tRNA-Ala    hitchhiker  0.00000907858  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00090  CDS  NC_013170  9818  10384  +  567  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  YP_003150426  decreased coverage  0.000000577913  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00100  CDS  NC_013170  10384  12198  +  1815  GTP-binding protein TypA/BipA  YP_003150427  decreased coverage  0.0000172571  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00110  CDS  NC_013170  12702  12818  -  117  hypothetical protein  YP_003150428  hitchhiker  0.000691982  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00120  rRNA  NC_013170  12849  14352  +  1504  16S ribosomal RNA    normal  0.0247514  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00130  rRNA  NC_013170  14822  17843  +  3022  23S ribosomal RNA    normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00140  CDS  NC_013170  18251  19192  -  942  thiamine biosynthesis lipoprotein  YP_003150429  normal  1  normal  0.594186  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00150  CDS  NC_013170  19329  20315  +  987  L-asparaginase type II family protein  YP_003150430  normal  1  normal  0.589872  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00160  CDS  NC_013170  20541  22661  -  2121  DNA/RNA helicase, superfamily I  YP_003150431  normal  1  normal  0.805287  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00170  CDS  NC_013170  22665  22889  -  225  hypothetical protein  YP_003150432  normal  1  normal  0.729028  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00180  CDS  NC_013170  23263  24135  +  873  methionine aminopeptidase, type I  YP_003150433  normal  1  normal  0.55421  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00190  CDS  NC_013170  24114  24995  -  882  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase /5,10-methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+)  YP_003150434  normal  1  normal  0.483719  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00200  CDS  NC_013170  25000  25632  -  633  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  YP_003150435  normal  1  normal  0.322798  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00210  CDS  NC_013170  25897  27735  +  1839  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  YP_003150436  normal  1  normal  0.301732  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00220  CDS  NC_013170  27728  30448  +  2721  formate dehydrogenase, alpha subunit  YP_003150437  normal  1  normal  0.0797991  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00230  CDS  NC_013170  30745  32997  +  2253  dipeptidase  YP_003150438  normal  1  hitchhiker  0.00762022  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00240  CDS  NC_013170  33290  34321  +  1032  hypothetical protein  YP_003150439  normal  1  hitchhiker  0.000336169  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00250  CDS  NC_013170  34389  34883  -  495  hypothetical protein  YP_003150440  normal  1  hitchhiker  0.000127334  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00260  CDS  NC_013170  34906  35349  -  444  response regulator of the LytR/AlgR family  YP_003150441  normal  1  hitchhiker  0.000118135  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00270  CDS  NC_013170  35641  36984  -  1344  signal transduction histidine kinase  YP_003150442  normal  1  hitchhiker  0.0000230413  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00280  CDS  NC_013170  36965  37669  -  705  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  YP_003150443  normal  1  hitchhiker  0.0000064956  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00290  CDS  NC_013170  37662  38204  -  543  UBA/TS-N domain-containing protein  YP_003150444  normal  1  hitchhiker  0.00000331222  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00300  CDS  NC_013170  38690  44140  +  5451  conserved repeat protein (List_Bact_rpt)  YP_003150445  normal  0.0283714  decreased coverage  0.000000000390455  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00310  CDS  NC_013170  44311  44553  +  243  SSU ribosomal protein S16P  YP_003150446  unclonable  0.00000000491979  decreased coverage  0.00000000000378635  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00320  CDS  NC_013170  44558  44812  +  255  RNA-binding protein (KH domain)  YP_003150447  hitchhiker  0.00000739144  hitchhiker  0.00000000000355006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00330  CDS  NC_013170  44813  45517  +  705  16S rRNA processing protein RimM  YP_003150448  hitchhiker  0.000114022  hitchhiker  0.0000000000400055  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00340  CDS  NC_013170  45517  46272  +  756  tRNA (Guanine37-N(1)-) methyltransferase  YP_003150449  hitchhiker  0.00142568  hitchhiker  0.000000000209047  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00350  CDS  NC_013170  46461  47036  +  576  signal peptidase I  YP_003150450  normal  0.0652665  hitchhiker  0.0000000236329  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00360  CDS  NC_013170  47077  48198  +  1122  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  YP_003150451  normal  0.148194  hitchhiker  0.000000113884  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00370  CDS  NC_013170  48203  50287  +  2085  glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, beta subunit  YP_003150452  normal  0.740961  hitchhiker  0.00000247045  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00380  CDS  NC_013170  50284  51159  +  876  hypothetical protein  YP_003150453  normal  0.89921  hitchhiker  0.00000633643  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00390  CDS  NC_013170  51169  53880  +  2712  pyruvate phosphate dikinase  YP_003150454  normal  0.149609  hitchhiker  0.0000341949  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00400  CDS  NC_013170  54298  55869  +  1572  amino acid carrier protein  YP_003150455  normal  0.149456  hitchhiker  0.00282795  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00410  CDS  NC_013170  56933  57535  -  603  uracil-DNA glycosylase  YP_003150456  normal  1  normal  0.188097  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00420  CDS  NC_013170  57883  58230  +  348  cupin domain-containing protein  YP_003150457  normal  1  normal  0.33037  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00430  CDS  NC_013170  58347  59252  +  906  hypothetical protein  YP_003150458  normal  1  normal  0.381463  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00440  CDS  NC_013170  59386  60717  -  1332  Fe-S oxidoreductase, coproporphyrinogen III oxidase  YP_003150459  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00450  CDS  NC_013170  60794  60949  -  156  hypothetical protein  YP_003150460  normal  1  normal  0.721349  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00460  CDS  NC_013170  61126  62679  -  1554  hypothetical protein  YP_003150461  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00470  CDS  NC_013170  62764  62925  +  162  hypothetical protein  YP_003150462  normal  0.63141  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00480  CDS  NC_013170  63325  65145  -  1821  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  YP_003150463  decreased coverage  0.00118843  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00490  CDS  NC_013170  65318  67756  +  2439  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  YP_003150464  normal  0.0942837  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00500  CDS  NC_013170  67772  68392  +  621  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  YP_003150465  normal  0.791376  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00510  CDS  NC_013170  68394  69257  +  864  DMSO reductase anchor subunit  YP_003150466  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00520  CDS  NC_013170  69503  70141  +  639  uncharacterized component of anaerobic dehydrogenase  YP_003150467  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00530  CDS  NC_013170  70166  71218  +  1053  DMSO reductase anchor subunit  YP_003150468  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00540  CDS  NC_013170  71345  71599  -  255  hypothetical protein  YP_003150469  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00550  CDS  NC_013170  71620  71826  -  207  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  YP_003150470  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00560  CDS  NC_013170  71916  73061  -  1146  hypothetical protein  YP_003150471  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00570  CDS  NC_013170  73466  74122  -  657  transcriptional regulator, tetR family  YP_003150472  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00580  CDS  NC_013170  74347  75780  +  1434  predicted Fe-S oxidoreductase  YP_003150473  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00590  CDS  NC_013170  75946  76977  +  1032  predicted phosphohydrolase  YP_003150474  normal  0.632945  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00600  CDS  NC_013170  77004  77408  +  405  hypothetical protein  YP_003150475  normal  0.263766  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00610  CDS  NC_013170  77571  77993  +  423  predicted transcriptional regulator with CopG/Arc/MetJ DNA-binding domain protein and metal-binding domain protein  YP_003150476  normal  0.0616517  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00620  CDS  NC_013170  78181  79203  +  1023  hydrogenase expression/formation protein HypE  YP_003150477  hitchhiker  0.00293327  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00630  CDS  NC_013170  79236  79358  -  123  hypothetical protein  YP_003150478  decreased coverage  0.0000364486  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00640  CDS  NC_013170  79357  79545  +  189  dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin), alpha/beta subunit  YP_003150479  decreased coverage  0.0000382755  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00650  CDS  NC_013170  79917  81845  +  1929  chaperone protein DnaK  YP_003150480  normal  0.0257003  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00660  CDS  NC_013170  81851  82597  +  747  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  YP_003150481  normal  0.204562  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00670  CDS  NC_013170  82681  83646  +  966  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain protein  YP_003150482  normal  0.772796  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00680  CDS  NC_013170  83643  84035  +  393  predicted transcriptional regulator  YP_003150483  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00690  CDS  NC_013170  84276  86891  +  2616  ATP-dependent chaperone ClpB  YP_003150484  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00700  CDS  NC_013170  87090  87560  +  471  deoxycytidylate deaminase  YP_003150485  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00710  CDS  NC_013170  87779  87916  +  138  hypothetical protein  YP_003150486  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00720  CDS  NC_013170  87926  89458  +  1533  Trk-type K+ transport system, membrane component  YP_003150487  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00730  CDS  NC_013170  89455  90078  +  624  hypothetical protein  YP_003150488  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00740  CDS  NC_013170  90087  91154  +  1068  predicted GTPase  YP_003150489  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00750  CDS  NC_013170  91315  92217  +  903  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  YP_003150490  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00760  CDS  NC_013170  92257  92814  +  558  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  YP_003150491  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00770  CDS  NC_013170  93173  96961  -  3789  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  YP_003150492  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00780  CDS  NC_013170  96961  99933  -  2973  hypothetical protein  YP_003150493  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00790  CDS  NC_013170  99959  100219  +  261  hypothetical protein  YP_003150494  normal  0.384358  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00800  CDS  NC_013170  100469  101128  -  660  hypothetical protein  YP_003150495  normal  0.438932  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00810  CDS  NC_013170  101455  102897  +  1443  Cna protein B-type domain-containing protein  YP_003150496  decreased coverage  0.00133256  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00820  CDS  NC_013170  103391  105685  +  2295  putative collagen-binding protein  YP_003150497  normal  0.0774638  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00830  CDS  NC_013170  105729  107177  +  1449  Cna protein B-type domain-containing protein  YP_003150498  normal  0.444591  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00840  CDS  NC_013170  107217  108140  +  924  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  YP_003150499  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00850  CDS  NC_013170  108365  109537  +  1173  Fe-dependent oxidoreductase, alcohol dehydrogenase  YP_003150500  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00860  CDS  NC_013170  109555  110259  -  705  putative effector of murein hydrolase  YP_003150501  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00870  CDS  NC_013170  110277  111023  -  747  putative effector of murein hydrolase LrgA  YP_003150502  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00880  CDS  NC_013170  111360  111806  -  447  transcriptional regulator, MarR family  YP_003150503  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00890  CDS  NC_013170  112162  112545  -  384  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain protein  YP_003150504  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00900  CDS  NC_013170  112580  112912  -  333  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  YP_003150505  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00910  CDS  NC_013170  113406  113939  +  534  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  YP_003150506  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00920  CDS  NC_013170  114034  116247  +  2214  formate dehydrogenase alpha subunit  YP_003150507  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00930  CDS  NC_013170  116312  116911  +  600  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  YP_003150508  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00940  CDS  NC_013170  116908  118926  +  2019  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  YP_003150509  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00950  CDS  NC_013170  118937  119866  +  930  formate hydrogenlyase subunit 4  YP_003150510  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00960  CDS  NC_013170  119882  121336  +  1455  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  YP_003150511  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00970  CDS  NC_013170  121346  121999  +  654  hydrogenase 4 membrane subunit  YP_003150512  normal  1  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00980  CDS  NC_013170  122010  123611  +  1602  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  YP_003150513  normal  0.558351  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_00990  CDS  NC_013170  123620  125350  +  1731  Ni,Fe-hydrogenase III large subunit  YP_003150514  normal  0.823272  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Ccur_01000  CDS  NC_013170  125351  125896  +  546  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain I-like protein  YP_003150515  normal  0.598496  normal  1  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 15    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>