8859 genes were found for organism Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 89    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Mnod_0001  CDS  NC_011894  1500  1500  chromosomal replication initiation protein  YP_002495356  hitchhiker  0.00640124  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0002  CDS  NC_011894  1663  2784  1122  DNA polymerase III subunit beta  YP_002495357  normal  0.0823829  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0003  CDS  NC_011894  2901  4049  1149  DNA replication and repair protein RecF  YP_002495358  normal  0.241044  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0004    NC_011894  4346  4590  245      normal  0.0580424  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0005  CDS  NC_011894  4708  6558  1851  ATP-dependent DNA helicase RecQ  YP_002495359  normal  0.6085  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0006  CDS  NC_011894  6770  8899  2130  TonB-dependent siderophore receptor  YP_002495360  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0007  CDS  NC_011894  8901  10046  1146  PepSY-associated TM helix domain protein  YP_002495361  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0008  CDS  NC_011894  10128  12341  2214  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  YP_002495362  normal  0.70389  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0009  CDS  NC_011894  12368  12604  237  BolA family protein  YP_002495363  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0010  CDS  NC_011894  12622  13137  516  protein of unknown function DUF29  YP_002495364  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0011  CDS  NC_011894  13151  13489  339  glutaredoxin-like protein  YP_002495365  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0012  CDS  NC_011894  13608  14507  900  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_002495366  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0013  CDS  NC_011894  14708  14893  186  hypothetical protein  YP_002495367  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0014  CDS  NC_011894  15480  15659  180  hypothetical protein  YP_002495368  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0015  CDS  NC_011894  15663  16535  873  hypothetical protein  YP_002495369  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0016  CDS  NC_011894  16640  18697  2058  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  YP_002495370  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0017  CDS  NC_011894  18830  19576  747  Extensin family protein  YP_002495371  normal  0.638179  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0018  CDS  NC_011894  19635  20654  1020  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  YP_002495372  normal  0.363302  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0019  CDS  NC_011894  20817  21560  744  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002495373  normal  0.305196  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0020  CDS  NC_011894  21557  22696  1140  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002495374  normal  0.164397  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0021  CDS  NC_011894  22760  23692  933  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  YP_002495375  hitchhiker  0.00384901  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0022  CDS  NC_011894  23879  24307  429  response regulator receiver and SARP domain protein  YP_002495376  hitchhiker  0.000346597  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0023  CDS  NC_011894  24264  24503  240  hypothetical protein  YP_002495377  normal  0.0160118  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0024  CDS  NC_011894  24591  24980  390  hypothetical protein  YP_002495378  normal  0.0228023  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0025  CDS  NC_011894  24967  25920  954  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  YP_002495379  normal  0.076683  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0026  CDS  NC_011894  26098  27294  1197  Extracellular ligand-binding receptor  YP_002495380  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0027  CDS  NC_011894  27573  28736  1164  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  YP_002495381  normal  0.444781  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0028  CDS  NC_011894  29036  29338  303  protein of unknown function UPF0153  YP_002495382  normal  0.186945  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0029  CDS  NC_011894  29335  29595  261  putative signal peptide  YP_002495383  normal  0.180521  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0030  CDS  NC_011894  29671  30090  420  thioesterase superfamily protein  YP_002495384  normal  0.137519  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0031  CDS  NC_011894  30342  31670  1329  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  YP_002495385  normal  0.0940426  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0032  CDS  NC_011894  31804  32214  411  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  YP_002495386  normal  0.195903  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0033  CDS  NC_011894  32653  34866  2214  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  YP_002495387  normal  0.0805282  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0034  CDS  NC_011894  35063  35653  591  orotate phosphoribosyltransferase  YP_002495388  normal  0.153215  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0035  CDS  NC_011894  35854  36513  660  protein of unknown function DUF88  YP_002495389  normal  0.153842  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0036  CDS  NC_011894  36708  37649  942  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_002495390  normal  0.395488  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0037  CDS  NC_011894  37646  38647  1002  glycosyl transferase family 4  YP_002495391  normal  0.126036  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0038  CDS  NC_011894  38939  41011  2073  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  YP_002495392  normal  0.579469  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0039  CDS  NC_011894  41301  42596  1296  crotonyl-CoA reductase  YP_002495393  normal  0.392309  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0040  CDS  NC_011894  42670  43782  1113  transcriptional regulator, LuxR family  YP_002495394  normal  0.864605  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0041  CDS  NC_011894  44173  44775  603  isopropylmalate isomerase small subunit  YP_002495395  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0042  CDS  NC_011894  44871  46067  1197  lytic murein transglycosylase  YP_002495396  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0043  CDS  NC_011894  46344  47576  1233  major facilitator superfamily MFS_1  YP_002495397  normal  0.973221  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0044  CDS  NC_011894  47783  49618  1836  heat shock protein 90  YP_002495398  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0045  CDS  NC_011894  49702  50373  672  DNA polymerase III subunit epsilon  YP_002495399  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0046  CDS  NC_011894  50375  52192  1818  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  YP_002495400  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0047  CDS  NC_011894  52331  52789  459  MaoC domain protein dehydratase  YP_002495401  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0048  CDS  NC_011894  52794  54176  1383  MATE efflux family protein  YP_002495402  normal  0.782578  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0049  CDS  NC_011894  54826  56358  1533  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_002495403  normal  0.541922  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0050  CDS  NC_011894  56404  57411  1008  2-dehydropantoate 2-reductase  YP_002495404  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0051  CDS  NC_011894  57500  58363  864  aminotransferase class IV  YP_002495405  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0052  CDS  NC_011894  58350  58955  606  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  YP_002495406  normal  0.297322  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0053  CDS  NC_011894  59059  60453  1395  para-aminobenzoate synthase, subunit I  YP_002495407  normal  0.421404  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0054  CDS  NC_011894  60575  61591  1017  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  YP_002495408  normal  0.940543  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0055  CDS  NC_011894  61654  62532  879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002495409  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0056  CDS  NC_011894  62722  63492  771  ABC transporter related  YP_002495410  normal  0.672257  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0057  CDS  NC_011894  63612  64289  678  two component transcriptional regulator, winged helix family  YP_002495411  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0058  CDS  NC_011894  64286  65671  1386  histidine kinase  YP_002495412  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0059  CDS  NC_011894  65668  66780  1113  extracellular solute-binding protein family 1  YP_002495413  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0060    NC_011894  66782  66934  153      normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0061  CDS  NC_011894  67135  67992  858  hypothetical protein  YP_002495414  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0062  CDS  NC_011894  68147  68353  207  hypothetical protein  YP_002495415  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0063  CDS  NC_011894  68448  69587  1140  iron-containing alcohol dehydrogenase  YP_002495416  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0064  CDS  NC_011894  69889  71154  1266  Extracellular ligand-binding receptor  YP_002495417  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0065  CDS  NC_011894  71240  72115  876  inner-membrane translocator  YP_002495418  normal  0.655704  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0066  CDS  NC_011894  72137  73063  927  inner-membrane translocator  YP_002495419  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0067  CDS  NC_011894  73089  74597  1509  ABC transporter related  YP_002495420  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0068  CDS  NC_011894  75039  75563  525  transcriptional regulator, MucR family  YP_002495421  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0069  CDS  NC_011894  75893  76396  504  hypothetical protein  YP_002495422  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0070  CDS  NC_011894  76656  76862  207  hypothetical protein  YP_002495423  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0071  CDS  NC_011894  76846  77127  282  hypothetical protein  YP_002495424  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0072  CDS  NC_011894  77203  77832  630  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  YP_002495425  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0073  CDS  NC_011894  78352  78738  387  response regulator receiver protein  YP_002495426  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0074  CDS  NC_011894  79282  80016  735  hypothetical protein  YP_002495427  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0075  CDS  NC_011894  80003  81148  1146  biotin carboxylase  YP_002495428  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0076  CDS  NC_011894  81266  81772  507  hypothetical protein  YP_002495429  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0077  CDS  NC_011894  82001  82246  246  hypothetical protein  YP_002495430  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0078  CDS  NC_011894  83111  84526  1416  adenylate/guanylate cyclase  YP_002495431  normal  0.294245  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0079  CDS  NC_011894  85171  86010  840  lipolytic protein G-D-S-L family  YP_002495432  normal  0.848092  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0080  CDS  NC_011894  86372  86647  276  hypothetical protein  YP_002495433  normal  0.210836  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0081  CDS  NC_011894  87265  87861  597  hypothetical protein  YP_002495434  decreased coverage  0.00750579  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0082    NC_011894  88499  88762  264      normal  0.0759711  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0083  CDS  NC_011894  89014  89613  600  hypothetical protein  YP_002495435  normal  0.0959336  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0084  CDS  NC_011894  90204  90302  99  hypothetical protein  YP_002495436  normal  0.04303  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0085  CDS  NC_011894  90479  90703  225  hypothetical protein  YP_002495437  normal  0.0171724  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0086  CDS  NC_011894  91649  91822  174  CsbD family protein  YP_002495438  normal  0.0727679  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0087  CDS  NC_011894  91955  92227  273  hypothetical protein  YP_002495439  normal  0.0258957  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0088  CDS  NC_011894  92845  93063  219  hypothetical protein  YP_002495440  normal  0.254743  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0089  CDS  NC_011894  93415  95358  1944  adenylate/guanylate cyclase  YP_002495441  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0090  CDS  NC_011894  95644  95769  126  hypothetical protein  YP_002495442  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0091  CDS  NC_011894  96128  96322  195  hypothetical protein  YP_002495443  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0092  CDS  NC_011894  97100  97657  558  hypothetical protein  YP_002495444  normal  0.6003  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0093    NC_011894  98091  98345  255      normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0094  CDS  NC_011894  99254  99505  252  hypothetical protein  YP_002495445  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0095  CDS  NC_011894  99795  100073  279  hypothetical protein  YP_002495446  normal  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0096  CDS  NC_011894  100201  102144  1944  adenylate/guanylate cyclase  YP_002495447  normal  0.019026  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0097    NC_011894  102203  104788  2586      normal  0.107048  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0098  CDS  NC_011894  102570  102830  261  hypothetical protein  YP_002495448  normal  0.224905  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0099  CDS  NC_011894  103128  103847  720  hypothetical protein  YP_002495449  normal  0.631485  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Mnod_0100  CDS  NC_011894  105255  106244  990  ABC transporter related  YP_002495450  normal  0.1727  n/a    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 89    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>