2517 genes were found for organism Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 26    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Mboo_0001  CDS  NC_009712  346  1638  +  1293  AAA ATPase  YP_001403168  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0002  CDS  NC_009712  1645  2136  +  492  AsnC family transcriptional regulator  YP_001403169  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0003  CDS  NC_009712  2146  3303  +  1158  aminotransferase, class I and II  YP_001403170  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0004  CDS  NC_009712  3422  4435  +  1014  adenylosuccinate synthetase  YP_001403171  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0005  CDS  NC_009712  4432  4611  +  180  hypothetical protein  YP_001403172  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0006  CDS  NC_009712  4623  5198  +  576  hypothetical protein  YP_001403173  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0007  CDS  NC_009712  5180  6124  +  945  cobalamin biosynthesis protein CobD  YP_001403174  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0008  CDS  NC_009712  6134  7030  +  897  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  YP_001403175  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0009  CDS  NC_009712  7020  7619  +  600  glutamine amidotransferase subunit PdxT  YP_001403176  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0010  CDS  NC_009712  7660  8340  +  681  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_001403177  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0011  CDS  NC_009712  8438  9136  +  699  MIP family channel protein  YP_001403178  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0012  CDS  NC_009712  9146  9871  -  726  hypothetical protein  YP_001403179  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0013  CDS  NC_009712  9962  10342  -  381  HxlR family transcriptional regulator  YP_001403180  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0014  CDS  NC_009712  10509  11078  +  570  flavin reductase domain-containing protein  YP_001403181  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0015  CDS  NC_009712  11102  11920  +  819  nitroreductase  YP_001403182  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0016  CDS  NC_009712  12008  12793  +  786  carboxymuconolactone decarboxylase  YP_001403183  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0017  CDS  NC_009712  12825  13409  +  585  NADPH-dependent FMN reductase  YP_001403184  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0018  CDS  NC_009712  13488  14174  +  687  NADPH-dependent FMN reductase  YP_001403185  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0019  CDS  NC_009712  14181  14771  +  591  nitroreductase  YP_001403186  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0020  CDS  NC_009712  14815  15018  +  204  YHS domain-containing protein  YP_001403187  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0021  CDS  NC_009712  15018  15443  +  426  beta-Ig-H3/fasciclin  YP_001403188  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0022  CDS  NC_009712  15560  17785  +  2226  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  YP_001403189  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0023  CDS  NC_009712  17997  20057  -  2061  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  YP_001403190  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0024  CDS  NC_009712  20562  22469  +  1908  NADH dehydrogenase (quinone)  YP_001403191  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0025  CDS  NC_009712  22466  23323  +  858  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  YP_001403192  normal  0.610569  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0026  CDS  NC_009712  23328  23819  +  492  NADH ubiquinone oxidoreductase, 20 kDa subunit  YP_001403193  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0027  CDS  NC_009712  23820  24188  +  369  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  YP_001403194  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0028  CDS  NC_009712  24188  25267  +  1080  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  YP_001403195  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0029  CDS  NC_009712  25274  25672  +  399  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_001403196  normal  0.740591  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0030  CDS  NC_009712  25697  26248  -  552  hypothetical protein  YP_001403197  normal  0.510938  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0031  CDS  NC_009712  26985  27362  +  378  large-conductance mechanosensitive channel-like protein  YP_001403198  normal  0.840685  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0032  CDS  NC_009712  27388  27843  -  456  hypothetical protein  YP_001403199  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0033  CDS  NC_009712  28158  28325  +  168  hypothetical protein  YP_001403200  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0034  CDS  NC_009712  28486  30906  +  2421  phosphoenolpyruvate synthase  YP_001403201  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0035  CDS  NC_009712  30951  32348  -  1398  DNA polymerase II small subunit  YP_001403202  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0036  CDS  NC_009712  32459  33088  +  630  lysine exporter protein LysE/YggA  YP_001403203  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0037  CDS  NC_009712  33146  34111  +  966  hypothetical protein  YP_001403204  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0038  CDS  NC_009712  34139  35227  +  1089  radical SAM domain-containing protein  YP_001403205  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0039  CDS  NC_009712  35295  35594  -  300  hypothetical protein  YP_001403206  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0040  CDS  NC_009712  35710  36798  +  1089  radical SAM domain-containing protein  YP_001403207  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0041  CDS  NC_009712  36864  37322  +  459  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  YP_001403208  normal  0.295446  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0042  CDS  NC_009712  37349  37789  -  441  hypothetical protein  YP_001403209  normal  0.899596  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0043  CDS  NC_009712  37782  38384  -  603  beta-lactamase domain-containing protein  YP_001403210  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0044  CDS  NC_009712  38425  39702  +  1278  thiamine biosynthesis protein ThiC  YP_001403211  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0045  CDS  NC_009712  39752  41386  -  1635  hypothetical protein  YP_001403212  normal  0.380843  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0046  CDS  NC_009712  41557  41910  +  354  anti-sigma-factor antagonist  YP_001403213  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0047  CDS  NC_009712  41975  42478  +  504  anti-sigma-factor antagonist  YP_001403214  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0048  CDS  NC_009712  42481  43509  +  1029  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001403215  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0049  CDS  NC_009712  43523  44047  -  525  hypothetical protein  YP_001403216  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0050  CDS  NC_009712  44104  44541  -  438  water stress/hypersensitive response protein  YP_001403217  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0051  CDS  NC_009712  44724  46250  +  1527  hypothetical protein  YP_001403218  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0052  CDS  NC_009712  46377  46769  -  393  phosphoribosylaminoimidazole carboxylase  YP_001403219  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0053  CDS  NC_009712  46826  47956  +  1131  aminotransferase, class V  YP_001403220  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0054  CDS  NC_009712  47953  48414  +  462  riboflavin synthase  YP_001403221  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0055  CDS  NC_009712  48459  48878  +  420  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  YP_001403222  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0056  CDS  NC_009712  48875  50014  +  1140  aspartate aminotransferase  YP_001403223  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0057  CDS  NC_009712  50211  51647  +  1437  major facilitator transporter  YP_001403224  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0058  CDS  NC_009712  51669  52532  -  864  methyltransferase type 11  YP_001403225  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0059  CDS  NC_009712  52587  53780  -  1194  hypothetical protein  YP_001403226  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0060  CDS  NC_009712  53777  54475  -  699  ABC transporter related  YP_001403227  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0061  CDS  NC_009712  54480  55640  -  1161  hypothetical protein  YP_001403228  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0062  CDS  NC_009712  55641  56309  -  669  hypothetical protein  YP_001403229  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0063  CDS  NC_009712  56578  57936  +  1359  tryptophan synthase subunit beta  YP_001403230  normal  0.636154  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0064  CDS  NC_009712  57953  59050  +  1098  ATP-NAD/AcoX kinase  YP_001403231  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0065  CDS  NC_009712  59086  59676  -  591  GPR1/FUN34/yaaH family protein  YP_001403232  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0066  CDS  NC_009712  59744  61642  -  1899  acetate--CoA ligase  YP_001403233  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0067  CDS  NC_009712  61883  62770  +  888  ADP-ribosylation/crystallin J1  YP_001403234  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0068  CDS  NC_009712  62879  63865  +  987  N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase  YP_001403235  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0069  CDS  NC_009712  63883  64359  +  477  signal transduction protein  YP_001403236  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0070  CDS  NC_009712  64402  65559  +  1158  arginine biosynthesis bifunctional protein ArgJ  YP_001403237  normal  0.795001  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0071  CDS  NC_009712  65556  66431  +  876  acetylglutamate kinase  YP_001403238  normal  0.945463  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0072  CDS  NC_009712  66506  66910  +  405  thioredoxin domain-containing protein  YP_001403239  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0073  CDS  NC_009712  67132  67992  +  861  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  YP_001403240  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0074  CDS  NC_009712  68066  68443  -  378  chorismate mutase  YP_001403241  normal  0.287871  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0075  CDS  NC_009712  68478  69116  +  639  peptidase M50  YP_001403242  normal  0.211405  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0076  CDS  NC_009712  69145  69753  -  609  NADPH-dependent FMN reductase  YP_001403243  normal  0.399945  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0077  CDS  NC_009712  69750  70376  -  627  NADPH-dependent FMN reductase  YP_001403244  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0078  CDS  NC_009712  70547  70954  -  408  carboxymuconolactone decarboxylase  YP_001403245  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0079  CDS  NC_009712  70951  71079  -  129  desulfoferrodoxin Dfx domain-containing protein  YP_001403246  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0080  CDS  NC_009712  71569  72174  +  606  NADPH-dependent FMN reductase  YP_001403247  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0081  CDS  NC_009712  72197  72859  -  663  DNA repair protein RadC  YP_001403248  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0082  CDS  NC_009712  73044  73547  +  504  rubrerythrin  YP_001403249  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0083  CDS  NC_009712  73615  74907  -  1293  LamG domain-containing protein  YP_001403250  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0084  CDS  NC_009712  75022  76176  +  1155  glutaredoxin  YP_001403251  normal  0.833578  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0085  CDS  NC_009712  76738  78207  -  1470  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  YP_001403252  normal  0.52676  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0086  CDS  NC_009712  78204  79832  -  1629  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  YP_001403253  normal  0.970646  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0087  CDS  NC_009712  79894  81291  +  1398  aspartate kinase  YP_001403254  normal  0.0531987  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0088  CDS  NC_009712  81288  82280  +  993  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  YP_001403255  normal  0.457574  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0089  CDS  NC_009712  82330  82755  +  426  hypothetical protein  YP_001403256  normal  0.342195  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0090  CDS  NC_009712  82797  83336  -  540  ZPR1-related zinc finger protein  YP_001403257  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0091  CDS  NC_009712  83341  83709  -  369  hypothetical protein  YP_001403258  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0092  CDS  NC_009712  83802  84314  -  513  putative RNA-binding protein  YP_001403259  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0093  CDS  NC_009712  84470  84700  +  231  like-Sm ribonucleoprotein, core  YP_001403260  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0094  CDS  NC_009712  84712  84894  +  183  50S ribosomal protein L37e  YP_001403261  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0095  CDS  NC_009712  84905  86335  +  1431  amidophosphoribosyltransferase  YP_001403262  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0096  CDS  NC_009712  86435  87112  +  678  methyltransferase type 12  YP_001403263  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0097  CDS  NC_009712  87498  87947  +  450  thioredoxin  YP_001403264  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0098  CDS  NC_009712  88008  88307  -  300  hypothetical protein  YP_001403265  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0099  CDS  NC_009712  88395  88958  -  564  hypothetical protein  YP_001403266  normal  0.785868  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Mboo_0100  CDS  NC_009712  89083  90642  +  1560  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_001403267  normal  1  normal  1  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea 
 
 
-
 
Page 1 of 26    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>