5111 genes were found for organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



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Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
SeHA_A0001  CDS  NC_011081  128  247  -  120  hypothetical protein  YP_002043841  normal  1  normal  1  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0002  CDS  NC_011081  410  1486  +  1077  replication initiation protein  YP_002043842  normal  0.45999  normal  1  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0003  CDS  NC_011081  1818  1967  +  150  hypothetical protein  YP_002043843  normal  0.235196  normal  1  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0004  CDS  NC_011081  2218  2340  +  123  hypothetical protein  YP_002043844  normal  0.236227  normal  1  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0005  CDS  NC_011081  2395  2664  +  270  hypothetical protein  YP_002043845  normal  0.301407  normal  1  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0006  CDS  NC_011081  2661  2942  +  282  YacB  YP_002043846  normal  0.137576  normal  1  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0007  CDS  NC_011081  2982  3830  +  849  YacC  YP_002043847  normal  0.292935  normal  1  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0008  CDS  NC_011081  3947  4420  +  474  YadA  YP_002043848  normal  0.186328  normal  1  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0009  CDS  NC_011081  4461  4580  +  120  hypothetical protein  YP_002043849  normal  0.13029  normal  1  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0010  CDS  NC_011081  4652  4774  +  123  hypothetical protein  YP_002043850  normal  0.181966  normal  1  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0011  CDS  NC_011081  4897  5163  -  267  hypothetical protein  YP_002043851  normal  0.334657  normal  1  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0012  CDS  NC_011081  5163  5696  -  534  hypothetical protein  YP_002043852  normal  0.285123  normal  1  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0013  CDS  NC_011081  5713  6315  -  603  YafB  YP_002043853  normal  0.084758  normal  1  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0014  CDS  NC_011081  6472  6591  -  120  hypothetical protein  YP_002043854  normal  0.153475  normal  1  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0015  CDS  NC_011081  6669  8015  +  1347  YagA  YP_002043855  normal  0.118405  normal  1  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0016  CDS  NC_011081  8024  8188  +  165  hypothetical protein  YP_002043856  normal  0.196138  normal  1  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0017  CDS  NC_011081  8294  10174  +  1881  colicin Ib protein  YP_002043857  normal  0.249038  normal  1  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0018  CDS  NC_011081  10192  10539  -  348  colicin-Ib immunity protein  YP_002043858  normal  1  normal  1  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0019    NC_011081  10658  10978  +  321      normal  1  normal  1  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0020  CDS  NC_011081  10558  10689  -  132  hypothetical protein  YP_002043859  normal  1  normal  1  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0021  CDS  NC_011081  11026  11616  -  591  hypothetical protein  YP_002043860  normal  1  normal  1  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0022  CDS  NC_011081  11616  11861  -  246  hypothetical protein  YP_002043861  normal  1  normal  1  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0023  CDS  NC_011081  11858  12025  -  168  hypothetical protein  YP_002043862  normal  1  normal  0.848918  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0024  CDS  NC_011081  12027  12176  -  150  hypothetical protein  YP_002043863  normal  1  normal  0.845391  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0025  CDS  NC_011081  12224  13225  +  1002  hypothetical protein  YP_002043864  normal  1  normal  0.567338  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0026  CDS  NC_011081  14244  14498  -  255  hypothetical protein  YP_002043865  normal  1  normal  0.506914  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0027  CDS  NC_011081  14543  15469  -  927  hypothetical protein  YP_002043866  normal  1  normal  0.597602  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0028  CDS  NC_011081  15562  15675  -  114  hypothetical protein  YP_002043867  normal  0.725476  normal  0.495717  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0029    NC_011081  15684  15857  +  174      normal  0.58718  normal  0.40363  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0030  CDS  NC_011081  15962  16414  +  453  hypothetical protein  YP_002043868  normal  0.672001  normal  0.26608  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0031  CDS  NC_011081  16416  17195  +  780  resolvase  YP_002043869  normal  0.131142  normal  0.303073  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0032  CDS  NC_011081  17375  18019  +  645  ParA protein homolog  YP_002043870  normal  0.178481  normal  0.176869  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0033  CDS  NC_011081  18106  18414  +  309  putative 60 kDa chaperonin  YP_002043871  normal  0.309553  normal  0.170268  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0034  CDS  NC_011081  18828  19808  +  981  plasmid segregation protein ParM  YP_002043872  normal  1  normal  0.0737307  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0035  CDS  NC_011081  19801  20217  +  417  plasmid stability protein  YP_002043873  normal  0.942785  normal  0.0562477  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0036  CDS  NC_011081  20219  21493  -  1275  DNA polymerase V subunit UmuC  YP_002043874  normal  1  normal  0.0503759  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0037  CDS  NC_011081  21493  21930  -  438  protein ImpA  YP_002043875  normal  1  normal  0.0603297  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0038  CDS  NC_011081  21927  22175  -  249  protein ImpC  YP_002043876  normal  0.511285  normal  0.0568274  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0039  CDS  NC_011081  22172  22336  -  165  hypothetical protein  YP_002043877  normal  0.318204  normal  0.0553197  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0040  CDS  NC_011081  22438  22551  -  114  hypothetical protein  YP_002043878  normal  0.568915  normal  0.0533071  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0041  CDS  NC_011081  22569  23495  +  927  hypothetical protein  YP_002043879  normal  0.432272  normal  0.0746912  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0042  CDS  NC_011081  23647  23772  -  126  hypothetical protein  YP_002043880  normal  0.594369  normal  0.0385602  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0043  CDS  NC_011081  23880  24563  +  684  putative methylase  YP_002043881  normal  0.181539  normal  0.0471117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0044  CDS  NC_011081  24564  24785  +  222  hypothetical protein  YP_002043882  normal  0.321448  normal  0.0385602  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0045  CDS  NC_011081  24797  25231  +  435  hypothetical protein  YP_002043883  normal  0.200778  normal  0.0427856  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0046  CDS  NC_011081  25231  26052  +  822  hypothetical protein  YP_002043884  normal  0.189681  normal  0.0198007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0047  CDS  NC_011081  26470  26895  +  426  putative antirestriction protein  YP_002043885  normal  0.0721486  normal  0.0114762  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0048  CDS  NC_011081  26942  27364  +  423  hypothetical protein  YP_002043886  normal  0.151827  normal  0.011105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0049  CDS  NC_011081  27361  27552  +  192  hypothetical protein  YP_002043887  normal  0.430708  normal  0.0164723  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0050    NC_011081  27743  28201  -  459      normal  0.225945  normal  0.017537  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0051  CDS  NC_011081  28322  28849  +  528  single-stranded DNA-binding protein  YP_002043888  normal  0.772758  normal  0.0108774  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0052  CDS  NC_011081  28907  29140  +  234  hypothetical protein  YP_002043889  normal  0.23275  hitchhiker  0.00952034  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0053  CDS  NC_011081  29199  31157  +  1959  ParB-like partition protein  YP_002043890  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0054  CDS  NC_011081  31212  31646  +  435  plasmid SOS inhibition protein B  YP_002043891  normal  1  hitchhiker  0.000112545  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0055  CDS  NC_011081  31643  32362  +  720  plasmid SOS inhibition protein A  YP_002043892  normal  1  hitchhiker  0.000152732  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0056  CDS  NC_011081  32359  32955  +  597  hypothetical protein  YP_002043893  normal  1  hitchhiker  0.0000655611  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0057  CDS  NC_011081  33117  33257  -  141  hypothetical protein  YP_002043894  normal  1  hitchhiker  0.0000216061  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0058  CDS  NC_011081  33418  33918  +  501  anti-restriction protein  YP_002043895  normal  1  hitchhiker  0.0000101972  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0059  CDS  NC_011081  33902  34045  +  144  hypothetical protein  YP_002043896  normal  1  hitchhiker  0.00000795083  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0060    NC_011081  34058  34342  -  285      normal  0.768323  hitchhiker  0.00000864277  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
-
 
SeHA_A0061    NC_011081  34339  34542  -  204      normal  0.342294  hitchhiker  0.00000800311  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0062  CDS  NC_011081  34626  34844  -  219  hypothetical protein  YP_002043897  normal  0.175644  hitchhiker  0.00000323263  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0063  CDS  NC_011081  34860  35081  +  222  hypothetical protein  YP_002043898  normal  0.159229  hitchhiker  0.00000302444  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0064  CDS  NC_011081  35173  35439  +  267  hypothetical protein  YP_002043899  normal  0.0797901  hitchhiker  0.0000000961136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0065  CDS  NC_011081  35504  36445  +  942  hypothetical protein  YP_002043900  normal  0.0980043  hitchhiker  0.0000000385113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0066  CDS  NC_011081  36507  36677  +  171  YdgA  YP_002043901  normal  0.019834  hitchhiker  0.0000000210262  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0067  CDS  NC_011081  36708  36959  -  252  hypothetical protein  YP_002043902  normal  0.0124071  hitchhiker  0.000000024099  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0068  CDS  NC_011081  36993  37190  -  198  hypothetical protein  YP_002043903  hitchhiker  0.00252915  decreased coverage  0.00000000543514  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0069  CDS  NC_011081  37160  37369  -  210  hypothetical protein  YP_002043904  hitchhiker  0.000986372  decreased coverage  0.00000000556492  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0070  CDS  NC_011081  37539  38387  +  849  hypothetical protein  YP_002043905  hitchhiker  0.000494627  decreased coverage  0.00000000181014  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0071  CDS  NC_011081  38472  38807  -  336  hypothetical protein  YP_002043906  hitchhiker  0.0000104049  hitchhiker  0.0000000782416  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0072  CDS  NC_011081  38797  38913  -  117  hypothetical protein  YP_002043907  decreased coverage  0.00000000122297  hitchhiker  0.00000073951  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0073  CDS  NC_011081  38993  39373  +  381  relaxosome component  YP_002043908  hitchhiker  0.000555431  hitchhiker  0.000000896276  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0074  CDS  NC_011081  39384  42083  +  2700  putative relaxase/mobilization nuclease domain protein  YP_002043909  normal  1  normal  0.0174778  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0075  CDS  NC_011081  42120  44411  -  2292  TrbC  YP_002043910  normal  1  normal  0.0356259  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0076  CDS  NC_011081  44404  45474  -  1071  TrbB  YP_002043911  normal  1  normal  0.0207375  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0077  CDS  NC_011081  45493  46701  -  1209  conjugal transfer protein  YP_002043912  normal  1  normal  0.0326934  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0078  CDS  NC_011081  46990  47145  +  156  hypothetical protein  YP_002043913  normal  1  normal  0.099278  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0079  CDS  NC_011081  47217  47468  -  252  hypothetical protein  YP_002043914  normal  1  normal  0.0998661  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0080  CDS  NC_011081  48127  48303  -  177  hypothetical protein  YP_002043915  normal  0.507568  normal  0.098973  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0081  CDS  NC_011081  48332  48460  -  129  hypothetical protein  YP_002043916  normal  0.468668  normal  0.101673  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0082  CDS  NC_011081  48695  48904  +  210  hypothetical protein  YP_002043917  normal  0.938998  normal  0.146656  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0083  CDS  NC_011081  48976  49638  -  663  surface exclusion protein  YP_002043918  normal  1  normal  0.168688  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0084  CDS  NC_011081  49709  51877  -  2169  integral membrane protein  YP_002043919  normal  0.421711  normal  0.537014  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0085  CDS  NC_011081  51974  52558  -  585  TraX  YP_002043920  normal  0.238721  normal  0.713843  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0086  CDS  NC_011081  52587  53789  -  1203  lipoprotein  YP_002043921  normal  0.0606562  normal  0.65665  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0087  CDS  NC_011081  53756  54370  -  615  TraV  YP_002043922  normal  0.783654  normal  0.577351  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0088  CDS  NC_011081  54370  57414  -  3045  TraU  YP_002043923  normal  1  normal  0.83032  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0089  CDS  NC_011081  57504  58304  -  801  hypothetical protein  YP_002043924  normal  1  normal  0.787548  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0090  CDS  NC_011081  58288  58476  -  189  hypothetical protein  YP_002043925  normal  1  normal  0.838067  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0091  CDS  NC_011081  58540  58944  -  405  TraR  YP_002043926  normal  1  normal  0.84921  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0092  CDS  NC_011081  58995  59522  -  528  TraQ  YP_002043927  normal  1  normal  1  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0093  CDS  NC_011081  59522  60226  -  705  TraP  YP_002043928  normal  0.523141  normal  1  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0094  CDS  NC_011081  60226  61515  -  1290  TraO  YP_002043929  normal  0.517105  normal  1  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0095  CDS  NC_011081  61518  62501  -  984  TraN  YP_002043930  normal  0.174781  normal  1  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0096  CDS  NC_011081  62512  63204  -  693  TraM  YP_002043931  normal  0.0937912  normal  1  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0097  CDS  NC_011081  63201  63548  -  348  TraL  YP_002043932  normal  0.371194  normal  1  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0098  CDS  NC_011081  63566  67333  -  3768  DNA primase  YP_002043933  normal  1  normal  1  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0099  CDS  NC_011081  67423  67974  -  552  phospholipase D (PLD) family protein  YP_002043934  normal  1  normal  1  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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SeHA_A0100  CDS  NC_011081  67989  68279  -  291  TraK  YP_002043935  normal  1  normal  1  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria 
 
 
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