4705 genes were found for organism Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 48    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Oter_0001  CDS  NC_010571  20  1423  +  1404  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_001816893  normal  1  normal  1  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0002  CDS  NC_010571  1618  2259  +  642  hypothetical protein  YP_001816894  normal  1  normal  1  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0003  CDS  NC_010571  2399  4396  -  1998  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  YP_001816895  normal  1  normal  1  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0004  CDS  NC_010571  4567  6594  -  2028  DNA ligase, NAD-dependent  YP_001816896  normal  1  normal  1  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0005  CDS  NC_010571  6594  7019  -  426  VanZ family protein  YP_001816897  normal  0.391845  normal  1  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0006  CDS  NC_010571  7525  9024  -  1500  endonuclease/exonuclease/phosphatase  YP_001816898  normal  0.113565  normal  1  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0007  CDS  NC_010571  9030  9224  -  195  hypothetical protein  YP_001816899  normal  0.137547  normal  1  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0008  CDS  NC_010571  9221  9727  -  507  hypothetical protein  YP_001816900  normal  0.0602923  normal  1  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0009  CDS  NC_010571  9872  14572  +  4701  ATP-dependent helicase HrpA  YP_001816901  normal  0.765475  normal  1  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0010  CDS  NC_010571  14717  15151  -  435  hypothetical protein  YP_001816902  normal  0.347428  normal  1  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0011  CDS  NC_010571  15267  16067  -  801  hypothetical protein  YP_001816903  normal  0.496053  normal  1  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0012  CDS  NC_010571  16173  16811  -  639  LemA family protein  YP_001816904  normal  0.417656  normal  1  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0013  CDS  NC_010571  17133  17576  +  444  signal-transduction protein  YP_001816905  normal  0.371187  normal  1  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0014  CDS  NC_010571  17889  18710  +  822  dienelactone hydrolase  YP_001816906  normal  0.332863  normal  1  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0015  CDS  NC_010571  18815  19231  +  417  hypothetical protein  YP_001816907  normal  0.824233  normal  1  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0016  CDS  NC_010571  19665  20645  -  981  hypothetical protein  YP_001816908  normal  1  normal  0.601739  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0017  CDS  NC_010571  20654  21481  -  828  ABC transporter related  YP_001816909  normal  0.930557  normal  0.586429  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0018  CDS  NC_010571  21762  22343  +  582  hypothetical protein  YP_001816910  normal  0.215123  normal  0.56065  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0019  CDS  NC_010571  22672  23202  +  531  transcription activator effector binding  YP_001816911  normal  0.833859  normal  0.221599  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0020  CDS  NC_010571  23235  23906  +  672  hypothetical protein  YP_001816912  normal  0.444219  normal  0.221599  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0021  CDS  NC_010571  24092  26677  +  2586  permease  YP_001816913  normal  0.0686049  normal  0.167334  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0022  CDS  NC_010571  26817  27917  -  1101  cytidyltransferase-like protein  YP_001816914  normal  0.112935  normal  0.136771  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0023  CDS  NC_010571  28309  28554  +  246  hypothetical protein  YP_001816915  normal  0.156985  normal  0.220464  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0024  CDS  NC_010571  28575  29240  +  666  ABC transporter related  YP_001816916  normal  0.247291  normal  0.125364  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0025  CDS  NC_010571  29348  30808  +  1461  outer membrane efflux protein  YP_001816917  normal  0.245374  normal  0.08145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0026  CDS  NC_010571  31136  32140  +  1005  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  YP_001816918  normal  0.377313  normal  0.0775026  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0027  CDS  NC_010571  32742  34388  -  1647  cytochrome c class I  YP_001816919  normal  0.16509  normal  0.0410464  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0028  CDS  NC_010571  34576  34893  +  318  hypothetical protein  YP_001816920  normal  0.534657  normal  0.0311908  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0029  CDS  NC_010571  35051  36568  -  1518  beta-lactamase  YP_001816921  normal  0.667975  normal  0.0405415  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0030  CDS  NC_010571  36798  39425  +  2628  hypothetical protein  YP_001816922  normal  1  normal  0.0193988  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0031  CDS  NC_010571  39458  41563  +  2106  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  YP_001816923  normal  1  normal  0.0166776  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0032  CDS  NC_010571  41749  43743  +  1995  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  YP_001816924  normal  0.468114  decreased coverage  0.00512066  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0033    NC_010571  43880  44472  -  593      normal  1  decreased coverage  0.00363799  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0034  CDS  NC_010571  44472  45494  -  1023  hypothetical protein  YP_001816925  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0035  CDS  NC_010571  45701  45877  +  177  hypothetical protein  YP_001816926  normal  1  normal  0.0121621  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0036  CDS  NC_010571  46060  46587  +  528  hypothetical protein  YP_001816927  normal  1  normal  0.0130409  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0037  CDS  NC_010571  46734  47093  +  360  hypothetical protein  YP_001816928  normal  1  normal  0.0692369  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0038  CDS  NC_010571  47264  50395  +  3132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  YP_001816929  normal  1  normal  0.11404  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0039  CDS  NC_010571  50382  50831  +  450  response regulator receiver protein  YP_001816930  normal  1  normal  0.138289  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0040  CDS  NC_010571  50924  51526  +  603  hypothetical protein  YP_001816931  normal  1  normal  0.142691  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0041  CDS  NC_010571  51605  52942  -  1338  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  YP_001816932  normal  1  normal  0.161462  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0042  CDS  NC_010571  52954  53802  -  849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001816933  normal  1  normal  0.144902  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0043  CDS  NC_010571  54100  54804  -  705  two component LuxR family transcriptional regulator  YP_001816934  normal  1  normal  0.14113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0044  CDS  NC_010571  54801  56483  -  1683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  YP_001816935  normal  1  normal  0.158232  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0045  CDS  NC_010571  56891  57727  -  837  Ku domainn containing protein  YP_001816936  normal  0.661126  normal  0.14113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0046  CDS  NC_010571  57983  58339  +  357  hypothetical protein  YP_001816937  normal  0.959285  normal  0.12686  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0047  CDS  NC_010571  58656  59411  +  756  hypothetical protein  YP_001816938  normal  1  normal  0.133218  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0048  CDS  NC_010571  59471  60415  +  945  putative D-ribose-binding periplasmic protein  YP_001816939  normal  0.955909  normal  0.240357  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0049  CDS  NC_010571  60630  61631  -  1002  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  YP_001816940  normal  1  normal  0.397537  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0050  CDS  NC_010571  61652  62158  -  507  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  YP_001816941  normal  1  normal  0.360909  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0051  CDS  NC_010571  62271  63065  -  795  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  YP_001816942  normal  1  normal  0.375271  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0052  CDS  NC_010571  63141  64805  -  1665  CTP synthetase  YP_001816943  normal  1  normal  0.431062  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0053  CDS  NC_010571  64991  65215  -  225  hypothetical protein  YP_001816944  normal  1  normal  0.359342  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0054  CDS  NC_010571  65296  65679  +  384  hypothetical protein  YP_001816945  normal  1  normal  0.349855  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0055  CDS  NC_010571  65730  66734  +  1005  ribokinase-like domain-containing protein  YP_001816946  normal  0.747338  normal  0.368725  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0056  CDS  NC_010571  66971  67906  +  936  ABC transporter related  YP_001816947  normal  1  normal  0.576476  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0057  CDS  NC_010571  67914  69263  +  1350  ABC-2 type transporter  YP_001816948  normal  1  normal  0.616267  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0058  CDS  NC_010571  69387  69617  +  231  hypothetical protein  YP_001816949  normal  0.827843  normal  0.492726  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0059  CDS  NC_010571  69821  70324  +  504  hypothetical protein  YP_001816950  normal  0.953926  normal  0.49742  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0060  CDS  NC_010571  70435  72723  +  2289  hypothetical protein  YP_001816951  normal  1  normal  0.691294  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0061  CDS  NC_010571  72996  73268  -  273  AsnC family transcriptional regulator  YP_001816952  normal  1  normal  0.492726  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0062  CDS  NC_010571  73456  75570  -  2115  Pyrrolo-quinoline quinone  YP_001816953  normal  1  normal  0.387664  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0063  CDS  NC_010571  75869  76201  -  333  transport-associated  YP_001816954  normal  0.37402  normal  0.306207  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0064  CDS  NC_010571  76437  76850  +  414  response regulator receiver protein  YP_001816955  normal  0.273047  normal  0.307579  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0065  CDS  NC_010571  76959  78119  -  1161  alcohol dehydrogenase  YP_001816956  normal  0.130136  normal  0.343389  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0066  CDS  NC_010571  78116  78712  -  597  cyclase/dehydrase  YP_001816957  normal  0.364974  normal  0.163087  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0067  CDS  NC_010571  78842  79648  -  807  LytTR family two component transcriptional regulator  YP_001816958  normal  0.169577  normal  0.169612  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0068  CDS  NC_010571  79835  80935  -  1101  signal transduction histidine kinase, LytS  YP_001816959  normal  0.361346  normal  0.172153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0069  CDS  NC_010571  81032  81769  -  738  ROK family protein  YP_001816960  normal  0.590227  normal  0.282068  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0070  CDS  NC_010571  81833  82288  -  456  peptidylprolyl isomerase FKBP-type  YP_001816961  normal  1  normal  0.269035  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0071  CDS  NC_010571  82411  84936  -  2526  hypothetical protein  YP_001816962  normal  1  normal  0.116894  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0072  CDS  NC_010571  84952  85356  -  405  hypothetical protein  YP_001816963  normal  0.391845  normal  0.0725128  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0073  CDS  NC_010571  85372  86085  -  714  ABC transporter related  YP_001816964  normal  1  normal  0.0776828  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0074  CDS  NC_010571  86131  86835  +  705  GDSL family lipase  YP_001816965  normal  1  normal  0.0776828  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0075  CDS  NC_010571  86929  87822  +  894  hypothetical protein  YP_001816966  normal  1  normal  0.150871  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0076  CDS  NC_010571  87835  87963  +  129  hypothetical protein  YP_001816967  normal  1  normal  0.125007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0077  CDS  NC_010571  87982  88632  +  651  hypothetical protein  YP_001816968  normal  1  normal  0.132463  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0078  CDS  NC_010571  88632  90389  +  1758  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  YP_001816969  normal  1  normal  0.0981996  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0079  CDS  NC_010571  90406  91176  -  771  hypothetical protein  YP_001816970  normal  0.340378  normal  0.0805808  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0080  CDS  NC_010571  91484  92863  -  1380  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  YP_001816971  normal  1  normal  0.163875  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0081  CDS  NC_010571  92990  94684  -  1695  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  YP_001816972  normal  1  normal  0.171245  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0082  CDS  NC_010571  94898  98800  +  3903  beta strand repeat-containing protein  YP_001816973  normal  1  normal  0.420525  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0083  CDS  NC_010571  98949  100226  +  1278  gamma-glutamyl phosphate reductase  YP_001816974  normal  1  normal  0.775503  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0084  CDS  NC_010571  100485  101099  +  615  hypothetical protein  YP_001816975  normal  1  normal  0.403447  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0085  CDS  NC_010571  101247  101558  -  312  hypothetical protein  YP_001816976  normal  0.748524  normal  0.608651  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0086  CDS  NC_010571  101611  102609  +  999  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  YP_001816977  normal  0.296315  normal  0.688317  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0087  CDS  NC_010571  102826  103851  +  1026  ABC transporter related  YP_001816978  normal  0.875685  normal  0.704785  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0088  CDS  NC_010571  104003  104764  +  762  hypothetical protein  YP_001816979  normal  0.754127  normal  0.283193  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0089  CDS  NC_010571  104900  106396  +  1497  hypothetical protein  YP_001816980  normal  0.927452  normal  0.329867  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0090  CDS  NC_010571  106501  108447  +  1947  hypothetical protein  YP_001816981  normal  0.89176  normal  0.349855  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0091  CDS  NC_010571  108714  111494  +  2781  hypothetical protein  YP_001816982  normal  0.791962  normal  0.637484  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0092  CDS  NC_010571  111568  115509  +  3942  multi-sensor hybrid histidine kinase  YP_001816983  normal  1  normal  0.783031  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0093  CDS  NC_010571  115615  116868  -  1254  sulfatase  YP_001816984  normal  1  normal  0.814662  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0094  CDS  NC_010571  116935  117801  -  867  hypothetical protein  YP_001816985  normal  1  normal  0.817877  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0095  CDS  NC_010571  117936  119327  -  1392  hypothetical protein  YP_001816986  normal  0.743924  normal  0.601739  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0096  CDS  NC_010571  119324  121030  -  1707  hypothetical protein  YP_001816987  normal  0.427326  normal  1  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0097  CDS  NC_010571  121093  121671  +  579  peptide deformylase  YP_001816988  normal  0.375417  normal  1  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0098  CDS  NC_010571  121668  122192  +  525  ATP--cobalamin adenosyltransferase  YP_001816989  normal  0.552457  normal  1  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0099  CDS  NC_010571  122349  123887  -  1539  PhoH family protein  YP_001816990  normal  0.494499  normal  1  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Oter_0100  CDS  NC_010571  124158  124469  -  312  hypothetical protein  YP_001816991  normal  0.640711  normal  1  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 48    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>