3191 genes were found for organism Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 32    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Bfae_00010  CDS  NC_013172  44  1741  +  1698  chromosomal replication initiator protein DnaA  YP_003153479  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00020  CDS  NC_013172  2358  3482  +  1125  DNA polymerase III, beta subunit  YP_003153480  normal  0.218776  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00030  CDS  NC_013172  3502  4746  +  1245  DNA replication and repair protein RecF  YP_003153481  normal  0.0950556  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00040  CDS  NC_013172  4743  5543  +  801  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  YP_003153482  normal  0.221602  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00060  CDS  NC_013172  5920  6987  +  1068  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase /5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  YP_003153483  normal  0.168249  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00070  CDS  NC_013172  7003  7617  +  615  riboflavin synthase, alpha subunit  YP_003153484  normal  0.189885  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00080  CDS  NC_013172  7614  8882  +  1269  GTP cyclohydrolase II /3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  YP_003153485  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00090  CDS  NC_013172  8879  9379  +  501  6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase  YP_003153486  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00100  CDS  NC_013172  9789  11924  +  2136  DNA gyrase subunit B  YP_003153487  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00110  CDS  NC_013172  12012  14843  +  2832  DNA gyrase subunit A  YP_003153488  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00120  CDS  NC_013172  14847  15452  +  606  hypothetical protein  YP_003153489  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00130  CDS  NC_013172  15605  16084  -  480  hypothetical protein  YP_003153490  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00140  CDS  NC_013172  16178  17014  +  837  hypothetical protein  YP_003153491  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00150  CDS  NC_013172  17055  17906  -  852  Phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH)  YP_003153492  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00160  CDS  NC_013172  17982  18917  +  936  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  YP_003153493  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00170  tRNA  NC_013172  19009  19082  +  74  tRNA-Ile    normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00180  CDS  NC_013172  19104  19277  +  174  hypothetical protein  YP_003153494  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00190  tRNA  NC_013172  19289  19364  +  76  tRNA-Ala    normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00200  CDS  NC_013172  19490  20470  +  981  predicted permease, DMT superfamily  YP_003153495  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00210    NC_013172  20546  21730  +  1185      normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00220  CDS  NC_013172  21866  22981  +  1116  hypothetical protein  YP_003153496  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00230  CDS  NC_013172  22983  23654  +  672  short-chain alcohol dehydrogenase  YP_003153497  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00240  CDS  NC_013172  23703  24047  -  345  predicted transcriptional regulator  YP_003153498  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00250  CDS  NC_013172  24186  24515  -  330  ferredoxin  YP_003153499  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00260  CDS  NC_013172  24592  25101  +  510  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  YP_003153500  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00270  CDS  NC_013172  25180  25809  +  630  superoxide dismutase  YP_003153501  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00280  CDS  NC_013172  25953  26711  -  759  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  YP_003153502  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00290  CDS  NC_013172  26711  27784  -  1074  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  YP_003153503  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00300  CDS  NC_013172  27915  29159  +  1245  signal transduction histidine kinase  YP_003153504  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00310  CDS  NC_013172  29156  29797  +  642  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  YP_003153505  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00320  CDS  NC_013172  29956  31407  +  1452  amino acid transporter  YP_003153506  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00330  CDS  NC_013172  31518  32066  -  549  hypothetical protein  YP_003153507  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00340  CDS  NC_013172  32272  32766  +  495  flavodoxin  YP_003153508  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00350  CDS  NC_013172  32819  33721  -  903  pyridoxal biosynthesis lyase PdxS  YP_003153509  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00360  CDS  NC_013172  33904  35271  +  1368  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  YP_003153510  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00370  CDS  NC_013172  35368  36280  -  913  transposase  YP_003153511  normal  0.632263  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00380  CDS  NC_013172  36573  37565  +  993  predicted dehydrogenase  YP_003153512  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00390  CDS  NC_013172  37559  38593  +  1035  predicted dehydrogenase  YP_003153513  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00400  CDS  NC_013172  38639  39109  -  471  transcriptional regulator, AsnC family  YP_003153514  normal  0.261926  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00410  CDS  NC_013172  39289  40425  +  1137  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component alpha subunit  YP_003153515  normal  0.151376  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00420  CDS  NC_013172  40422  41453  +  1032  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  YP_003153516  normal  0.189299  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00430  CDS  NC_013172  41453  42796  +  1344  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide acyltransferase component  YP_003153517  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00440  CDS  NC_013172  42800  44395  +  1596  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  YP_003153518  normal  0.123454  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00450  CDS  NC_013172  44403  46412  +  2010  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  YP_003153519  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00460  CDS  NC_013172  46409  46906  +  498  acyl dehydratase  YP_003153520  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00470  CDS  NC_013172  46903  47793  +  891  citrate lyase beta subunit  YP_003153521  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00480  CDS  NC_013172  47790  49046  +  1257  butyryl-CoA dehydrogenase  YP_003153522  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00490  CDS  NC_013172  49171  49863  +  693  transcriptional regulator  YP_003153523  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00500  CDS  NC_013172  49918  50637  -  720  hypothetical protein  YP_003153524  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00510  CDS  NC_013172  51076  51567  -  492  cytosine/adenosine deaminase  YP_003153525  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00520  CDS  NC_013172  51600  52442  -  843  triosephosphate isomerase  YP_003153526  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00530  CDS  NC_013172  52594  53064  -  471  ribose 5-phosphate isomerase  YP_003153527  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00540  CDS  NC_013172  53157  54872  -  1716  dihydroxyacetone kinase  YP_003153528  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00550  CDS  NC_013172  55335  56777  +  1443  protein of unknown function (DUF1593) with cadherin domain  YP_003153529  normal  0.451215  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00560  CDS  NC_013172  56965  57894  +  930  sugar phosphate isomerase/epimerase  YP_003153530  hitchhiker  0.00706398  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00570  CDS  NC_013172  57921  58724  +  804  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  YP_003153531  hitchhiker  0.000200385  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00580  CDS  NC_013172  58922  59893  +  972  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  YP_003153532  decreased coverage  0.000379628  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00590  CDS  NC_013172  60093  61493  +  1401  gluconate transporter  YP_003153533  hitchhiker  0.00877233  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00600  CDS  NC_013172  61583  62950  +  1368  hypothetical protein  YP_003153534  normal  0.172586  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00610  CDS  NC_013172  63085  63969  +  885  beta-hydroxyacid dehydrogenase, 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  YP_003153535  normal  0.171403  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00620  CDS  NC_013172  63988  64770  -  783  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  YP_003153536  normal  0.297652  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00630  CDS  NC_013172  64986  65867  +  882  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  YP_003153537  normal  0.601421  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00640  CDS  NC_013172  65864  67192  +  1329  L-fuconate dehydratase  YP_003153538  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00650  CDS  NC_013172  67205  67543  +  339  hypothetical protein  YP_003153539  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00660  CDS  NC_013172  67540  68661  +  1122  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  YP_003153540  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00670  CDS  NC_013172  68658  69533  +  876  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase, COG3618  YP_003153541  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00680  CDS  NC_013172  69609  70301  -  693  transcriptional regulator, GntR family  YP_003153542  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00690  CDS  NC_013172  70315  71538  -  1224  uncharacterized protein involved in tellurite resistance  YP_003153543  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00700  CDS  NC_013172  71592  72488  -  897  hypothetical protein  YP_003153544  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00710  CDS  NC_013172  72711  73697  +  987  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  YP_003153545  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00720  CDS  NC_013172  73694  74746  +  1053  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  YP_003153546  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00730  CDS  NC_013172  74743  76425  +  1683  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  YP_003153547  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00740  CDS  NC_013172  76422  78158  +  1737  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  YP_003153548  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00750    NC_013172  78499  78981  -  483      normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00760    NC_013172  79042  79206  +  165      normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00770  CDS  NC_013172  79312  80079  +  768  transcriptional regulator, GntR family  YP_003153549  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00780  CDS  NC_013172  80118  82454  -  2337  hypothetical protein  YP_003153550  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00790  CDS  NC_013172  82555  84084  -  1530  hypothetical protein  YP_003153551  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00800  CDS  NC_013172  84303  85727  +  1425  alpha-L-fucosidase  YP_003153552  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00810  CDS  NC_013172  86014  86766  -  753  protein of unknown function DUF81  YP_003153553  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00820  CDS  NC_013172  86987  87817  +  831  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  YP_003153554  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00830  CDS  NC_013172  87945  89402  -  1458  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  YP_003153555  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00840  CDS  NC_013172  89520  90875  +  1356  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  YP_003153556  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00850  CDS  NC_013172  90881  91843  +  963  carbohydrate ABC transporter membrane protein  YP_003153557  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00860  CDS  NC_013172  91840  92643  +  804  ABC-type sugar transport system, permease component  YP_003153558  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00870  CDS  NC_013172  92643  93980  +  1338  sugar kinase, ribokinase  YP_003153559  normal  0.454231  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00880  CDS  NC_013172  94024  95232  +  1209  Kef-type K+ transport system, membrane component  YP_003153560  normal  0.919832  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00890  CDS  NC_013172  95267  95851  -  585  Activator of Hsp90 ATPase homolog 1-like protein  YP_003153561  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00900  CDS  NC_013172  95848  96546  -  699  hypothetical protein  YP_003153562  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00910  CDS  NC_013172  96548  97099  -  552  dihydrofolate reductase  YP_003153563  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00920  CDS  NC_013172  97183  97905  +  723  transcriptional regulator, tetR family  YP_003153564  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00930  CDS  NC_013172  98681  98863  +  183  hypothetical protein  YP_003153565  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00940  CDS  NC_013172  99057  99740  -  684  16S RNA G1207 methylase RsmC  YP_003153566  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00950  CDS  NC_013172  99931  101232  +  1302  hypothetical protein  YP_003153567  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00960  CDS  NC_013172  101277  102233  +  957  hypothetical protein  YP_003153568  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00970  CDS  NC_013172  102723  102872  +  150  hypothetical protein  YP_003153569  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00980  CDS  NC_013172  102969  104252  -  1284  purine-cytosine permease-like transporter  YP_003153570  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_00990  CDS  NC_013172  104249  104776  -  528  cytosine/adenosine deaminase  YP_003153571  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_01000  CDS  NC_013172  105419  105670  +  252  hypothetical protein  YP_003153572  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Bfae_01010  CDS  NC_013172  105846  106886  -  1041  monosaccharide ABC transporter membrane protein  YP_003153573  normal  1  n/a    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 32    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>