7179 genes were found for organism Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 72    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Amir_0001  CDS  NC_013093  98  1831  +  1734  chromosomal replication initiation protein  YP_003097821  normal  0.0108959  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0002  CDS  NC_013093  2628  3764  +  1137  DNA polymerase III subunit beta  YP_003097822  normal  0.065739  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0003  CDS  NC_013093  3806  4720  +  915  6-phosphogluconate dehydrogenase-like protein  YP_003097823  hitchhiker  0.00463998  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0004  CDS  NC_013093  4728  5843  +  1116  recombination protein F  YP_003097824  hitchhiker  0.00656338  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0005  CDS  NC_013093  6031  6462  +  432  protein of unknown function DUF721  YP_003097825  hitchhiker  0.00151548  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0006  CDS  NC_013093  6701  8674  +  1974  DNA gyrase, B subunit  YP_003097826  normal  0.0640432  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0007  CDS  NC_013093  8721  11243  +  2523  DNA gyrase subunit A  YP_003097827  normal  0.277019  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0008  CDS  NC_013093  11278  12144  +  867  hypothetical protein  YP_003097828  normal  0.625071  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0009  CDS  NC_013093  12309  12428  +  120  hypothetical protein  YP_003097829  normal  0.967501  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0010  CDS  NC_013093  12873  13304  -  432  DoxX family protein  YP_003097830  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0011  CDS  NC_013093  13441  13986  +  546  hypothetical protein  YP_003097831  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0012  CDS  NC_013093  14069  14509  -  441  hypothetical protein  YP_003097832  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0013  CDS  NC_013093  14769  15317  +  549  Peptidylprolyl isomerase  YP_003097833  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0014  CDS  NC_013093  15317  16213  +  897  Rhomboid family protein  YP_003097834  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0015  CDS  NC_013093  16463  16885  -  423  hypothetical protein  YP_003097835  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0016  CDS  NC_013093  17118  17384  -  267  putative septation inhibitor protein  YP_003097836  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0017  CDS  NC_013093  17775  18836  +  1062  sortase family protein  YP_003097837  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0018  CDS  NC_013093  18838  18996  +  159  hypothetical protein  YP_003097838  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0019  CDS  NC_013093  19042  20388  -  1347  Ferredoxin--NADP(+) reductase  YP_003097839  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0020  CDS  NC_013093  20454  21095  +  642  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  YP_003097840  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0021  CDS  NC_013093  21196  23241  -  2046  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  YP_003097841  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0022  CDS  NC_013093  23322  25025  -  1704  serine/threonine protein kinase  YP_003097842  normal  0.0878271  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0023  CDS  NC_013093  25025  26491  -  1467  Peptidoglycan glycosyltransferase  YP_003097843  normal  0.0951925  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0024  CDS  NC_013093  26488  27951  -  1464  cell cycle protein  YP_003097844  normal  0.0545169  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0025  CDS  NC_013093  27955  29379  -  1425  protein serine/threonine phosphatase  YP_003097845  normal  0.0922005  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0026  CDS  NC_013093  29376  29840  -  465  FHA domain containing protein  YP_003097846  normal  0.259874  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0027  CDS  NC_013093  29891  31153  -  1263  FHA domain containing protein  YP_003097847  normal  0.340956  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0028  CDS  NC_013093  31797  32417  +  621  hypothetical protein  YP_003097848  normal  0.433025  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0029  CDS  NC_013093  32468  33103  +  636  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_003097849  normal  0.825731  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0030  CDS  NC_013093  33316  34593  -  1278  FAD-linked oxidoreductase  YP_003097850  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0031  CDS  NC_013093  34677  35864  +  1188  alanine racemase domain protein  YP_003097851  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0032  CDS  NC_013093  35861  36493  -  633  transcriptional regulator, TetR family  YP_003097852  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0033  CDS  NC_013093  36613  37875  +  1263  beta-galactosidase  YP_003097853  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0034  CDS  NC_013093  37872  39179  +  1308  major facilitator superfamily MFS_1  YP_003097854  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0035  CDS  NC_013093  39176  39943  +  768  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_003097855  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0036  CDS  NC_013093  40316  40678  -  363  hypothetical protein  YP_003097856  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0037  CDS  NC_013093  41233  42615  +  1383  transcriptional regulator, XRE family  YP_003097857  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0038  CDS  NC_013093  42689  43585  +  897  aminoglycoside phosphotransferase  YP_003097858  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0039  CDS  NC_013093  43715  43996  +  282  hypothetical protein  YP_003097859  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0040  CDS  NC_013093  44172  45191  -  1020  copper resistance D domain protein  YP_003097860  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0041  CDS  NC_013093  45188  45736  -  549  copper resistance protein CopC  YP_003097861  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0042  CDS  NC_013093  45733  46482  -  750  nuclear export factor GLE1  YP_003097862  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0043  CDS  NC_013093  46508  47065  -  558  hypothetical protein  YP_003097863  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0044  CDS  NC_013093  47159  48991  +  1833  choline/carnitine/betaine transporter  YP_003097864  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0045  CDS  NC_013093  49044  49484  -  441  hypothetical protein  YP_003097865  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0046  CDS  NC_013093  49586  51220  +  1635  nuclease (RecB family)-like protein  YP_003097866  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0047  CDS  NC_013093  51262  52014  -  753  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_003097867  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0048  CDS  NC_013093  52050  52175  -  126  hypothetical protein  YP_003097868  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0049  CDS  NC_013093  52353  54134  +  1782  Gamma-glutamyltransferase  YP_003097869  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0050  CDS  NC_013093  54212  54541  -  330  hypothetical protein  YP_003097870  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0051  CDS  NC_013093  55503  55877  -  375  hypothetical protein  YP_003097871  normal  0.7829  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0052  CDS  NC_013093  56251  57537  +  1287  hypothetical protein  YP_003097872  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0053  CDS  NC_013093  57672  59063  +  1392  hypothetical protein  YP_003097873  normal  0.560507  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0054  CDS  NC_013093  59060  60733  +  1674  glycosyl transferase family 2  YP_003097874  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0055  CDS  NC_013093  60861  64376  -  3516  glycosyl transferase family 2  YP_003097875  normal  0.180545  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0056  CDS  NC_013093  64376  65581  -  1206  hypothetical protein  YP_003097876  normal  0.227027  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0057  CDS  NC_013093  65703  68078  -  2376  glycosyl transferase group 1  YP_003097877  normal  0.169678  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0058  CDS  NC_013093  68337  69401  -  1065  Methyltransferase type 11  YP_003097878  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0059  CDS  NC_013093  69961  70266  -  306  hypothetical protein  YP_003097879  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0060  CDS  NC_013093  70271  70696  -  426  OsmC family protein  YP_003097880  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0061  CDS  NC_013093  70942  71337  -  396  hypothetical protein  YP_003097881  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0062  CDS  NC_013093  71534  73003  +  1470  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  YP_003097882  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0063  CDS  NC_013093  73127  73564  +  438  hypothetical protein  YP_003097883  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0064  CDS  NC_013093  73786  75072  +  1287  signal transduction histidine kinase, LytS  YP_003097884  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0065  CDS  NC_013093  75077  75244  -  168  hypothetical protein  YP_003097885  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0066  CDS  NC_013093  75285  76157  +  873  peptidase S49  YP_003097886  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0067  CDS  NC_013093  76254  77081  +  828  two component transcriptional regulator, LytTR family  YP_003097887  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0068  CDS  NC_013093  77078  77500  +  423  hypothetical protein  YP_003097888  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0069  CDS  NC_013093  77504  79315  +  1812  Na+/solute symporter  YP_003097889  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0070  CDS  NC_013093  79609  79965  +  357  protein of unknown function DUF485  YP_003097890  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0071  CDS  NC_013093  79962  81548  +  1587  SSS sodium solute transporter superfamily  YP_003097891  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0072  CDS  NC_013093  81691  82116  +  426  DNA binding domain protein, excisionase family  YP_003097892  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0073  CDS  NC_013093  82184  82774  +  591  hypothetical protein  YP_003097893  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0074  CDS  NC_013093  82815  83162  +  348  Rhodanese domain protein  YP_003097894  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0075  CDS  NC_013093  83164  84072  +  909  hypothetical protein  YP_003097895  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0076  CDS  NC_013093  84163  85212  +  1050  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  YP_003097896  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0077  CDS  NC_013093  85244  86476  -  1233  cytochrome P450  YP_003097897  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0078  CDS  NC_013093  86596  87294  +  699  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  YP_003097898  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0079  CDS  NC_013093  87313  88257  +  945  SEC-C motif domain protein  YP_003097899  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0080  CDS  NC_013093  88330  88656  +  327  protein of unknown function DUF952  YP_003097900  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0081  CDS  NC_013093  88777  89808  +  1032  Phenylacetaldoxime dehydratase  YP_003097901  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0082  CDS  NC_013093  89920  90483  -  564  Ferritin Dps family protein  YP_003097902  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0083  CDS  NC_013093  90632  91879  -  1248  arginine deiminase  YP_003097903  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0084  CDS  NC_013093  92019  92672  -  654  hypothetical protein  YP_003097904  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0085  CDS  NC_013093  92746  93540  -  795  Abortive infection protein  YP_003097905  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0086  CDS  NC_013093  93550  94308  -  759  hypothetical protein  YP_003097906  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0087  CDS  NC_013093  94407  95036  +  630  hypothetical protein  YP_003097907  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0088  CDS  NC_013093  95197  96399  -  1203  homogentisate 12-dioxygenase  YP_003097908  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0089  CDS  NC_013093  96535  97335  +  801  hypothetical protein  YP_003097909  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0090  CDS  NC_013093  97332  98516  +  1185  Fumarylacetoacetase  YP_003097910  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0091  CDS  NC_013093  98519  99178  +  660  transcriptional regulator, IclR family  YP_003097911  normal  0.804126  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0092  CDS  NC_013093  99260  100771  +  1512  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  YP_003097912  normal  0.294178  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0093  CDS  NC_013093  100786  101790  +  1005  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  YP_003097913  normal  0.0317391  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0094  CDS  NC_013093  102023  103051  -  1029  TIR protein  YP_003097914  normal  0.127625  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0095  CDS  NC_013093  103158  106223  +  3066  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydD  YP_003097915  normal  1  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0096  CDS  NC_013093  106220  107338  +  1119  GAF sensor signal transduction histidine kinase  YP_003097916  normal  0.642474  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0097  CDS  NC_013093  107555  108184  -  630  two component transcriptional regulator, LuxR family  YP_003097917  normal  0.142871  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0098  CDS  NC_013093  108245  108727  +  483  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_003097918  normal  0.196703  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0099  CDS  NC_013093  108789  109388  -  600  Appr-1-p processing domain protein  YP_003097919  normal  0.310207  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Amir_0100  CDS  NC_013093  109492  110394  +  903  Prephenate dehydratase  YP_003097920  normal  0.863601  n/a    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 72    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>