2055 genes were found for organism Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 21    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
TNEU_0  tRNA  NC_010525  774142  774258  117  tRNA-OTHER    normal  normal  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0001  CDS  NC_010525  75  1244  1170  cell division control protein 6  YP_001793405  normal  normal  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0002  CDS  NC_010525  1241  1519  279  regulatory protein ArsR  YP_001793406  normal  normal  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0003  CDS  NC_010525  1555  2136  582  hypothetical protein  YP_001793407  normal  normal  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0004  CDS  NC_010525  2187  2438  252  hypothetical protein  YP_001793408  normal  normal  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0005  CDS  NC_010525  2423  3520  1098  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  YP_001793409  normal  normal  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0006  CDS  NC_010525  3629  3946  318  hypothetical protein  YP_001793410  normal  normal  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0007  CDS  NC_010525  3943  5070  1128  PUA domain-containing protein  YP_001793411  normal  normal  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0008  CDS  NC_010525  5057  5296  240  hypothetical protein  YP_001793412  normal  normal  0.87111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0009  CDS  NC_010525  5361  6023  663  AMMECR1 domain-containing protein  YP_001793413  normal  normal  0.717418  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0010  CDS  NC_010525  5995  6462  468  hypothetical protein  YP_001793414  normal  normal  0.680977  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0011  CDS  NC_010525  6650  6814  165  hypothetical protein  YP_001793415  normal  normal  0.499005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0012  CDS  NC_010525  7135  7470  336  hypothetical protein  YP_001793416  normal  normal  0.271383  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0013  CDS  NC_010525  7467  8522  1056  H+-transporting ATP synthase subunit C  YP_001793417  normal  normal  0.325873  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0014  CDS  NC_010525  8519  8794  276  H+transporting two-sector ATPase C subunit  YP_001793418  normal  normal  0.274435  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0015  CDS  NC_010525  8809  8958  150  hypothetical protein  YP_001793419  normal  normal  0.381923  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0016  CDS  NC_010525  8980  9588  609  V-type ATPase, D subunit  YP_001793420  normal  normal  0.304681  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0017  CDS  NC_010525  9625  10404  780  GTP-binding protein HSR1-related  YP_001793421  normal  normal  0.437741  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0018  CDS  NC_010525  10425  10898  474  hypothetical protein  YP_001793422  normal  normal  0.394099  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0019  CDS  NC_010525  11000  11548  549  hypothetical protein  YP_001793423  normal  normal  0.394099  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0020  CDS  NC_010525  11665  13077  1413  hypothetical protein  YP_001793424  normal  0.177122  normal  0.337265  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0021  CDS  NC_010525  13059  14348  1290  phosphomannomutase  YP_001793425  normal  0.0431995  normal  0.0965198  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0022  CDS  NC_010525  14396  15508  1113  hypothetical protein  YP_001793426  normal  0.982389  normal  0.0622424  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0023  CDS  NC_010525  15505  16113  609  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  YP_001793427  normal  hitchhiker  0.00826547  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0024  CDS  NC_010525  16196  17110  915  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  YP_001793428  normal  decreased coverage  0.00458204  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0025  CDS  NC_010525  17221  17751  531  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  YP_001793429  normal  normal  0.0146128  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0026  CDS  NC_010525  17789  19318  1530  hypothetical protein  YP_001793430  normal  normal  0.0243816  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0027  CDS  NC_010525  19322  20806  1485  type II secretion system protein E  YP_001793431  normal  decreased coverage  0.00644516  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0028  CDS  NC_010525  20784  20996  213  hypothetical protein  YP_001793432  normal  decreased coverage  0.00345108  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0029  CDS  NC_010525  20993  21505  513  hypothetical protein  YP_001793433  normal  decreased coverage  0.00385043  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0030  CDS  NC_010525  21573  23057  1485  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  YP_001793434  normal  decreased coverage  0.00267485  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0031  CDS  NC_010525  23040  23759  720  hypothetical protein  YP_001793435  normal  hitchhiker  0.00817392  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0032  CDS  NC_010525  23756  24268  513  transcription factor TFIIE, alpha subunit  YP_001793436  normal  hitchhiker  0.00767088  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0033  CDS  NC_010525  24361  25572  1212  GTP-binding proten HflX  YP_001793437  normal  hitchhiker  0.00542605  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0034  CDS  NC_010525  25562  26044  483  XRE family transcriptional regulator  YP_001793438  normal  hitchhiker  0.00826547  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0035  CDS  NC_010525  26090  26548  459  PUA domain-containing protein  YP_001793439  normal  decreased coverage  0.00396797  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0036  CDS  NC_010525  26514  26795  282  hypothetical protein  YP_001793440  normal  decreased coverage  0.00385043  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0037  CDS  NC_010525  26779  27072  294  hypothetical protein  YP_001793441  normal  decreased coverage  0.00382776  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0038  CDS  NC_010525  27171  27413  243  like-Sm ribonucleoprotein core  YP_001793442  normal  decreased coverage  0.00385043  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0039  CDS  NC_010525  27410  27568  159  50S ribosomal protein L37e  YP_001793443  normal  hitchhiker  0.00771386  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0040  CDS  NC_010525  27626  28246  621  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  YP_001793444  normal  normal  0.0101018  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0041  CDS  NC_010525  28274  29188  915  hypothetical protein  YP_001793445  normal  normal  0.0118047  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0042  CDS  NC_010525  29350  29745  396  cytidine deaminase  YP_001793446  normal  normal  0.0173738  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0043  CDS  NC_010525  29809  30756  948  hypothetical protein  YP_001793447  normal  normal  0.0208895  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0044  CDS  NC_010525  30789  31568  780  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001793448  normal  normal  0.0333473  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0045  CDS  NC_010525  31557  32849  1293  serine hydroxymethyltransferase  YP_001793449  normal  normal  0.0231458  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0046  CDS  NC_010525  32978  33715  738  molybdopterin cofactor biosynthesis protein with MoaC region  YP_001793450  normal  normal  0.0178118  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0047  CDS  NC_010525  33712  34041  330  hypothetical protein  YP_001793451  normal  normal  0.0152334  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0048  CDS  NC_010525  34070  35134  1065  isopentenyl pyrophosphate isomerase  YP_001793452  normal  normal  0.0360256  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0049  CDS  NC_010525  35134  35871  738  50S ribosomal protein L2P  YP_001793453  normal  normal  0.0336538  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0050  CDS  NC_010525  36019  36234  216  30S ribosomal protein S17e  YP_001793454  normal  normal  0.0479934  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0051  CDS  NC_010525  36237  36926  690  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  YP_001793455  normal  normal  0.0543276  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0052  CDS  NC_010525  36957  37562  606  proteasome endopeptidase complex  YP_001793456  normal  normal  0.0529482  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0053  CDS  NC_010525  37597  38850  1254  phosphopyruvate hydratase  YP_001793457  normal  normal  0.0387594  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0054  CDS  NC_010525  38960  39376  417  ModE family transcriptional regulator  YP_001793458  normal  normal  0.0286693  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0055  CDS  NC_010525  39361  40338  978  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  YP_001793459  normal  normal  0.0195901  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0056  CDS  NC_010525  40423  41874  1452  serine/threonine protein kinase  YP_001793460  normal  normal  0.0129993  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0057  CDS  NC_010525  41877  42329  453  FHA domain-containing protein  YP_001793461  normal  hitchhiker  0.00934225  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0058  CDS  NC_010525  42378  42998  621  30S ribosomal protein S2  YP_001793462  normal  normal  0.0190126  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0059  CDS  NC_010525  43028  43876  849  hypothetical protein  YP_001793463  normal  normal  0.0213251  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0060  CDS  NC_010525  44133  46037  1905  beta-lactamase domain-containing protein  YP_001793464  normal  0.287706  normal  0.0538773  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0061  CDS  NC_010525  46086  47510  1425  cysteinyl-tRNA synthetase  YP_001793465  normal  0.63624  normal  0.0841758  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0062  CDS  NC_010525  47523  51113  3591  hypothetical protein  YP_001793466  normal  normal  0.631926  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0063  CDS  NC_010525  51171  53072  1902  hypothetical protein  YP_001793467  normal  normal  0.61129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0064  CDS  NC_010525  53112  61142  8031  hypothetical protein  YP_001793468  normal  normal  0.795538  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0065  CDS  NC_010525  61200  61796  597  AMMECR1 domain-containing protein  YP_001793469  normal  0.582871  normal  0.222281  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0066  CDS  NC_010525  61826  62650  825  hypothetical protein  YP_001793470  normal  normal  0.217744  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0067  CDS  NC_010525  62631  63161  531  adenylyl cyclase CyaB  YP_001793471  normal  0.160565  normal  0.206262  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0068  CDS  NC_010525  63169  64923  1755  ATP-dependent DNA ligase  YP_001793472  decreased coverage  0.00333872  normal  0.197829  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0069  CDS  NC_010525  64911  65402  492  hypothetical protein  YP_001793473  normal  0.0616102  normal  0.0914571  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0070  CDS  NC_010525  65443  66360  918  ribokinase-like domain-containing protein  YP_001793474  normal  0.60231  normal  0.104072  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0071  CDS  NC_010525  66383  66718  336  hypothetical protein  YP_001793475  normal  0.533909  normal  0.137046  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0072  CDS  NC_010525  66715  67392  678  nucleotidyl transferase  YP_001793476  normal  normal  0.155346  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0073  CDS  NC_010525  67424  68143  720  hypothetical protein  YP_001793477  normal  0.878166  normal  0.217744  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0074  CDS  NC_010525  68140  68694  555  hypothetical protein  YP_001793478  normal  0.515157  normal  0.1447  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0075  CDS  NC_010525  68793  69860  1068  hypothetical protein  YP_001793479  normal  normal  0.109256  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0076  CDS  NC_010525  70360  70647  288  hypothetical protein  YP_001793480  normal  normal  0.0965198  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0077  CDS  NC_010525  70617  71516  900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  YP_001793481  normal  normal  0.17648  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0078  CDS  NC_010525  71509  71913  405  hypothetical protein  YP_001793482  normal  normal  0.149247  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0079  CDS  NC_010525  72242  72553  312  50S ribosomal protein L14e  YP_001793483  normal  normal  0.149247  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0080  CDS  NC_010525  72550  73545  996  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  YP_001793484  normal  normal  0.178289  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0081  CDS  NC_010525  73569  73862  294  hypothetical protein  YP_001793485  normal  0.861033  normal  0.214557  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0082  CDS  NC_010525  73859  74356  498  hypothetical protein  YP_001793486  normal  0.431696  normal  0.238452  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0083  CDS  NC_010525  74383  74844  462  hypothetical protein  YP_001793487  normal  0.356672  normal  0.241585  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0084  CDS  NC_010525  74874  75812  939  oxidoreductase domain-containing protein  YP_001793488  normal  0.481662  normal  0.273394  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0085  CDS  NC_010525  75863  76402  540  hypothetical protein  YP_001793489  normal  0.273973  normal  0.252446  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0086  CDS  NC_010525  76389  76970  582  abortive infection protein  YP_001793490  normal  0.49455  normal  0.25136  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0087  CDS  NC_010525  76999  77460  462  hypothetical protein  YP_001793491  normal  0.548637  normal  0.245283  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0088  CDS  NC_010525  77432  78247  816  competence damage-inducible protein A  YP_001793492  normal  0.747767  normal  0.181951  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0089  CDS  NC_010525  78256  79113  858  hypothetical protein  YP_001793493  normal  0.893408  normal  0.178289  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0090  CDS  NC_010525  79151  79561  411  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  YP_001793494  normal  0.909568  normal  0.100021  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0091  CDS  NC_010525  79558  79779  222  hypothetical protein  YP_001793495  normal  0.618475  normal  0.214557  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0092  CDS  NC_010525  79763  80152  390  hypothetical protein  YP_001793496  normal  0.741351  normal  0.223758  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0093  CDS  NC_010525  80203  80871  669  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  YP_001793497  normal  normal  0.169395  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0094  CDS  NC_010525  80916  81407  492  hypothetical protein  YP_001793498  normal  normal  0.0104802  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0095  CDS  NC_010525  81452  82228  777  hypothetical protein  YP_001793499  normal  0.837753  normal  0.0116764  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0096  CDS  NC_010525  82312  83787  1476  carboxypeptidase Taq  YP_001793500  normal  0.116202  hitchhiker  0.00735546  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0097  CDS  NC_010525  83784  84422  639  hypothetical protein  YP_001793501  normal  0.0393817  hitchhiker  0.0023307  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0098  CDS  NC_010525  84464  84925  462  phosphopantetheine adenylyltransferase  YP_001793502  normal  0.174389  hitchhiker  0.00207658  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Tneu_0099  CDS  NC_010525  84911  86218  1308  hypothetical protein  YP_001793503  normal  0.428389  decreased coverage  0.00133655  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea 
 
 
-
 
Page 1 of 21    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>