5546 genes were found for organism Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 56    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Mpop_0001  CDS  NC_010725  198  464  +  267  30S ribosomal protein S20  YP_001922732  normal  1  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0002  CDS  NC_010725  1161  2666  +  1506  chromosomal replication initiation protein  YP_001922733  normal  1  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0003  CDS  NC_010725  2841  3962  +  1122  DNA polymerase III subunit beta  YP_001922734  normal  0.174848  normal  0.920378  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0004  CDS  NC_010725  4003  5160  +  1158  DNA replication and repair protein RecF  YP_001922735  normal  0.350342  normal  0.69961  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0005  CDS  NC_010725  5168  5779  +  612  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  YP_001922736  normal  0.610199  normal  0.647138  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0006  CDS  NC_010725  5928  7775  +  1848  ATP-dependent DNA helicase RecQ  YP_001922737  normal  1  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0007  CDS  NC_010725  8058  8744  +  687  hypothetical protein  YP_001922738  normal  1  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0008  CDS  NC_010725  8864  11047  +  2184  helicase, RecD/TraA family  YP_001922739  normal  1  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0009  CDS  NC_010725  11190  12374  +  1185  hypothetical protein  YP_001922740  normal  1  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0010  CDS  NC_010725  12563  14788  +  2226  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  YP_001922741  normal  1  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0011  CDS  NC_010725  14816  15052  +  237  BolA family protein  YP_001922742  normal  1  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0012  CDS  NC_010725  15115  15450  +  336  glutaredoxin-like protein  YP_001922743  normal  1  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0013  CDS  NC_010725  15523  16425  +  903  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_001922744  normal  1  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0014  CDS  NC_010725  16536  17420  +  885  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  YP_001922745  normal  1  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0015  CDS  NC_010725  17607  17822  +  216  hypothetical protein  YP_001922746  normal  1  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0016  CDS  NC_010725  17839  18660  -  822  hypothetical protein  YP_001922747  normal  0.571689  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0017  CDS  NC_010725  19483  20142  +  660  chaperone protein HtpG  YP_001922748  normal  0.247503  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0018  CDS  NC_010725  20130  22940  +  2811  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  YP_001922749  normal  0.653204  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0019  CDS  NC_010725  22937  24322  +  1386  Polysulphide reductase NrfD  YP_001922750  normal  0.0465805  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0020  CDS  NC_010725  24319  24837  +  519  hypothetical protein  YP_001922751  normal  0.764117  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0021  CDS  NC_010725  24834  25361  +  528  hypothetical protein  YP_001922752  normal  1  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0022  CDS  NC_010725  25358  26314  +  957  hypothetical protein  YP_001922753  normal  1  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0023  CDS  NC_010725  26307  26828  +  522  hypothetical protein  YP_001922754  normal  1  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0024  CDS  NC_010725  26828  27916  +  1089  cytochrome c oxidase, subunit II  YP_001922755  normal  1  normal  0.901821  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0025  CDS  NC_010725  27948  29639  +  1692  cytochrome c oxidase, subunit I  YP_001922756  normal  1  normal  0.785934  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0026  CDS  NC_010725  29636  30325  +  690  cytochrome c oxidase subunit III  YP_001922757  normal  1  normal  0.471967  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0027  CDS  NC_010725  30322  30624  +  303  caa(3)-type oxidase, subunit IV  YP_001922758  normal  1  normal  0.41821  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0028  CDS  NC_010725  31039  31398  +  360  hypothetical protein  YP_001922759  normal  0.463032  normal  0.326692  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0029  CDS  NC_010725  31484  32314  -  831  Lytic transglycosylase catalytic  YP_001922760  normal  0.240678  normal  0.132165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0030  CDS  NC_010725  32370  33293  -  924  Curli production assembly/transport component CsgG  YP_001922761  normal  1  normal  0.133065  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0031  CDS  NC_010725  33442  33888  -  447  hypothetical protein  YP_001922762  normal  1  normal  0.0754943  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0032  CDS  NC_010725  33927  34571  -  645  hypothetical protein  YP_001922763  normal  1  normal  0.0801235  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0033  CDS  NC_010725  34866  35198  -  333  hypothetical protein  YP_001922764  normal  1  normal  0.0727682  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0034  CDS  NC_010725  35308  36510  -  1203  hypothetical protein  YP_001922765  normal  1  normal  0.0940044  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0035  CDS  NC_010725  37201  37764  +  564  transcriptional regulator, LuxR family  YP_001922766  normal  1  normal  0.0538241  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0036  CDS  NC_010725  38104  38718  +  615  hypothetical protein  YP_001922767  normal  1  normal  0.0527865  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0037  CDS  NC_010725  38767  39165  +  399  hypothetical protein  YP_001922768  normal  1  normal  0.054688  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0038  CDS  NC_010725  39279  41324  -  2046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  YP_001922769  normal  1  normal  0.0323591  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0039  CDS  NC_010725  41324  42841  -  1518  putative circadian clock protein, KaiC  YP_001922770  normal  1  normal  0.0424208  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0040  CDS  NC_010725  43038  45467  -  2430  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  YP_001922771  normal  1  normal  0.0581395  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0041  CDS  NC_010725  46113  47318  +  1206  hypothetical protein  YP_001922772  normal  0.0602392  normal  0.0628482  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0042  CDS  NC_010725  47337  48335  -  999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001922773  normal  0.15937  normal  0.0190305  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0043  CDS  NC_010725  48445  49140  -  696  transcriptional regulator, GntR family  YP_001922774  normal  1  normal  0.0169991  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0044  CDS  NC_010725  49137  49901  -  765  malonate transporter, MadM subunit  YP_001922775  normal  1  normal  0.0292354  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0045  CDS  NC_010725  49905  50360  -  456  malonate transporter, MadL subunit  YP_001922776  normal  1  normal  0.0451668  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0046  CDS  NC_010725  50630  52276  +  1647  malonate decarboxylase, alpha subunit  YP_001922777  normal  0.725165  normal  0.092171  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0047  CDS  NC_010725  52284  52592  +  309  malonate decarboxylase subunit delta  YP_001922778  normal  0.328223  normal  0.098952  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0048  CDS  NC_010725  52595  53527  +  933  malonate decarboxylase subunit beta  YP_001922779  normal  0.179733  normal  0.0754943  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0049  CDS  NC_010725  53514  54230  +  717  malonate decarboxylase, gamma subunit  YP_001922780  normal  0.210818  normal  0.0466048  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0050  CDS  NC_010725  54223  54882  +  660  hypothetical protein  YP_001922781  normal  0.390549  normal  0.0698555  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0051  CDS  NC_010725  54879  55739  +  861  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  YP_001922782  normal  0.32958  normal  0.107341  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0052  CDS  NC_010725  55736  56659  +  924  acyl transferase domain protein  YP_001922783  normal  0.399872  normal  0.113572  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0053  CDS  NC_010725  56876  59161  +  2286  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  YP_001922784  normal  1  normal  0.0431346  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0054  CDS  NC_010725  59272  60711  -  1440  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  YP_001922785  normal  0.38477  normal  0.137274  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0055  CDS  NC_010725  61075  61557  +  483  hypothetical protein  YP_001922786  normal  0.899149  normal  0.0738281  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0056  CDS  NC_010725  61617  62693  +  1077  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  YP_001922787  normal  1  normal  0.0850628  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0057  CDS  NC_010725  62647  63750  +  1104  Radical SAM domain protein  YP_001922788  normal  0.615692  normal  0.0888986  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0058  CDS  NC_010725  63750  64292  +  543  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001922789  normal  0.23701  normal  0.118558  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0059  CDS  NC_010725  64292  65287  +  996  AIR synthase related protein  YP_001922790  normal  0.148611  normal  0.181031  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0060  CDS  NC_010725  65284  65808  +  525  glycosyltransferase  YP_001922791  normal  0.377233  normal  0.16157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0061  CDS  NC_010725  65805  66980  +  1176  glycosyl transferase group 1  YP_001922792  normal  0.659761  normal  0.125882  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0062  CDS  NC_010725  66973  67254  +  282  hypothetical protein  YP_001922793  normal  1  normal  0.143041  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0063  CDS  NC_010725  67293  68561  +  1269  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_001922794  normal  1  normal  0.191395  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0064  CDS  NC_010725  68909  70000  -  1092  hypothetical protein  YP_001922795  normal  1  normal  0.257348  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0065  CDS  NC_010725  70091  71155  -  1065  hypothetical protein  YP_001922796  normal  1  normal  0.346664  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0066  CDS  NC_010725  71625  71999  -  375  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_001922797  normal  1  normal  0.293899  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0067  CDS  NC_010725  72889  74469  +  1581  integrase family protein  YP_001922798  normal  1  normal  0.620539  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0068  CDS  NC_010725  74624  75001  +  378  metallophosphoesterase  YP_001922799  normal  1  normal  0.494721  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0069  CDS  NC_010725  75117  76625  +  1509  Integrase catalytic region  YP_001922800  normal  1  normal  0.83421  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0070  CDS  NC_010725  76625  77356  +  732  IstB domain protein ATP-binding protein  YP_001922801  normal  0.166344  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0071    NC_010725  77538  77729  +  192      normal  0.0593652  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0072  CDS  NC_010725  77731  78003  +  273  hypothetical protein  YP_001922802  normal  0.0740869  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0073  CDS  NC_010725  78000  78965  -  966  hypothetical protein  YP_001922803  normal  0.011221  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0074  CDS  NC_010725  78965  79246  -  282  hypothetical protein  YP_001922804  normal  0.0761091  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0075  CDS  NC_010725  79246  79836  -  591  hypothetical protein  YP_001922805  normal  0.136378  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0076  CDS  NC_010725  79926  80990  -  1065  hypothetical protein  YP_001922806  normal  0.335554  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0077  CDS  NC_010725  81085  81339  -  255  hypothetical protein  YP_001922807  normal  1  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0078  CDS  NC_010725  81378  81851  -  474  hypothetical protein  YP_001922808  normal  1  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0079  CDS  NC_010725  81865  82866  -  1002  HIRAN  YP_001922809  normal  1  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0080  CDS  NC_010725  82877  83194  -  318  hypothetical protein  YP_001922810  normal  1  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0081  CDS  NC_010725  83191  83445  -  255  hypothetical protein  YP_001922811  normal  1  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0082  CDS  NC_010725  83756  84616  +  861  hypothetical protein  YP_001922812  normal  1  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0083  CDS  NC_010725  84669  85502  +  834  hypothetical protein  YP_001922813  normal  1  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0084  CDS  NC_010725  85582  85896  -  315  hypothetical protein  YP_001922814  normal  1  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0085  CDS  NC_010725  86830  87303  -  474  hypothetical protein  YP_001922815  normal  0.215078  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0086  CDS  NC_010725  87578  89620  +  2043  hypothetical protein  YP_001922816  normal  0.169561  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0087    NC_010725  90024  90143  -  120      normal  0.0313226  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0088  CDS  NC_010725  90386  91123  +  738  TIR protein  YP_001922817  normal  0.0832287  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0089  CDS  NC_010725  91288  92511  -  1224  diguanylate cyclase  YP_001922818  normal  0.181863  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0090  CDS  NC_010725  92667  92879  +  213  hypothetical protein  YP_001922819  normal  0.275754  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0091    NC_010725  92899  93093  +  195      normal  0.645335  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0092  CDS  NC_010725  93093  95321  -  2229  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  YP_001922820  normal  1  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0093  CDS  NC_010725  95330  95557  -  228  hypothetical protein  YP_001922821  normal  0.403714  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0094  CDS  NC_010725  95869  98658  +  2790  signal transduction histidine kinase  YP_001922822  normal  1  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0095  CDS  NC_010725  98948  99319  +  372  response regulator receiver protein  YP_001922823  normal  0.898425  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0096  CDS  NC_010725  99399  101624  -  2226  multi-sensor hybrid histidine kinase  YP_001922824  normal  0.770159  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0097  CDS  NC_010725  101977  104139  -  2163  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  YP_001922825  normal  1  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0098  CDS  NC_010725  104132  107284  -  3153  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  YP_001922826  normal  1  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0099  CDS  NC_010725  107288  107476  -  189  putative addiction module antidote protein, CopG/Arc/MetJ family  YP_001922827  normal  1  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Mpop_0100    NC_010725  107892  108089  +  198      normal  1  normal  1  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 56    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>