1845 genes were found for organism Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 19    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NMAR_0  tRNA  NC_010085  232881  232958  +  78  tRNA-Asp    n/a    normal  0.0614073  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0001  CDS  NC_010085  146  1348  +  1203  cell division control protein 6 family protein  YP_001581339  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0002  CDS  NC_010085  1325  2770  -  1446  DNA polymerase II small subunit  YP_001581340  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0003  CDS  NC_010085  2881  3387  +  507  hypothetical protein  YP_001581341  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0004  CDS  NC_010085  3463  4359  +  897  hypothetical protein  YP_001581342  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0005  CDS  NC_010085  4356  5072  -  717  precorrin-6y C5,15-methyltransferase subunit CbiE  YP_001581343  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0006  CDS  NC_010085  5075  5566  -  492  hypothetical protein  YP_001581344  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0007  CDS  NC_010085  5639  7168  +  1530  peptidylprolyl isomerase  YP_001581345  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0008  CDS  NC_010085  7169  8524  -  1356  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_001581346  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0009  CDS  NC_010085  8594  9244  -  651  hypothetical protein  YP_001581347  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0010  CDS  NC_010085  9370  9861  +  492  heat shock protein HSP20  YP_001581348  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0011  CDS  NC_010085  9889  12030  +  2142  AAA family ATPase  YP_001581349  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0012  CDS  NC_010085  12340  12783  +  444  hypothetical protein  YP_001581350  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0013  CDS  NC_010085  12800  13720  -  921  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  YP_001581351  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0014  CDS  NC_010085  13897  14136  -  240  hypothetical protein  YP_001581352  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0015  CDS  NC_010085  14212  14592  +  381  camphor resistance CrcB protein  YP_001581353  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0016  CDS  NC_010085  14599  14826  +  228  hypothetical protein  YP_001581354  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0017  CDS  NC_010085  14827  15099  -  273  hypothetical protein  YP_001581355  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0018  CDS  NC_010085  15531  15830  +  300  hypothetical protein  YP_001581356  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0019  CDS  NC_010085  15827  16771  -  945  hypothetical protein  YP_001581357  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0020  CDS  NC_010085  16889  17794  +  906  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  YP_001581358  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0021  CDS  NC_010085  17795  19249  -  1455  sodium/hydrogen exchanger  YP_001581359  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0022  CDS  NC_010085  19365  19907  +  543  hypothetical protein  YP_001581360  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0023  CDS  NC_010085  19920  20459  +  540  adenylylsulfate kinase  YP_001581361  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0024  CDS  NC_010085  20451  21266  -  816  inositol monophosphatase  YP_001581362  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0025  CDS  NC_010085  21275  21481  -  207  hypothetical protein  YP_001581363  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0026  CDS  NC_010085  21522  22331  -  810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001581364  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0027  CDS  NC_010085  22532  22960  -  429  hypothetical protein  YP_001581365  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0028  CDS  NC_010085  22998  23549  -  552  hypothetical protein  YP_001581366  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0029  CDS  NC_010085  23675  24322  +  648  hypothetical protein  YP_001581367  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0030  CDS  NC_010085  24466  25470  +  1005  hypothetical protein  YP_001581368  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0031  CDS  NC_010085  25473  25946  -  474  hypothetical protein  YP_001581369  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0032  CDS  NC_010085  26047  26688  -  642  hypothetical protein  YP_001581370  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0033  CDS  NC_010085  27032  27292  +  261  hypothetical protein  YP_001581371  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0034  CDS  NC_010085  27296  28303  +  1008  hypothetical protein  YP_001581372  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0035  CDS  NC_010085  28300  28650  +  351  hypothetical protein  YP_001581373  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0036  CDS  NC_010085  28710  28904  +  195  hypothetical protein  YP_001581374  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0037  CDS  NC_010085  28946  29659  +  714  radical SAM domain-containing protein  YP_001581375  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0038  CDS  NC_010085  29723  30280  +  558  GTP cyclohydrolase I  YP_001581376  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0039  CDS  NC_010085  30258  30575  +  318  hypothetical protein  YP_001581377  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0040  CDS  NC_010085  30578  31252  -  675  ExsB family protein  YP_001581378  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0041  CDS  NC_010085  31256  32179  -  924  homoserine kinase  YP_001581379  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0042  CDS  NC_010085  32179  32937  -  759  GTPase  YP_001581380  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0043  CDS  NC_010085  33030  34121  +  1092  hypothetical protein  YP_001581381  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0044  CDS  NC_010085  34156  34950  +  795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001581382  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0045  CDS  NC_010085  34958  35362  -  405  hypothetical protein  YP_001581383  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0046  CDS  NC_010085  35374  35685  -  312  hypothetical protein  YP_001581384  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0047  CDS  NC_010085  35839  37074  -  1236  hypothetical protein  YP_001581385  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0048  CDS  NC_010085  37114  38277  -  1164  thiamine biosynthesis ATP pyrophosphatase-like protein  YP_001581386  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0049  CDS  NC_010085  38305  39030  +  726  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  YP_001581387  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0050  CDS  NC_010085  39032  40174  +  1143  sulfate adenylyltransferase  YP_001581388  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0051  CDS  NC_010085  40206  40871  +  666  hypothetical protein  YP_001581389  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0052  CDS  NC_010085  40855  41511  -  657  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  YP_001581390  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0053  CDS  NC_010085  41561  42715  +  1155  hypothetical protein  YP_001581391  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0054  CDS  NC_010085  42712  43098  +  387  hypothetical protein  YP_001581392  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0055  CDS  NC_010085  43073  45031  -  1959  hypothetical protein  YP_001581393  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0056  CDS  NC_010085  45126  45602  +  477  hypothetical protein  YP_001581394  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0057  CDS  NC_010085  45627  46217  +  591  precorrin-6y C5,15-methyltransferase subunit CbiT  YP_001581395  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0058  CDS  NC_010085  46253  46975  +  723  precorrin-2 C20-methyltransferase  YP_001581396  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0059  CDS  NC_010085  46968  47738  +  771  precorrin-4 C11-methyltransferase  YP_001581397  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0060  CDS  NC_010085  47719  48474  -  756  glutamate racemase  YP_001581398  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0061  CDS  NC_010085  48580  49230  +  651  hypothetical protein  YP_001581399  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0062  CDS  NC_010085  49278  50438  -  1161  glycosyl transferase family protein  YP_001581400  n/a    normal  0.963311  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0063  CDS  NC_010085  50600  52057  -  1458  glycyl-tRNA synthetase  YP_001581401  n/a    normal  0.823142  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0064  CDS  NC_010085  52088  52927  -  840  apurinic endonuclease Apn1  YP_001581402  n/a    normal  0.751168  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0065  CDS  NC_010085  53013  54038  +  1026  DNA primase large subunit  YP_001581403  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0066  CDS  NC_010085  54038  55159  +  1122  DNA primase small subunit  YP_001581404  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0067  CDS  NC_010085  55201  58062  +  2862  hypothetical protein  YP_001581405  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0068  CDS  NC_010085  58063  58605  +  543  class I glutamine amidotransferase  YP_001581406  n/a    normal  0.919484  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0069  CDS  NC_010085  58640  59602  +  963  TPR repeat-containing protein  YP_001581407  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0070  CDS  NC_010085  59729  59902  +  174  hypothetical protein  YP_001581408  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0071  CDS  NC_010085  60101  60514  +  414  30S ribosomal protein S6e  YP_001581409  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0072  CDS  NC_010085  60546  61808  +  1263  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  YP_001581410  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0073  CDS  NC_010085  61801  62169  +  369  hypothetical protein  YP_001581411  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0074  CDS  NC_010085  62205  62654  +  450  PEBP family protein  YP_001581412  n/a    normal  1  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0075  CDS  NC_010085  62723  64861  +  2139  dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase  YP_001581413  n/a    normal  0.70229  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0076  CDS  NC_010085  64864  65019  -  156  RNA-binding protein Nop10p  YP_001581414  n/a    normal  0.592689  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0077  CDS  NC_010085  65021  65818  -  798  RNA-binding S1 domain-containing protein  YP_001581415  n/a    normal  0.541121  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0078  CDS  NC_010085  65859  66389  -  531  cob(I)alamin adenosyltransferase  YP_001581416  n/a    normal  0.974042  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0079  CDS  NC_010085  66477  67829  +  1353  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  YP_001581417  n/a    normal  0.786214  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0080  CDS  NC_010085  67818  68459  -  642  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  YP_001581418  n/a    normal  0.52758  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0081  CDS  NC_010085  68449  69201  -  753  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  YP_001581419  n/a    normal  0.53662  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0082  CDS  NC_010085  69198  70250  -  1053  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiG protein  YP_001581420  n/a    normal  0.243954  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0083  CDS  NC_010085  70282  71367  -  1086  cobalamin biosynthesis protein CbiD  YP_001581421  n/a    normal  0.25516  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0084  CDS  NC_010085  71458  72327  +  870  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_001581422  n/a    normal  0.257288  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0085  CDS  NC_010085  72304  73470  -  1167  methionine adenosyltransferase  YP_001581423  n/a    normal  0.486268  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0086  CDS  NC_010085  73486  73731  -  246  like-Sm ribonucleoprotein core  YP_001581424  n/a    normal  0.514735  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0087  CDS  NC_010085  73840  74493  +  654  RecA/RadA recombinase-like protein  YP_001581425  n/a    normal  0.439691  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0088  CDS  NC_010085  74592  77333  +  2742  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  YP_001581426  n/a    normal  0.403606  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0089  CDS  NC_010085  77330  78730  -  1401  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  YP_001581427  n/a    normal  0.235418  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0090  CDS  NC_010085  78944  79882  +  939  ABC transporter-like protein  YP_001581428  n/a    normal  0.101268  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0091  CDS  NC_010085  79866  80627  +  762  ABC transporter  YP_001581429  n/a    normal  0.13223  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0092  CDS  NC_010085  80633  81373  -  741  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  YP_001581430  n/a    normal  0.133912  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0093  CDS  NC_010085  81548  82600  -  1053  hypothetical protein  YP_001581431  n/a    normal  0.0978162  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0094  CDS  NC_010085  82664  83803  +  1140  hypothetical protein  YP_001581432  n/a    normal  0.0992132  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0095  CDS  NC_010085  83839  84402  +  564  GrpE protein  YP_001581433  n/a    normal  0.0826396  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0096  CDS  NC_010085  84405  86315  +  1911  chaperone protein DnaK  YP_001581434  n/a    normal  0.0207175  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0097  CDS  NC_010085  86365  87450  +  1086  chaperone protein DnaJ  YP_001581435  n/a    hitchhiker  0.00841674  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0098  CDS  NC_010085  87456  87989  +  534  hypothetical protein  YP_001581436  n/a    hitchhiker  0.0065858  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Nmar_0099  CDS  NC_010085  88308  90212  -  1905  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit E  YP_001581437  n/a    hitchhiker  0.00583486  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea 
 
 
-
 
Page 1 of 19    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>