29 genes were found for organism Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Adeg_2153  CDS  NC_013386  95  3451  3357  copper amine oxidase domain protein  YP_003240080  normal  0.0231006  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_2154  CDS  NC_013386  3672  5972  2301  peptidase C11 clostripain  YP_003240081  normal  0.372371  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_2155  CDS  NC_013386  6207  6863  657  hypothetical protein  YP_003240082  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_2156  CDS  NC_013386  6936  7898  963  hypothetical protein  YP_003240083  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_2157  CDS  NC_013386  8016  8261  246  transcriptional regulator, AbrB family  YP_003240084  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_2158  CDS  NC_013386  8246  8866  621  DNA binding domain protein, excisionase family  YP_003240085  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_2159  CDS  NC_013386  8942  9118  177  hypothetical protein  YP_003240086  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_2160  CDS  NC_013386  9671  11050  1380  HNH endonuclease  YP_003240087  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_2161  CDS  NC_013386  11065  12546  1482  hypothetical protein  YP_003240088  hitchhiker  0.00252617  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_2162  CDS  NC_013386  12918  13208  291  transcriptional regulator, AbrB family  YP_003240089  normal  0.0368662  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_2163  CDS  NC_013386  13278  14180  903  hypothetical protein  YP_003240090  hitchhiker  0.00106867  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_2164  CDS  NC_013386  15086  15325  240  hypothetical protein  YP_003240091  decreased coverage  0.0000000354539  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_2165  CDS  NC_013386  15564  16922  1359  hypothetical protein  YP_003240092  hitchhiker  0.00029385  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_2166  CDS  NC_013386  17136  17519  384  hypothetical protein  YP_003240093  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_2167  CDS  NC_013386  17522  17839  318  CopG domain protein DNA-binding domain protein  YP_003240094  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_2168  CDS  NC_013386  18237  18920  684  hypothetical protein  YP_003240095  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_2169  CDS  NC_013386  18924  19619  696  hypothetical protein  YP_003240096  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_2170  CDS  NC_013386  19636  19953  318  hypothetical protein  YP_003240097  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_2171  CDS  NC_013386  19940  20590  651  hypothetical protein  YP_003240098  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_2172  CDS  NC_013386  21422  22729  1308  regulatory protein LacI  YP_003240099  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_2173  CDS  NC_013386  22958  23281  324  hypothetical protein  YP_003240100  normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_2174    NC_013386  23282  23559  278      normal  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_2175  CDS  NC_013386  23665  24102  438  DNA binding domain protein, excisionase family  YP_003240101  normal  0.0558091  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_2176  CDS  NC_013386  24247  24435  189  hypothetical protein  YP_003240102  normal  0.0122389  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_2177  CDS  NC_013386  24630  25496  867  Domain of unknown function DUF1814  YP_003240103  decreased coverage  0.000000211086  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_2178  CDS  NC_013386  25450  26079  630  hypothetical protein  YP_003240104  normal  0.0251781  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_2179  CDS  NC_013386  26066  26932  867  integrase family protein  YP_003240105  normal  0.353401  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_2180  CDS  NC_013386  26960  27382  423  PilT protein domain protein  YP_003240106  normal  0.18775  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Adeg_2181  CDS  NC_013386  27370  27651  282  prevent-host-death family protein  YP_003240107  normal  0.131866  n/a    Ammonifex degensii KC4  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>