432 genes were found for organism Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 5    << first  < prev  1  2  3  4  5    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Rpic12D_4666  CDS  NC_012855  251  517  +  267  hypothetical protein  YP_002979559  normal  0.330319  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4667  CDS  NC_012855  514  1140  +  627  hypothetical protein  YP_002979560  normal  0.737237  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4668  CDS  NC_012855  1197  2318  +  1122  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  YP_002979561  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4669  CDS  NC_012855  2429  2926  +  498  hypothetical protein  YP_002979562  normal  0.558445  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4670  CDS  NC_012855  2939  3994  +  1056  hypothetical protein  YP_002979563  normal  0.811002  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4671  CDS  NC_012855  4010  4486  +  477  single-strand binding protein  YP_002979564  normal  0.726649  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4672  CDS  NC_012855  4596  4823  +  228  hypothetical protein  YP_002979565  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4673  CDS  NC_012855  5226  8075  +  2850  ribonucleoside-diphosphate reductase, alpha subunit  YP_002979566  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4674  CDS  NC_012855  8155  9141  +  987  ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta  YP_002979567  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4675  CDS  NC_012855  9659  9913  +  255  hypothetical protein  YP_002979568  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4676  CDS  NC_012855  9977  10630  +  654  hypothetical protein  YP_002979569  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4677  CDS  NC_012855  11281  11643  +  363  transcriptional regulator, XRE family  YP_002979570  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4678  CDS  NC_012855  11640  12194  +  555  protein of unknown function DUF955  YP_002979571  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4679  CDS  NC_012855  12367  12495  +  129  hypothetical protein  YP_002979572  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4680  CDS  NC_012855  13043  13807  +  765  hypothetical protein  YP_002979573  normal  0.081889  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4681  CDS  NC_012855  14166  15182  +  1017  hypothetical protein  YP_002979574  normal  0.214959  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4682    NC_012855  15469  15747  +  279      normal  0.198151  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4683  CDS  NC_012855  15859  15966  +  108  hypothetical protein  YP_002979575  normal  0.135326  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4684  CDS  NC_012855  16042  16266  -  225  hypothetical protein  YP_002979576  normal  0.252579  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4685  CDS  NC_012855  16424  16786  +  363  transposase IS3/IS911  YP_002979577  normal  0.137823  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4686  CDS  NC_012855  16783  17583  +  801  Integrase catalytic region  YP_002979578  normal  0.191676  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4687  CDS  NC_012855  17660  18445  -  786  IstB domain protein ATP-binding protein  YP_002979579  normal  0.212682  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4688  CDS  NC_012855  18435  19961  -  1527  Integrase catalytic region  YP_002979580  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4689  CDS  NC_012855  20038  20316  +  279  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  YP_002979581  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4690  CDS  NC_012855  21919  22623  -  705  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  YP_002979582  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4691  CDS  NC_012855  22649  24157  -  1509  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_002979583  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4692  CDS  NC_012855  24161  24745  +  585  transcriptional regulator, AraC family  YP_002979584  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4693  CDS  NC_012855  25515  25943  -  429  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  YP_002979585  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4694  CDS  NC_012855  25954  26379  -  426  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  YP_002979586  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4695  CDS  NC_012855  26383  27294  -  912  MotA/TolQ/ExbB proton channel  YP_002979587  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4696  CDS  NC_012855  27374  28084  -  711  TonB family protein  YP_002979588  normal  1  normal  0.923334  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4697  CDS  NC_012855  28283  28438  -  156  hypothetical protein  YP_002979589  normal  0.428545  normal  0.853139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4698  CDS  NC_012855  29091  31772  +  2682  TonB-dependent receptor  YP_002979590  normal  1  normal  0.644067  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4699  CDS  NC_012855  32248  33585  -  1338  amine oxidase  YP_002979591  normal  0.0922876  normal  0.472473  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4700  CDS  NC_012855  33715  33849  +  135  hypothetical protein  YP_002979592  normal  0.578447  normal  0.377592  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4701  CDS  NC_012855  34151  35566  -  1416  Chloride channel core  YP_002979593  normal  1  normal  0.10029  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4702  CDS  NC_012855  35709  37964  +  2256  hypothetical protein  YP_002979594  normal  1  normal  0.185453  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4703  CDS  NC_012855  38066  39493  +  1428  Aldehyde Dehydrogenase  YP_002979595  normal  1  normal  0.100697  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4704  CDS  NC_012855  39751  41367  +  1617  glucose-methanol-choline oxidoreductase  YP_002979596  normal  1  normal  0.101516  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4705  CDS  NC_012855  41658  42962  +  1305  major facilitator superfamily MFS_1  YP_002979597  normal  1  normal  0.0828035  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4706  CDS  NC_012855  43085  43378  -  294  hypothetical protein  YP_002979598  normal  0.458096  normal  0.0684173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4707  CDS  NC_012855  43510  44421  +  912  transcriptional regulator, LysR family  YP_002979599  normal  0.453216  normal  0.0471653  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4708  CDS  NC_012855  44439  45569  -  1131  hypothetical protein  YP_002979600  normal  0.993904  normal  0.0847852  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4709    NC_012855  46028  46345  -  318      normal  0.225613  normal  0.172047  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4710  CDS  NC_012855  46367  47812  -  1446  amine oxidase  YP_002979601  normal  0.173844  normal  0.0970024  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4711  CDS  NC_012855  48021  49946  -  1926  flagellar hook-associated protein FlgK  YP_002979602  normal  0.402809  normal  0.0701142  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4712  CDS  NC_012855  49989  50774  -  786  flagellar basal-body rod protein FlgG  YP_002979603  normal  0.374892  normal  0.0910143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4713  CDS  NC_012855  50821  52026  -  1206  flagellar hook protein FlgE  YP_002979604  normal  1  normal  0.0589234  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4714  CDS  NC_012855  52384  53205  -  822  flagellin domain protein  YP_002979605  normal  1  normal  0.0875271  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4715  CDS  NC_012855  54193  55593  +  1401  amine oxidase  YP_002979606  normal  1  normal  0.0990147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4716  CDS  NC_012855  56084  57097  -  1014  hypothetical protein  YP_002979607  normal  1  normal  0.147365  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4717  CDS  NC_012855  58495  58998  -  504  protein of unknown function DUF159  YP_002979608  normal  1  normal  0.143313  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4718  CDS  NC_012855  58995  59339  -  345  hypothetical protein  YP_002979609  normal  0.974871  normal  0.136432  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4719  CDS  NC_012855  60536  61306  +  771  hypothetical protein  YP_002979610  normal  1  normal  0.102384  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4720  CDS  NC_012855  61465  63477  +  2013  Integrase catalytic region  YP_002979611  normal  1  normal  0.086869  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4721  CDS  NC_012855  63487  64470  +  984  AAA ATPase  YP_002979612  normal  0.895386  normal  0.068339  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4722  CDS  NC_012855  64472  66556  +  2085  hypothetical protein  YP_002979613  normal  0.224738  normal  0.0942649  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4723  CDS  NC_012855  67156  67617  -  462  hypothetical protein  YP_002979614  normal  0.215281  normal  0.138985  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4724  CDS  NC_012855  67607  68809  -  1203  hypothetical protein  YP_002979615  normal  0.0242073  normal  0.178225  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4725  CDS  NC_012855  68784  69041  -  258  hypothetical protein  YP_002979616  normal  0.100581  normal  0.212711  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4726  CDS  NC_012855  69170  70006  +  837  hypothetical protein  YP_002979617  normal  0.607896  normal  0.237386  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4727  CDS  NC_012855  70003  70686  +  684  hypothetical protein  YP_002979618  normal  0.198002  normal  0.221757  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4728  CDS  NC_012855  70752  71378  +  627  hypothetical protein  YP_002979619  normal  0.114541  normal  0.213547  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4729  CDS  NC_012855  71710  72123  -  414  hypothetical protein  YP_002979620  decreased coverage  0.0039354  normal  0.208766  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4730    NC_012855  72905  73072  +  168      normal  0.148976  normal  0.209685  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4731  CDS  NC_012855  73707  75035  +  1329  Ribonucleotide reductase alpha subunit-like protein  YP_002979621  normal  1  normal  0.181499  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4732  CDS  NC_012855  75254  76363  +  1110  hypothetical protein  YP_002979622  normal  0.972118  normal  0.160192  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4733  CDS  NC_012855  76420  78510  +  2091  von Willebrand factor type A  YP_002979623  normal  0.345063  normal  0.296861  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4734  CDS  NC_012855  78573  79640  +  1068  P4 alpha zinc-binding domain protein  YP_002979624  normal  1  normal  0.48462  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4735  CDS  NC_012855  79783  80487  +  705  hypothetical protein  YP_002979625  normal  1  normal  0.322187  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4736    NC_012855  80570  81202  -  633      normal  1  normal  0.453159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4737  CDS  NC_012855  81596  81790  +  195  hypothetical protein  YP_002979626  normal  0.412224  normal  0.565531  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4738  CDS  NC_012855  81793  82350  +  558  flagellar transcriptional activator FlhC  YP_002979627  normal  0.697972  normal  0.622  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4739  CDS  NC_012855  82427  83299  +  873  hypothetical protein  YP_002979628  normal  1  normal  0.481527  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4740  CDS  NC_012855  83470  85635  +  2166  Relaxase  YP_002979629  normal  1  normal  0.428204  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4741  CDS  NC_012855  85632  87521  +  1890  hypothetical protein  YP_002979630  normal  1  normal  0.404612  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4742  CDS  NC_012855  87564  88190  +  627  hypothetical protein  YP_002979631  normal  1  normal  0.322187  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4743  CDS  NC_012855  88187  88825  +  639  hypothetical protein  YP_002979632  normal  1  normal  0.307237  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4744  CDS  NC_012855  88937  89986  +  1050  type II secretion system protein E  YP_002979633  normal  1  normal  0.332576  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4745  CDS  NC_012855  89928  90287  +  360  Conjugal transfer protein TrbC  YP_002979634  normal  1  normal  0.277852  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4746  CDS  NC_012855  90303  90623  +  321  type IV secretory pathway VirB3 family protein  YP_002979635  normal  1  normal  0.276825  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4747  CDS  NC_012855  90617  93151  +  2535  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  YP_002979636  normal  1  normal  0.290977  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4748  CDS  NC_012855  93144  93905  +  762  hypothetical protein  YP_002979637  normal  1  normal  0.439827  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4749  CDS  NC_012855  93936  94709  +  774  hypothetical protein  YP_002979638  normal  0.695335  normal  0.293585  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4750  CDS  NC_012855  94827  96149  +  1323  hypothetical protein  YP_002979639  normal  1  normal  0.231745  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4751  CDS  NC_012855  96202  96492  +  291  hypothetical protein  YP_002979640  normal  1  normal  0.178521  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4752  CDS  NC_012855  96566  96724  +  159  hypothetical protein  YP_002979641  normal  1  normal  0.177051  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4753  CDS  NC_012855  96721  98661  +  1941  AAA ATPase central domain protein  YP_002979642  normal  1  normal  0.239114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4754  CDS  NC_012855  98861  99559  +  699  hypothetical protein  YP_002979643  normal  1  normal  0.26139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4755  CDS  NC_012855  99559  100326  +  768  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  YP_002979644  normal  1  normal  0.369632  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4756  CDS  NC_012855  100323  101657  +  1335  conjugation TrbI family protein  YP_002979645  normal  1  normal  0.745717  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4757  CDS  NC_012855  101663  103183  +  1521  hypothetical protein  YP_002979646  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4758  CDS  NC_012855  103180  103623  +  444  hypothetical protein  YP_002979647  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4759  CDS  NC_012855  103927  105717  +  1791  hypothetical protein  YP_002979648  normal  1  normal  0.8477  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4760  CDS  NC_012855  105714  107015  +  1302  hypothetical protein  YP_002979649  normal  0.350974  normal  0.760268  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4761  CDS  NC_012855  107020  107595  +  576  hypothetical protein  YP_002979650  normal  0.564371  normal  0.481086  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4762  CDS  NC_012855  107596  109521  +  1926  type II secretion system protein E  YP_002979651  normal  0.228994  normal  0.63689  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4763  CDS  NC_012855  109518  110672  +  1155  type II secretory pathway component PulF-like protein  YP_002979652  normal  0.861897  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4764  CDS  NC_012855  110882  111484  +  603  hypothetical protein  YP_002979653  normal  0.974143  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4765  CDS  NC_012855  111640  113055  +  1416  hypothetical protein  YP_002979654  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 5    << first  < prev  1  2  3  4  5    next >  last >>