68 genes were found for organism Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Rpic12D_5385  CDS  NC_012851  14  397  -  384  hypothetical protein  YP_002978417  normal  0.526877  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5386  CDS  NC_012851  459  656  -  198  hypothetical protein  YP_002978418  normal  0.715249  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5387  CDS  NC_012851  707  1012  -  306  hypothetical protein  YP_002978419  normal  0.800555  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5388  CDS  NC_012851  1064  1303  -  240  hypothetical protein  YP_002978420  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5389  CDS  NC_012851  1343  1984  -  642  hypothetical protein  YP_002978421  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5390  CDS  NC_012851  2155  2808  -  654  hypothetical protein  YP_002978422  normal  0.467019  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5391  CDS  NC_012851  3587  4342  +  756  initiator RepB protein  YP_002978423  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5392  CDS  NC_012851  4753  5175  -  423  hypothetical protein  YP_002978424  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5393  CDS  NC_012851  5153  5881  -  729  hypothetical protein  YP_002978425  normal  0.962433  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5394  CDS  NC_012851  7806  9545  +  1740  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  YP_002978426  normal  0.709491  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5395  CDS  NC_012851  9571  9726  +  156  hypothetical protein  YP_002978427  normal  0.658141  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5396  CDS  NC_012851  10019  10822  -  804  hypothetical protein  YP_002978428  normal  0.613339  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5397  CDS  NC_012851  10834  11058  -  225  hypothetical protein  YP_002978429  normal  0.180379  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5398  CDS  NC_012851  11122  11355  -  234  hypothetical protein  YP_002978430  normal  0.181461  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5399  CDS  NC_012851  11453  13324  -  1872  ParB domain protein nuclease  YP_002978431  normal  0.883883  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5400  CDS  NC_012851  13390  14217  -  828  protein of unknown function DUF932  YP_002978432  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5401  CDS  NC_012851  14413  14976  -  564  hypothetical protein  YP_002978433  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5402  CDS  NC_012851  14973  15569  -  597  hypothetical protein  YP_002978434  normal  0.775175  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5403  CDS  NC_012851  15626  15832  +  207  hypothetical protein  YP_002978435  normal  0.84094  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5404  CDS  NC_012851  15937  16284  -  348  hypothetical protein  YP_002978436  normal  0.979033  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5405  CDS  NC_012851  16310  16543  -  234  hypothetical protein  YP_002978437  normal  0.591042  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5406  CDS  NC_012851  16600  16809  -  210  hypothetical protein  YP_002978438  normal  0.91124  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5407  CDS  NC_012851  17119  17685  -  567  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  YP_002978439  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5408  CDS  NC_012851  17682  17876  -  195  hypothetical protein  YP_002978440  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5409  CDS  NC_012851  17929  18177  -  249  hypothetical protein  YP_002978441  normal  0.917762  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5410  CDS  NC_012851  18174  19427  -  1254  conjugal transfer protein TraB  YP_002978442  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5411    NC_012851  19434  19844  -  411      normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5412  CDS  NC_012851  19841  21184  -  1344  conjugation TrbI family protein  YP_002978443  normal  0.525455  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5413  CDS  NC_012851  21184  22137  -  954  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  YP_002978444  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5414  CDS  NC_012851  22134  22862  -  729  hypothetical protein  YP_002978445  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5415  CDS  NC_012851  22862  23878  -  1017  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  YP_002978446  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5416  CDS  NC_012851  23883  24215  -  333  hypothetical protein  YP_002978447  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5417  CDS  NC_012851  24251  25162  -  912  hypothetical protein  YP_002978448  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5418  CDS  NC_012851  25155  27833  -  2679  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  YP_002978449  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5419  CDS  NC_012851  27827  28183  -  357  type IV secretory pathway VirB3 family protein  YP_002978450  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5420  CDS  NC_012851  28189  28605  -  417  hypothetical protein  YP_002978451  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5421  CDS  NC_012851  28623  29654  -  1032  type II secretion system protein E  YP_002978452  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5422  CDS  NC_012851  29647  30198  -  552  Lytic transglycosylase catalytic  YP_002978453  normal  0.984316  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5423  CDS  NC_012851  30195  30548  -  354  hypothetical protein  YP_002978454  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5424  CDS  NC_012851  30569  30961  -  393  single-strand binding protein  YP_002978455  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5425  CDS  NC_012851  30998  31210  -  213  hypothetical protein  YP_002978456  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5426  CDS  NC_012851  31240  31473  -  234  hypothetical protein  YP_002978457  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5427  CDS  NC_012851  31631  32656  -  1026  SCP-like extracellular  YP_002978458  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5428  CDS  NC_012851  32777  32938  +  162  hypothetical protein  YP_002978459  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5429  CDS  NC_012851  32962  33567  -  606  hypothetical protein  YP_002978460  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5430  CDS  NC_012851  33591  34829  -  1239  putative adhesin precursor  YP_002978461  normal  0.178225  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5431  CDS  NC_012851  34841  35320  -  480  hypothetical protein  YP_002978462  normal  0.436714  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5432  CDS  NC_012851  35352  35852  -  501  putative prepilin type IV pili  YP_002978463  normal  0.278232  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5433  CDS  NC_012851  35888  36928  -  1041  type II secretion system protein  YP_002978464  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5434  CDS  NC_012851  36925  38754  -  1830  type II secretion system protein E  YP_002978465  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5435  CDS  NC_012851  38754  40013  -  1260  putative component of type II secretion apparatus  YP_002978466  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5436  CDS  NC_012851  40016  40582  -  567  type IV pilus biogenesis protein PilP  YP_002978467  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5437  CDS  NC_012851  40600  42285  -  1686  type IV secretion pathway protein  YP_002978468  normal  0.357309  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5438  CDS  NC_012851  42282  42506  -  225  putative pilus-related protein  YP_002978469  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5439  CDS  NC_012851  42911  43348  -  438  Lytic transglycosylase catalytic  YP_002978470  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5440  CDS  NC_012851  43345  43836  -  492  putative PilL-like protein  YP_002978471  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5441  CDS  NC_012851  44358  44627  -  270  hypothetical protein  YP_002978472  normal  0.773409  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5442  CDS  NC_012851  44698  45111  +  414  hypothetical protein  YP_002978473  normal  0.989966  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5443  CDS  NC_012851  45283  45654  +  372  hypothetical protein  YP_002978474  normal  0.877927  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5444  CDS  NC_012851  46079  46306  +  228  hypothetical protein  YP_002978475  normal  0.718655  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5445  CDS  NC_012851  46345  46584  -  240  hypothetical protein  YP_002978476  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5446  CDS  NC_012851  46581  46952  -  372  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  YP_002978477  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5447  CDS  NC_012851  46939  47169  -  231  putative antitoxin protein of the toxin/antitoxin system  YP_002978478  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5448  CDS  NC_012851  47606  49339  +  1734  integrase family protein  YP_002978479  normal  1  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5449  CDS  NC_012851  49643  50092  -  450  hypothetical protein  YP_002978480  normal  0.975418  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5450  CDS  NC_012851  50183  50482  -  300  hypothetical protein  YP_002978481  normal  0.32225  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5451  CDS  NC_012851  50610  50867  -  258  hypothetical protein  YP_002978482  normal  0.484703  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5452  CDS  NC_012851  50905  51333  -  429  hypothetical protein  YP_002978483  normal  0.343673  n/a    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>