287 genes were found for organism Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Rpic12D_5098  CDS  NC_012849  135  1505  -  1371  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  YP_002973576  normal  1  normal  0.0940065  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5099  CDS  NC_012849  1505  2191  -  687  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  YP_002973577  normal  1  normal  0.0773075  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5100  CDS  NC_012849  2379  4301  +  1923  copper-resistance protein, CopA family  YP_002973578  normal  1  normal  0.0626586  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5101  CDS  NC_012849  4321  5586  +  1266  copper resistance B precursor  YP_002973579  normal  1  normal  0.082477  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5102  CDS  NC_012849  5621  6007  +  387  copper resistance protein CopC  YP_002973580  normal  1  normal  0.0403069  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5103  CDS  NC_012849  6012  6941  +  930  copper resistance D domain protein  YP_002973581  normal  1  normal  0.013846  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5104  CDS  NC_012849  7026  7463  +  438  protein of unknown function DUF411  YP_002973582  normal  1  normal  0.0385442  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5105  CDS  NC_012849  7854  9119  -  1266  hypothetical protein  YP_002973583  normal  1  hitchhiker  0.00753919  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5106  CDS  NC_012849  9881  10363  -  483  blue (type 1) copper domain protein  YP_002973584  normal  1  hitchhiker  0.00549955  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5107  CDS  NC_012849  10740  11147  +  408  hypothetical protein  YP_002973585  normal  1  hitchhiker  0.00244392  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5108  CDS  NC_012849  11200  12102  -  903  transcriptional regulator, LysR family  YP_002973586  normal  1  decreased coverage  0.00133603  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5109  CDS  NC_012849  12188  13345  +  1158  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  YP_002973587  normal  1  hitchhiker  0.00360486  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5110  CDS  NC_012849  13389  14276  +  888  extracellular solute-binding protein family 3  YP_002973588  normal  1  hitchhiker  0.00738161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5111  CDS  NC_012849  14305  15042  +  738  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  YP_002973589  normal  1  normal  0.013919  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5112  CDS  NC_012849  15050  15739  +  690  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  YP_002973590  normal  1  normal  0.0266858  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5113  CDS  NC_012849  15790  16524  +  735  ABC transporter related  YP_002973591  normal  1  normal  0.0263177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5114  CDS  NC_012849  16626  17069  +  444  hypothetical protein  YP_002973592  normal  1  normal  0.0238673  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5115  CDS  NC_012849  17098  18105  +  1008  porin Gram-negative type  YP_002973593  normal  1  normal  0.0274682  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5116    NC_012849  18117  18559  +  443      normal  1  normal  0.0225402  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5117  CDS  NC_012849  18603  18989  +  387  copper resistance protein CopC  YP_002973594  normal  0.834452  normal  0.0118387  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5118  CDS  NC_012849  19043  19714  +  672  hypothetical protein  YP_002973595  normal  0.852708  normal  0.0129702  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5119    NC_012849  20020  20274  +  255      normal  0.314688  normal  0.0206186  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5120  CDS  NC_012849  20279  23509  -  3231  heavy metal efflux pump, CzcA family  YP_002973596  normal  0.682933  normal  0.0269626  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5121    NC_012849  23506  24174  -  669      normal  0.859075  normal  0.0127083  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5122    NC_012849  24348  26579  -  2232      normal  0.28474  normal  0.0365145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5123  CDS  NC_012849  26755  27297  -  543  hypothetical protein  YP_002973597  normal  1  normal  0.068099  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5124  CDS  NC_012849  27305  27631  -  327  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  YP_002973598  normal  1  normal  0.067207  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5125  CDS  NC_012849  27628  27885  -  258  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  YP_002973599  normal  1  normal  0.105676  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5126  CDS  NC_012849  28046  28639  +  594  Resolvase domain protein  YP_002973600  normal  1  normal  0.114051  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5127  CDS  NC_012849  28636  29019  +  384  hypothetical protein  YP_002973601  normal  1  normal  0.10773  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5128  CDS  NC_012849  29190  29315  -  126  hypothetical protein  YP_002973602  normal  1  normal  0.100886  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5129  CDS  NC_012849  29488  29694  +  207  hypothetical protein  YP_002973603  normal  0.881379  normal  0.102541  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5130  CDS  NC_012849  29703  29897  +  195  hypothetical protein  YP_002973604  normal  0.614667  normal  0.101689  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5131  CDS  NC_012849  29870  31123  +  1254  hypothetical protein  YP_002973605  normal  0.285021  normal  0.133381  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5132  CDS  NC_012849  31174  31443  +  270  hypothetical protein  YP_002973606  normal  0.525921  normal  0.108154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5133  CDS  NC_012849  31383  32102  -  720  zinc/iron permease  YP_002973607  normal  0.426324  normal  0.124574  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5134  CDS  NC_012849  32391  32768  +  378  hypothetical protein  YP_002973608  normal  0.64815  normal  0.122196  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5135  CDS  NC_012849  32829  34136  +  1308  outer membrane efflux protein  YP_002973609  normal  1  normal  0.0970024  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5136  CDS  NC_012849  34133  35326  +  1194  efflux transporter, RND family, MFP subunit  YP_002973610  normal  1  normal  0.465852  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5137  CDS  NC_012849  35323  38562  +  3240  heavy metal efflux pump, CzcA family  YP_002973611  normal  0.858708  normal  0.481716  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5138  CDS  NC_012849  38628  39413  +  786  hypothetical protein  YP_002973612  normal  0.187307  normal  0.615211  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5139  CDS  NC_012849  39463  39813  +  351  hypothetical protein  YP_002973613  normal  0.253102  normal  0.752621  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5140  CDS  NC_012849  39888  41207  +  1320  major facilitator superfamily MFS_1  YP_002973614  normal  0.0730511  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5141  CDS  NC_012849  41212  41757  +  546  hypothetical protein  YP_002973615  normal  0.114035  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5142  CDS  NC_012849  41754  42152  +  399  hypothetical protein  YP_002973616  normal  0.0223041  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5143  CDS  NC_012849  42309  42611  +  303  hypothetical protein  YP_002973617  normal  0.0380703  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5144    NC_012849  42630  42776  -  147      normal  0.242113  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5145  CDS  NC_012849  43681  44688  +  1008  transposase Tn3  YP_002973618  normal  0.904999  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5146  CDS  NC_012849  44805  47720  -  2916  transposase Tn3 family protein  YP_002973619  normal  0.427024  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5147    NC_012849  47835  48341  -  507      normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5148  CDS  NC_012849  48338  49645  -  1308  outer membrane efflux protein  YP_002973620  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5149  CDS  NC_012849  49813  50091  +  279  protein of unknown function DUF156  YP_002973621  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5150  CDS  NC_012849  50099  51376  +  1278  cation diffusion facilitator family transporter  YP_002973622  normal  0.634213  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5151  CDS  NC_012849  51588  51734  +  147  hypothetical protein  YP_002973623  normal  0.627608  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5152  CDS  NC_012849  51819  52811  +  993  putative cointegrate resolution protein T  YP_002973624  normal  0.14112  normal  0.670321  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5153  CDS  NC_012849  53252  53830  +  579  2'-5' RNA ligase  YP_002973625  normal  0.198908  normal  0.46298  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5154  CDS  NC_012849  53930  54823  -  894  integrase family protein  YP_002973626  normal  0.557863  normal  0.471019  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5155  CDS  NC_012849  55000  55293  -  294  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  YP_002973627  normal  0.336859  normal  0.425922  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5156  CDS  NC_012849  55594  55692  +  99  hypothetical protein  YP_002973628  normal  0.236382  normal  0.408598  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5157  CDS  NC_012849  55878  56399  +  522  hypothetical protein  YP_002973629  normal  0.47592  normal  0.450232  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5158  CDS  NC_012849  56482  56775  -  294  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  YP_002973630  normal  0.521264  normal  0.418842  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5159  CDS  NC_012849  56888  57988  -  1101  hypothetical protein  YP_002973631  normal  1  normal  0.347874  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5160  CDS  NC_012849  58083  58991  -  909  hypothetical protein  YP_002973632  normal  1  normal  0.651921  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5161  CDS  NC_012849  59222  60115  +  894  mucin-associated surface protein  YP_002973633  normal  1  normal  0.619669  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5162  CDS  NC_012849  60220  61170  +  951  hypothetical protein  YP_002973634  normal  1  normal  0.844585  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5163  CDS  NC_012849  61182  62036  +  855  hypothetical protein  YP_002973635  normal  1  normal  0.869381  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5164  CDS  NC_012849  62156  62548  +  393  histone family protein DNA-binding protein  YP_002973636  normal  1  normal  0.771962  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5165  CDS  NC_012849  62634  63395  +  762  hypothetical protein  YP_002973637  normal  0.99218  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5166  CDS  NC_012849  63410  63559  -  150  hypothetical protein  YP_002973638  normal  0.662958  normal  0.981113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5167  CDS  NC_012849  63540  64265  -  726  hypothetical protein  YP_002973639  normal  0.317464  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5168  CDS  NC_012849  64655  67054  -  2400  restriction endonuclease  YP_002973640  normal  0.741445  normal  0.440558  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5169  CDS  NC_012849  67071  67925  -  855  hypothetical protein  YP_002973641  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5170  CDS  NC_012849  67980  68165  -  186  hypothetical protein  YP_002973642  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5171  CDS  NC_012849  68162  68749  -  588  hypothetical protein  YP_002973643  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5172  CDS  NC_012849  68967  71081  +  2115  integrase family protein  YP_002973644  normal  0.301594  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5173  CDS  NC_012849  71800  72498  +  699  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_002973645  normal  0.0876458  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5174  CDS  NC_012849  72491  73567  +  1077  parB-like partition protein  YP_002973646  normal  0.161151  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5175  CDS  NC_012849  74537  75844  +  1308  replication protein  YP_002973647  normal  0.367447  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5176  CDS  NC_012849  75849  77570  -  1722  UvrD/REP helicase  YP_002973648  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5177  CDS  NC_012849  77678  78151  -  474  hypothetical protein  YP_002973649  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5178  CDS  NC_012849  78288  78590  -  303  flagellar transcriptional activator  YP_002973650  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5179  CDS  NC_012849  78739  79605  -  867  hypothetical protein  YP_002973651  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5180  CDS  NC_012849  79665  80282  -  618  hypothetical protein  YP_002973652  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5181  CDS  NC_012849  80282  80530  -  249  hypothetical protein  YP_002973653  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5182  CDS  NC_012849  80502  81008  -  507  hypothetical protein  YP_002973654  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5183  CDS  NC_012849  81016  82872  -  1857  hypothetical protein  YP_002973655  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5184  CDS  NC_012849  82869  84131  -  1263  type IV secretory pathway, putative conjugative relaxase  YP_002973656  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5185  CDS  NC_012849  84136  85206  -  1071  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  YP_002973657  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5186  CDS  NC_012849  85218  86009  -  792  type IV secretory pathway, entry exclusion protein A (putative protein precursor)  YP_002973658  normal  0.178055  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5187    NC_012849  86066  86638  -  573      normal  0.198908  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5188  CDS  NC_012849  86702  87034  +  333  transposase IS3/IS911 family protein  YP_002973659  normal  0.0746115  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5189  CDS  NC_012849  87031  87900  +  870  Integrase catalytic region  YP_002973660  normal  0.100014  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5190  CDS  NC_012849  87990  89039  -  1050  type II secretion system protein E  YP_002973661  normal  0.0937857  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5191  CDS  NC_012849  89461  90174  +  714  type IV secretory pathway, conjugal transfert protein (putative precursor)  YP_002973662  normal  0.100483  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5192  CDS  NC_012849  90171  91052  +  882  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  YP_002973663  normal  0.0164987  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5193  CDS  NC_012849  91063  92274  +  1212  conjugation TrbI family protein  YP_002973664  normal  0.261515  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5194  CDS  NC_012849  92294  93067  +  774  type IV secretory pathway, putative lytic transglycosylase; putative exported protein  YP_002973665  normal  0.851054  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5195  CDS  NC_012849  93064  94314  +  1251  conserved hypothetical protein; putative PilL-like protein; putative exported protein  YP_002973666  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5196  CDS  NC_012849  94311  94787  +  477  Lytic transglycosylase catalytic  YP_002973667  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_5197  CDS  NC_012849  94805  95329  +  525  putative pilus-related protein  YP_002973668  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>