5522 genes were found for organism Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 56    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Rpic12D_0001  CDS  NC_012856  613  2202  +  1590  chromosomal replication initiation protein  YP_002979986  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0002  CDS  NC_012856  2479  3594  +  1116  DNA polymerase III subunit beta  YP_002979987  normal  0.0290452  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0003  CDS  NC_012856  3723  6251  +  2529  DNA gyrase subunit B  YP_002979988  normal  0.267231  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0004  CDS  NC_012856  6417  7163  +  747  hypothetical protein  YP_002979989  normal  0.333332  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0005    NC_012856  7331  7546  +  216      normal  0.396454  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0006  CDS  NC_012856  7604  9472  +  1869  hypothetical protein  YP_002979990  normal  0.0880431  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0007  CDS  NC_012856  9627  10877  -  1251  transposase mutator type  YP_002979991  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0008  CDS  NC_012856  10937  12040  -  1104  hypothetical protein  YP_002979992  normal  0.642073  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0009  CDS  NC_012856  12433  12801  +  369  hypothetical protein  YP_002979993  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0010  CDS  NC_012856  13272  14231  +  960  Fimbrial protein  YP_002979994  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0011  CDS  NC_012856  14723  15487  +  765  GntR domain protein  YP_002979995  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0012  CDS  NC_012856  15515  16342  +  828  extracellular solute-binding protein family 3  YP_002979996  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0013  CDS  NC_012856  16501  17235  +  735  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  YP_002979997  normal  0.38894  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0014  CDS  NC_012856  17232  17885  +  654  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  YP_002979998  normal  0.792397  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0015  CDS  NC_012856  17872  18609  +  738  ABC transporter related  YP_002979999  normal  0.619929  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0016  CDS  NC_012856  18693  19640  +  948  protein of unknown function UPF0187  YP_002980000  normal  0.742789  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0017  CDS  NC_012856  19663  20334  -  672  hypothetical protein  YP_002980001  normal  0.784085  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0018  CDS  NC_012856  20437  21135  -  699  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  YP_002980002  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0019  CDS  NC_012856  21329  22963  +  1635  acyl-CoA synthetase  YP_002980003  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0020  CDS  NC_012856  23072  24637  -  1566  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  YP_002980004  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0021  CDS  NC_012856  24853  25398  +  546  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_002980005  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0022  CDS  NC_012856  25484  25954  -  471  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  YP_002980006  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0023  CDS  NC_012856  26093  27004  -  912  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  YP_002980007  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0024  CDS  NC_012856  27076  29280  -  2205  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  YP_002980008  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0025  CDS  NC_012856  29521  30135  +  615  Glutathione S-transferase domain protein  YP_002980009  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0026  CDS  NC_012856  30143  31291  -  1149  CBS domain containing membrane protein  YP_002980010  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0027  CDS  NC_012856  31524  33509  +  1986  autotransporter-associated beta strand repeat protein  YP_002980011  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0028  CDS  NC_012856  33530  34369  -  840  transcriptional regulator, AraC family  YP_002980012  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0029  CDS  NC_012856  34681  34974  +  294  GYD family protein  YP_002980013  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0030  CDS  NC_012856  35045  36235  -  1191  S-adenosylmethionine synthetase  YP_002980014  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0031  CDS  NC_012856  36475  37323  +  849  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  YP_002980015  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0032  CDS  NC_012856  37337  38230  +  894  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  YP_002980016  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0033  CDS  NC_012856  38320  39198  +  879  diaminopimelate epimerase  YP_002980017  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0034  CDS  NC_012856  39246  40073  +  828  protein of unknown function DUF344  YP_002980018  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0035  CDS  NC_012856  40199  40876  -  678  orotate phosphoribosyltransferase  YP_002980019  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0036  CDS  NC_012856  40910  41695  +  786  exodeoxyribonuclease III Xth  YP_002980020  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0037  CDS  NC_012856  41823  42836  +  1014  N-acetyl-gamma-glutamyl-phosphate reductase  YP_002980021  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0038  CDS  NC_012856  42908  43816  -  909  band 7 protein  YP_002980022  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0039  CDS  NC_012856  44125  44880  -  756  protein of unknown function DUF218  YP_002980023  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0040  CDS  NC_012856  45002  45607  -  606  hypothetical protein  YP_002980024  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0041  CDS  NC_012856  45633  46145  -  513  transcriptional regulator, MarR family  YP_002980025  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0042  CDS  NC_012856  46363  47271  +  909  protein of unknown function DUF6 transmembrane  YP_002980026  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0043  CDS  NC_012856  47280  48224  -  945  peptidase M48 Ste24p  YP_002980027  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0044  CDS  NC_012856  48322  49611  +  1290  muropeptide transporter  YP_002980028  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0045  CDS  NC_012856  49616  50809  -  1194  protein of unknown function DUF185  YP_002980029  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0046  CDS  NC_012856  50826  51644  +  819  short chain dehydrogenase  YP_002980030  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0047  CDS  NC_012856  51664  52062  +  399  dihydroneopterin aldolase  YP_002980031  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0048  CDS  NC_012856  52342  53271  -  930  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  YP_002980032  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0049  CDS  NC_012856  53297  54523  -  1227  ornithine aminotransferase  YP_002980033  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0050  CDS  NC_012856  54653  55576  +  924  transcriptional regulator, LysR family  YP_002980034  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0051  CDS  NC_012856  55663  56415  +  753  transcriptional regulator, TetR family  YP_002980035  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0052  CDS  NC_012856  56464  57438  +  975  secretion protein HlyD family protein  YP_002980036  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0053  CDS  NC_012856  57435  58415  +  981  ABC transporter related  YP_002980037  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0054  CDS  NC_012856  58412  59578  +  1167  ABC-2 type transporter  YP_002980038  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0055  CDS  NC_012856  59586  61325  +  1740  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  YP_002980039  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0056  CDS  NC_012856  61347  61613  -  267  PAAR repeat-containing protein  YP_002980040  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0057  CDS  NC_012856  61619  62281  -  663  hypothetical protein  YP_002980041  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0058  CDS  NC_012856  62278  63408  -  1131  hypothetical protein  YP_002980042  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0059  CDS  NC_012856  63405  63587  -  183  hypothetical protein  YP_002980043  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0060  CDS  NC_012856  63584  64723  -  1140  hypothetical protein  YP_002980044  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0061  CDS  NC_012856  64720  64902  -  183  hypothetical protein  YP_002980045  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0062  CDS  NC_012856  64899  66029  -  1131  hypothetical protein  YP_002980046  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0063  CDS  NC_012856  66026  68614  -  2589  conserved hypothetical membrane anchored protein  YP_002980047  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0064  CDS  NC_012856  68619  69515  -  897  hypothetical protein  YP_002980048  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0065  CDS  NC_012856  69524  71992  -  2469  type VI secretion system Vgr family protein  YP_002980049  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0066  CDS  NC_012856  72152  72316  +  165  outer membrane channel lipoprotein  YP_002980050  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0067  CDS  NC_012856  72598  73563  -  966  2-dehydropantoate 2-reductase  YP_002980051  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0068  CDS  NC_012856  73718  74665  +  948  C32 tRNA thiolase  YP_002980052  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0069  CDS  NC_012856  75003  76370  +  1368  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  YP_002980053  normal  1  normal  0.881986  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0070  CDS  NC_012856  76487  78325  +  1839  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  YP_002980054  normal  1  normal  0.499476  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0071    NC_012856  78451  78756  +  306      normal  1  normal  0.69027  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0072  CDS  NC_012856  78884  79156  +  273  hypothetical protein  YP_002980055  normal  1  normal  0.504797  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0073  CDS  NC_012856  79265  80185  +  921  Patatin  YP_002980056  normal  1  normal  0.568339  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0074  CDS  NC_012856  80300  81313  +  1014  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  YP_002980057  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0075  CDS  NC_012856  81315  82229  -  915  transcriptional regulator, LysR family  YP_002980058  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0076  CDS  NC_012856  82396  84186  -  1791  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  YP_002980059  normal  1  normal  0.686266  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0077  CDS  NC_012856  84239  84715  -  477  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  YP_002980060  normal  1  normal  0.556159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0078  CDS  NC_012856  84912  85382  +  471  PRC-barrel domain protein  YP_002980061  normal  1  normal  0.559393  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0079  CDS  NC_012856  85444  85632  +  189  hypothetical protein  YP_002980062  normal  0.860546  normal  0.390037  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0080  CDS  NC_012856  85700  86053  -  354  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_002980063  normal  0.767302  normal  0.415982  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0081  CDS  NC_012856  86180  87388  +  1209  putative transcriptional regulator, GntR family  YP_002980064  normal  1  normal  0.48267  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0082  CDS  NC_012856  87407  87913  +  507  transcriptional regulator, AraC family  YP_002980065  normal  1  normal  0.802043  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0083  CDS  NC_012856  87913  88329  +  417  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_002980066  normal  1  normal  0.794727  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0084  CDS  NC_012856  88326  88580  +  255  hypothetical protein  YP_002980067  normal  1  normal  0.761061  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0085  CDS  NC_012856  89056  90252  -  1197  major facilitator superfamily MFS_1  YP_002980068  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0086  CDS  NC_012856  90315  90740  -  426  Glutathione S-transferase domain protein  YP_002980069  normal  0.798103  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0087    NC_012856  90745  91575  -  831      normal  0.0819977  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0088  CDS  NC_012856  91610  92257  -  648  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  YP_002980070  normal  0.462277  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0089  CDS  NC_012856  92560  93810  -  1251  transposase mutator type  YP_002980071  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0090  CDS  NC_012856  94253  95233  -  981  protein of unknown function DUF6 transmembrane  YP_002980072  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0091  CDS  NC_012856  95340  96062  -  723  transcriptional regulator, AraC family  YP_002980073  normal  1  normal  0.994797  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0092  CDS  NC_012856  96226  96582  -  357  protein of unknown function DUF427  YP_002980074  normal  1  normal  0.941324  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0093  CDS  NC_012856  96662  97864  -  1203  Rh family protein/ammonium transporter  YP_002980075  normal  1  normal  0.850827  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0094  CDS  NC_012856  98122  99135  -  1014  hypothetical protein  YP_002980076  normal  1  normal  0.822984  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0095  CDS  NC_012856  99477  102764  +  3288  methylmalonyl-CoA mutase, large subunit  YP_002980077  normal  0.778156  normal  0.758233  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0096  CDS  NC_012856  103472  104326  +  855  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  YP_002980078  normal  1  normal  0.617524  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0097  CDS  NC_012856  104482  105339  +  858  phenazine biosynthesis protein PhzF family  YP_002980079  normal  1  normal  0.639097  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0098  CDS  NC_012856  105348  105896  -  549  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_002980080  normal  1  normal  0.590685  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0099  CDS  NC_012856  105896  106480  -  585  transcriptional regulator, XRE family  YP_002980081  normal  1  normal  0.798061  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_0100  CDS  NC_012856  106648  107550  -  903  transcriptional regulator, LysR family  YP_002980082  normal  1  normal  0.872592  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 56    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>