536 genes were found for organism Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 6    << first  < prev  1  2  3  4  5  6    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Mrad2831_5770  CDS  NC_010510  142  507  366  ArsR family transcriptional regulator  YP_001766516  normal  normal  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5771  CDS  NC_010510  614  1360  747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001766517  normal  normal  0.997672  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5772    NC_010510  1456  1893  438      normal  0.584765  normal  0.928492  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5773  CDS  NC_010510  1938  2825  888  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_001766518  normal  normal  0.986449  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5774  CDS  NC_010510  2904  3053  150  hypothetical protein  YP_001766519  normal  0.368284  normal  0.864738  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5775  CDS  NC_010510  3755  5899  2145  CheA signal transduction histidine kinase  YP_001766520  normal  normal  0.19026  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5776  CDS  NC_010510  5899  6456  558  CheW protein  YP_001766521  normal  0.727432  normal  0.120994  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5777  CDS  NC_010510  6540  8657  2118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_001766522  normal  0.807181  normal  0.137814  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5778  CDS  NC_010510  8759  9247  489  CheW protein  YP_001766523  normal  0.0235487  normal  0.138046  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5779  CDS  NC_010510  9269  9583  315  hypothetical protein  YP_001766524  normal  0.0482026  normal  0.207438  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5780  CDS  NC_010510  9634  10365  732  hypothetical protein  YP_001766525  normal  0.0435089  normal  0.224986  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5781    NC_010510  10386  10571  186      normal  0.0827943  normal  0.286019  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5782  CDS  NC_010510  11067  11780  714  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001766526  normal  0.175261  normal  0.299031  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5783  CDS  NC_010510  11872  12552  681  hypothetical protein  YP_001766527  normal  0.176235  normal  0.282421  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5784  CDS  NC_010510  13103  14062  960  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_001766528  normal  0.667939  normal  0.0304013  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5785  CDS  NC_010510  14059  15954  1896  hypothetical protein  YP_001766529  normal  normal  0.0121407  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5786  CDS  NC_010510  16543  18312  1770  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  YP_001766530  normal  normal  0.0113735  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5787    NC_010510  18347  18886  540      normal  normal  0.026658  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5788    NC_010510  19104  20721  1618      normal  0.141999  normal  0.0405647  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5789  CDS  NC_010510  21022  21228  207  hypothetical protein  YP_001766531  normal  0.0701101  normal  0.110357  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5790  CDS  NC_010510  21248  21616  369  response regulator receiver protein  YP_001766532  normal  0.0889979  normal  0.112489  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5791  CDS  NC_010510  22505  22723  219  hypothetical protein  YP_001766533  normal  0.0745256  normal  0.162287  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5792  CDS  NC_010510  22994  23191  198  hypothetical protein  YP_001766534  normal  0.248542  normal  0.157626  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5793    NC_010510  23538  23766  229      normal  0.138479  normal  0.158251  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5794  CDS  NC_010510  23930  26083  2154  signal transduction histidine kinase  YP_001766535  normal  0.63151  normal  0.343732  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5795  CDS  NC_010510  26675  28348  1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_001766536  normal  0.922446  normal  0.440426  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5796  CDS  NC_010510  28781  30019  1239  hypothetical protein  YP_001766537  normal  normal  0.199495  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5797  CDS  NC_010510  30067  31467  1401  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  YP_001766538  normal  normal  0.203932  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5798  CDS  NC_010510  32014  34281  2268  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  YP_001766539  normal  normal  0.256428  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5799  CDS  NC_010510  34420  35259  840  aldo/keto reductase  YP_001766540  normal  normal  0.384289  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5800  CDS  NC_010510  35543  38242  2700  ABC transporter related  YP_001766541  normal  0.177592  normal  0.587186  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5801  CDS  NC_010510  38337  39020  684  ThiJ/PfpI domain-containing protein  YP_001766542  normal  0.716355  normal  0.558329  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5802  CDS  NC_010510  39253  40539  1287  allantoate amidohydrolase  YP_001766543  normal  0.587062  normal  0.818494  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5803  CDS  NC_010510  40551  41870  1320  dihydroorotase  YP_001766544  normal  0.356381  normal  0.871974  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5804  CDS  NC_010510  41884  42564  681  Asp/Glu/hydantoin racemase  YP_001766545  normal  0.372709  normal  0.802095  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5805  CDS  NC_010510  42734  44200  1467  amidohydrolase  YP_001766546  normal  0.494829  normal  0.718811  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5806  CDS  NC_010510  44214  45806  1593  extracellular solute-binding protein  YP_001766547  normal  0.068843  normal  0.564208  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5807  CDS  NC_010510  45995  47161  1167  peptidase M24  YP_001766548  normal  normal  0.625105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5808  CDS  NC_010510  47188  47868  681  GntR family transcriptional regulator  YP_001766549  normal  0.432179  normal  0.582432  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5809  CDS  NC_010510  47938  48747  810  extracellular solute-binding protein  YP_001766550  normal  0.287013  normal  0.321236  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5810  CDS  NC_010510  48814  49497  684  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  YP_001766551  normal  0.709635  normal  0.465789  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5811  CDS  NC_010510  49532  50338  807  ABC transporter related  YP_001766552  normal  0.306389  normal  0.349168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5812  CDS  NC_010510  50543  50773  231  hypothetical protein  YP_001766553  normal  0.369762  normal  0.215603  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5813  CDS  NC_010510  50770  52026  1257  allantoate amidohydrolase  YP_001766554  normal  0.734094  normal  0.203308  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5814  CDS  NC_010510  52053  52826  774  LamB/YcsF family protein  YP_001766555  normal  0.492113  normal  0.0676141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5815  CDS  NC_010510  52819  53553  735  allophanate hydrolase subunit 1  YP_001766556  normal  0.100836  normal  0.0693408  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5816  CDS  NC_010510  53546  54580  1035  urea amidolyase related protein  YP_001766557  normal  0.174826  normal  0.0709434  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5817  CDS  NC_010510  54619  55032  414  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_001766558  normal  0.0574559  normal  0.0623413  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5818  CDS  NC_010510  55084  56679  1596  extracellular solute-binding protein  YP_001766559  normal  0.0665054  normal  0.029553  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5819  CDS  NC_010510  56813  58336  1524  AMP-dependent synthetase and ligase  YP_001766560  normal  0.28201  normal  0.0308443  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5820  CDS  NC_010510  58333  59145  813  hypothetical protein  YP_001766561  normal  0.330441  normal  0.0260789  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5821  CDS  NC_010510  59142  59561  420  thioesterase superfamily protein  YP_001766562  normal  0.104468  normal  0.024751  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5822  CDS  NC_010510  59626  60642  1017  alcohol dehydrogenase  YP_001766563  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5823  CDS  NC_010510  60674  61654  981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  YP_001766564  normal  0.473052  hitchhiker  0.00768111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5824  CDS  NC_010510  61716  62531  816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_001766565  normal  0.371064  hitchhiker  0.00175636  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5825  CDS  NC_010510  62522  63292  771  ABC transporter related  YP_001766566  normal  hitchhiker  0.000661116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5826  CDS  NC_010510  63289  64053  765  GntR family transcriptional regulator  YP_001766567  normal  hitchhiker  0.000644703  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5827  CDS  NC_010510  64419  64949  531  MarR family transcriptional regulator  YP_001766568  normal  hitchhiker  0.000586451  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5828  CDS  NC_010510  65071  66354  1284  dihydroorotase  YP_001766569  normal  decreased coverage  0.000105478  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5829  CDS  NC_010510  66365  67234  870  esterase  YP_001766570  normal  decreased coverage  0.0000904381  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5830  CDS  NC_010510  67231  69585  2355  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  YP_001766571  normal  hitchhiker  0.00123946  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5831  CDS  NC_010510  69582  70454  873  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  YP_001766572  normal  0.399968  hitchhiker  0.00360913  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5832  CDS  NC_010510  70451  71650  1200  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  YP_001766573  normal  0.671661  hitchhiker  0.00379539  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5833  CDS  NC_010510  71685  72833  1149  extracellular ligand-binding receptor  YP_001766574  normal  hitchhiker  0.00373072  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5834  CDS  NC_010510  72916  73788  873  inner-membrane translocator  YP_001766575  normal  hitchhiker  0.00317168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5835  CDS  NC_010510  73785  74819  1035  inner-membrane translocator  YP_001766576  normal  0.825187  hitchhiker  0.0031354  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5836  CDS  NC_010510  74816  75634  819  ABC transporter related  YP_001766577  normal  hitchhiker  0.0011865  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5837  CDS  NC_010510  75627  76331  705  ABC transporter related  YP_001766578  normal  hitchhiker  0.000984285  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5838  CDS  NC_010510  76324  76770  447  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  YP_001766579  normal  0.592792  hitchhiker  0.000871266  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5839  CDS  NC_010510  77368  77964  597  two component LuxR family transcriptional regulator  YP_001766580  normal  0.242407  hitchhiker  0.00194364  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5840  CDS  NC_010510  77961  79826  1866  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  YP_001766581  normal  0.481716  hitchhiker  0.00124548  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5841  CDS  NC_010510  79979  80422  444  transmembrane pair domain-containing protein  YP_001766582  normal  hitchhiker  0.000571539  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5842  CDS  NC_010510  80512  81420  909  LysR family transcriptional regulator  YP_001766583  normal  0.328842  hitchhiker  0.000251126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5843  CDS  NC_010510  81556  82470  915  LysR family transcriptional regulator  YP_001766584  normal  hitchhiker  0.000271378  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5844  CDS  NC_010510  82596  83759  1164  urate catabolism protein  YP_001766585  normal  hitchhiker  0.000306631  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5845  CDS  NC_010510  83936  85435  1500  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  YP_001766586  normal  hitchhiker  0.000149577  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5846  CDS  NC_010510  85601  86350  750  Asp/Glu/hydantoin racemase  YP_001766587  normal  0.963057  hitchhiker  0.000744144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5847  CDS  NC_010510  86447  87814  1368  major facilitator transporter  YP_001766588  normal  0.677532  hitchhiker  0.000346248  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5848  CDS  NC_010510  87819  88391  573  hydroxyisourate hydrolase  YP_001766589  normal  0.0613871  hitchhiker  0.00026614  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5849  CDS  NC_010510  88427  88780  354  hydroxyisourate hydrolase  YP_001766590  normal  0.0962741  hitchhiker  0.000257681  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5850  CDS  NC_010510  88786  89298  513  hypothetical protein  YP_001766591  normal  0.107994  hitchhiker  0.000262716  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5851  CDS  NC_010510  89392  90609  1218  hypothetical protein  YP_001766592  normal  0.3306  hitchhiker  0.00183506  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5852  CDS  NC_010510  90606  91040  435  hypothetical protein  YP_001766593  normal  0.515868  hitchhiker  0.00131166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5853  CDS  NC_010510  91192  91884  693  TetR family transcriptional regulator  YP_001766594  normal  hitchhiker  0.00161572  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5854  CDS  NC_010510  91983  92855  873  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  YP_001766595  normal  hitchhiker  0.00694407  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5855  CDS  NC_010510  92845  93372  528  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  YP_001766596  normal  hitchhiker  0.00619804  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5856  CDS  NC_010510  93369  95753  2385  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  YP_001766597  normal  hitchhiker  0.00622163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5857  CDS  NC_010510  95826  97061  1236  extracellular ligand-binding receptor  YP_001766598  normal  0.101493  normal  0.03083  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5858  CDS  NC_010510  97096  97995  900  inner-membrane translocator  YP_001766599  normal  normal  0.0449527  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5859  CDS  NC_010510  97992  99020  1029  inner-membrane translocator  YP_001766600  normal  normal  0.0455278  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5860  CDS  NC_010510  99014  99832  819  ABC transporter related  YP_001766601  normal  normal  0.0731407  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5861  CDS  NC_010510  99829  100581  753  ABC transporter related  YP_001766602  normal  normal  0.0731407  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5862  CDS  NC_010510  100627  101103  477  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  YP_001766603  normal  normal  0.0618522  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5863  CDS  NC_010510  101172  102323  1152  hypothetical protein  YP_001766604  normal  normal  0.0680656  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5864  CDS  NC_010510  102824  104170  1347  general substrate transporter  YP_001766605  normal  0.256271  normal  0.0753031  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5865  CDS  NC_010510  104388  104837  450  HxlR family transcriptional regulator  YP_001766606  normal  0.480533  normal  0.03101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5866  CDS  NC_010510  104940  105710  771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001766607  normal  0.117974  normal  0.033856  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5867  CDS  NC_010510  105806  106003  198  putative tautomerase protein  YP_001766608  normal  0.0453525  normal  0.0277582  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5868  CDS  NC_010510  106077  107414  1338  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  YP_001766609  normal  0.478941  normal  0.0701056  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Mrad2831_5869  CDS  NC_010510  107428  108480  1053  alkanesulfonate monooxygenase  YP_001766610  normal  0.134888  normal  0.180246  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 6    << first  < prev  1  2  3  4  5  6    next >  last >>