4956 genes were found for organism Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 50    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Mext_0001  CDS  NC_010172  44  1549  +  1506  chromosomal replication initiation protein  YP_001637501  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0002  CDS  NC_010172  1870  2991  +  1122  DNA polymerase III subunit beta  YP_001637502  normal  0.969312  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0003  CDS  NC_010172  3032  4186  +  1155  DNA replication and repair protein RecF  YP_001637503  normal  0.64703  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0004  CDS  NC_010172  4190  4594  -  405  PilT domain-containing protein  YP_001637504  normal  0.162666  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0005  CDS  NC_010172  4594  4833  -  240  transcription factor  YP_001637505  normal  0.235769  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0006  CDS  NC_010172  4936  6783  +  1848  ATP-dependent DNA helicase RecQ  YP_001637506  normal  0.354235  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0007  CDS  NC_010172  6841  7179  -  339  hypothetical protein  YP_001637507  normal  0.229138  normal  0.738899  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0008  CDS  NC_010172  7495  8181  +  687  hypothetical protein  YP_001637508  normal  0.336181  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0009  CDS  NC_010172  8303  10504  +  2202  RecD/TraA family helicase  YP_001637509  normal  0.0549724  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0010  CDS  NC_010172  10657  11832  +  1176  hypothetical protein  YP_001637510  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0011  CDS  NC_010172  12023  14248  +  2226  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  YP_001637511  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0012  CDS  NC_010172  14276  14512  +  237  BolA family protein  YP_001637512  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0013  CDS  NC_010172  14586  14921  +  336  glutaredoxin-like protein  YP_001637513  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0014  CDS  NC_010172  14994  15896  +  903  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  YP_001637514  normal  0.783797  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0015  CDS  NC_010172  16005  16889  +  885  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  YP_001637515  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0016  CDS  NC_010172  17075  17290  +  216  hypothetical protein  YP_001637516  normal  0.907801  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0017  CDS  NC_010172  17318  18154  -  837  hypothetical protein  YP_001637517  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0018  CDS  NC_010172  18512  20557  -  2046  ATPase domain-containing protein  YP_001637518  normal  0.434302  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0019  CDS  NC_010172  20557  22119  -  1563  non-specific serine/threonine protein kinase  YP_001637519  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0020  CDS  NC_010172  22475  23674  +  1200  hypothetical protein  YP_001637520  normal  0.117767  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0021  CDS  NC_010172  23704  24702  -  999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001637521  normal  0.867274  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0022  CDS  NC_010172  24825  25511  -  687  GntR domain-containing protein  YP_001637522  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0023    NC_010172  25517  25888  -  372      normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0024  CDS  NC_010172  26161  27807  +  1647  malonate decarboxylase, alpha subunit  YP_001637523  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0025  CDS  NC_010172  27815  28123  +  309  malonate decarboxylase subunit delta  YP_001637524  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0026  CDS  NC_010172  28126  29058  +  933  malonate decarboxylase subunit beta  YP_001637525  normal  0.840906  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0027  CDS  NC_010172  29045  29761  +  717  malonate decarboxylase, gamma subunit  YP_001637526  normal  0.2409  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0028  CDS  NC_010172  29754  30410  +  657  hypothetical protein  YP_001637527  normal  0.920505  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0029  CDS  NC_010172  30407  31267  +  861  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase MdcB  YP_001637528  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0030  CDS  NC_010172  31264  32187  +  924  acyl transferase domain-containing protein  YP_001637529  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0031  CDS  NC_010172  32325  34709  -  2385  general secretion pathway protein D  YP_001637530  normal  0.412275  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0032  CDS  NC_010172  34769  35206  -  438  ROSMUCR transcriptional regulator  YP_001637531  normal  0.269512  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0033  CDS  NC_010172  35503  35946  -  444  hypothetical protein  YP_001637532  normal  0.229138  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0034  CDS  NC_010172  36123  37223  +  1101  helix-turn-helix domain-containing protein  YP_001637533  normal  0.131953  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0035  CDS  NC_010172  37811  38818  +  1008  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  YP_001637534  normal  0.496651  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0036  CDS  NC_010172  38822  41194  +  2373  Kojibiose phosphorylase  YP_001637535  normal  0.0720168  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0037  CDS  NC_010172  41357  42952  +  1596  YidE/YbjL duplication  YP_001637536  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0038  CDS  NC_010172  43248  45533  -  2286  Kojibiose phosphorylase  YP_001637537  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0039  CDS  NC_010172  45526  46254  -  729  HAD family hydrolase  YP_001637538  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0040  CDS  NC_010172  46285  48720  -  2436  putative phosphoketolase  YP_001637539  normal  0.383665  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0041  CDS  NC_010172  48862  49362  -  501  hypothetical protein  YP_001637540  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0042  CDS  NC_010172  49557  49808  -  252  hypothetical protein  YP_001637541  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0043  CDS  NC_010172  50049  51131  -  1083  helix-turn-helix domain-containing protein  YP_001637542  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0044  CDS  NC_010172  51685  51957  -  273  hypothetical protein  YP_001637543  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0045  CDS  NC_010172  52134  53255  -  1122  helix-turn-helix domain-containing protein  YP_001637544  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0046  CDS  NC_010172  53426  53734  +  309  hypothetical protein  YP_001637545  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0047  CDS  NC_010172  53886  54443  +  558  hypothetical protein  YP_001637546  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0048  CDS  NC_010172  54670  55209  +  540  hypothetical protein  YP_001637547  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0049  CDS  NC_010172  55414  57084  -  1671  sulphate transporter  YP_001637548  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0050  CDS  NC_010172  57598  58023  +  426  hypothetical protein  YP_001637549  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0051  CDS  NC_010172  58205  58726  -  522  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_001637550  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0052  CDS  NC_010172  59158  60132  +  975  phosphate butyryltransferase  YP_001637551  normal  0.619315  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0053  CDS  NC_010172  60136  61344  +  1209  acetate kinase  YP_001637552  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0054  CDS  NC_010172  61361  61855  +  495  hypothetical protein  YP_001637553  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0055  CDS  NC_010172  62921  63733  -  813  transposase IS4 family protein  YP_001637554  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0056  CDS  NC_010172  63895  64893  -  999  alpha/beta hydrolase fold  YP_001637555  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0057  CDS  NC_010172  65086  65331  -  246  hypothetical protein  YP_001637556  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0058  CDS  NC_010172  65450  66517  -  1068  peptidase M42 family protein  YP_001637557  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0059  CDS  NC_010172  68678  69493  -  816  inositol monophosphatase  YP_001637558  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0060  CDS  NC_010172  69694  70113  +  420  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_001637559  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0061  CDS  NC_010172  70186  71049  +  864  alpha/beta hydrolase fold  YP_001637560  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0062  CDS  NC_010172  71265  71876  +  612  isochorismatase hydrolase  YP_001637561  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0063  CDS  NC_010172  71912  72652  +  741  hypothetical protein  YP_001637562  normal  0.462333  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0064  CDS  NC_010172  72717  73016  +  300  hypothetical protein  YP_001637563  normal  0.980549  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0065  CDS  NC_010172  74421  75104  -  684  nuclease  YP_001637564  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0066  CDS  NC_010172  76284  76625  +  342  hypothetical protein  YP_001637565  normal  0.375464  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0067  CDS  NC_010172  76972  77427  -  456  hypothetical protein  YP_001637566  normal  0.731609  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0068  CDS  NC_010172  78700  80124  -  1425  GTP-binding proten HflX  YP_001637567  normal  0.943914  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0069  CDS  NC_010172  80629  80832  -  204  hypothetical protein  YP_001637568  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0070  CDS  NC_010172  81062  81523  -  462  hypothetical protein  YP_001637569  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0071  CDS  NC_010172  82224  82778  +  555  hypothetical protein  YP_001637570  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0072  CDS  NC_010172  83173  83415  +  243  hypothetical protein  YP_001637571  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0073  CDS  NC_010172  83457  84224  -  768  cyclic nucleotide-binding  YP_001637572  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0074  CDS  NC_010172  84221  84610  -  390  response regulator receiver protein  YP_001637573  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0075  CDS  NC_010172  84876  85589  +  714  hypothetical protein  YP_001637574  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0076  CDS  NC_010172  85589  85849  +  261  hypothetical protein  YP_001637575  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0077  CDS  NC_010172  85897  86175  +  279  hypothetical protein  YP_001637576  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0078  CDS  NC_010172  86210  86464  -  255  hypothetical protein  YP_001637577  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0079  CDS  NC_010172  87032  87292  +  261  hypothetical protein  YP_001637578  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0080  CDS  NC_010172  88117  88515  -  399  hypothetical protein  YP_001637579  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0081  CDS  NC_010172  88725  89294  +  570  integrase family protein  YP_001637580  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0082  CDS  NC_010172  89423  90529  +  1107  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  YP_001637581  normal  0.526711  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0083  CDS  NC_010172  90667  91758  -  1092  lytic transglycosylase catalytic  YP_001637582  normal  0.928607  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0084  CDS  NC_010172  92148  92423  -  276  hypothetical protein  YP_001637583  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0085  CDS  NC_010172  92517  93680  -  1164  hypothetical protein  YP_001637584  normal  0.56108  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0086  CDS  NC_010172  93748  93933  +  186  hypothetical protein  YP_001637585  normal  0.430383  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0087  CDS  NC_010172  94010  94405  +  396  hypothetical protein  YP_001637586  normal  0.554674  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0088  CDS  NC_010172  94529  95107  +  579  hypothetical protein  YP_001637587  normal  0.485772  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0089  CDS  NC_010172  95151  95393  +  243  transcriptional regulator protein-like protein  YP_001637588  normal  0.483254  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0090  CDS  NC_010172  95390  95767  +  378  transcriptional regulator protein-like protein  YP_001637589  normal  0.21436  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0091  CDS  NC_010172  95764  96468  -  705  dienelactone hydrolase  YP_001637590  normal  0.334688  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0092  CDS  NC_010172  96638  97042  -  405  hypothetical protein  YP_001637591  normal  0.215485  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0093  CDS  NC_010172  97029  97979  -  951  hypothetical protein  YP_001637592  normal  0.152001  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0094  CDS  NC_010172  98364  99014  -  651  putative cytochrome c oxidase subunit III protein  YP_001637593  normal  0.512296  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0095  CDS  NC_010172  99011  100927  -  1917  cytochrome c oxidase, subunit I  YP_001637594  normal  0.160377  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0096  CDS  NC_010172  100924  101928  -  1005  cytochrome c oxidase, subunit II  YP_001637595  normal  0.296292  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0097  CDS  NC_010172  101936  102499  -  564  cytochrome c class I  YP_001637596  normal  0.340864  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0098  CDS  NC_010172  102496  103332  -  837  extracellular solute-binding protein  YP_001637597  normal  0.155933  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0099  CDS  NC_010172  103313  105130  -  1818  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  YP_001637598  normal  0.850532  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Mext_0100  CDS  NC_010172  105565  105888  +  324  hypothetical protein  YP_001637599  normal  1  normal  1  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 50    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>