2802 genes were found for organism Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 29    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Hlac_0001  CDS  NC_012029  780  2453  +  1674  orc1/cdc6 family replication initiation protein  YP_002564677  normal  1  normal  0.810382  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0002  CDS  NC_012029  2519  3616  -  1098  Signal peptidase I-like protein  YP_002564678  normal  1  normal  0.756287  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0003  CDS  NC_012029  3728  5494  +  1767  DNA polymerase II small subunit  YP_002564679  normal  1  normal  0.626198  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0004  CDS  NC_012029  5540  6172  -  633  protein of unknown function UPF0029  YP_002564680  normal  1  normal  0.528127  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0005  CDS  NC_012029  6169  6693  -  525  hypothetical protein  YP_002564681  normal  1  normal  0.664383  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0006  CDS  NC_012029  6698  7303  -  606  hypothetical protein  YP_002564682  normal  1  normal  0.901562  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0007  CDS  NC_012029  7402  8322  -  921  beta-lactamase domain protein  YP_002564683  normal  1  normal  0.963887  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0008  CDS  NC_012029  8436  9371  +  936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_002564684  normal  1  normal  0.97826  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0009  CDS  NC_012029  9368  10036  +  669  hypothetical protein  YP_002564685  normal  1  normal  0.91294  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0010  CDS  NC_012029  10106  10279  -  174  hypothetical protein  YP_002564686  normal  1  normal  1  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0011  CDS  NC_012029  10391  11437  +  1047  hypothetical protein  YP_002564687  normal  1  normal  1  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0012  CDS  NC_012029  11560  11844  -  285  hypothetical protein  YP_002564688  normal  1  normal  1  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0013  CDS  NC_012029  11986  12795  +  810  PHP domain protein  YP_002564689  normal  1  normal  1  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0014  CDS  NC_012029  12865  13029  +  165  hypothetical protein  YP_002564690  normal  1  normal  0.893728  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0015  CDS  NC_012029  13164  14144  +  981  delta-aminolevulinic acid dehydratase  YP_002564691  normal  1  normal  0.767271  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0016  CDS  NC_012029  14486  14728  -  243  hypothetical protein  YP_002564692  normal  1  normal  0.510016  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0017  CDS  NC_012029  15109  15363  +  255  hypothetical protein  YP_002564693  normal  1  normal  0.212589  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0018  CDS  NC_012029  15448  18126  +  2679  valyl-tRNA synthetase  YP_002564694  normal  0.910453  normal  0.161561  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0019  CDS  NC_012029  18147  19229  -  1083  dihydroorotate dehydrogenase 2  YP_002564695  normal  0.146471  normal  0.113107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0020  CDS  NC_012029  19335  19538  -  204  hypothetical protein  YP_002564696  normal  0.0613603  normal  0.0927264  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0021  CDS  NC_012029  19833  20162  +  330  Non-histone chromosomal MC1 family protein  YP_002564697  normal  0.0467199  normal  0.0969177  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0022  CDS  NC_012029  20374  20517  -  144  hypothetical protein  YP_002564698  normal  0.0286264  normal  0.0937878  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0023  CDS  NC_012029  26033  26836  -  804  regulatory protein Crp  YP_002564699  normal  0.780112  normal  0.0232711  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0024  CDS  NC_012029  27137  27994  +  858  hypothetical protein  YP_002564700  normal  1  normal  0.0384083  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0025  CDS  NC_012029  28130  28339  +  210  hypothetical protein  YP_002564701  normal  1  normal  0.0529678  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0026  CDS  NC_012029  28383  28529  -  147  hypothetical protein  YP_002564702  normal  1  normal  0.0500855  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0027  CDS  NC_012029  28706  29320  +  615  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_002564703  normal  1  normal  0.0562097  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0028  CDS  NC_012029  29317  30066  +  750  phospholipase/Carboxylesterase  YP_002564704  normal  1  normal  0.0609492  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0029  CDS  NC_012029  30107  32185  -  2079  SpoVR family protein  YP_002564705  normal  1  normal  0.0800461  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0030  CDS  NC_012029  32182  33564  -  1383  hypothetical protein  YP_002564706  normal  1  normal  0.0419378  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0031  CDS  NC_012029  33555  35996  -  2442  putative serine protein kinase, PrkA  YP_002564707  normal  0.168109  normal  0.0188605  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0032  CDS  NC_012029  35998  38073  -  2076  putative serine protein kinase, PrkA  YP_002564708  normal  1  normal  0.0177084  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0033  CDS  NC_012029  38462  39142  +  681  protein of unknown function DUF1028  YP_002564709  normal  1  normal  0.0234991  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0034  CDS  NC_012029  39163  40005  -  843  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  YP_002564710  normal  1  normal  0.0129877  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0035  CDS  NC_012029  40168  40650  -  483  putative RNA-binding protein  YP_002564711  normal  1  normal  0.0118889  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0036  CDS  NC_012029  40700  40819  +  120  hypothetical protein  YP_002564712  normal  1  normal  0.020346  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0037  CDS  NC_012029  40843  41445  +  603  ferredoxin  YP_002564713  normal  0.92312  normal  0.0229363  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0038  CDS  NC_012029  41554  41880  +  327  hypothetical protein  YP_002564714  normal  0.580143  normal  0.0215031  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0039  CDS  NC_012029  42002  42328  +  327  NifU domain-containing protein  YP_002564715  normal  0.781326  normal  0.020346  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0040  CDS  NC_012029  42396  43853  -  1458  protein of unknown function DUF402  YP_002564716  normal  0.708501  normal  0.0289003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0041  CDS  NC_012029  43850  44272  -  423  hypothetical protein  YP_002564717  normal  1  normal  0.0222123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0042  CDS  NC_012029  44396  45406  +  1011  hypothetical protein  YP_002564718  normal  1  normal  0.0273863  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0043  CDS  NC_012029  45462  46442  -  981  ROK family protein  YP_002564719  normal  1  normal  0.0272588  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0044  CDS  NC_012029  46564  47019  -  456  UspA domain protein  YP_002564720  normal  0.34339  normal  0.0217028  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0045  CDS  NC_012029  47168  47536  -  369  hypothetical protein  YP_002564721  normal  0.589671  normal  0.0208205  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0046  CDS  NC_012029  47675  48769  -  1095  hypothetical protein  YP_002564722  normal  0.56451  normal  0.0146014  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0047  CDS  NC_012029  48991  49305  +  315  ferredoxin  YP_002564723  normal  0.208509  hitchhiker  0.00273393  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0048  CDS  NC_012029  49494  49688  -  195  cold-shock DNA-binding domain protein  YP_002564724  normal  0.152198  hitchhiker  0.00109076  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0049  CDS  NC_012029  49902  50417  +  516  hypothetical protein  YP_002564725  normal  0.172931  hitchhiker  0.00049209  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0050  CDS  NC_012029  50487  50792  +  306  hypothetical protein  YP_002564726  normal  0.0691707  hitchhiker  0.00047379  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0051  CDS  NC_012029  50898  51791  +  894  hypothetical protein  YP_002564727  normal  0.134629  hitchhiker  0.000640863  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0052  CDS  NC_012029  51841  52593  -  753  inositol monophosphatase  YP_002564728  normal  1  hitchhiker  0.000665533  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0053  CDS  NC_012029  52649  53089  -  441  hypothetical protein  YP_002564729  normal  1  hitchhiker  0.00139933  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0054  CDS  NC_012029  53180  54352  +  1173  transposase IS4 family protein  YP_002564730  normal  1  hitchhiker  0.00175854  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0055  CDS  NC_012029  55031  55651  -  621  Late embryogenesis abundant protein  YP_002564731  normal  1  hitchhiker  0.000530901  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0056  CDS  NC_012029  56851  58905  -  2055  DEAD/DEAH box helicase domain protein  YP_002564732  normal  1  decreased coverage  0.000344856  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0057  CDS  NC_012029  59022  59552  -  531  50S ribosomal protein L10e  YP_002564733  normal  0.737976  decreased coverage  0.000179775  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0058  CDS  NC_012029  59697  60437  -  741  hypothetical protein  YP_002564734  normal  1  hitchhiker  0.000572818  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0059  CDS  NC_012029  60774  62063  -  1290  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  YP_002564735  normal  1  hitchhiker  0.00179042  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0060  CDS  NC_012029  62166  63548  -  1383  hypothetical protein  YP_002564736  normal  1  hitchhiker  0.00451014  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0061  CDS  NC_012029  64231  65565  -  1335  amidohydrolase  YP_002564737  normal  1  normal  0.0182363  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0062  CDS  NC_012029  65682  66035  +  354  Protein of unknown function DUF372  YP_002564738  normal  1  normal  0.0126732  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0063  CDS  NC_012029  66270  66815  -  546  hypothetical protein  YP_002564739  normal  1  normal  0.0135127  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0064  CDS  NC_012029  66856  67254  -  399  hypothetical protein  YP_002564740  normal  1  normal  0.0231612  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0065  CDS  NC_012029  67238  68572  -  1335  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  YP_002564741  normal  1  normal  0.0310035  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0066  CDS  NC_012029  68569  69657  -  1089  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  YP_002564742  normal  0.869927  normal  0.262294  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0067  CDS  NC_012029  69657  71090  -  1434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002564743  normal  0.654716  normal  0.634393  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0068  CDS  NC_012029  71209  72297  -  1089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002564744  normal  1  normal  0.603916  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0069  CDS  NC_012029  72570  74471  -  1902  extracellular solute-binding protein family 5  YP_002564745  normal  1  normal  0.884442  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0070  CDS  NC_012029  74640  76262  -  1623  protein synthesis factor GTP-binding  YP_002564746  normal  1  normal  1  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0071  CDS  NC_012029  76604  77593  +  990  Bile acid:sodium symporter  YP_002564747  normal  1  normal  1  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0072  CDS  NC_012029  77693  78685  -  993  Transcription factor TFIIB cyclin-related  YP_002564748  normal  1  normal  0.96574  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0073  CDS  NC_012029  78849  79385  +  537  hypothetical protein  YP_002564749  normal  1  normal  1  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0074  CDS  NC_012029  79414  80205  -  792  cell division inhibitor  YP_002564750  normal  1  normal  1  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0075  CDS  NC_012029  80264  80695  -  432  histidine triad (HIT) protein  YP_002564751  normal  1  normal  1  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0076  CDS  NC_012029  80775  81707  -  933  ribonuclease Z  YP_002564752  normal  0.887393  normal  1  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0077  CDS  NC_012029  81745  82095  +  351  hypothetical protein  YP_002564753  normal  0.502829  normal  1  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0078  CDS  NC_012029  82260  84206  +  1947  ABC transporter related  YP_002564754  normal  0.213516  normal  1  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0079  CDS  NC_012029  84225  84566  -  342  hypothetical protein  YP_002564755  normal  0.562933  normal  1  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0080  CDS  NC_012029  84685  85434  +  750  Creatininase  YP_002564756  normal  1  normal  1  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0081  CDS  NC_012029  85461  85904  -  444  hypothetical protein  YP_002564757  normal  1  normal  1  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0082  CDS  NC_012029  86332  87138  -  807  aldo/keto reductase  YP_002564758  normal  1  normal  1  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0083  CDS  NC_012029  87308  87862  +  555  DoxX family protein  YP_002564759  normal  1  normal  1  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0084  CDS  NC_012029  87996  89711  +  1716  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_002564760  normal  1  normal  1  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0085  CDS  NC_012029  89713  90477  +  765  rhodopsin  YP_002564761  normal  1  normal  1  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0086  CDS  NC_012029  90498  91613  -  1116  putative transcriptional regulator, AsnC family  YP_002564762  normal  1  normal  1  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0087  CDS  NC_012029  91738  91896  -  159  hypothetical protein  YP_002564763  normal  1  normal  1  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0088  CDS  NC_012029  92216  93322  +  1107  glycosyl transferase family 3  YP_002564764  normal  0.826373  normal  1  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0089  CDS  NC_012029  93525  93674  +  150  hypothetical protein  YP_002564765  normal  0.624913  normal  1  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0090  CDS  NC_012029  93736  94569  -  834  NAD synthetase  YP_002564766  normal  0.670089  normal  1  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0091  CDS  NC_012029  94665  95090  -  426  hypothetical protein  YP_002564767  normal  0.510964  normal  1  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0092  CDS  NC_012029  95146  95736  -  591  NUDIX hydrolase  YP_002564768  normal  0.932953  normal  1  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0093  CDS  NC_012029  95733  96116  -  384  hypothetical protein  YP_002564769  normal  1  normal  1  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0094  CDS  NC_012029  96254  97210  +  957  hypothetical protein  YP_002564770  normal  1  normal  1  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0095  CDS  NC_012029  97267  97674  +  408  putative signal transduction protein with CBS domains  YP_002564771  normal  1  normal  1  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0096  CDS  NC_012029  97884  99260  +  1377  hypothetical protein  YP_002564772  normal  1  normal  1  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0097  CDS  NC_012029  99610  100083  -  474  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase  YP_002564773  normal  1  normal  1  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0098  CDS  NC_012029  100350  102335  +  1986  aconitate hydratase  YP_002564774  normal  1  normal  1  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0099  CDS  NC_012029  102386  103678  -  1293  sodium:dicarboxylate symporter  YP_002564775  normal  1  normal  1  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Hlac_0100  CDS  NC_012029  103848  104501  -  654  30S ribosomal protein S7P  YP_002564776  normal  0.252795  normal  1  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea 
 
 
-
 
Page 1 of 29    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>