64 genes were found for organism Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Sbal223_4417  CDS  NC_011668  436  1416  +  981  domain of unknown function DUF1738  YP_002364241  hitchhiker  0.0000000308922  normal  0.463356  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4418    NC_011668  1482  2835  +  1354      decreased coverage  0.0000000152454  normal  0.385259  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4419  CDS  NC_011668  1589  2536  -  948  Integrase catalytic region  YP_002364242  decreased coverage  0.000000000630887  normal  0.64784  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4420  CDS  NC_011668  3410  3778  +  369  hypothetical protein  YP_002364243  normal  1  normal  0.511  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4421  CDS  NC_011668  3829  9789  -  5961  conjugative transfer relaxase protein TraI  YP_002364244  normal  1  normal  0.478197  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4422  CDS  NC_011668  9901  10152  +  252  hypothetical protein  YP_002364245  normal  1  normal  0.562637  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4423  CDS  NC_011668  10251  10430  -  180  hypothetical protein  YP_002364246  normal  1  normal  0.46622  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4424  CDS  NC_011668  10427  10705  -  279  hypothetical protein  YP_002364247  normal  0.910643  normal  0.396835  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4425  CDS  NC_011668  10733  12856  -  2124  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  YP_002364248  normal  1  normal  0.664949  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4426  CDS  NC_011668  12859  13392  -  534  hypothetical protein  YP_002364249  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4427  CDS  NC_011668  13430  16243  -  2814  TraG domain protein  YP_002364250  normal  0.364582  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4428  CDS  NC_011668  16246  17634  -  1389  TraH family protein  YP_002364251  normal  0.679998  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4429  CDS  NC_011668  17631  17819  -  189  hypothetical protein  YP_002364252  normal  0.232564  normal  0.901853  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4430  CDS  NC_011668  17830  18273  -  444  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  YP_002364253  normal  0.462395  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4431  CDS  NC_011668  18270  19004  -  735  hypothetical protein  YP_002364254  normal  0.829961  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4432  CDS  NC_011668  19040  19915  -  876  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  YP_002364255  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4433  CDS  NC_011668  19912  21729  -  1818  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  YP_002364256  normal  0.345027  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4434  CDS  NC_011668  21726  22466  -  741  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  YP_002364257  normal  0.341224  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4435  CDS  NC_011668  22489  23502  -  1014  TraU family protein  YP_002364258  normal  0.235263  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4436  CDS  NC_011668  23489  24193  -  705  type-F conjugative transfer system protein TraW  YP_002364259  normal  0.526647  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4437  CDS  NC_011668  24190  24561  -  372  conjugal transfer protein TrbI  YP_002364260  normal  0.391432  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4438  CDS  NC_011668  24563  27151  -  2589  type-IV secretion system protein TraC  YP_002364261  normal  0.314552  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4439  CDS  NC_011668  27155  27613  -  459  type IV conjugative transfer system protein TraV  YP_002364262  normal  0.802446  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4440  CDS  NC_011668  27631  29157  -  1527  TraB pilus assembly family protein  YP_002364263  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4441  CDS  NC_011668  29154  29969  -  816  type-F conjugative transfer system secretin TraK  YP_002364264  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4442  CDS  NC_011668  29969  30535  -  567  type IV conjugative transfer system protein TraE  YP_002364265  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4443  CDS  NC_011668  30576  30878  -  303  type IV conjugative transfer system protein TraL  YP_002364266  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4444  CDS  NC_011668  30882  31253  -  372  hypothetical protein  YP_002364267  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4445  CDS  NC_011668  31308  31586  -  279  hypothetical protein  YP_002364268  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4446  CDS  NC_011668  31623  32252  +  630  putative phage repressor  YP_002364269  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4447  CDS  NC_011668  32698  33432  +  735  hypothetical protein  YP_002364270  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4448  CDS  NC_011668  34178  34333  +  156  Hok/gef cell toxic protein  YP_002364271  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4449  CDS  NC_011668  35053  35706  +  654  Methyltransferase type 12  YP_002364272  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4450    NC_011668  35746  35844  +  99      normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4451    NC_011668  36173  36841  -  669      normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4452  CDS  NC_011668  37223  37468  -  246  hypothetical protein  YP_002364273  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4453  CDS  NC_011668  37470  38612  -  1143  hypothetical protein  YP_002364274  normal  0.868828  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4454  CDS  NC_011668  38622  39842  -  1221  restriction modification system DNA specificity domain protein  YP_002364275  normal  0.859615  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4455  CDS  NC_011668  39845  41323  -  1479  N-6 DNA methylase  YP_002364276  normal  0.435107  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4456  CDS  NC_011668  41327  43177  -  1851  hypothetical protein  YP_002364277  normal  0.756747  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4457  CDS  NC_011668  43179  45494  -  2316  EcoEI R domain protein  YP_002364278  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4458  CDS  NC_011668  45516  45731  -  216  putative transcriptional regulator, XRE family  YP_002364279  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4459  CDS  NC_011668  46135  46311  +  177  phage transcriptional regulator, AlpA  YP_002364280  normal  0.744245  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4460  CDS  NC_011668  46425  47054  -  630  Resolvase domain protein  YP_002364281  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4461  CDS  NC_011668  47297  47566  +  270  hypothetical protein  YP_002364282  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4462  CDS  NC_011668  47662  47814  -  153  hypothetical protein  YP_002364283  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4463  CDS  NC_011668  47887  48222  -  336  hypothetical protein  YP_002364284  normal  0.993854  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4464  CDS  NC_011668  48330  49004  -  675  chromosome partitioning ATPase  YP_002364285  normal  1  normal  0.763597  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4465  CDS  NC_011668  49050  49211  +  162  hypothetical protein  YP_002364286  normal  1  normal  0.859655  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4466  CDS  NC_011668  49441  50061  +  621  hypothetical protein  YP_002364287  normal  1  normal  0.751756  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4467  CDS  NC_011668  50154  50426  +  273  hypothetical protein  YP_002364288  normal  1  normal  0.660566  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4468  CDS  NC_011668  50806  51048  +  243  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  YP_002364289  normal  0.791173  normal  0.577271  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4469  CDS  NC_011668  51038  51322  +  285  addiction module toxin, RelE/StbE family  YP_002364290  normal  0.505994  normal  0.573834  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4470  CDS  NC_011668  51610  54864  -  3255  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  YP_002364291  normal  0.566129  normal  0.610404  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4471  CDS  NC_011668  54861  56009  -  1149  hypothetical protein  YP_002364292  normal  1  normal  0.623888  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4472  CDS  NC_011668  56027  57313  -  1287  restriction modification system DNA specificity domain protein  YP_002364293  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4473  CDS  NC_011668  57303  59006  -  1704  N-6 DNA methylase  YP_002364294  normal  1  normal  0.844286  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4474  CDS  NC_011668  59117  59713  +  597  integrase family protein  YP_002364295  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4475  CDS  NC_011668  60203  61051  +  849  protein of unknown function DUF1526  YP_002364296  normal  0.681857  normal  0.769643  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4476  CDS  NC_011668  61456  61854  -  399  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  YP_002364297  hitchhiker  0.00112117  normal  0.570223  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4477  CDS  NC_011668  62349  64223  +  1875  ParB domain protein nuclease  YP_002364298  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4478  CDS  NC_011668  64365  64610  +  246  HicA protein  YP_002364299  hitchhiker  0.00000136781  normal  0.357695  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4479  CDS  NC_011668  64607  64945  +  339  HicB family protein  YP_002364300  hitchhiker  0.00000336163  normal  0.448324  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4480  CDS  NC_011668  64964  65308  +  345  hypothetical protein  YP_002364301  hitchhiker  0.00000201237  normal  0.370117  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>