51 genes were found for organism Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Sbal223_4481  CDS  NC_011665  1094  1477  -  384  hypothetical protein  YP_002360297  normal  1  normal  0.94121  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4482  CDS  NC_011665  1556  2095  +  540  hypothetical protein  YP_002360298  normal  1  normal  0.761751  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4483  CDS  NC_011665  2738  4240  +  1503  integrase, catalytic region  YP_002360299  normal  1  normal  0.658405  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4484  CDS  NC_011665  4230  4976  +  747  IstB domain protein ATP-binding protein  YP_002360300  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4485  CDS  NC_011665  5479  5766  +  288  hypothetical protein  YP_002360301  normal  1  normal  0.936914  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4486  CDS  NC_011665  6360  6929  +  570  chromosome partitioning ATPase  YP_002360302  normal  0.905908  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4487  CDS  NC_011665  6926  7300  +  375  hypothetical protein  YP_002360303  normal  0.744767  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4488  CDS  NC_011665  8519  11176  -  2658  hypothetical protein  YP_002360304  decreased coverage  0.0000000018455  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4489  CDS  NC_011665  11458  12018  +  561  Resolvase domain protein  YP_002360305  hitchhiker  0.000146883  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4490  CDS  NC_011665  12022  15054  +  3033  transposase Tn3 family protein  YP_002360306  normal  0.666147  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4491  CDS  NC_011665  14890  15264  -  375  hypothetical protein  YP_002360307  normal  0.714337  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4492  CDS  NC_011665  15599  15805  -  207  Hok/gef cell toxic protein  YP_002360308  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4493  CDS  NC_011665  16500  17234  -  735  hypothetical protein  YP_002360309  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4494  CDS  NC_011665  17658  18353  -  696  putative phage repressor  YP_002360310  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4495  CDS  NC_011665  18469  18645  +  177  hypothetical protein  YP_002360311  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4496  CDS  NC_011665  18700  19086  +  387  hypothetical protein  YP_002360312  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4497  CDS  NC_011665  19090  19392  +  303  type IV conjugative transfer system protein TraL  YP_002360313  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4498  CDS  NC_011665  19433  19999  +  567  type IV conjugative transfer system protein TraE  YP_002360314  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4499  CDS  NC_011665  19999  20814  +  816  type-F conjugative transfer system secretin TraK  YP_002360315  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4500  CDS  NC_011665  20811  22340  +  1530  TraB pilus assembly family protein  YP_002360316  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4501  CDS  NC_011665  22361  22816  +  456  type IV conjugative transfer system protein TraV  YP_002360317  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4502  CDS  NC_011665  22820  25408  +  2589  type-IV secretion system protein TraC  YP_002360318  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4503  CDS  NC_011665  25410  25781  +  372  conjugal transfer protein TrbI  YP_002360319  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4504  CDS  NC_011665  25778  26479  +  702  type-F conjugative transfer system protein TraW  YP_002360320  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4505  CDS  NC_011665  26466  27473  +  1008  TraU family protein  YP_002360321  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4506  CDS  NC_011665  27496  28233  +  738  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TrbC  YP_002360322  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4507  CDS  NC_011665  28230  30044  +  1815  conjugal transfer mating pair stabilization protein TraN  YP_002360323  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4508  CDS  NC_011665  30041  30916  +  876  type-F conjugative transfer system pilin assembly protein TraF  YP_002360324  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4509  CDS  NC_011665  30952  31689  +  738  hypothetical protein  YP_002360325  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4510  CDS  NC_011665  31686  32129  +  444  type-F conjugative transfer system pilin assembly thiol-disulfide isomerase TrbB  YP_002360326  normal  0.993291  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4511  CDS  NC_011665  32141  32305  +  165  hypothetical protein  YP_002360327  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4512  CDS  NC_011665  32302  33690  +  1389  TraH family protein  YP_002360328  normal  0.732355  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4513  CDS  NC_011665  33693  36521  +  2829  TraG domain protein  YP_002360329  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4514  CDS  NC_011665  36559  37092  +  534  hypothetical protein  YP_002360330  normal  0.0784088  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4515  CDS  NC_011665  37095  39221  +  2127  type IV conjugative transfer system coupling protein TraD  YP_002360331  normal  0.115139  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4516  CDS  NC_011665  39235  39414  +  180  hypothetical protein  YP_002360332  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4517  CDS  NC_011665  39473  45433  +  5961  conjugative transfer relaxase protein TraI  YP_002360333  normal  1  normal  1  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4518  CDS  NC_011665  45496  45738  -  243  hypothetical protein  YP_002360334  normal  1  normal  0.92714  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4519  CDS  NC_011665  45792  46145  -  354  hypothetical protein  YP_002360335  normal  1  normal  0.941788  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4520  CDS  NC_011665  46728  47003  -  276  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  YP_002360336  hitchhiker  0.0000000000000483431  normal  0.192194  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4521  CDS  NC_011665  47069  48049  -  981  domain of unknown function DUF1738  YP_002360337  decreased coverage  0.00000000000111703  normal  0.206085  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4522  CDS  NC_011665  48012  48356  -  345  hypothetical protein  YP_002360338  hitchhiker  0.000000000803875  normal  0.196204  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4523  CDS  NC_011665  48431  48601  -  171  hypothetical protein  YP_002360339  hitchhiker  0.00000000817271  normal  0.187838  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4524  CDS  NC_011665  48613  48957  -  345  hypothetical protein  YP_002360340  hitchhiker  0.0000000804428  normal  0.306161  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4525  CDS  NC_011665  49085  50959  -  1875  ParB domain protein nuclease  YP_002360341  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4526  CDS  NC_011665  51620  52021  -  402  hypothetical protein  YP_002360342  normal  0.0205454  normal  0.727263  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4527  CDS  NC_011665  52023  52646  -  624  hypothetical protein  YP_002360343  normal  0.0278757  normal  0.802011  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4528  CDS  NC_011665  53317  54645  -  1329  hypothetical protein  YP_002360344  normal  0.103833  normal  0.57888  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4529  CDS  NC_011665  55743  57245  +  1503  hypothetical protein  YP_002360345  normal  0.40856  normal  0.764722  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4530  CDS  NC_011665  57742  58716  +  975  hypothetical protein  YP_002360346  normal  0.21756  normal  0.729646  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Sbal223_4531  CDS  NC_011665  58691  58861  +  171  hypothetical protein  YP_002360347  normal  1  normal  0.763066  Shewanella baltica OS223  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>