2368 genes were found for organism Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 24    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Xfasm12_0001  CDS  NC_010513  20  1351  +  1332  chromosomal replication initiation protein  YP_001774685  normal  0.0296464  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0002  CDS  NC_010513  1637  2737  +  1101  DNA polymerase III subunit beta  YP_001774686  hitchhiker  0.0011847  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0003  CDS  NC_010513  3041  4135  +  1095  recombination protein F  YP_001774687  normal  0.0185053  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0004    NC_010513  4439  4648  +  210      normal  0.656881  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0005  CDS  NC_010513  4648  7092  +  2445  DNA gyrase subunit B  YP_001774688  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0006  CDS  NC_010513  7296  7967  +  672  hypothetical protein  YP_001774689  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0007  CDS  NC_010513  8032  8847  +  816  hypothetical protein  YP_001774690  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0008  CDS  NC_010513  8950  10143  +  1194  hypothetical protein  YP_001774691  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0009  CDS  NC_010513  10589  11254  +  666  TonB protein  YP_001774692  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0010  CDS  NC_010513  11350  12114  +  765  biopolymer transport ExbB protein  YP_001774693  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0011  CDS  NC_010513  12171  12590  +  420  biopolymer transport ExbD1 protein  YP_001774694  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0012  CDS  NC_010513  12597  13007  +  411  biopolymer transport ExbD2 protein  YP_001774695  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0013    NC_010513  13098  13241  +  144      normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0014  CDS  NC_010513  13400  13516  -  117  hypothetical protein  YP_001774696  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0015  CDS  NC_010513  13727  16114  +  2388  dipeptidyl-peptidase  YP_001774697  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0016  CDS  NC_010513  16169  16711  +  543  hypothetical protein  YP_001774698  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0017  CDS  NC_010513  16940  17857  +  918  coproporphyrinogen III oxidase  YP_001774699  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0018    NC_010513  18925  19077  -  153      normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0019    NC_010513  19292  19621  +  330      normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0020    NC_010513  20634  20924  +  291      normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0021  CDS  NC_010513  21409  22572  -  1164  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  YP_001774700  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0022    NC_010513  22575  22712  -  138      normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0023  CDS  NC_010513  23734  24237  +  504  pre-pilin like leader sequence  YP_001774701  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0024  CDS  NC_010513  24247  24726  +  480  pre-pilin leader sequence  YP_001774702  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0025  CDS  NC_010513  24723  25673  +  951  type IV pilus assembly protein PilW  YP_001774703  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0026  CDS  NC_010513  25670  26257  +  588  PilX protein  YP_001774704  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0027  CDS  NC_010513  26281  29928  +  3648  PilY1-like protein  YP_001774705  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0028  CDS  NC_010513  29928  30350  +  423  PilE protein  YP_001774706  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0029  CDS  NC_010513  30789  31523  -  735  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  YP_001774707  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0030  CDS  NC_010513  32648  33850  +  1203  aromatic amino acid aminotransferase  YP_001774708  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0031  CDS  NC_010513  33879  34064  +  186  hypothetical protein  YP_001774709  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0032  CDS  NC_010513  34385  34540  -  156  hypothetical protein  YP_001774710  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0033  CDS  NC_010513  34733  35137  -  405  large-conductance mechanosensitive channel  YP_001774711  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0034  CDS  NC_010513  35457  35678  -  222  hypothetical protein  YP_001774712  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0035  CDS  NC_010513  35820  36080  +  261  hypothetical protein  YP_001774713  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0036  CDS  NC_010513  36102  37361  +  1260  hypothetical protein  YP_001774714  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0037  CDS  NC_010513  37545  38426  +  882  transformation competence-related protein  YP_001774715  normal  0.932971  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0038  CDS  NC_010513  39023  39562  +  540  hypothetical protein  YP_001774716  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0039  CDS  NC_010513  39630  43211  +  3582  transcription-repair coupling factor  YP_001774717  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0040  CDS  NC_010513  43545  44279  +  735  3-dehydroquinate dehydratase  YP_001774718  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0041  CDS  NC_010513  44343  44828  +  486  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit  YP_001774719  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0042  CDS  NC_010513  44886  46253  +  1368  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  YP_001774720  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0043  CDS  NC_010513  46435  48606  -  2172  DNA-dependent helicase II  YP_001774721  normal  0.779926  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0044  CDS  NC_010513  49832  51025  +  1194  nitric oxide dioxygenase  YP_001774722  normal  0.534216  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0045  CDS  NC_010513  52753  53064  +  312  hypothetical protein  YP_001774723  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0046  CDS  NC_010513  53061  53843  +  783  pyridoxine 5'-phosphate synthase  YP_001774724  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0047  CDS  NC_010513  54338  55417  -  1080  transcriptional repressor  YP_001774725  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0048    NC_010513  55422  55718  -  297      normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0049  CDS  NC_010513  56488  57213  -  726  competence protein F  YP_001774726  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0050  CDS  NC_010513  57263  58288  +  1026  biotin synthase  YP_001774727  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0051  CDS  NC_010513  58663  59703  +  1041  lipoprotein  YP_001774728  normal  0.678832  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0052    NC_010513  60249  60468  +  220      normal  0.152194  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0053  CDS  NC_010513  60599  61498  -  900  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  YP_001774729  normal  0.0716312  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0054    NC_010513  61718  61948  -  231      hitchhiker  0.00974005  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0055  CDS  NC_010513  70998  71813  +  816  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  YP_001774730  normal  0.0268618  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0056  CDS  NC_010513  71948  72745  -  798  hypothetical protein  YP_001774731  normal  0.046398  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0057  CDS  NC_010513  72885  74252  +  1368  signal recognition particle protein  YP_001774732  normal  0.201387  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0058  CDS  NC_010513  74500  74901  +  402  hypothetical protein  YP_001774733  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0059    NC_010513  74985  75781  +  797      normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0060  CDS  NC_010513  76093  77157  -  1065  fimbrial adhesin precursor  YP_001774734  normal  0.485498  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0061    NC_010513  77241  77446  +  206      normal  0.291282  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0062  CDS  NC_010513  77728  78774  -  1047  fimbrial adhesin precursor  YP_001774735  normal  0.571199  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0063  CDS  NC_010513  78765  81470  -  2706  outer membrane usher protein precursor  YP_001774736  normal  0.0335545  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0064  CDS  NC_010513  81497  82297  -  801  chaperone protein precursor  YP_001774737  decreased coverage  0.00812776  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0065  CDS  NC_010513  82369  82923  -  555  fimbrial subunit precursor  YP_001774738  normal  0.0704887  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0066    NC_010513  83594  83758  +  165      normal  0.128971  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0067  CDS  NC_010513  84543  85031  -  489  competence/damage inducible protein CinA  YP_001774739  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0068  CDS  NC_010513  85118  86419  -  1302  alpha-ketoglutarate permease symporter  YP_001774740  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0069  CDS  NC_010513  86468  87820  -  1353  GTP-binding protein  YP_001774741  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0070  CDS  NC_010513  87835  88113  -  279  RNA-binding protein Hfq  YP_001774742  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0071  CDS  NC_010513  88217  89170  -  954  tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase  YP_001774743  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0072  CDS  NC_010513  89170  90066  -  897  dihydropteroate synthase  YP_001774744  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0073  CDS  NC_010513  90167  90373  +  207  hypothetical protein  YP_001774745  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0074  CDS  NC_010513  90375  92312  -  1938  cell division protein  YP_001774746  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0075  CDS  NC_010513  92359  93000  -  642  cell division protein  YP_001774747  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0076  CDS  NC_010513  93070  93375  +  306  RNA-binding protein  YP_001774748  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0077  CDS  NC_010513  93394  93774  +  381  hypothetical protein  YP_001774749  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0078    NC_010513  94167  94361  -  195      normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0079  CDS  NC_010513  94358  96190  -  1833  dihydroxy-acid dehydratase  YP_001774750  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0080    NC_010513  96457  96797  -  341      normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0081  CDS  NC_010513  97076  97360  +  285  hypothetical protein  YP_001774751  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0082  CDS  NC_010513  97361  98491  +  1131  hypothetical protein  YP_001774752  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0083  CDS  NC_010513  98472  99803  +  1332  membrane protein  YP_001774753  normal  0.735968  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0084  CDS  NC_010513  99989  100909  -  921  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  YP_001774754  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0085  CDS  NC_010513  100952  102298  +  1347  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase  YP_001774755  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0086  CDS  NC_010513  102682  104064  +  1383  alpha-L-fucosidase  YP_001774756  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0087  CDS  NC_010513  104280  104540  +  261  30S ribosomal protein S16  YP_001774757  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0088  CDS  NC_010513  104584  105096  +  513  16S rRNA-processing protein RimM  YP_001774758  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0089  CDS  NC_010513  105119  105985  +  867  tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  YP_001774759  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0090  CDS  NC_010513  106156  106566  +  411  50S ribosomal protein L19  YP_001774760  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0091  CDS  NC_010513  106998  107777  +  780  methionine aminopeptidase  YP_001774761  normal  0.781027  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0092  CDS  NC_010513  107861  108022  +  162  hypothetical protein  YP_001774762  normal  0.671621  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0093  CDS  NC_010513  108469  109371  +  903  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-carboxylate N-succinyltransferase  YP_001774763  normal  0.805943  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0094  CDS  NC_010513  109386  109742  +  357  hypothetical protein  YP_001774764  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0095  CDS  NC_010513  109814  110947  +  1134  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  YP_001774765  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0096  CDS  NC_010513  111348  113039  +  1692  asparagine synthetase B  YP_001774766  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0097  CDS  NC_010513  113097  114125  -  1029  hypothetical protein  YP_001774767  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0098  CDS  NC_010513  114895  115926  +  1032  hypothetical protein  YP_001774768  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0099  CDS  NC_010513  116399  117034  +  636  LexA repressor  YP_001774769  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Xfasm12_0100  CDS  NC_010513  117216  118259  +  1044  recombinase A  YP_001774770  normal  1  n/a    Xylella fastidiosa M12  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 24    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>