91 genes were found for organism Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Rpic_4948  CDS  NC_010683  25  249  -  225  hypothetical protein  YP_001901309  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4949  CDS  NC_010683  246  617  -  372  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  YP_001901310  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4950  CDS  NC_010683  604  834  -  231  hypothetical protein  YP_001901311  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4951  CDS  NC_010683  1045  1335  +  291  hypothetical protein  YP_001901312  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4952  CDS  NC_010683  1344  3077  +  1734  integrase family protein  YP_001901313  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4953  CDS  NC_010683  3380  3829  -  450  hypothetical protein  YP_001901314  normal  0.917246  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4954  CDS  NC_010683  3981  4238  -  258  hypothetical protein  YP_001901315  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4955  CDS  NC_010683  4276  4689  -  414  hypothetical protein  YP_001901316  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4956  CDS  NC_010683  4768  5124  -  357  hypothetical protein  YP_001901317  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4957  CDS  NC_010683  5213  5410  -  198  hypothetical protein  YP_001901318  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4958  CDS  NC_010683  5460  5765  -  306  hypothetical protein  YP_001901319  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4959  CDS  NC_010683  5817  6056  -  240  hypothetical protein  YP_001901320  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4960  CDS  NC_010683  6096  6737  -  642  hypothetical protein  YP_001901321  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4961  CDS  NC_010683  6908  7561  -  654  hypothetical protein  YP_001901322  normal  0.251145  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4962  CDS  NC_010683  8340  9095  +  756  initiator RepB protein  YP_001901323  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4963  CDS  NC_010683  9507  9929  -  423  hypothetical protein  YP_001901324  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4964  CDS  NC_010683  9907  10635  -  729  hypothetical protein  YP_001901325  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4965  CDS  NC_010683  12560  14299  +  1740  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  YP_001901326  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4966  CDS  NC_010683  14773  15576  -  804  hypothetical protein  YP_001901327  normal  1  normal  0.954454  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4967  CDS  NC_010683  15588  15812  -  225  hypothetical protein  YP_001901328  normal  1  normal  0.662937  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4968  CDS  NC_010683  15876  16109  -  234  hypothetical protein  YP_001901329  normal  1  normal  0.665096  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4969  CDS  NC_010683  16207  17094  -  888  ParB-like nuclease  YP_001901330  normal  1  normal  0.522723  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4970  CDS  NC_010683  17491  18699  +  1209  AAA ATPase central domain protein  YP_001901331  normal  0.0954175  normal  0.395306  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4971  CDS  NC_010683  18990  19823  +  834  metallophosphoesterase  YP_001901332  normal  0.840085  normal  0.403662  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4972  CDS  NC_010683  19859  21121  -  1263  hypothetical protein  YP_001901333  normal  0.990538  normal  0.205743  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4973  CDS  NC_010683  21201  21959  -  759  Gp37Gp68 family protein  YP_001901334  normal  1  normal  0.18502  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4974  CDS  NC_010683  21956  22594  -  639  peptidase S24 and S26 domain protein  YP_001901335  normal  1  normal  0.17826  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4975  CDS  NC_010683  22695  23567  -  873  hypothetical protein  YP_001901336  normal  1  normal  0.194568  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4976  CDS  NC_010683  24012  24365  +  354  hypothetical protein  YP_001901337  normal  1  normal  0.114617  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4977  CDS  NC_010683  24457  26136  +  1680  hypothetical protein  YP_001901338  normal  1  hitchhiker  0.0087225  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4978  CDS  NC_010683  26095  27168  -  1074  hypothetical protein  YP_001901339  normal  1  hitchhiker  0.00760749  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4979  CDS  NC_010683  27165  28070  -  906  TniB family protein  YP_001901340  normal  1  hitchhiker  0.00635243  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4980  CDS  NC_010683  28063  29985  -  1923  TniA transposase  YP_001901341  normal  1  normal  0.01794  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4981  CDS  NC_010683  29989  30636  -  648  TnsA endonuclease  YP_001901342  normal  1  normal  0.0242609  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4982  CDS  NC_010683  31078  32001  +  924  cation diffusion facilitator family transporter  YP_001901343  normal  1  normal  0.0279964  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4983  CDS  NC_010683  31998  33605  -  1608  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  YP_001901344  normal  1  normal  0.0185741  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4984  CDS  NC_010683  33683  34288  +  606  two component transcriptional regulator, LuxR family  YP_001901345  normal  1  normal  0.0145131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4985  CDS  NC_010683  34318  37485  -  3168  heavy metal efflux pump, CzcA family  YP_001901346  normal  1  decreased coverage  0.00799341  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4986  CDS  NC_010683  37498  38652  -  1155  efflux transporter, RND family, MFP subunit  YP_001901347  normal  1  hitchhiker  0.00839264  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4987  CDS  NC_010683  38855  40372  +  1518  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  YP_001901348  normal  1  hitchhiker  0.00867259  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4988  CDS  NC_010683  40426  41214  -  789  hypothetical protein  YP_001901349  normal  1  hitchhiker  0.00700854  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4989  CDS  NC_010683  41498  41938  +  441  hypothetical protein  YP_001901350  normal  0.172732  normal  0.013314  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4990  CDS  NC_010683  42016  43659  -  1644  natural resistance-associated macrophage protein  YP_001901351  normal  0.0850771  normal  0.0195368  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4991  CDS  NC_010683  43703  43909  -  207  hypothetical protein  YP_001901352  hitchhiker  0.000114824  normal  0.0124436  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4992  CDS  NC_010683  44304  45800  -  1497  Carbohydrate-selective porin OprB  YP_001901353  decreased coverage  0.0000000000000230615  hitchhiker  0.00966153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4993    NC_010683  46629  47018  +  390      hitchhiker  0.000000360767  hitchhiker  0.00732344  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4994  CDS  NC_010683  47099  48241  -  1143  ParB domain protein nuclease  YP_001901354  hitchhiker  0.00893638  normal  0.0336784  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4995  CDS  NC_010683  48307  49134  -  828  protein of unknown function DUF932  YP_001901355  normal  0.0426401  normal  0.148352  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4996  CDS  NC_010683  49331  49894  -  564  hypothetical protein  YP_001901356  normal  0.17537  normal  0.0874387  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4997  CDS  NC_010683  50011  50346  +  336  hypothetical protein  YP_001901357  normal  0.0398476  normal  0.0830316  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4998  CDS  NC_010683  50545  50751  +  207  hypothetical protein  YP_001901358  normal  0.463323  normal  0.081215  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_4999  CDS  NC_010683  50856  51203  -  348  hypothetical protein  YP_001901359  normal  0.457501  normal  0.0845037  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5000  CDS  NC_010683  51229  51495  -  267  hypothetical protein  YP_001901360  normal  0.643137  normal  0.130611  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5001  CDS  NC_010683  51519  51728  -  210  hypothetical protein  YP_001901361  normal  0.575003  normal  0.194568  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5002  CDS  NC_010683  51731  52303  -  573  endonuclease  YP_001901362  normal  1  normal  0.209573  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5003  CDS  NC_010683  52300  52494  -  195  hypothetical protein  YP_001901363  normal  0.985025  normal  0.405333  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5004  CDS  NC_010683  52547  52795  -  249  hypothetical protein  YP_001901364  normal  1  normal  0.409472  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5005  CDS  NC_010683  52792  54045  -  1254  conjugal transfer protein TraB  YP_001901365  normal  0.441858  normal  0.356102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5006  CDS  NC_010683  54052  54462  -  411  lytic transglycosylase catalytic  YP_001901366  normal  0.0840995  normal  0.821315  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5007  CDS  NC_010683  54459  55802  -  1344  conjugation TrbI family protein  YP_001901367  normal  0.14472  normal  0.964803  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5008  CDS  NC_010683  55802  56755  -  954  Conjugal transfer protein TrbG/VirB9/CagX  YP_001901368  normal  0.116389  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5009  CDS  NC_010683  56752  57480  -  729  hypothetical protein  YP_001901369  normal  0.289444  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5010  CDS  NC_010683  57480  58496  -  1017  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  YP_001901370  normal  0.12085  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5011  CDS  NC_010683  58501  58833  -  333  hypothetical protein  YP_001901371  normal  0.300437  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5012  CDS  NC_010683  58869  59780  -  912  hypothetical protein  YP_001901372  normal  0.155851  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5013  CDS  NC_010683  59773  62451  -  2679  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  YP_001901373  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5014  CDS  NC_010683  62445  62801  -  357  type IV secretory pathway VirB3 family protein  YP_001901374  normal  0.0416986  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5015  CDS  NC_010683  62807  63223  -  417  hypothetical protein  YP_001901375  normal  0.120417  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5016  CDS  NC_010683  63241  64272  -  1032  type II secretion system protein E  YP_001901376  normal  0.0975061  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5017  CDS  NC_010683  64265  64816  -  552  Lytic transglycosylase catalytic  YP_001901377  normal  0.260237  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5018  CDS  NC_010683  64813  65166  -  354  hypothetical protein  YP_001901378  normal  0.182168  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5019  CDS  NC_010683  65187  65579  -  393  single-strand binding protein  YP_001901379  normal  0.0663797  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5020  CDS  NC_010683  65616  65828  -  213  hypothetical protein  YP_001901380  normal  0.0753857  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5021  CDS  NC_010683  65858  66091  -  234  hypothetical protein  YP_001901381  normal  0.0298125  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5022  CDS  NC_010683  66249  67274  -  1026  SCP-like extracellular  YP_001901382  normal  0.0390932  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5023  CDS  NC_010683  67580  68185  -  606  hypothetical protein  YP_001901383  normal  0.35415  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5024  CDS  NC_010683  68209  69447  -  1239  hypothetical protein  YP_001901384  normal  0.501103  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5025  CDS  NC_010683  69459  69938  -  480  hypothetical protein  YP_001901385  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5026  CDS  NC_010683  69970  70470  -  501  hypothetical protein  YP_001901386  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5027  CDS  NC_010683  70505  71545  -  1041  type II secretion system protein  YP_001901387  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5028  CDS  NC_010683  71542  73371  -  1830  type II secretion system protein E  YP_001901388  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5029  CDS  NC_010683  73371  74627  -  1257  hypothetical protein  YP_001901389  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5030  CDS  NC_010683  74630  75196  -  567  hypothetical protein  YP_001901390  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5031  CDS  NC_010683  75214  76899  -  1686  PilN  YP_001901391  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5032  CDS  NC_010683  76896  77495  -  600  hypothetical protein  YP_001901392  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5033  CDS  NC_010683  77525  77962  -  438  Lytic transglycosylase catalytic  YP_001901393  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5034  CDS  NC_010683  77959  78861  -  903  hypothetical protein  YP_001901394  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5035  CDS  NC_010683  78972  79241  -  270  hypothetical protein  YP_001901395  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5036  CDS  NC_010683  79312  79725  +  414  hypothetical protein  YP_001901396  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5037  CDS  NC_010683  79897  80268  +  372  hypothetical protein  YP_001901397  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic_5038  CDS  NC_010683  80594  80920  +  327  hypothetical protein  YP_001901398  normal  1  normal  1  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>